MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI02

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009956	GA	4	8	158	165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009956	GC	3	6	12884	12889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009956	GC	3	6	22068	22073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009956	CG	3	6	32246	32251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009956	CG	3	6	32317	32322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009956	CG	3	6	37964	37969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009956	CG	4	8	38021	38028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009956	GC	3	6	38194	38199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009956	GA	3	6	40165	40170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009956	CG	3	6	45665	45670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009956	CG	3	6	52064	52069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009956	GC	3	6	53983	53988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009956	GC	4	8	54345	54352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009956	CG	3	6	54498	54503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009956	CA	3	6	56931	56936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009956	CT	3	6	57025	57030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009956	TA	3	6	58208	58213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009956	CG	5	10	58217	58226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009956	CG	3	6	60447	60452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009956	AT	3	6	60564	60569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009956	CG	3	6	62176	62181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009956	GA	3	6	62240	62245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009956	GA	4	8	63730	63737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009956	CG	3	6	65769	65774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009956	CA	3	6	65806	65811	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009956	GC	3	6	65816	65821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009956	GC	3	6	65824	65829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009956	TC	3	6	65961	65966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009956	CG	3	6	72719	72724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009956	TG	3	6	80736	80741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009956	CT	3	6	84365	84370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009956	CG	3	6	84385	84390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009956	TC	3	6	88333	88338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009956	CA	3	6	97818	97823	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009956	TA	3	6	100241	100246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009956	AT	3	6	103943	103948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009956	CT	3	6	104745	104750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009956	GC	3	6	108139	108144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009956	TG	4	8	130483	130490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009956	CA	3	6	136859	136864	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009956	CG	3	6	136890	136895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009956	GT	3	6	141347	141352	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009956	CG	3	6	143702	143707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009956	CA	3	6	144339	144344	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009956	AT	3	6	144985	144990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009956	CG	3	6	146172	146177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009956	GC	5	10	147119	147128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009956	GC	3	6	148556	148561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.