MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldivirga maquilingensis IC-167 chromosome

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009954	CTAGTG	2	12	54553	54564	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009954	TACATA	2	12	118889	118900	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_009954	AGTATC	2	12	140113	140124	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009954	AATAAA	2	12	147066	147077	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009954	TGAGGA	2	12	150364	150375	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009954	ACCCTA	2	12	156258	156269	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009954	TAAATA	2	12	176357	176368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009954	CCTTAA	2	12	180230	180241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009954	TACCGG	2	12	211491	211502	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009954	ATTTAG	2	12	244823	244834	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009954	AATTTA	2	12	244841	244852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009954	CTTAAC	2	12	249300	249311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009954	TATAAG	2	12	267324	267335	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009954	GATGTA	2	12	288716	288727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009954	TTAATG	2	12	289604	289615	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009954	TAGCAG	2	12	323933	323944	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_009954	AACCTT	2	12	331861	331872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009954	GGTGAA	2	12	351915	351926	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009954	AACCTA	2	12	385176	385187	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009954	CTTAAC	2	12	403054	403065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009954	TAAGGG	2	12	439073	439084	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009954	TGATGC	2	12	441973	441984	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_009954	TGGTTT	2	12	442266	442277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009954	AGGTTA	2	12	442350	442361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009954	ATACCT	2	12	448283	448294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009954	TAATTA	2	12	468185	468196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009954	TAAGAT	2	12	494456	494467	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009954	GGCAAT	2	12	518470	518481	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009954	TTATTT	2	12	521032	521043	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009954	AGTCTT	2	12	596576	596587	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009954	GCCACC	2	12	600329	600340	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_009954	GAAGGG	2	12	621281	621292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009954	TAGCCT	2	12	625558	625569	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009954	CCCCTC	2	12	653500	653511	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
35	NC_009954	GAAAAA	2	12	663740	663751	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009954	AGGTGG	2	12	664897	664908	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009954	TAGCAT	2	12	665210	665221	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_009954	TTAGTT	2	12	666337	666348	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009954	TTAAAT	2	12	695684	695695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009954	AATTAA	2	12	723377	723388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009954	CTGAGG	2	12	729564	729575	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_009954	CCCGGC	2	12	747550	747561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_009954	TCCGCT	2	12	747762	747773	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009954	TACACT	2	12	747874	747885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009954	GTCCAT	2	12	761326	761337	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009954	ATTTTT	2	12	783937	783948	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009954	TAATAT	2	12	791375	791386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009954	CTTATT	2	12	791473	791484	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_009954	AGTGCA	2	12	792712	792723	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_009954	CCTAAG	2	12	807251	807262	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009954	CCTAAG	2	12	847727	847738	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009954	AGCCCC	2	12	847746	847757	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_009954	TAAGGA	2	12	871554	871565	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009954	TATTCC	2	12	871735	871746	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009954	AACTAA	2	12	876280	876291	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_009954	TTTAGT	2	12	958632	958643	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009954	ATTTTA	2	12	995343	995354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009954	TATAAT	2	12	997970	997981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009954	ATTAAA	2	12	1017315	1017326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009954	GTTAAC	2	12	1037228	1037239	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_009954	TAGGTA	2	12	1037422	1037433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009954	TAGGTG	2	12	1037611	1037622	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009954	GTTAAT	2	12	1037803	1037814	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009954	ATATTT	2	12	1042252	1042263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009954	TCATTA	2	12	1055988	1055999	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009954	TTTTAT	2	12	1078743	1078754	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009954	TGGGGT	2	12	1079257	1079268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009954	ATGAAT	2	12	1085509	1085520	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009954	TAACCA	2	12	1110300	1110311	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009954	TTAAAA	2	12	1110662	1110673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009954	ATTTAA	2	12	1117304	1117315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009954	TTTATA	2	12	1128619	1128630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009954	CTGGGG	2	12	1206333	1206344	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_009954	TAATGC	2	12	1206638	1206649	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_009954	AGCAAT	2	12	1220754	1220765	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_009954	GCCGGG	2	12	1220938	1220949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009954	AATCCC	2	12	1232628	1232639	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009954	TCCATA	2	12	1278081	1278092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009954	ATTTTT	2	12	1341609	1341620	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009954	TTATAA	2	12	1356150	1356161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009954	TTAATG	2	12	1356202	1356213	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009954	CCCGGC	2	12	1356671	1356682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_009954	CTGAAC	2	12	1397208	1397219	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009954	CCCGGC	2	12	1429850	1429861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_009954	TTAAGG	2	12	1460581	1460592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009954	CTTTAA	2	12	1495860	1495871	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_009954	TAACAA	2	12	1499138	1499149	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_009954	ATCATG	2	12	1556370	1556381	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_009954	ACAACC	2	12	1556511	1556522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009954	TTATCG	2	12	1566979	1566990	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_009954	GGATAA	2	12	1567788	1567799	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009954	AATTTT	2	12	1580246	1580257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009954	ATGCAT	2	12	1613867	1613878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_009954	AGGTTA	2	12	1624608	1624619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009954	AACCCG	2	12	1633148	1633159	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009954	TAAAGC	2	12	1646512	1646523	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_009954	ATTAAT	2	12	1655149	1655160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009954	TTATGG	2	12	1666001	1666012	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009954	TAATCC	2	12	1666033	1666044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009954	GAAAAA	2	12	1668693	1668704	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009954	CTTTAA	2	12	1684251	1684262	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_009954	CATTAC	2	12	1689890	1689901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009954	TAAACT	2	12	1756413	1756424	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_009954	ACCTTA	2	12	1787251	1787262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009954	ATGAAT	2	12	1856593	1856604	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009954	GATAAT	2	12	1870502	1870513	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009954	AAGTTA	2	12	1879408	1879419	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009954	AACCAA	2	12	1884598	1884609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009954	CTGGTG	2	12	1900736	1900747	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_009954	ACCAAT	2	12	1901376	1901387	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009954	TCAATT	2	12	1927218	1927229	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_009954	CAGTTA	2	12	1927378	1927389	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_009954	ACGTGT	2	12	2011152	2011163	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_009954	GGATAA	2	12	2022033	2022044	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009954	TTTATA	2	12	2048513	2048524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009954	ATTAAA	2	12	2052530	2052541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009954	CCTGAC	2	12	2058979	2058990	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009954	TCCCTA	2	12	2072236	2072247	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.