MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI03

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009957	CGGGGT	2	12	2020	2031	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	159046472
2	NC_009957	TTCGGT	2	12	5922	5933	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_009957	ATCGAG	2	12	7090	7101	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	159046478
4	NC_009957	CGCCCC	2	12	12078	12089	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	159046481
5	NC_009957	CGCCCA	2	12	12090	12101	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	159046481
6	NC_009957	TGCCTA	2	12	15564	15575	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159046486
7	NC_009957	TCGCTT	2	12	15755	15766	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	159046486
8	NC_009957	CGGCCG	2	12	15879	15890	0 %	0 %	50 %	50 %	159046486
9	NC_009957	ATGCCC	2	12	16131	16142	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	159046486
10	NC_009957	ACCGCC	2	12	20841	20852	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	159046492
11	NC_009957	CCGACG	2	12	20928	20939	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	159046492
12	NC_009957	CAGCCG	2	12	21715	21726	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	159046493
13	NC_009957	GATGGC	2	12	23133	23144	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	159046494
14	NC_009957	AGGGGC	2	12	23694	23705	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	159046495
15	NC_009957	GAAAAG	2	12	25485	25496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046499
16	NC_009957	CCCGAA	2	12	33322	33333	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	159046511
17	NC_009957	TCTTCG	2	12	36108	36119	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	159046515
18	NC_009957	AGCGGC	2	12	37493	37504	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	159046517
19	NC_009957	GCCCGA	2	12	40796	40807	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	159046521
20	NC_009957	GTTTCG	2	12	46757	46768	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009957	TCCATC	2	12	48730	48741	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	159046527
22	NC_009957	GCATCG	2	12	50790	50801	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	159046528
23	NC_009957	ATCGGT	2	12	54234	54245	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	159046530
24	NC_009957	CGATGT	2	12	55381	55392	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	159046531
25	NC_009957	GGCTCT	2	12	60201	60212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046535
26	NC_009957	GCCATC	2	12	60379	60390	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	159046536
27	NC_009957	GCGCTG	2	12	62812	62823	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	159046536
28	NC_009957	GGTCAG	2	12	65234	65245	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	159046539
29	NC_009957	GGGTCA	2	12	66141	66152	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	159046541
30	NC_009957	TGGTCA	2	12	69966	69977	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	159046543
31	NC_009957	GGACCG	2	12	71377	71388	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	159046545
32	NC_009957	TGCATT	2	12	80250	80261	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_009957	CCGCGC	2	12	85952	85963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046557
34	NC_009957	CGCGAT	2	12	89535	89546	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	159046560
35	NC_009957	AGCGAA	2	12	97006	97017	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	159046569
36	NC_009957	GTTCCT	2	12	101746	101757	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	159046576
37	NC_009957	TGACGC	2	12	106578	106589	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009957	CCTGTT	2	12	108610	108621	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	159046587
39	NC_009957	TGGGCT	2	12	109792	109803	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	159046587
40	NC_009957	GCGCTT	2	12	110345	110356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046589
41	NC_009957	GTCCAG	2	12	118132	118143	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	159046596
42	NC_009957	TCGAGA	2	12	124316	124327	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	159046603
43	NC_009957	CATCGT	2	12	124350	124361	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159046603
44	NC_009957	CTGCGG	2	12	125794	125805	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	159046603

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.