MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI03

Total Repeats: 1624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009957	ATC	3	9	55	63	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046470
2	NC_009957	CCG	2	6	109	114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046470
3	NC_009957	CAG	2	6	216	221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046470
4	NC_009957	TCA	2	6	233	238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046470
5	NC_009957	CAG	2	6	300	305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046470
6	NC_009957	TCG	2	6	323	328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046470
7	NC_009957	ATC	2	6	546	551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046470
8	NC_009957	CCG	2	6	556	561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046470
9	NC_009957	GCG	2	6	587	592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046470
10	NC_009957	CAG	2	6	681	686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046470
11	NC_009957	GCG	2	6	964	969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046471
12	NC_009957	GTC	2	6	1248	1253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046471
13	NC_009957	ATG	2	6	1303	1308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046471
14	NC_009957	GTG	2	6	1317	1322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046471
15	NC_009957	CGC	2	6	1389	1394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046471
16	NC_009957	ACA	2	6	1454	1459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046471
17	NC_009957	AGA	2	6	1529	1534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046471
18	NC_009957	ATC	2	6	1597	1602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046471
19	NC_009957	AGT	2	6	1616	1621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046471
20	NC_009957	CGT	2	6	1928	1933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046472
21	NC_009957	CGT	2	6	1960	1965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046472
22	NC_009957	CGA	2	6	1969	1974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046472
23	NC_009957	TGG	2	6	2093	2098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046472
24	NC_009957	AAC	2	6	2174	2179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046472
25	NC_009957	GAG	2	6	2385	2390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046472
26	NC_009957	CAG	2	6	2543	2548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046473
27	NC_009957	ACG	2	6	2603	2608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046473
28	NC_009957	GGT	2	6	2629	2634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046473
29	NC_009957	GGA	2	6	2700	2705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046473
30	NC_009957	TCG	2	6	2900	2905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046473
31	NC_009957	GTT	2	6	2941	2946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046473
32	NC_009957	TTC	2	6	2950	2955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046473
33	NC_009957	ACG	2	6	2984	2989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046473
34	NC_009957	CGA	2	6	3279	3284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046473
35	NC_009957	CCG	2	6	3515	3520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046473
36	NC_009957	GAC	2	6	3528	3533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046473
37	NC_009957	CCA	2	6	3591	3596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046473
38	NC_009957	GCG	2	6	3613	3618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046473
39	NC_009957	TCG	2	6	3680	3685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046473
40	NC_009957	TGC	2	6	3710	3715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046473
41	NC_009957	CCA	2	6	3732	3737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046473
42	NC_009957	GCG	2	6	3921	3926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046474
43	NC_009957	GCC	2	6	3936	3941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046474
44	NC_009957	TGG	2	6	4149	4154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046474
45	NC_009957	CTT	2	6	4165	4170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046474
46	NC_009957	TGC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046474
47	NC_009957	GAC	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046475
48	NC_009957	AGC	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046475
49	NC_009957	CAA	2	6	4588	4593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046475
50	NC_009957	GCT	2	6	4619	4624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046475
51	NC_009957	CCG	2	6	4784	4789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046475
52	NC_009957	CAA	2	6	4886	4891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046475
53	NC_009957	GCA	2	6	4900	4905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046475
54	NC_009957	TCG	2	6	4921	4926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046475
55	NC_009957	GCA	2	6	4972	4977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046475
56	NC_009957	GGC	2	6	4980	4985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046475
57	NC_009957	GTC	2	6	5236	5241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046476
58	NC_009957	GAC	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046476
59	NC_009957	GCT	2	6	5623	5628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046476
60	NC_009957	TGT	2	6	5649	5654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046476
61	NC_009957	TGA	2	6	5712	5717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046476
62	NC_009957	ATG	2	6	6260	6265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
63	NC_009957	GGT	2	6	6272	6277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046477
64	NC_009957	ATG	2	6	6284	6289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
65	NC_009957	ATG	2	6	6305	6310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
66	NC_009957	ATG	2	6	6314	6319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
67	NC_009957	ATG	2	6	6338	6343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
68	NC_009957	ATG	2	6	6353	6358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
69	NC_009957	ATG	2	6	6380	6385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
70	NC_009957	ATG	2	6	6407	6412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
71	NC_009957	ACG	2	6	6443	6448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046477
72	NC_009957	GAA	2	6	6452	6457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046477
73	NC_009957	GAT	2	6	6550	6555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
74	NC_009957	ATG	2	6	6563	6568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
75	NC_009957	GAT	2	6	6661	6666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
76	NC_009957	ATG	2	6	6731	6736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
77	NC_009957	CGA	2	6	7007	7012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046478
78	NC_009957	GCC	2	6	7038	7043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046478
79	NC_009957	TGC	2	6	7382	7387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046479
80	NC_009957	CCG	2	6	7558	7563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046479
81	NC_009957	TCT	2	6	7587	7592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046479
82	NC_009957	ATC	3	9	7600	7608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046479
83	NC_009957	TGG	2	6	7620	7625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046479
84	NC_009957	GGC	2	6	7702	7707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046479
85	NC_009957	ACC	2	6	7815	7820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046479
86	NC_009957	CAA	2	6	7854	7859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046479
87	NC_009957	TCG	2	6	8102	8107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046479
88	NC_009957	CAA	2	6	8128	8133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046479
89	NC_009957	CGG	2	6	8141	8146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046479
90	NC_009957	CGG	2	6	8254	8259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046479
91	NC_009957	CAG	2	6	8408	8413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046480
92	NC_009957	CTT	2	6	8414	8419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046480
93	NC_009957	ATC	2	6	8534	8539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046480
94	NC_009957	ATG	2	6	8600	8605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046480
95	NC_009957	TGG	2	6	8732	8737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046480
96	NC_009957	CGG	2	6	8746	8751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046480
97	NC_009957	TCG	2	6	8807	8812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046480
98	NC_009957	CAC	2	6	8847	8852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046480
99	NC_009957	GCC	2	6	8983	8988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046480
100	NC_009957	CGT	2	6	9000	9005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046480
101	NC_009957	GGC	3	9	9078	9086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046480
102	NC_009957	TGC	2	6	9104	9109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046480
103	NC_009957	GGC	2	6	9177	9182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046480
104	NC_009957	GAC	2	6	9205	9210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046480
105	NC_009957	GAG	2	6	9217	9222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046480
106	NC_009957	GGA	2	6	9234	9239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046480
107	NC_009957	CGA	2	6	9324	9329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046480
108	NC_009957	CGA	2	6	9392	9397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046480
109	NC_009957	CGG	2	6	9629	9634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046480
110	NC_009957	ATC	2	6	9646	9651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046480
111	NC_009957	TCG	2	6	9782	9787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046480
112	NC_009957	ACG	2	6	9851	9856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046480
113	NC_009957	CGC	2	6	9876	9881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046480
114	NC_009957	GGA	2	6	9936	9941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046480
115	NC_009957	GAT	2	6	10044	10049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046480
116	NC_009957	CGC	2	6	10099	10104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046480
117	NC_009957	TCA	2	6	10232	10237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046480
118	NC_009957	TGC	2	6	10313	10318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046480
119	NC_009957	GGA	2	6	10320	10325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046480
120	NC_009957	ATC	2	6	10336	10341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046480
121	NC_009957	ACG	2	6	10394	10399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046480
122	NC_009957	CGG	2	6	10516	10521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046480
123	NC_009957	TTC	2	6	10561	10566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046480
124	NC_009957	CGG	2	6	10601	10606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046480
125	NC_009957	CTT	2	6	10620	10625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046480
126	NC_009957	TCA	2	6	10634	10639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046480
127	NC_009957	TGC	2	6	10650	10655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046480
128	NC_009957	CGT	2	6	10670	10675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046480
129	NC_009957	GGT	2	6	10683	10688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046480
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497	NC_009957	CGG	2	6	37561	37566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046517
498	NC_009957	AGC	2	6	37602	37607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046517
499	NC_009957	TCA	2	6	37608	37613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046517
500	NC_009957	TGG	2	6	37840	37845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046517

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