MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI02

Total Repeats: 399

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009956	GA	4	8	158	165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009956	GC	3	6	887	892	0 %	0 %	50 %	50 %	159046332
3	NC_009956	CG	3	6	940	945	0 %	0 %	50 %	50 %	159046332
4	NC_009956	TG	4	8	1131	1138	0 %	50 %	50 %	0 %	159046332
5	NC_009956	CG	4	8	1260	1267	0 %	0 %	50 %	50 %	159046332
6	NC_009956	GC	3	6	1473	1478	0 %	0 %	50 %	50 %	159046332
7	NC_009956	CG	3	6	1731	1736	0 %	0 %	50 %	50 %	159046332
8	NC_009956	CG	3	6	2410	2415	0 %	0 %	50 %	50 %	159046333
9	NC_009956	GC	3	6	2827	2832	0 %	0 %	50 %	50 %	159046333
10	NC_009956	GC	3	6	3142	3147	0 %	0 %	50 %	50 %	159046334
11	NC_009956	GC	3	6	3316	3321	0 %	0 %	50 %	50 %	159046334
12	NC_009956	CG	3	6	3842	3847	0 %	0 %	50 %	50 %	159046335
13	NC_009956	CG	4	8	4147	4154	0 %	0 %	50 %	50 %	159046335
14	NC_009956	CG	3	6	4246	4251	0 %	0 %	50 %	50 %	159046335
15	NC_009956	GC	5	10	5125	5134	0 %	0 %	50 %	50 %	159046336
16	NC_009956	GC	3	6	5555	5560	0 %	0 %	50 %	50 %	159046336
17	NC_009956	CG	4	8	5614	5621	0 %	0 %	50 %	50 %	159046336
18	NC_009956	GC	3	6	5677	5682	0 %	0 %	50 %	50 %	159046336
19	NC_009956	CG	4	8	5804	5811	0 %	0 %	50 %	50 %	159046337
20	NC_009956	GC	3	6	6000	6005	0 %	0 %	50 %	50 %	159046337
21	NC_009956	GC	3	6	6212	6217	0 %	0 %	50 %	50 %	159046337
22	NC_009956	GC	3	6	6513	6518	0 %	0 %	50 %	50 %	159046338
23	NC_009956	CG	3	6	6625	6630	0 %	0 %	50 %	50 %	159046338
24	NC_009956	CG	4	8	6664	6671	0 %	0 %	50 %	50 %	159046338
25	NC_009956	GC	3	6	7271	7276	0 %	0 %	50 %	50 %	159046339
26	NC_009956	GC	4	8	7739	7746	0 %	0 %	50 %	50 %	159046340
27	NC_009956	GC	4	8	8185	8192	0 %	0 %	50 %	50 %	159046340
28	NC_009956	GC	3	6	8738	8743	0 %	0 %	50 %	50 %	159046341
29	NC_009956	CG	3	6	9112	9117	0 %	0 %	50 %	50 %	159046341
30	NC_009956	GC	4	8	9310	9317	0 %	0 %	50 %	50 %	159046341
31	NC_009956	GC	3	6	9783	9788	0 %	0 %	50 %	50 %	159046341
32	NC_009956	CG	3	6	10715	10720	0 %	0 %	50 %	50 %	159046342
33	NC_009956	GC	5	10	10807	10816	0 %	0 %	50 %	50 %	159046342
34	NC_009956	GC	3	6	10859	10864	0 %	0 %	50 %	50 %	159046342
35	NC_009956	CG	3	6	11028	11033	0 %	0 %	50 %	50 %	159046342
36	NC_009956	GC	3	6	11161	11166	0 %	0 %	50 %	50 %	159046342
37	NC_009956	CG	4	8	11794	11801	0 %	0 %	50 %	50 %	159046343
38	NC_009956	GC	3	6	11937	11942	0 %	0 %	50 %	50 %	159046344
39	NC_009956	GC	4	8	12300	12307	0 %	0 %	50 %	50 %	159046344
40	NC_009956	GC	5	10	12594	12603	0 %	0 %	50 %	50 %	159046344
41	NC_009956	CG	3	6	12676	12681	0 %	0 %	50 %	50 %	159046344
42	NC_009956	GC	3	6	12884	12889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009956	GC	3	6	13408	13413	0 %	0 %	50 %	50 %	159046345
44	NC_009956	GC	3	6	14182	14187	0 %	0 %	50 %	50 %	159046345
45	NC_009956	GC	3	6	14520	14525	0 %	0 %	50 %	50 %	159046345
46	NC_009956	CG	3	6	14581	14586	0 %	0 %	50 %	50 %	159046345
47	NC_009956	CG	3	6	15274	15279	0 %	0 %	50 %	50 %	159046345
48	NC_009956	AT	3	6	15572	15577	50 %	50 %	0 %	0 %	159046345
49	NC_009956	CG	3	6	15692	15697	0 %	0 %	50 %	50 %	159046345
50	NC_009956	GC	3	6	16266	16271	0 %	0 %	50 %	50 %	159046347
51	NC_009956	CG	4	8	16487	16494	0 %	0 %	50 %	50 %	159046347
52	NC_009956	GC	3	6	16646	16651	0 %	0 %	50 %	50 %	159046347
53	NC_009956	GC	3	6	17473	17478	0 %	0 %	50 %	50 %	159046347
54	NC_009956	GC	3	6	17584	17589	0 %	0 %	50 %	50 %	159046347
55	NC_009956	AG	3	6	19076	19081	50 %	0 %	50 %	0 %	159046351
56	NC_009956	CG	3	6	19448	19453	0 %	0 %	50 %	50 %	159046351
57	NC_009956	AG	4	8	19737	19744	50 %	0 %	50 %	0 %	159046351
58	NC_009956	CG	3	6	19870	19875	0 %	0 %	50 %	50 %	159046351
59	NC_009956	CG	3	6	20863	20868	0 %	0 %	50 %	50 %	159046352
60	NC_009956	CG	3	6	20903	20908	0 %	0 %	50 %	50 %	159046352
61	NC_009956	TG	3	6	21073	21078	0 %	50 %	50 %	0 %	159046352
62	NC_009956	CG	3	6	21594	21599	0 %	0 %	50 %	50 %	159046353
63	NC_009956	CG	3	6	21746	21751	0 %	0 %	50 %	50 %	159046353
64	NC_009956	AG	3	6	21849	21854	50 %	0 %	50 %	0 %	159046353
65	NC_009956	CG	3	6	21879	21884	0 %	0 %	50 %	50 %	159046353
66	NC_009956	GC	3	6	22068	22073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009956	GC	3	6	22576	22581	0 %	0 %	50 %	50 %	159046354
68	NC_009956	GC	3	6	22786	22791	0 %	0 %	50 %	50 %	159046354
69	NC_009956	GC	3	6	22850	22855	0 %	0 %	50 %	50 %	159046354
70	NC_009956	GC	3	6	22888	22893	0 %	0 %	50 %	50 %	159046354
71	NC_009956	GC	3	6	23317	23322	0 %	0 %	50 %	50 %	159046355
72	NC_009956	GC	4	8	24050	24057	0 %	0 %	50 %	50 %	159046355
73	NC_009956	GT	3	6	24327	24332	0 %	50 %	50 %	0 %	159046355
74	NC_009956	GC	3	6	24382	24387	0 %	0 %	50 %	50 %	159046355
75	NC_009956	CG	3	6	24570	24575	0 %	0 %	50 %	50 %	159046355
76	NC_009956	GC	3	6	25127	25132	0 %	0 %	50 %	50 %	159046357
77	NC_009956	CG	3	6	25213	25218	0 %	0 %	50 %	50 %	159046357
78	NC_009956	CG	4	8	25312	25319	0 %	0 %	50 %	50 %	159046357
79	NC_009956	CG	3	6	25376	25381	0 %	0 %	50 %	50 %	159046357
80	NC_009956	CG	3	6	25937	25942	0 %	0 %	50 %	50 %	159046357
81	NC_009956	GC	3	6	26100	26105	0 %	0 %	50 %	50 %	159046357
82	NC_009956	GC	3	6	26302	26307	0 %	0 %	50 %	50 %	159046358
83	NC_009956	CG	3	6	26543	26548	0 %	0 %	50 %	50 %	159046358
84	NC_009956	GC	3	6	27118	27123	0 %	0 %	50 %	50 %	159046358
85	NC_009956	CA	3	6	27215	27220	50 %	0 %	0 %	50 %	159046359
86	NC_009956	GC	3	6	27423	27428	0 %	0 %	50 %	50 %	159046359
87	NC_009956	GC	3	6	27883	27888	0 %	0 %	50 %	50 %	159046360
88	NC_009956	GC	3	6	30164	30169	0 %	0 %	50 %	50 %	159046363
89	NC_009956	GC	4	8	30362	30369	0 %	0 %	50 %	50 %	159046363
90	NC_009956	GC	3	6	30507	30512	0 %	0 %	50 %	50 %	159046364
91	NC_009956	GC	3	6	30813	30818	0 %	0 %	50 %	50 %	159046364
92	NC_009956	CG	3	6	30845	30850	0 %	0 %	50 %	50 %	159046364
93	NC_009956	GC	3	6	31401	31406	0 %	0 %	50 %	50 %	159046364
94	NC_009956	CG	3	6	31505	31510	0 %	0 %	50 %	50 %	159046364
95	NC_009956	CG	3	6	31819	31824	0 %	0 %	50 %	50 %	159046365
96	NC_009956	GC	3	6	32198	32203	0 %	0 %	50 %	50 %	159046365
97	NC_009956	CG	3	6	32246	32251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009956	CG	3	6	32317	32322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009956	CG	3	6	32449	32454	0 %	0 %	50 %	50 %	159046366
100	NC_009956	GC	4	8	32840	32847	0 %	0 %	50 %	50 %	159046366
101	NC_009956	GC	3	6	32905	32910	0 %	0 %	50 %	50 %	159046366
102	NC_009956	GC	3	6	32929	32934	0 %	0 %	50 %	50 %	159046366
103	NC_009956	GC	4	8	32967	32974	0 %	0 %	50 %	50 %	159046366
104	NC_009956	CG	4	8	33068	33075	0 %	0 %	50 %	50 %	159046366
105	NC_009956	CG	3	6	33159	33164	0 %	0 %	50 %	50 %	159046366
106	NC_009956	GC	3	6	33179	33184	0 %	0 %	50 %	50 %	159046366
107	NC_009956	GC	3	6	33237	33242	0 %	0 %	50 %	50 %	159046366
108	NC_009956	CG	3	6	33268	33273	0 %	0 %	50 %	50 %	159046366
109	NC_009956	CG	3	6	33637	33642	0 %	0 %	50 %	50 %	159046366
110	NC_009956	GC	3	6	33920	33925	0 %	0 %	50 %	50 %	159046366
111	NC_009956	GC	3	6	34020	34025	0 %	0 %	50 %	50 %	159046366
112	NC_009956	GC	3	6	34079	34084	0 %	0 %	50 %	50 %	159046366
113	NC_009956	GC	4	8	34249	34256	0 %	0 %	50 %	50 %	159046366
114	NC_009956	GC	3	6	34608	34613	0 %	0 %	50 %	50 %	159046367
115	NC_009956	GC	4	8	34666	34673	0 %	0 %	50 %	50 %	159046367
116	NC_009956	CA	3	6	34728	34733	50 %	0 %	0 %	50 %	159046367
117	NC_009956	GC	3	6	35115	35120	0 %	0 %	50 %	50 %	159046367
118	NC_009956	CG	3	6	35478	35483	0 %	0 %	50 %	50 %	159046367
119	NC_009956	CG	3	6	35815	35820	0 %	0 %	50 %	50 %	159046367
120	NC_009956	CG	3	6	36792	36797	0 %	0 %	50 %	50 %	159046368
121	NC_009956	GC	3	6	37138	37143	0 %	0 %	50 %	50 %	159046368
122	NC_009956	CG	3	6	37964	37969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_009956	CG	4	8	38021	38028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_009956	GC	3	6	38194	38199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009956	GC	3	6	38471	38476	0 %	0 %	50 %	50 %	159046370
126	NC_009956	GC	3	6	38494	38499	0 %	0 %	50 %	50 %	159046370
127	NC_009956	CG	3	6	38555	38560	0 %	0 %	50 %	50 %	159046370
128	NC_009956	CG	4	8	39116	39123	0 %	0 %	50 %	50 %	159046370
129	NC_009956	CG	3	6	39310	39315	0 %	0 %	50 %	50 %	159046370
130	NC_009956	GC	3	6	40094	40099	0 %	0 %	50 %	50 %	159046371
131	NC_009956	GA	3	6	40165	40170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009956	TC	3	6	40409	40414	0 %	50 %	0 %	50 %	159046372
133	NC_009956	CG	3	6	40645	40650	0 %	0 %	50 %	50 %	159046372
134	NC_009956	CG	3	6	40812	40817	0 %	0 %	50 %	50 %	159046372
135	NC_009956	CG	3	6	40993	40998	0 %	0 %	50 %	50 %	159046372
136	NC_009956	CG	3	6	41296	41301	0 %	0 %	50 %	50 %	159046372
137	NC_009956	GC	3	6	41574	41579	0 %	0 %	50 %	50 %	159046372
138	NC_009956	GC	4	8	41993	42000	0 %	0 %	50 %	50 %	159046373
139	NC_009956	GC	3	6	42116	42121	0 %	0 %	50 %	50 %	159046373
140	NC_009956	CG	3	6	42150	42155	0 %	0 %	50 %	50 %	159046373
141	NC_009956	GC	3	6	42636	42641	0 %	0 %	50 %	50 %	159046373
142	NC_009956	GC	3	6	42838	42843	0 %	0 %	50 %	50 %	159046373
143	NC_009956	CG	3	6	43110	43115	0 %	0 %	50 %	50 %	159046373
144	NC_009956	CG	3	6	43341	43346	0 %	0 %	50 %	50 %	159046374
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.