MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI01

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009955	T	6	6	1194	1199	0 %	100 %	0 %	0 %	159046137
2	NC_009955	A	6	6	4533	4538	100 %	0 %	0 %	0 %	159046141
3	NC_009955	T	7	7	5175	5181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009955	C	6	6	5314	5319	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_009955	T	7	7	5983	5989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009955	G	7	7	6660	6666	0 %	0 %	100 %	0 %	159046144
7	NC_009955	G	6	6	6939	6944	0 %	0 %	100 %	0 %	159046144
8	NC_009955	T	7	7	8051	8057	0 %	100 %	0 %	0 %	159046145
9	NC_009955	A	6	6	11759	11764	100 %	0 %	0 %	0 %	159046147
10	NC_009955	T	6	6	14941	14946	0 %	100 %	0 %	0 %	159046151
11	NC_009955	G	6	6	25501	25506	0 %	0 %	100 %	0 %	159046165
12	NC_009955	T	6	6	28815	28820	0 %	100 %	0 %	0 %	159046170
13	NC_009955	A	6	6	34427	34432	100 %	0 %	0 %	0 %	159046174
14	NC_009955	A	7	7	47989	47995	100 %	0 %	0 %	0 %	159046190
15	NC_009955	C	6	6	50332	50337	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_009955	A	6	6	54567	54572	100 %	0 %	0 %	0 %	159046196
17	NC_009955	T	6	6	55557	55562	0 %	100 %	0 %	0 %	159046197
18	NC_009955	C	6	6	55703	55708	0 %	0 %	0 %	100 %	159046197
19	NC_009955	C	6	6	55710	55715	0 %	0 %	0 %	100 %	159046197
20	NC_009955	C	6	6	60285	60290	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_009955	G	6	6	60692	60697	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009955	G	6	6	67606	67611	0 %	0 %	100 %	0 %	159046207
23	NC_009955	A	6	6	68681	68686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009955	T	6	6	68759	68764	0 %	100 %	0 %	0 %	159046209
25	NC_009955	T	6	6	69826	69831	0 %	100 %	0 %	0 %	159046210
26	NC_009955	C	6	6	71683	71688	0 %	0 %	0 %	100 %	159046212
27	NC_009955	T	6	6	71738	71743	0 %	100 %	0 %	0 %	159046212
28	NC_009955	T	6	6	73927	73932	0 %	100 %	0 %	0 %	159046214
29	NC_009955	C	7	7	74730	74736	0 %	0 %	0 %	100 %	159046215
30	NC_009955	T	6	6	75105	75110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009955	T	6	6	77848	77853	0 %	100 %	0 %	0 %	159046217
32	NC_009955	T	6	6	78024	78029	0 %	100 %	0 %	0 %	159046218
33	NC_009955	T	6	6	81008	81013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009955	T	6	6	84115	84120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009955	C	6	6	84344	84349	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_009955	G	6	6	84379	84384	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009955	T	6	6	84505	84510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009955	T	6	6	86579	86584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009955	T	6	6	86654	86659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009955	A	6	6	89391	89396	100 %	0 %	0 %	0 %	159046226
41	NC_009955	G	6	6	90118	90123	0 %	0 %	100 %	0 %	159046226
42	NC_009955	G	6	6	90491	90496	0 %	0 %	100 %	0 %	159046227
43	NC_009955	C	6	6	92464	92469	0 %	0 %	0 %	100 %	159046230
44	NC_009955	A	7	7	92481	92487	100 %	0 %	0 %	0 %	159046230
45	NC_009955	G	6	6	95699	95704	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009955	G	6	6	98416	98421	0 %	0 %	100 %	0 %	159046237
47	NC_009955	A	6	6	103465	103470	100 %	0 %	0 %	0 %	159046240
48	NC_009955	C	6	6	104562	104567	0 %	0 %	0 %	100 %	159046241
49	NC_009955	T	6	6	106431	106436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009955	T	6	6	106560	106565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009955	T	7	7	110757	110763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009955	C	6	6	115184	115189	0 %	0 %	0 %	100 %	159046249
53	NC_009955	T	6	6	124539	124544	0 %	100 %	0 %	0 %	159046258
54	NC_009955	T	6	6	127513	127518	0 %	100 %	0 %	0 %	159046259
55	NC_009955	G	6	6	127591	127596	0 %	0 %	100 %	0 %	159046259
56	NC_009955	G	6	6	133561	133566	0 %	0 %	100 %	0 %	159046266
57	NC_009955	G	6	6	136187	136192	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009955	C	6	6	136599	136604	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59	NC_009955	C	6	6	138526	138531	0 %	0 %	0 %	100 %	159046272
60	NC_009955	G	6	6	140905	140910	0 %	0 %	100 %	0 %	159046273
61	NC_009955	A	6	6	143663	143668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009955	A	6	6	143771	143776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009955	G	6	6	147568	147573	0 %	0 %	100 %	0 %	159046280
64	NC_009955	T	6	6	148838	148843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009955	T	6	6	150562	150567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009955	A	6	6	153675	153680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009955	G	6	6	155883	155888	0 %	0 %	100 %	0 %	159046287
68	NC_009955	T	6	6	157683	157688	0 %	100 %	0 %	0 %	159046290
69	NC_009955	A	6	6	159686	159691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009955	T	6	6	161664	161669	0 %	100 %	0 %	0 %	159046296
71	NC_009955	G	6	6	161983	161988	0 %	0 %	100 %	0 %	159046296
72	NC_009955	A	7	7	164747	164753	100 %	0 %	0 %	0 %	159046300
73	NC_009955	G	6	6	165465	165470	0 %	0 %	100 %	0 %	159046302
74	NC_009955	A	6	6	168906	168911	100 %	0 %	0 %	0 %	159046307
75	NC_009955	G	6	6	170579	170584	0 %	0 %	100 %	0 %	159046310
76	NC_009955	T	6	6	175787	175792	0 %	100 %	0 %	0 %	159046315
77	NC_009955	A	7	7	180557	180563	100 %	0 %	0 %	0 %	159046319
78	NC_009955	G	6	6	181185	181190	0 %	0 %	100 %	0 %	159046320
79	NC_009955	G	6	6	185478	185483	0 %	0 %	100 %	0 %	159046325
80	NC_009955	C	7	7	186685	186691	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.