MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI02

Total Repeats: 348

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009956	GGTG	2	8	571	578	0 %	25 %	75 %	0 %	159046332
2	NC_009956	GCGG	2	8	763	770	0 %	0 %	75 %	25 %	159046332
3	NC_009956	CTGG	2	8	2339	2346	0 %	25 %	50 %	25 %	159046333
4	NC_009956	GCTG	2	8	2383	2390	0 %	25 %	50 %	25 %	159046333
5	NC_009956	GATC	2	8	2671	2678	25 %	25 %	25 %	25 %	159046333
6	NC_009956	CGGT	2	8	2925	2932	0 %	25 %	50 %	25 %	159046334
7	NC_009956	CGTC	2	8	3286	3293	0 %	25 %	25 %	50 %	159046334
8	NC_009956	TCCT	2	8	3564	3571	0 %	50 %	0 %	50 %	159046334
9	NC_009956	GCCC	2	8	3586	3593	0 %	0 %	25 %	75 %	159046334
10	NC_009956	TGGC	2	8	3651	3658	0 %	25 %	50 %	25 %	159046334
11	NC_009956	CAAG	2	8	3751	3758	50 %	0 %	25 %	25 %	159046335
12	NC_009956	CGGG	2	8	4218	4225	0 %	0 %	75 %	25 %	159046335
13	NC_009956	CGAT	2	8	4587	4594	25 %	25 %	25 %	25 %	159046335
14	NC_009956	CGGG	2	8	4977	4984	0 %	0 %	75 %	25 %	159046336
15	NC_009956	CCGA	2	8	5820	5827	25 %	0 %	25 %	50 %	159046337
16	NC_009956	GCCT	2	8	5895	5902	0 %	25 %	25 %	50 %	159046337
17	NC_009956	CGCC	2	8	6787	6794	0 %	0 %	25 %	75 %	159046338
18	NC_009956	CACC	2	8	7200	7207	25 %	0 %	0 %	75 %	159046339
19	NC_009956	CGCC	2	8	7423	7430	0 %	0 %	25 %	75 %	159046339
20	NC_009956	CGGT	2	8	8635	8642	0 %	25 %	50 %	25 %	159046341
21	NC_009956	GCCC	2	8	9737	9744	0 %	0 %	25 %	75 %	159046341
22	NC_009956	TCAT	2	8	9769	9776	25 %	50 %	0 %	25 %	159046341
23	NC_009956	CGGC	2	8	10283	10290	0 %	0 %	50 %	50 %	159046341
24	NC_009956	AGGC	2	8	10590	10597	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009956	GCTC	2	8	11316	11323	0 %	25 %	25 %	50 %	159046342
26	NC_009956	CCGC	2	8	11397	11404	0 %	0 %	25 %	75 %	159046342
27	NC_009956	GTCG	2	8	11413	11420	0 %	25 %	50 %	25 %	159046342
28	NC_009956	CGGG	2	8	11741	11748	0 %	0 %	75 %	25 %	159046343
29	NC_009956	TGCC	2	8	11775	11782	0 %	25 %	25 %	50 %	159046343
30	NC_009956	GCGG	2	8	12139	12146	0 %	0 %	75 %	25 %	159046344
31	NC_009956	GGCT	2	8	12192	12199	0 %	25 %	50 %	25 %	159046344
32	NC_009956	CGGG	2	8	12266	12273	0 %	0 %	75 %	25 %	159046344
33	NC_009956	GGGC	2	8	12500	12507	0 %	0 %	75 %	25 %	159046344
34	NC_009956	GGCT	2	8	13113	13120	0 %	25 %	50 %	25 %	159046345
35	NC_009956	TACC	2	8	13262	13269	25 %	25 %	0 %	50 %	159046345
36	NC_009956	TCCT	2	8	13359	13366	0 %	50 %	0 %	50 %	159046345
37	NC_009956	GGCG	2	8	13517	13524	0 %	0 %	75 %	25 %	159046345
38	NC_009956	GGCG	2	8	13685	13692	0 %	0 %	75 %	25 %	159046345
39	NC_009956	GCAG	2	8	13886	13893	25 %	0 %	50 %	25 %	159046345
40	NC_009956	GGCT	2	8	14136	14143	0 %	25 %	50 %	25 %	159046345
41	NC_009956	CGCC	2	8	14431	14438	0 %	0 %	25 %	75 %	159046345
42	NC_009956	GCTG	2	8	14740	14747	0 %	25 %	50 %	25 %	159046345
43	NC_009956	GTCG	2	8	14768	14775	0 %	25 %	50 %	25 %	159046345
44	NC_009956	GTCG	2	8	14888	14895	0 %	25 %	50 %	25 %	159046345
45	NC_009956	GGCC	2	8	15543	15550	0 %	0 %	50 %	50 %	159046345
46	NC_009956	GCGG	2	8	15965	15972	0 %	0 %	75 %	25 %	159046346
47	NC_009956	GACC	2	8	16128	16135	25 %	0 %	25 %	50 %	159046346
48	NC_009956	GCCA	2	8	16172	16179	25 %	0 %	25 %	50 %	159046346
49	NC_009956	GCCC	2	8	16892	16899	0 %	0 %	25 %	75 %	159046347
50	NC_009956	CCTG	2	8	17206	17213	0 %	25 %	25 %	50 %	159046347
51	NC_009956	GCTC	2	8	17434	17441	0 %	25 %	25 %	50 %	159046347
52	NC_009956	CGGG	2	8	17463	17470	0 %	0 %	75 %	25 %	159046347
53	NC_009956	CGGG	2	8	17652	17659	0 %	0 %	75 %	25 %	159046347
54	NC_009956	CTGG	2	8	17757	17764	0 %	25 %	50 %	25 %	159046348
55	NC_009956	CGCC	2	8	19052	19059	0 %	0 %	25 %	75 %	159046351
56	NC_009956	TCGG	2	8	19223	19230	0 %	25 %	50 %	25 %	159046351
57	NC_009956	GGGC	2	8	20463	20470	0 %	0 %	75 %	25 %	159046352
58	NC_009956	GGAT	2	8	21187	21194	25 %	25 %	50 %	0 %	159046352
59	NC_009956	GTCC	2	8	21983	21990	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009956	CAGA	2	8	22079	22086	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009956	CCGC	2	8	22398	22405	0 %	0 %	25 %	75 %	159046354
62	NC_009956	TGCC	2	8	22937	22944	0 %	25 %	25 %	50 %	159046354
63	NC_009956	GGCC	2	8	23424	23431	0 %	0 %	50 %	50 %	159046355
64	NC_009956	CCGA	2	8	23752	23759	25 %	0 %	25 %	50 %	159046355
65	NC_009956	GTCA	2	8	24235	24242	25 %	25 %	25 %	25 %	159046355
66	NC_009956	CCCG	2	8	25689	25696	0 %	0 %	25 %	75 %	159046357
67	NC_009956	CGGG	2	8	26142	26149	0 %	0 %	75 %	25 %	159046357
68	NC_009956	GGCT	2	8	26641	26648	0 %	25 %	50 %	25 %	159046358
69	NC_009956	CGCC	2	8	26795	26802	0 %	0 %	25 %	75 %	159046358
70	NC_009956	CGCC	2	8	27241	27248	0 %	0 %	25 %	75 %	159046359
71	NC_009956	GCGG	2	8	28132	28139	0 %	0 %	75 %	25 %	159046360
72	NC_009956	GCCC	2	8	28552	28559	0 %	0 %	25 %	75 %	159046361
73	NC_009956	GTCA	2	8	28802	28809	25 %	25 %	25 %	25 %	159046362
74	NC_009956	CCGG	2	8	29341	29348	0 %	0 %	50 %	50 %	159046362
75	NC_009956	CGCA	2	8	29989	29996	25 %	0 %	25 %	50 %	159046363
76	NC_009956	ATCC	2	8	30148	30155	25 %	25 %	0 %	50 %	159046363
77	NC_009956	GATA	2	8	30309	30316	50 %	25 %	25 %	0 %	159046363
78	NC_009956	CATT	2	8	31006	31013	25 %	50 %	0 %	25 %	159046364
79	NC_009956	CGCC	2	8	31370	31377	0 %	0 %	25 %	75 %	159046364
80	NC_009956	CGAC	2	8	32124	32131	25 %	0 %	25 %	50 %	159046365
81	NC_009956	ACCG	2	8	32376	32383	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009956	GCGG	2	8	32826	32833	0 %	0 %	75 %	25 %	159046366
83	NC_009956	GGAA	2	8	33151	33158	50 %	0 %	50 %	0 %	159046366
84	NC_009956	CAAC	2	8	33613	33620	50 %	0 %	0 %	50 %	159046366
85	NC_009956	GGCG	2	8	34364	34371	0 %	0 %	75 %	25 %	159046366
86	NC_009956	CGGC	2	8	34521	34528	0 %	0 %	50 %	50 %	159046367
87	NC_009956	CGGG	2	8	34595	34602	0 %	0 %	75 %	25 %	159046367
88	NC_009956	CGGG	2	8	36250	36257	0 %	0 %	75 %	25 %	159046367
89	NC_009956	ACCA	2	8	36464	36471	50 %	0 %	0 %	50 %	159046367
90	NC_009956	GCCC	2	8	36574	36581	0 %	0 %	25 %	75 %	159046368
91	NC_009956	TCCT	2	8	36633	36640	0 %	50 %	0 %	50 %	159046368
92	NC_009956	ACCG	2	8	36822	36829	25 %	0 %	25 %	50 %	159046368
93	NC_009956	CTGG	2	8	36896	36903	0 %	25 %	50 %	25 %	159046368
94	NC_009956	GGCG	2	8	36944	36951	0 %	0 %	75 %	25 %	159046368
95	NC_009956	CGGC	2	8	36987	36994	0 %	0 %	50 %	50 %	159046368
96	NC_009956	TGGC	2	8	37193	37200	0 %	25 %	50 %	25 %	159046368
97	NC_009956	CGAA	2	8	37468	37475	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009956	GTGA	2	8	37675	37682	25 %	25 %	50 %	0 %	159046369
99	NC_009956	GTCC	2	8	37758	37765	0 %	25 %	25 %	50 %	159046369
100	NC_009956	CGCC	2	8	38288	38295	0 %	0 %	25 %	75 %	159046370
101	NC_009956	GCCC	2	8	39288	39295	0 %	0 %	25 %	75 %	159046370
102	NC_009956	GACC	2	8	39652	39659	25 %	0 %	25 %	50 %	159046371
103	NC_009956	GCCT	2	8	40017	40024	0 %	25 %	25 %	50 %	159046371
104	NC_009956	GCCC	2	8	40048	40055	0 %	0 %	25 %	75 %	159046371
105	NC_009956	CACC	2	8	40132	40139	25 %	0 %	0 %	75 %	159046371
106	NC_009956	GCTC	2	8	41261	41268	0 %	25 %	25 %	50 %	159046372
107	NC_009956	GGCC	2	8	43122	43129	0 %	0 %	50 %	50 %	159046373
108	NC_009956	GGCC	2	8	43424	43431	0 %	0 %	50 %	50 %	159046374
109	NC_009956	CCGC	2	8	43536	43543	0 %	0 %	25 %	75 %	159046374
110	NC_009956	ACTG	2	8	44423	44430	25 %	25 %	25 %	25 %	159046374
111	NC_009956	GTTC	2	8	44448	44455	0 %	50 %	25 %	25 %	159046374
112	NC_009956	CGGG	2	8	44627	44634	0 %	0 %	75 %	25 %	159046374
113	NC_009956	CCGC	2	8	45060	45067	0 %	0 %	25 %	75 %	159046375
114	NC_009956	CTTC	2	8	45522	45529	0 %	50 %	0 %	50 %	159046376
115	NC_009956	CGGT	2	8	46181	46188	0 %	25 %	50 %	25 %	159046377
116	NC_009956	CTCC	2	8	46873	46880	0 %	25 %	0 %	75 %	159046378
117	NC_009956	TCGG	2	8	47398	47405	0 %	25 %	50 %	25 %	159046378
118	NC_009956	CGCC	2	8	47690	47697	0 %	0 %	25 %	75 %	159046378
119	NC_009956	CCGC	2	8	47912	47919	0 %	0 %	25 %	75 %	159046378
120	NC_009956	CAGG	2	8	48190	48197	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009956	TGTC	2	8	48713	48720	0 %	50 %	25 %	25 %	159046379
122	NC_009956	GGCA	2	8	49930	49937	25 %	0 %	50 %	25 %	159046380
123	NC_009956	CGCC	2	8	50357	50364	0 %	0 %	25 %	75 %	159046380
124	NC_009956	CCGC	2	8	50631	50638	0 %	0 %	25 %	75 %	159046381
125	NC_009956	AGCC	2	8	51219	51226	25 %	0 %	25 %	50 %	159046381
126	NC_009956	GCAC	2	8	52020	52027	25 %	0 %	25 %	50 %	159046382
127	NC_009956	CCTG	2	8	52779	52786	0 %	25 %	25 %	50 %	159046384
128	NC_009956	CGGA	2	8	52818	52825	25 %	0 %	50 %	25 %	159046384
129	NC_009956	ACCC	2	8	52973	52980	25 %	0 %	0 %	75 %	159046384
130	NC_009956	GCCC	3	12	53605	53616	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_009956	CCGC	2	8	54186	54193	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_009956	GAGG	2	8	55829	55836	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009956	GTGG	2	8	56628	56635	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009956	TCCA	2	8	57143	57150	25 %	25 %	0 %	50 %	159046390
135	NC_009956	GCCT	2	8	59079	59086	0 %	25 %	25 %	50 %	159046391
136	NC_009956	CCGC	2	8	59845	59852	0 %	0 %	25 %	75 %	159046392
137	NC_009956	TGCC	2	8	59946	59953	0 %	25 %	25 %	50 %	159046392
138	NC_009956	GCTG	2	8	60087	60094	0 %	25 %	50 %	25 %	159046392
139	NC_009956	CCGG	2	8	60201	60208	0 %	0 %	50 %	50 %	159046392
140	NC_009956	CCGG	2	8	60544	60551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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142	NC_009956	CAGG	2	8	61957	61964	25 %	0 %	50 %	25 %	159046393
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340	NC_009956	CTAG	2	8	145701	145708	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.