MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI03

Total Repeats: 258

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009957	GACC	2	8	414	421	25 %	0 %	25 %	50 %	159046470
2	NC_009957	GGGT	2	8	516	523	0 %	25 %	75 %	0 %	159046470
3	NC_009957	CTGT	2	8	757	764	0 %	50 %	25 %	25 %	159046470
4	NC_009957	CCAG	2	8	1376	1383	25 %	0 %	25 %	50 %	159046471
5	NC_009957	GAAC	2	8	1568	1575	50 %	0 %	25 %	25 %	159046471
6	NC_009957	AACG	2	8	2104	2111	50 %	0 %	25 %	25 %	159046472
7	NC_009957	GAAC	2	8	2247	2254	50 %	0 %	25 %	25 %	159046472
8	NC_009957	GCTG	2	8	2523	2530	0 %	25 %	50 %	25 %	159046473
9	NC_009957	CCGC	2	8	2672	2679	0 %	0 %	25 %	75 %	159046473
10	NC_009957	GGAT	2	8	2747	2754	25 %	25 %	50 %	0 %	159046473
11	NC_009957	CTCA	2	8	2767	2774	25 %	25 %	0 %	50 %	159046473
12	NC_009957	GCCC	2	8	3384	3391	0 %	0 %	25 %	75 %	159046473
13	NC_009957	GCCT	2	8	3491	3498	0 %	25 %	25 %	50 %	159046473
14	NC_009957	CTTG	2	8	4326	4333	0 %	50 %	25 %	25 %	159046474
15	NC_009957	TGGT	2	8	4338	4345	0 %	50 %	50 %	0 %	159046474
16	NC_009957	CGCC	2	8	4567	4574	0 %	0 %	25 %	75 %	159046475
17	NC_009957	TGCG	2	8	5001	5008	0 %	25 %	50 %	25 %	159046475
18	NC_009957	TGGC	2	8	6396	6403	0 %	25 %	50 %	25 %	159046477
19	NC_009957	CTGA	2	8	6985	6992	25 %	25 %	25 %	25 %	159046478
20	NC_009957	TGGC	2	8	7500	7507	0 %	25 %	50 %	25 %	159046479
21	NC_009957	GCTG	2	8	8036	8043	0 %	25 %	50 %	25 %	159046479
22	NC_009957	TGGC	2	8	8060	8067	0 %	25 %	50 %	25 %	159046479
23	NC_009957	GCCG	2	8	8562	8569	0 %	0 %	50 %	50 %	159046480
24	NC_009957	GGAT	2	8	8920	8927	25 %	25 %	50 %	0 %	159046480
25	NC_009957	CAGG	2	8	9718	9725	25 %	0 %	50 %	25 %	159046480
26	NC_009957	GGCG	2	8	10068	10075	0 %	0 %	75 %	25 %	159046480
27	NC_009957	AACG	2	8	10252	10259	50 %	0 %	25 %	25 %	159046480
28	NC_009957	CGTG	2	8	10506	10513	0 %	25 %	50 %	25 %	159046480
29	NC_009957	CGGG	2	8	11045	11052	0 %	0 %	75 %	25 %	159046481
30	NC_009957	TCGG	2	8	11221	11228	0 %	25 %	50 %	25 %	159046481
31	NC_009957	GCCC	2	8	11586	11593	0 %	0 %	25 %	75 %	159046481
32	NC_009957	CTTT	2	8	11834	11841	0 %	75 %	0 %	25 %	159046481
33	NC_009957	CGAC	2	8	12169	12176	25 %	0 %	25 %	50 %	159046482
34	NC_009957	GGAC	2	8	14099	14106	25 %	0 %	50 %	25 %	159046484
35	NC_009957	CAGC	2	8	14829	14836	25 %	0 %	25 %	50 %	159046485
36	NC_009957	GGGC	2	8	15788	15795	0 %	0 %	75 %	25 %	159046486
37	NC_009957	GTGG	2	8	16162	16169	0 %	25 %	75 %	0 %	159046486
38	NC_009957	CGGG	2	8	16364	16371	0 %	0 %	75 %	25 %	159046486
39	NC_009957	AACG	2	8	16901	16908	50 %	0 %	25 %	25 %	159046486
40	NC_009957	AAGA	2	8	17563	17570	75 %	0 %	25 %	0 %	159046487
41	NC_009957	GCCA	2	8	18570	18577	25 %	0 %	25 %	50 %	159046490
42	NC_009957	CAGC	2	8	19022	19029	25 %	0 %	25 %	50 %	159046490
43	NC_009957	AGGC	2	8	20172	20179	25 %	0 %	50 %	25 %	159046491
44	NC_009957	GCCA	2	8	20324	20331	25 %	0 %	25 %	50 %	159046491
45	NC_009957	CCAG	2	8	20566	20573	25 %	0 %	25 %	50 %	159046492
46	NC_009957	CCCG	2	8	20900	20907	0 %	0 %	25 %	75 %	159046492
47	NC_009957	CGTT	2	8	21054	21061	0 %	50 %	25 %	25 %	159046492
48	NC_009957	TCAG	2	8	21366	21373	25 %	25 %	25 %	25 %	159046493
49	NC_009957	CCCG	2	8	22043	22050	0 %	0 %	25 %	75 %	159046494
50	NC_009957	CGGG	2	8	22576	22583	0 %	0 %	75 %	25 %	159046494
51	NC_009957	GCGG	2	8	22674	22681	0 %	0 %	75 %	25 %	159046494
52	NC_009957	AGCC	2	8	23547	23554	25 %	0 %	25 %	50 %	159046495
53	NC_009957	GGTC	2	8	23665	23672	0 %	25 %	50 %	25 %	159046495
54	NC_009957	CCCG	2	8	23965	23972	0 %	0 %	25 %	75 %	159046496
55	NC_009957	GCAC	2	8	26336	26343	25 %	0 %	25 %	50 %	159046500
56	NC_009957	CGGA	2	8	26487	26494	25 %	0 %	50 %	25 %	159046500
57	NC_009957	GACC	2	8	26582	26589	25 %	0 %	25 %	50 %	159046500
58	NC_009957	TCGC	2	8	28137	28144	0 %	25 %	25 %	50 %	159046503
59	NC_009957	CGAT	2	8	29633	29640	25 %	25 %	25 %	25 %	159046505
60	NC_009957	GGCA	2	8	30488	30495	25 %	0 %	50 %	25 %	159046506
61	NC_009957	CGAA	2	8	30577	30584	50 %	0 %	25 %	25 %	159046506
62	NC_009957	AGCC	2	8	30888	30895	25 %	0 %	25 %	50 %	159046507
63	NC_009957	CCAC	2	8	31036	31043	25 %	0 %	0 %	75 %	159046507
64	NC_009957	GGCG	2	8	31345	31352	0 %	0 %	75 %	25 %	159046507
65	NC_009957	TCAG	2	8	31961	31968	25 %	25 %	25 %	25 %	159046508
66	NC_009957	CCGG	2	8	31971	31978	0 %	0 %	50 %	50 %	159046508
67	NC_009957	CAAC	2	8	32051	32058	50 %	0 %	0 %	50 %	159046508
68	NC_009957	CAAC	2	8	32495	32502	50 %	0 %	0 %	50 %	159046509
69	NC_009957	ACCG	2	8	32697	32704	25 %	0 %	25 %	50 %	159046510
70	NC_009957	CTGA	2	8	32710	32717	25 %	25 %	25 %	25 %	159046510
71	NC_009957	TCCT	2	8	33387	33394	0 %	50 %	0 %	50 %	159046511
72	NC_009957	GCTG	2	8	33458	33465	0 %	25 %	50 %	25 %	159046511
73	NC_009957	CGAC	2	8	33466	33473	25 %	0 %	25 %	50 %	159046511
74	NC_009957	CCGC	2	8	33968	33975	0 %	0 %	25 %	75 %	159046512
75	NC_009957	GCCC	2	8	34205	34212	0 %	0 %	25 %	75 %	159046513
76	NC_009957	TCCA	2	8	34678	34685	25 %	25 %	0 %	50 %	159046514
77	NC_009957	CGCC	2	8	35099	35106	0 %	0 %	25 %	75 %	159046515
78	NC_009957	CAGC	2	8	35800	35807	25 %	0 %	25 %	50 %	159046515
79	NC_009957	GCGT	2	8	35829	35836	0 %	25 %	50 %	25 %	159046515
80	NC_009957	GGCG	2	8	36158	36165	0 %	0 %	75 %	25 %	159046515
81	NC_009957	CTGG	2	8	36691	36698	0 %	25 %	50 %	25 %	159046515
82	NC_009957	GCCT	2	8	37227	37234	0 %	25 %	25 %	50 %	159046516
83	NC_009957	CCGG	2	8	37923	37930	0 %	0 %	50 %	50 %	159046517
84	NC_009957	GACC	2	8	39469	39476	25 %	0 %	25 %	50 %	159046519
85	NC_009957	ACCG	2	8	39595	39602	25 %	0 %	25 %	50 %	159046519
86	NC_009957	CCCG	2	8	40524	40531	0 %	0 %	25 %	75 %	159046520
87	NC_009957	CCTC	2	8	41951	41958	0 %	25 %	0 %	75 %	159046522
88	NC_009957	CGCC	2	8	42209	42216	0 %	0 %	25 %	75 %	159046522
89	NC_009957	AGGC	2	8	43106	43113	25 %	0 %	50 %	25 %	159046523
90	NC_009957	ATGG	2	8	43691	43698	25 %	25 %	50 %	0 %	159046524
91	NC_009957	GCTG	2	8	44109	44116	0 %	25 %	50 %	25 %	159046524
92	NC_009957	GCCC	2	8	44335	44342	0 %	0 %	25 %	75 %	159046524
93	NC_009957	GGAA	2	8	45998	46005	50 %	0 %	50 %	0 %	159046525
94	NC_009957	CGTT	2	8	46179	46186	0 %	50 %	25 %	25 %	159046525
95	NC_009957	AGTC	2	8	46658	46665	25 %	25 %	25 %	25 %	159046525
96	NC_009957	TTGC	2	8	47809	47816	0 %	50 %	25 %	25 %	159046526
97	NC_009957	CCAG	2	8	47895	47902	25 %	0 %	25 %	50 %	159046526
98	NC_009957	TTCT	2	8	47907	47914	0 %	75 %	0 %	25 %	159046526
99	NC_009957	ATCG	2	8	49614	49621	25 %	25 %	25 %	25 %	159046527
100	NC_009957	CCCG	2	8	49776	49783	0 %	0 %	25 %	75 %	159046527
101	NC_009957	GATC	2	8	49859	49866	25 %	25 %	25 %	25 %	159046527
102	NC_009957	CGGT	2	8	50949	50956	0 %	25 %	50 %	25 %	159046528
103	NC_009957	TGAT	2	8	51054	51061	25 %	50 %	25 %	0 %	159046528
104	NC_009957	CGCT	2	8	51483	51490	0 %	25 %	25 %	50 %	159046528
105	NC_009957	GCGG	2	8	52262	52269	0 %	0 %	75 %	25 %	159046528
106	NC_009957	AGAA	2	8	52389	52396	75 %	0 %	25 %	0 %	159046528
107	NC_009957	GATC	2	8	53003	53010	25 %	25 %	25 %	25 %	159046529
108	NC_009957	GAAC	2	8	53216	53223	50 %	0 %	25 %	25 %	159046529
109	NC_009957	CAGC	2	8	53429	53436	25 %	0 %	25 %	50 %	159046529
110	NC_009957	TGGT	2	8	54274	54281	0 %	50 %	50 %	0 %	159046530
111	NC_009957	CGGG	2	8	55073	55080	0 %	0 %	75 %	25 %	159046531
112	NC_009957	TTCC	2	8	55552	55559	0 %	50 %	0 %	50 %	159046531
113	NC_009957	CGGT	2	8	56799	56806	0 %	25 %	50 %	25 %	159046532
114	NC_009957	CGGA	2	8	58020	58027	25 %	0 %	50 %	25 %	159046533
115	NC_009957	GAAG	2	8	58049	58056	50 %	0 %	50 %	0 %	159046533
116	NC_009957	GCCC	2	8	58093	58100	0 %	0 %	25 %	75 %	159046533
117	NC_009957	GCCG	2	8	58184	58191	0 %	0 %	50 %	50 %	159046533
118	NC_009957	GACC	2	8	58485	58492	25 %	0 %	25 %	50 %	159046534
119	NC_009957	CGGG	2	8	59079	59086	0 %	0 %	75 %	25 %	159046535
120	NC_009957	CGCC	2	8	59227	59234	0 %	0 %	25 %	75 %	159046535
121	NC_009957	CCTG	2	8	59890	59897	0 %	25 %	25 %	50 %	159046535
122	NC_009957	TGCG	2	8	60093	60100	0 %	25 %	50 %	25 %	159046535
123	NC_009957	ACCG	2	8	60391	60398	25 %	0 %	25 %	50 %	159046536
124	NC_009957	AGCG	2	8	60474	60481	25 %	0 %	50 %	25 %	159046536
125	NC_009957	CCTG	2	8	61031	61038	0 %	25 %	25 %	50 %	159046536
126	NC_009957	CGGC	2	8	62405	62412	0 %	0 %	50 %	50 %	159046536
127	NC_009957	TCGC	2	8	62446	62453	0 %	25 %	25 %	50 %	159046536
128	NC_009957	CAGC	2	8	62682	62689	25 %	0 %	25 %	50 %	159046536
129	NC_009957	CTCG	2	8	62982	62989	0 %	25 %	25 %	50 %	159046536
130	NC_009957	CGGC	2	8	63493	63500	0 %	0 %	50 %	50 %	159046536
131	NC_009957	GGGT	2	8	63955	63962	0 %	25 %	75 %	0 %	159046537
132	NC_009957	CGGT	2	8	64715	64722	0 %	25 %	50 %	25 %	159046538
133	NC_009957	CCAT	2	8	65110	65117	25 %	25 %	0 %	50 %	159046539
134	NC_009957	GCGA	2	8	65563	65570	25 %	0 %	50 %	25 %	159046540
135	NC_009957	ATCA	2	8	66079	66086	50 %	25 %	0 %	25 %	159046541
136	NC_009957	GCCG	2	8	66793	66800	0 %	0 %	50 %	50 %	159046541
137	NC_009957	TGCG	2	8	67226	67233	0 %	25 %	50 %	25 %	159046541
138	NC_009957	CCGC	2	8	67343	67350	0 %	0 %	25 %	75 %	159046541
139	NC_009957	AGCG	2	8	67585	67592	25 %	0 %	50 %	25 %	159046541
140	NC_009957	GCTG	2	8	68580	68587	0 %	25 %	50 %	25 %	159046542
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.