MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI03

Total Repeats: 299

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009957	CG	3	6	24	29	0 %	0 %	50 %	50 %	159046470
2	NC_009957	CT	4	8	132	139	0 %	50 %	0 %	50 %	159046470
3	NC_009957	GC	3	6	294	299	0 %	0 %	50 %	50 %	159046470
4	NC_009957	CG	3	6	1268	1273	0 %	0 %	50 %	50 %	159046471
5	NC_009957	GC	3	6	1333	1338	0 %	0 %	50 %	50 %	159046471
6	NC_009957	GC	3	6	2072	2077	0 %	0 %	50 %	50 %	159046472
7	NC_009957	CG	3	6	2192	2197	0 %	0 %	50 %	50 %	159046472
8	NC_009957	GC	3	6	2292	2297	0 %	0 %	50 %	50 %	159046472
9	NC_009957	AC	3	6	2551	2556	50 %	0 %	0 %	50 %	159046473
10	NC_009957	CG	3	6	3534	3539	0 %	0 %	50 %	50 %	159046473
11	NC_009957	TC	3	6	3906	3911	0 %	50 %	0 %	50 %	159046474
12	NC_009957	CG	3	6	4685	4690	0 %	0 %	50 %	50 %	159046475
13	NC_009957	TC	3	6	8314	8319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009957	CG	3	6	9160	9165	0 %	0 %	50 %	50 %	159046480
15	NC_009957	CG	3	6	9189	9194	0 %	0 %	50 %	50 %	159046480
16	NC_009957	CG	3	6	9494	9499	0 %	0 %	50 %	50 %	159046480
17	NC_009957	GC	3	6	10728	10733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009957	CG	3	6	11100	11105	0 %	0 %	50 %	50 %	159046481
19	NC_009957	GC	4	8	12983	12990	0 %	0 %	50 %	50 %	159046483
20	NC_009957	CG	4	8	13122	13129	0 %	0 %	50 %	50 %	159046483
21	NC_009957	CG	3	6	13291	13296	0 %	0 %	50 %	50 %	159046483
22	NC_009957	GC	3	6	13647	13652	0 %	0 %	50 %	50 %	159046483
23	NC_009957	GC	3	6	14139	14144	0 %	0 %	50 %	50 %	159046484
24	NC_009957	CG	4	8	14198	14205	0 %	0 %	50 %	50 %	159046484
25	NC_009957	CA	3	6	14473	14478	50 %	0 %	0 %	50 %	159046484
26	NC_009957	GC	3	6	15999	16004	0 %	0 %	50 %	50 %	159046486
27	NC_009957	CG	3	6	16145	16150	0 %	0 %	50 %	50 %	159046486
28	NC_009957	CG	3	6	16177	16182	0 %	0 %	50 %	50 %	159046486
29	NC_009957	AC	3	6	16188	16193	50 %	0 %	0 %	50 %	159046486
30	NC_009957	GC	3	6	16308	16313	0 %	0 %	50 %	50 %	159046486
31	NC_009957	CG	3	6	16575	16580	0 %	0 %	50 %	50 %	159046486
32	NC_009957	GC	3	6	16663	16668	0 %	0 %	50 %	50 %	159046486
33	NC_009957	CG	5	10	16912	16921	0 %	0 %	50 %	50 %	159046486
34	NC_009957	GC	3	6	16951	16956	0 %	0 %	50 %	50 %	159046486
35	NC_009957	CG	3	6	17946	17951	0 %	0 %	50 %	50 %	159046488
36	NC_009957	CG	3	6	18062	18067	0 %	0 %	50 %	50 %	159046488
37	NC_009957	CG	3	6	18273	18278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009957	CG	3	6	18651	18656	0 %	0 %	50 %	50 %	159046490
39	NC_009957	CG	3	6	18702	18707	0 %	0 %	50 %	50 %	159046490
40	NC_009957	CG	3	6	18785	18790	0 %	0 %	50 %	50 %	159046490
41	NC_009957	CG	3	6	18795	18800	0 %	0 %	50 %	50 %	159046490
42	NC_009957	GC	3	6	18943	18948	0 %	0 %	50 %	50 %	159046490
43	NC_009957	CG	4	8	19209	19216	0 %	0 %	50 %	50 %	159046490
44	NC_009957	GC	3	6	19477	19482	0 %	0 %	50 %	50 %	159046490
45	NC_009957	AC	3	6	19507	19512	50 %	0 %	0 %	50 %	159046490
46	NC_009957	GC	3	6	19905	19910	0 %	0 %	50 %	50 %	159046490
47	NC_009957	GC	3	6	20373	20378	0 %	0 %	50 %	50 %	159046491
48	NC_009957	CG	3	6	21226	21231	0 %	0 %	50 %	50 %	159046492
49	NC_009957	AG	4	8	21963	21970	50 %	0 %	50 %	0 %	159046494
50	NC_009957	TG	3	6	22081	22086	0 %	50 %	50 %	0 %	159046494
51	NC_009957	CG	3	6	22226	22231	0 %	0 %	50 %	50 %	159046494
52	NC_009957	TG	3	6	22251	22256	0 %	50 %	50 %	0 %	159046494
53	NC_009957	GC	3	6	23229	23234	0 %	0 %	50 %	50 %	159046495
54	NC_009957	CG	3	6	23840	23845	0 %	0 %	50 %	50 %	159046496
55	NC_009957	GC	3	6	24629	24634	0 %	0 %	50 %	50 %	159046497
56	NC_009957	GA	3	6	24995	25000	50 %	0 %	50 %	0 %	159046498
57	NC_009957	TC	3	6	25374	25379	0 %	50 %	0 %	50 %	159046498
58	NC_009957	TG	3	6	26034	26039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009957	GC	3	6	26801	26806	0 %	0 %	50 %	50 %	159046501
60	NC_009957	GA	3	6	27243	27248	50 %	0 %	50 %	0 %	159046501
61	NC_009957	AG	3	6	27689	27694	50 %	0 %	50 %	0 %	159046502
62	NC_009957	CG	3	6	28126	28131	0 %	0 %	50 %	50 %	159046503
63	NC_009957	CT	3	6	28506	28511	0 %	50 %	0 %	50 %	159046503
64	NC_009957	TC	3	6	29658	29663	0 %	50 %	0 %	50 %	159046505
65	NC_009957	CG	3	6	29971	29976	0 %	0 %	50 %	50 %	159046505
66	NC_009957	GC	3	6	30983	30988	0 %	0 %	50 %	50 %	159046507
67	NC_009957	GC	3	6	31180	31185	0 %	0 %	50 %	50 %	159046507
68	NC_009957	TC	3	6	31561	31566	0 %	50 %	0 %	50 %	159046507
69	NC_009957	CG	3	6	31776	31781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009957	GC	4	8	32738	32745	0 %	0 %	50 %	50 %	159046510
71	NC_009957	AT	3	6	33043	33048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009957	CA	3	6	33238	33243	50 %	0 %	0 %	50 %	159046511
73	NC_009957	CT	3	6	33561	33566	0 %	50 %	0 %	50 %	159046512
74	NC_009957	GC	3	6	33916	33921	0 %	0 %	50 %	50 %	159046512
75	NC_009957	GC	4	8	34440	34447	0 %	0 %	50 %	50 %	159046514
76	NC_009957	CT	3	6	34448	34453	0 %	50 %	0 %	50 %	159046514
77	NC_009957	GC	3	6	34751	34756	0 %	0 %	50 %	50 %	159046515
78	NC_009957	GC	3	6	35139	35144	0 %	0 %	50 %	50 %	159046515
79	NC_009957	CG	3	6	36149	36154	0 %	0 %	50 %	50 %	159046515
80	NC_009957	TC	3	6	36571	36576	0 %	50 %	0 %	50 %	159046515
81	NC_009957	CG	3	6	36703	36708	0 %	0 %	50 %	50 %	159046515
82	NC_009957	CG	3	6	36824	36829	0 %	0 %	50 %	50 %	159046515
83	NC_009957	GC	3	6	37094	37099	0 %	0 %	50 %	50 %	159046516
84	NC_009957	GC	3	6	37199	37204	0 %	0 %	50 %	50 %	159046516
85	NC_009957	CG	3	6	37309	37314	0 %	0 %	50 %	50 %	159046517
86	NC_009957	GA	3	6	37338	37343	50 %	0 %	50 %	0 %	159046517
87	NC_009957	CG	3	6	37846	37851	0 %	0 %	50 %	50 %	159046517
88	NC_009957	GC	3	6	38273	38278	0 %	0 %	50 %	50 %	159046517
89	NC_009957	GA	3	6	38373	38378	50 %	0 %	50 %	0 %	159046518
90	NC_009957	CG	3	6	39020	39025	0 %	0 %	50 %	50 %	159046518
91	NC_009957	CG	3	6	39923	39928	0 %	0 %	50 %	50 %	159046520
92	NC_009957	GC	3	6	40126	40131	0 %	0 %	50 %	50 %	159046520
93	NC_009957	GC	3	6	40246	40251	0 %	0 %	50 %	50 %	159046520
94	NC_009957	CG	3	6	40608	40613	0 %	0 %	50 %	50 %	159046521
95	NC_009957	GC	3	6	41132	41137	0 %	0 %	50 %	50 %	159046521
96	NC_009957	GC	4	8	41878	41885	0 %	0 %	50 %	50 %	159046521
97	NC_009957	GC	4	8	42054	42061	0 %	0 %	50 %	50 %	159046522
98	NC_009957	GC	3	6	42336	42341	0 %	0 %	50 %	50 %	159046522
99	NC_009957	GC	3	6	42345	42350	0 %	0 %	50 %	50 %	159046522
100	NC_009957	GC	3	6	42454	42459	0 %	0 %	50 %	50 %	159046522
101	NC_009957	CT	3	6	42466	42471	0 %	50 %	0 %	50 %	159046522
102	NC_009957	AC	3	6	43055	43060	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009957	CA	3	6	43700	43705	50 %	0 %	0 %	50 %	159046524
104	NC_009957	GC	3	6	44238	44243	0 %	0 %	50 %	50 %	159046524
105	NC_009957	CG	3	6	44309	44314	0 %	0 %	50 %	50 %	159046524
106	NC_009957	GC	3	6	45143	45148	0 %	0 %	50 %	50 %	159046525
107	NC_009957	CT	3	6	45317	45322	0 %	50 %	0 %	50 %	159046525
108	NC_009957	TC	3	6	46553	46558	0 %	50 %	0 %	50 %	159046525
109	NC_009957	CG	3	6	46610	46615	0 %	0 %	50 %	50 %	159046525
110	NC_009957	GA	4	8	46873	46880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009957	GC	3	6	46884	46889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009957	GT	3	6	47588	47593	0 %	50 %	50 %	0 %	159046526
113	NC_009957	CA	3	6	48196	48201	50 %	0 %	0 %	50 %	159046526
114	NC_009957	TA	3	6	48527	48532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009957	GC	3	6	48901	48906	0 %	0 %	50 %	50 %	159046527
116	NC_009957	GC	3	6	49083	49088	0 %	0 %	50 %	50 %	159046527
117	NC_009957	AG	3	6	49105	49110	50 %	0 %	50 %	0 %	159046527
118	NC_009957	GA	3	6	49480	49485	50 %	0 %	50 %	0 %	159046527
119	NC_009957	CG	3	6	49748	49753	0 %	0 %	50 %	50 %	159046527
120	NC_009957	GC	3	6	49947	49952	0 %	0 %	50 %	50 %	159046527
121	NC_009957	GC	3	6	50270	50275	0 %	0 %	50 %	50 %	159046527
122	NC_009957	CG	3	6	50645	50650	0 %	0 %	50 %	50 %	159046528
123	NC_009957	CG	4	8	50839	50846	0 %	0 %	50 %	50 %	159046528
124	NC_009957	GC	4	8	51143	51150	0 %	0 %	50 %	50 %	159046528
125	NC_009957	CG	3	6	51332	51337	0 %	0 %	50 %	50 %	159046528
126	NC_009957	GC	3	6	51420	51425	0 %	0 %	50 %	50 %	159046528
127	NC_009957	GA	3	6	51645	51650	50 %	0 %	50 %	0 %	159046528
128	NC_009957	CG	3	6	51972	51977	0 %	0 %	50 %	50 %	159046528
129	NC_009957	CG	3	6	52082	52087	0 %	0 %	50 %	50 %	159046528
130	NC_009957	GC	3	6	52224	52229	0 %	0 %	50 %	50 %	159046528
131	NC_009957	CG	3	6	52549	52554	0 %	0 %	50 %	50 %	159046528
132	NC_009957	GC	3	6	52818	52823	0 %	0 %	50 %	50 %	159046528
133	NC_009957	AG	3	6	53170	53175	50 %	0 %	50 %	0 %	159046529
134	NC_009957	AC	3	6	53447	53452	50 %	0 %	0 %	50 %	159046529
135	NC_009957	TA	3	6	53596	53601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009957	GC	4	8	53951	53958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009957	GC	3	6	55614	55619	0 %	0 %	50 %	50 %	159046531
138	NC_009957	GC	5	10	55640	55649	0 %	0 %	50 %	50 %	159046531
139	NC_009957	GC	3	6	55703	55708	0 %	0 %	50 %	50 %	159046531
140	NC_009957	CT	4	8	55965	55972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009957	GC	3	6	56174	56179	0 %	0 %	50 %	50 %	159046532
142	NC_009957	GC	3	6	56576	56581	0 %	0 %	50 %	50 %	159046532
143	NC_009957	GC	3	6	56638	56643	0 %	0 %	50 %	50 %	159046532
144	NC_009957	CG	3	6	57030	57035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.