MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI02

Total Repeats: 2198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009956	GCC	2	6	209	214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046332
2	NC_009956	CGG	3	9	267	275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046332
3	NC_009956	ACG	2	6	345	350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046332
4	NC_009956	GTC	2	6	370	375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046332
5	NC_009956	GGT	2	6	391	396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046332
6	NC_009956	GGT	2	6	511	516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046332
7	NC_009956	CGA	3	9	538	546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046332
8	NC_009956	CGA	2	6	622	627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046332
9	NC_009956	CGC	2	6	790	795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046332
10	NC_009956	GGT	2	6	910	915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046332
11	NC_009956	CGG	2	6	948	953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046332
12	NC_009956	GGA	2	6	1084	1089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046332
13	NC_009956	GAG	2	6	1145	1150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046332
14	NC_009956	GTG	2	6	1213	1218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046332
15	NC_009956	GCG	2	6	1256	1261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046332
16	NC_009956	CAG	2	6	1376	1381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046332
17	NC_009956	CAA	2	6	1441	1446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046332
18	NC_009956	CGA	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046332
19	NC_009956	CCG	2	6	1562	1567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046332
20	NC_009956	AAC	2	6	1574	1579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046332
21	NC_009956	CTT	2	6	1585	1590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046332
22	NC_009956	CCT	2	6	1632	1637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046332
23	NC_009956	CGA	2	6	1639	1644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046332
24	NC_009956	GCG	2	6	1658	1663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046332
25	NC_009956	GGT	2	6	1684	1689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046332
26	NC_009956	ACG	2	6	1719	1724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046332
27	NC_009956	CGA	3	9	1807	1815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046332
28	NC_009956	GCC	2	6	2021	2026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046333
29	NC_009956	GCA	3	9	2045	2053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046333
30	NC_009956	GGC	2	6	2155	2160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046333
31	NC_009956	CGA	2	6	2218	2223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046333
32	NC_009956	CGG	2	6	2240	2245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046333
33	NC_009956	TCA	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046333
34	NC_009956	TCT	2	6	2365	2370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046333
35	NC_009956	CCG	2	6	2467	2472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046333
36	NC_009956	CGC	2	6	2615	2620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046333
37	NC_009956	CTG	2	6	2661	2666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046333
38	NC_009956	CTG	2	6	2718	2723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046333
39	NC_009956	GTT	2	6	2753	2758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046333
40	NC_009956	TTC	2	6	2787	2792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046333
41	NC_009956	CTG	2	6	2805	2810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046333
42	NC_009956	TCG	2	6	2977	2982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046334
43	NC_009956	CGC	2	6	3025	3030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046334
44	NC_009956	ATG	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046334
45	NC_009956	TTC	2	6	3189	3194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046334
46	NC_009956	CGG	2	6	3217	3222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046334
47	NC_009956	CCA	2	6	3250	3255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046334
48	NC_009956	CTG	2	6	3294	3299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046334
49	NC_009956	GGT	2	6	3359	3364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046334
50	NC_009956	CCG	2	6	3372	3377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046334
51	NC_009956	ACC	2	6	3402	3407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046334
52	NC_009956	GCC	2	6	3435	3440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046334
53	NC_009956	CCA	2	6	3476	3481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046334
54	NC_009956	CCA	2	6	3520	3525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046334
55	NC_009956	GAT	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046334
56	NC_009956	GGC	2	6	3551	3556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046334
57	NC_009956	TGA	2	6	3673	3678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046334
58	NC_009956	GGC	2	6	3812	3817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046335
59	NC_009956	GAA	2	6	3823	3828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046335
60	NC_009956	GTG	2	6	3836	3841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046335
61	NC_009956	CCA	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046335
62	NC_009956	CGC	2	6	4022	4027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046335
63	NC_009956	CTG	2	6	4157	4162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046335
64	NC_009956	CTG	2	6	4337	4342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046335
65	NC_009956	GTG	2	6	4400	4405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046335
66	NC_009956	CCG	2	6	4467	4472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046335
67	NC_009956	CTG	2	6	4511	4516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046335
68	NC_009956	GCG	2	6	4517	4522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046335
69	NC_009956	TCC	2	6	4576	4581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046335
70	NC_009956	CGC	2	6	4790	4795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046336
71	NC_009956	CGG	2	6	4932	4937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046336
72	NC_009956	GAT	2	6	5016	5021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046336
73	NC_009956	CAG	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046336
74	NC_009956	GGT	2	6	5085	5090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046336
75	NC_009956	GCG	2	6	5172	5177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046336
76	NC_009956	GGC	2	6	5206	5211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046336
77	NC_009956	GAT	2	6	5226	5231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046336
78	NC_009956	GCT	3	9	5259	5267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046336
79	NC_009956	ACC	2	6	5281	5286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046336
80	NC_009956	TGC	2	6	5315	5320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046336
81	NC_009956	CTG	2	6	5323	5328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046336
82	NC_009956	ATC	2	6	5461	5466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046336
83	NC_009956	GCG	2	6	5503	5508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046336
84	NC_009956	TGG	2	6	5513	5518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046336
85	NC_009956	CGC	2	6	5534	5539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046336
86	NC_009956	CCG	2	6	5578	5583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046336
87	NC_009956	CGC	2	6	5688	5693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046336
88	NC_009956	GGA	2	6	5697	5702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046336
89	NC_009956	CGG	2	6	5726	5731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046336
90	NC_009956	CGA	2	6	5786	5791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046337
91	NC_009956	CCG	2	6	5800	5805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046337
92	NC_009956	CCG	2	6	5812	5817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046337
93	NC_009956	GGA	2	6	5882	5887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046337
94	NC_009956	GTG	2	6	5958	5963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046337
95	NC_009956	CGA	2	6	5972	5977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046337
96	NC_009956	CGT	2	6	6158	6163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046337
97	NC_009956	CGC	2	6	6191	6196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046337
98	NC_009956	GCT	2	6	6230	6235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046337
99	NC_009956	GGC	2	6	6251	6256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046337
100	NC_009956	ATC	2	6	6324	6329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046337
101	NC_009956	GGC	2	6	6341	6346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046337
102	NC_009956	CGG	2	6	6364	6369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046337
103	NC_009956	CGA	2	6	6394	6399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046337
104	NC_009956	GGC	2	6	6470	6475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046338
105	NC_009956	GCC	2	6	6737	6742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046338
106	NC_009956	CGC	2	6	6826	6831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046338
107	NC_009956	TCG	2	6	6885	6890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046338
108	NC_009956	CAG	2	6	6932	6937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046338
109	NC_009956	GGC	2	6	6938	6943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046338
110	NC_009956	TGC	2	6	7085	7090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046339
111	NC_009956	CCG	2	6	7103	7108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046339
112	NC_009956	GGC	2	6	7177	7182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046339
113	NC_009956	GGC	2	6	7230	7235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046339
114	NC_009956	GGT	2	6	7296	7301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046339
115	NC_009956	CGG	2	6	7385	7390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046339
116	NC_009956	TGA	2	6	7403	7408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046339
117	NC_009956	GTG	2	6	7417	7422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046339
118	NC_009956	GGC	2	6	7440	7445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046339
119	NC_009956	TGG	3	9	7842	7850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046340
120	NC_009956	GCC	2	6	7898	7903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046340
121	NC_009956	GCT	2	6	7915	7920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046340
122	NC_009956	GGC	2	6	7936	7941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046340
123	NC_009956	TGG	2	6	7971	7976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046340
124	NC_009956	GCG	2	6	7988	7993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046340
125	NC_009956	GCG	2	6	8012	8017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046340
126	NC_009956	GCT	2	6	8029	8034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046340
127	NC_009956	TGG	2	6	8163	8168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046340
128	NC_009956	TGC	2	6	8169	8174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046340
129	NC_009956	GGC	2	6	8221	8226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046340
130	NC_009956	CAG	2	6	8364	8369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046341
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255	NC_009956	GGC	2	6	16495	16500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046347
256	NC_009956	GCG	2	6	16540	16545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046347
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259	NC_009956	TGA	2	6	16615	16620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046347
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287	NC_009956	GGC	2	6	17870	17875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046348
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289	NC_009956	ATC	2	6	17947	17952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046348
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