MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI02

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009956	A	6	6	63	68	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009956	G	6	6	1165	1170	0 %	0 %	100 %	0 %	159046332
3	NC_009956	G	6	6	2985	2990	0 %	0 %	100 %	0 %	159046334
4	NC_009956	G	6	6	3230	3235	0 %	0 %	100 %	0 %	159046334
5	NC_009956	G	6	6	7630	7635	0 %	0 %	100 %	0 %	159046339
6	NC_009956	G	6	6	8041	8046	0 %	0 %	100 %	0 %	159046340
7	NC_009956	G	6	6	13458	13463	0 %	0 %	100 %	0 %	159046345
8	NC_009956	C	6	6	15585	15590	0 %	0 %	0 %	100 %	159046345
9	NC_009956	G	8	8	15870	15877	0 %	0 %	100 %	0 %	159046346
10	NC_009956	C	6	6	24416	24421	0 %	0 %	0 %	100 %	159046355
11	NC_009956	T	6	6	24946	24951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009956	G	6	6	25004	25009	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009956	C	7	7	28620	28626	0 %	0 %	0 %	100 %	159046361
14	NC_009956	G	6	6	29133	29138	0 %	0 %	100 %	0 %	159046362
15	NC_009956	C	6	6	32225	32230	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_009956	C	6	6	32268	32273	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_009956	G	6	6	32432	32437	0 %	0 %	100 %	0 %	159046366
18	NC_009956	G	6	6	32730	32735	0 %	0 %	100 %	0 %	159046366
19	NC_009956	C	6	6	33091	33096	0 %	0 %	0 %	100 %	159046366
20	NC_009956	C	6	6	34584	34589	0 %	0 %	0 %	100 %	159046367
21	NC_009956	C	6	6	35907	35912	0 %	0 %	0 %	100 %	159046367
22	NC_009956	C	6	6	38272	38277	0 %	0 %	0 %	100 %	159046370
23	NC_009956	C	7	7	39403	39409	0 %	0 %	0 %	100 %	159046371
24	NC_009956	A	8	8	45692	45699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009956	T	6	6	46731	46736	0 %	100 %	0 %	0 %	159046378
26	NC_009956	C	6	6	47122	47127	0 %	0 %	0 %	100 %	159046378
27	NC_009956	C	7	7	47724	47730	0 %	0 %	0 %	100 %	159046378
28	NC_009956	A	6	6	48162	48167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009956	G	7	7	49860	49866	0 %	0 %	100 %	0 %	159046380
30	NC_009956	C	7	7	50103	50109	0 %	0 %	0 %	100 %	159046380
31	NC_009956	C	7	7	51178	51184	0 %	0 %	0 %	100 %	159046381
32	NC_009956	G	6	6	55555	55560	0 %	0 %	100 %	0 %	159046385
33	NC_009956	A	6	6	55786	55791	100 %	0 %	0 %	0 %	159046385
34	NC_009956	C	6	6	55903	55908	0 %	0 %	0 %	100 %	159046386
35	NC_009956	C	6	6	57406	57411	0 %	0 %	0 %	100 %	159046390
36	NC_009956	C	6	6	58413	58418	0 %	0 %	0 %	100 %	159046391
37	NC_009956	T	6	6	58627	58632	0 %	100 %	0 %	0 %	159046391
38	NC_009956	C	6	6	59172	59177	0 %	0 %	0 %	100 %	159046391
39	NC_009956	A	6	6	60502	60507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009956	T	7	7	60591	60597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009956	C	6	6	60763	60768	0 %	0 %	0 %	100 %	159046393
42	NC_009956	C	6	6	62376	62381	0 %	0 %	0 %	100 %	159046394
43	NC_009956	C	6	6	62397	62402	0 %	0 %	0 %	100 %	159046394
44	NC_009956	A	7	7	63523	63529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009956	G	6	6	65994	65999	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009956	G	7	7	66870	66876	0 %	0 %	100 %	0 %	159046396
47	NC_009956	G	6	6	70339	70344	0 %	0 %	100 %	0 %	159046399
48	NC_009956	G	6	6	72628	72633	0 %	0 %	100 %	0 %	159046400
49	NC_009956	C	6	6	72736	72741	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_009956	G	6	6	75180	75185	0 %	0 %	100 %	0 %	159046403
51	NC_009956	G	6	6	78865	78870	0 %	0 %	100 %	0 %	159046404
52	NC_009956	G	6	6	79830	79835	0 %	0 %	100 %	0 %	159046405
53	NC_009956	G	6	6	79859	79864	0 %	0 %	100 %	0 %	159046405
54	NC_009956	G	6	6	80628	80633	0 %	0 %	100 %	0 %	159046405
55	NC_009956	G	7	7	80848	80854	0 %	0 %	100 %	0 %	159046406
56	NC_009956	G	7	7	81929	81935	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009956	G	6	6	83411	83416	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009956	G	6	6	87602	87607	0 %	0 %	100 %	0 %	159046409
59	NC_009956	C	6	6	88751	88756	0 %	0 %	0 %	100 %	159046410
60	NC_009956	C	6	6	88819	88824	0 %	0 %	0 %	100 %	159046410
61	NC_009956	G	6	6	90120	90125	0 %	0 %	100 %	0 %	159046410
62	NC_009956	G	7	7	93650	93656	0 %	0 %	100 %	0 %	159046410
63	NC_009956	G	6	6	94110	94115	0 %	0 %	100 %	0 %	159046411
64	NC_009956	T	6	6	94726	94731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009956	T	6	6	97833	97838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009956	C	6	6	98062	98067	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
67	NC_009956	G	6	6	98097	98102	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009956	T	6	6	98223	98228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009956	T	6	6	100297	100302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009956	T	6	6	100372	100377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009956	A	7	7	102220	102226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009956	A	6	6	102915	102920	100 %	0 %	0 %	0 %	159046417
73	NC_009956	C	6	6	103756	103761	0 %	0 %	0 %	100 %	159046418
74	NC_009956	C	6	6	107560	107565	0 %	0 %	0 %	100 %	159046422
75	NC_009956	A	6	6	107922	107927	100 %	0 %	0 %	0 %	159046422
76	NC_009956	G	6	6	108078	108083	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009956	G	6	6	108860	108865	0 %	0 %	100 %	0 %	159046423
78	NC_009956	C	6	6	109852	109857	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79	NC_009956	C	6	6	109919	109924	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80	NC_009956	G	6	6	110585	110590	0 %	0 %	100 %	0 %	159046424
81	NC_009956	G	6	6	112560	112565	0 %	0 %	100 %	0 %	159046426
82	NC_009956	C	6	6	115560	115565	0 %	0 %	0 %	100 %	159046429
83	NC_009956	G	6	6	116698	116703	0 %	0 %	100 %	0 %	159046430
84	NC_009956	G	6	6	119263	119268	0 %	0 %	100 %	0 %	159046433
85	NC_009956	C	6	6	120525	120530	0 %	0 %	0 %	100 %	159046434
86	NC_009956	A	6	6	121291	121296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009956	G	6	6	121884	121889	0 %	0 %	100 %	0 %	159046436
88	NC_009956	G	6	6	122754	122759	0 %	0 %	100 %	0 %	159046436
89	NC_009956	C	6	6	123213	123218	0 %	0 %	0 %	100 %	159046436
90	NC_009956	G	6	6	124184	124189	0 %	0 %	100 %	0 %	159046437
91	NC_009956	G	6	6	125354	125359	0 %	0 %	100 %	0 %	159046439
92	NC_009956	G	6	6	126290	126295	0 %	0 %	100 %	0 %	159046439
93	NC_009956	G	6	6	128090	128095	0 %	0 %	100 %	0 %	159046439
94	NC_009956	G	6	6	132264	132269	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009956	G	6	6	132829	132834	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009956	T	8	8	132856	132863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009956	G	6	6	133020	133025	0 %	0 %	100 %	0 %	159046443
98	NC_009956	C	6	6	135701	135706	0 %	0 %	0 %	100 %	159046445
99	NC_009956	T	6	6	140597	140602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009956	A	7	7	140681	140687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009956	A	6	6	140726	140731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009956	A	6	6	146031	146036	100 %	0 %	0 %	0 %	159046457
103	NC_009956	G	7	7	148133	148139	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009956	G	6	6	150093	150098	0 %	0 %	100 %	0 %	159046464
105	NC_009956	G	7	7	150288	150294	0 %	0 %	100 %	0 %	159046464
106	NC_009956	C	6	6	151151	151156	0 %	0 %	0 %	100 %	159046466
107	NC_009956	T	6	6	151999	152004	0 %	100 %	0 %	0 %	159046467
108	NC_009956	G	6	6	152739	152744	0 %	0 %	100 %	0 %	159046468

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.