MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI01

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009955	TCAT	2	8	1678	1685	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009955	ATAC	2	8	3006	3013	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009955	ACAA	2	8	3641	3648	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009955	CCCG	2	8	12107	12114	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_009955	CTCA	2	8	14107	14114	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009955	ATCG	2	8	25301	25308	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009955	GTTA	2	8	25870	25877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009955	GTAT	2	8	28718	28725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009955	CAGT	2	8	31821	31828	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009955	CCGC	2	8	32004	32011	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_009955	TTGA	2	8	37400	37407	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009955	GAAC	2	8	51640	51647	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009955	CCCG	2	8	60481	60488	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_009955	CGGA	2	8	60515	60522	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009955	CGGG	2	8	60527	60534	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009955	CAGG	2	8	60559	60566	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009955	CGGC	2	8	60720	60727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009955	ACGG	2	8	61177	61184	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009955	CACG	2	8	62670	62677	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009955	GGGA	2	8	62916	62923	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009955	ACGA	2	8	63140	63147	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009955	CAGT	2	8	65428	65435	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009955	CCGC	2	8	65611	65618	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_009955	TAAA	2	8	74009	74016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009955	GTTT	2	8	80926	80933	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009955	CCAG	2	8	86473	86480	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009955	GTTG	2	8	86755	86762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009955	AACG	2	8	88417	88424	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009955	CGTT	2	8	93034	93041	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009955	TTCA	2	8	93481	93488	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009955	GCTT	2	8	94392	94399	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009955	ACGA	2	8	106990	106997	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009955	CTGT	2	8	109504	109511	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009955	TGAG	2	8	109737	109744	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009955	CGTC	2	8	109754	109761	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009955	GAAC	2	8	110764	110771	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009955	CCGC	2	8	111161	111168	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_009955	CTTT	2	8	111694	111701	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009955	GAGC	2	8	111997	112004	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009955	GCCT	2	8	113636	113643	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009955	ACCG	2	8	123588	123595	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009955	CCTG	2	8	136152	136159	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009955	GACG	2	8	136266	136273	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009955	TAGG	2	8	136497	136504	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009955	GAAC	2	8	142280	142287	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009955	CTTA	2	8	143594	143601	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009955	ACCG	2	8	146200	146207	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009955	GCTG	2	8	146239	146246	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009955	GAAA	2	8	146314	146321	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009955	AGCG	2	8	146824	146831	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009955	GCGG	2	8	146863	146870	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009955	CTGG	2	8	146939	146946	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009955	GTCA	2	8	148807	148814	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009955	AAAG	2	8	150418	150425	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009955	CATG	2	8	153189	153196	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009955	TGCC	2	8	163563	163570	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009955	CTCA	2	8	169948	169955	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009955	AGGA	2	8	171217	171224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009955	CTTC	2	8	180084	180091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009955	GCTT	2	8	180242	180249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009955	ATTT	2	8	186713	186720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.