MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI04

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009958	GC	3	6	3327	3332	0 %	0 %	50 %	50 %	159046607
2	NC_009958	TC	3	6	6384	6389	0 %	50 %	0 %	50 %	159046607
3	NC_009958	AG	3	6	6455	6460	50 %	0 %	50 %	0 %	159046607
4	NC_009958	CG	4	8	7503	7510	0 %	0 %	50 %	50 %	159046608
5	NC_009958	GC	3	6	8922	8927	0 %	0 %	50 %	50 %	159046609
6	NC_009958	GC	3	6	9040	9045	0 %	0 %	50 %	50 %	159046609
7	NC_009958	CG	4	8	10176	10183	0 %	0 %	50 %	50 %	159046610
8	NC_009958	GC	4	8	10214	10221	0 %	0 %	50 %	50 %	159046610
9	NC_009958	CG	3	6	10308	10313	0 %	0 %	50 %	50 %	159046610
10	NC_009958	CA	3	6	10341	10346	50 %	0 %	0 %	50 %	159046610
11	NC_009958	GC	3	6	12512	12517	0 %	0 %	50 %	50 %	159046613
12	NC_009958	CG	3	6	12653	12658	0 %	0 %	50 %	50 %	159046613
13	NC_009958	GC	3	6	12764	12769	0 %	0 %	50 %	50 %	159046613
14	NC_009958	CA	3	6	13121	13126	50 %	0 %	0 %	50 %	159046613
15	NC_009958	CG	3	6	13147	13152	0 %	0 %	50 %	50 %	159046613
16	NC_009958	GC	3	6	14112	14117	0 %	0 %	50 %	50 %	159046614
17	NC_009958	CG	4	8	14170	14177	0 %	0 %	50 %	50 %	159046614
18	NC_009958	CG	3	6	15354	15359	0 %	0 %	50 %	50 %	159046614
19	NC_009958	TC	3	6	17283	17288	0 %	50 %	0 %	50 %	159046616
20	NC_009958	CA	4	8	17497	17504	50 %	0 %	0 %	50 %	159046616
21	NC_009958	CG	3	6	17967	17972	0 %	0 %	50 %	50 %	159046616
22	NC_009958	CG	3	6	18191	18196	0 %	0 %	50 %	50 %	159046616
23	NC_009958	CA	3	6	18268	18273	50 %	0 %	0 %	50 %	159046616
24	NC_009958	GC	3	6	19480	19485	0 %	0 %	50 %	50 %	159046618
25	NC_009958	CG	3	6	19514	19519	0 %	0 %	50 %	50 %	159046618
26	NC_009958	GC	3	6	19798	19803	0 %	0 %	50 %	50 %	159046618
27	NC_009958	CG	3	6	20154	20159	0 %	0 %	50 %	50 %	159046619
28	NC_009958	GC	3	6	21419	21424	0 %	0 %	50 %	50 %	159046623
29	NC_009958	AG	3	6	21778	21783	50 %	0 %	50 %	0 %	159046623
30	NC_009958	GC	3	6	22350	22355	0 %	0 %	50 %	50 %	159046624
31	NC_009958	CA	4	8	22589	22596	50 %	0 %	0 %	50 %	159046625
32	NC_009958	AC	3	6	24584	24589	50 %	0 %	0 %	50 %	159046626
33	NC_009958	CG	3	6	24912	24917	0 %	0 %	50 %	50 %	159046626
34	NC_009958	CG	3	6	25101	25106	0 %	0 %	50 %	50 %	159046626
35	NC_009958	GA	3	6	25367	25372	50 %	0 %	50 %	0 %	159046627
36	NC_009958	TG	3	6	25913	25918	0 %	50 %	50 %	0 %	159046628
37	NC_009958	GC	3	6	26043	26048	0 %	0 %	50 %	50 %	159046628
38	NC_009958	GC	3	6	26852	26857	0 %	0 %	50 %	50 %	159046629
39	NC_009958	GC	3	6	31084	31089	0 %	0 %	50 %	50 %	159046631
40	NC_009958	CT	3	6	31202	31207	0 %	50 %	0 %	50 %	159046631
41	NC_009958	CG	3	6	31389	31394	0 %	0 %	50 %	50 %	159046631
42	NC_009958	GT	3	6	31687	31692	0 %	50 %	50 %	0 %	159046631
43	NC_009958	GC	4	8	34639	34646	0 %	0 %	50 %	50 %	159046634
44	NC_009958	AT	3	6	35259	35264	50 %	50 %	0 %	0 %	159046635
45	NC_009958	CG	3	6	35794	35799	0 %	0 %	50 %	50 %	159046635
46	NC_009958	TC	3	6	36173	36178	0 %	50 %	0 %	50 %	159046635
47	NC_009958	TC	3	6	36316	36321	0 %	50 %	0 %	50 %	159046635
48	NC_009958	CG	3	6	36715	36720	0 %	0 %	50 %	50 %	159046636
49	NC_009958	GC	3	6	36731	36736	0 %	0 %	50 %	50 %	159046636
50	NC_009958	GC	3	6	37702	37707	0 %	0 %	50 %	50 %	159046637
51	NC_009958	CG	3	6	39464	39469	0 %	0 %	50 %	50 %	159046638
52	NC_009958	GC	3	6	39549	39554	0 %	0 %	50 %	50 %	159046638
53	NC_009958	GC	3	6	39698	39703	0 %	0 %	50 %	50 %	159046638
54	NC_009958	CG	3	6	39856	39861	0 %	0 %	50 %	50 %	159046639
55	NC_009958	GC	3	6	40096	40101	0 %	0 %	50 %	50 %	159046639
56	NC_009958	GC	3	6	40116	40121	0 %	0 %	50 %	50 %	159046639
57	NC_009958	GC	3	6	40449	40454	0 %	0 %	50 %	50 %	159046639
58	NC_009958	CG	3	6	40673	40678	0 %	0 %	50 %	50 %	159046639
59	NC_009958	GC	3	6	40875	40880	0 %	0 %	50 %	50 %	159046639
60	NC_009958	GC	3	6	41676	41681	0 %	0 %	50 %	50 %	159046639
61	NC_009958	GC	3	6	43261	43266	0 %	0 %	50 %	50 %	159046640
62	NC_009958	CG	3	6	43629	43634	0 %	0 %	50 %	50 %	159046640
63	NC_009958	GC	3	6	43699	43704	0 %	0 %	50 %	50 %	159046640
64	NC_009958	CT	3	6	44721	44726	0 %	50 %	0 %	50 %	159046640
65	NC_009958	GA	3	6	45985	45990	50 %	0 %	50 %	0 %	159046642
66	NC_009958	GC	3	6	47305	47310	0 %	0 %	50 %	50 %	159046644
67	NC_009958	GC	3	6	47475	47480	0 %	0 %	50 %	50 %	159046644
68	NC_009958	CG	3	6	47844	47849	0 %	0 %	50 %	50 %	159046644
69	NC_009958	CG	3	6	47965	47970	0 %	0 %	50 %	50 %	159046644
70	NC_009958	CG	3	6	48071	48076	0 %	0 %	50 %	50 %	159046645
71	NC_009958	CG	4	8	48405	48412	0 %	0 %	50 %	50 %	159046645
72	NC_009958	CG	3	6	48522	48527	0 %	0 %	50 %	50 %	159046645
73	NC_009958	GC	3	6	48977	48982	0 %	0 %	50 %	50 %	159046646
74	NC_009958	GC	3	6	49244	49249	0 %	0 %	50 %	50 %	159046646
75	NC_009958	CG	4	8	49505	49512	0 %	0 %	50 %	50 %	159046646
76	NC_009958	CG	3	6	49640	49645	0 %	0 %	50 %	50 %	159046646
77	NC_009958	GC	3	6	49938	49943	0 %	0 %	50 %	50 %	159046647
78	NC_009958	GC	3	6	50048	50053	0 %	0 %	50 %	50 %	159046647
79	NC_009958	GC	3	6	50302	50307	0 %	0 %	50 %	50 %	159046647
80	NC_009958	GC	3	6	51039	51044	0 %	0 %	50 %	50 %	159046648
81	NC_009958	CG	3	6	51509	51514	0 %	0 %	50 %	50 %	159046648
82	NC_009958	CG	3	6	52201	52206	0 %	0 %	50 %	50 %	159046649
83	NC_009958	CG	3	6	52605	52610	0 %	0 %	50 %	50 %	159046650
84	NC_009958	GC	3	6	53384	53389	0 %	0 %	50 %	50 %	159046650
85	NC_009958	GC	3	6	53432	53437	0 %	0 %	50 %	50 %	159046650
86	NC_009958	GC	3	6	53587	53592	0 %	0 %	50 %	50 %	159046650
87	NC_009958	GC	3	6	53882	53887	0 %	0 %	50 %	50 %	159046650
88	NC_009958	GC	3	6	54298	54303	0 %	0 %	50 %	50 %	159046650
89	NC_009958	CG	3	6	54559	54564	0 %	0 %	50 %	50 %	159046650
90	NC_009958	GC	3	6	58275	58280	0 %	0 %	50 %	50 %	159046652
91	NC_009958	CG	3	6	58927	58932	0 %	0 %	50 %	50 %	159046652
92	NC_009958	GC	3	6	60849	60854	0 %	0 %	50 %	50 %	159046654
93	NC_009958	GC	3	6	60880	60885	0 %	0 %	50 %	50 %	159046654
94	NC_009958	AG	3	6	61050	61055	50 %	0 %	50 %	0 %	159046654
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101	NC_009958	CG	3	6	66767	66772	0 %	0 %	50 %	50 %	159046658
102	NC_009958	GC	3	6	67261	67266	0 %	0 %	50 %	50 %	159046658
103	NC_009958	GC	3	6	68103	68108	0 %	0 %	50 %	50 %	159046659
104	NC_009958	GC	3	6	68134	68139	0 %	0 %	50 %	50 %	159046659
105	NC_009958	GC	3	6	68480	68485	0 %	0 %	50 %	50 %	159046659
106	NC_009958	CG	5	10	68527	68536	0 %	0 %	50 %	50 %	159046659
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108	NC_009958	CG	4	8	69100	69107	0 %	0 %	50 %	50 %	159046659
109	NC_009958	GA	3	6	69751	69756	50 %	0 %	50 %	0 %	159046660
110	NC_009958	GC	3	6	70152	70157	0 %	0 %	50 %	50 %	159046660
111	NC_009958	GC	3	6	70927	70932	0 %	0 %	50 %	50 %	159046661
112	NC_009958	GC	3	6	71128	71133	0 %	0 %	50 %	50 %	159046661
113	NC_009958	CG	3	6	71263	71268	0 %	0 %	50 %	50 %	159046661
114	NC_009958	CG	3	6	72640	72645	0 %	0 %	50 %	50 %	159046662
115	NC_009958	GC	3	6	75683	75688	0 %	0 %	50 %	50 %	159046666
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117	NC_009958	TG	3	6	75892	75897	0 %	50 %	50 %	0 %	159046666
118	NC_009958	GC	3	6	76175	76180	0 %	0 %	50 %	50 %	159046666
119	NC_009958	CG	4	8	76302	76309	0 %	0 %	50 %	50 %	159046666
120	NC_009958	CG	3	6	76624	76629	0 %	0 %	50 %	50 %	159046667
121	NC_009958	GC	4	8	76751	76758	0 %	0 %	50 %	50 %	159046667
122	NC_009958	GC	3	6	77215	77220	0 %	0 %	50 %	50 %	159046668
123	NC_009958	CG	3	6	77374	77379	0 %	0 %	50 %	50 %	159046668
124	NC_009958	GC	3	6	79025	79030	0 %	0 %	50 %	50 %	159046669
125	NC_009958	CG	3	6	79385	79390	0 %	0 %	50 %	50 %	159046669
126	NC_009958	CG	3	6	80327	80332	0 %	0 %	50 %	50 %	159046670
127	NC_009958	GC	3	6	80415	80420	0 %	0 %	50 %	50 %	159046670
128	NC_009958	CA	3	6	80458	80463	50 %	0 %	0 %	50 %	159046670
129	NC_009958	CG	3	6	80616	80621	0 %	0 %	50 %	50 %	159046670
130	NC_009958	CG	3	6	80630	80635	0 %	0 %	50 %	50 %	159046670
131	NC_009958	AG	3	6	80654	80659	50 %	0 %	50 %	0 %	159046670
132	NC_009958	GC	4	8	80699	80706	0 %	0 %	50 %	50 %	159046670
133	NC_009958	GC	4	8	80806	80813	0 %	0 %	50 %	50 %	159046670
134	NC_009958	CG	3	6	80941	80946	0 %	0 %	50 %	50 %	159046671
135	NC_009958	AC	3	6	82020	82025	50 %	0 %	0 %	50 %	159046672
136	NC_009958	GC	3	6	82679	82684	0 %	0 %	50 %	50 %	159046673
137	NC_009958	GC	5	10	82975	82984	0 %	0 %	50 %	50 %	159046673
138	NC_009958	GC	3	6	83134	83139	0 %	0 %	50 %	50 %	159046673
139	NC_009958	GC	3	6	83252	83257	0 %	0 %	50 %	50 %	159046673
140	NC_009958	GC	3	6	83275	83280	0 %	0 %	50 %	50 %	159046673
141	NC_009958	TA	3	6	84621	84626	50 %	50 %	0 %	0 %	159046675

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.