MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Caldivirga maquilingensis IC-167 chromosome

Total Repeats: 1739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009954	ACCAT	2	10	766	775	40 %	20 %	0 %	40 %	159040593
2	NC_009954	ACCAT	2	10	988	997	40 %	20 %	0 %	40 %	159040593
3	NC_009954	ACCAT	2	10	1210	1219	40 %	20 %	0 %	40 %	159040593
4	NC_009954	CTGCA	2	10	1305	1314	20 %	20 %	20 %	40 %	159040593
5	NC_009954	ACTGT	2	10	1613	1622	20 %	40 %	20 %	20 %	159040593
6	NC_009954	TGGCT	2	10	2373	2382	0 %	40 %	40 %	20 %	159040593
7	NC_009954	CAACC	2	10	2759	2768	40 %	0 %	0 %	60 %	159040593
8	NC_009954	ACATT	2	10	3080	3089	40 %	40 %	0 %	20 %	159040593
9	NC_009954	ACTGG	2	10	3200	3209	20 %	20 %	40 %	20 %	159040593
10	NC_009954	CGTTG	2	10	4332	4341	0 %	40 %	40 %	20 %	159040593
11	NC_009954	TAACC	2	10	5265	5274	40 %	20 %	0 %	40 %	159040593
12	NC_009954	AACTG	2	10	6120	6129	40 %	20 %	20 %	20 %	159040593
13	NC_009954	GCTGA	2	10	6844	6853	20 %	20 %	40 %	20 %	159040593
14	NC_009954	GTTAC	2	10	6985	6994	20 %	40 %	20 %	20 %	159040593
15	NC_009954	GCCCA	2	10	8732	8741	20 %	0 %	20 %	60 %	159040593
16	NC_009954	TTAAG	2	10	12023	12032	40 %	40 %	20 %	0 %	159040595
17	NC_009954	CTACT	2	10	13325	13334	20 %	40 %	0 %	40 %	159040595
18	NC_009954	ACCAC	2	10	13384	13393	40 %	0 %	0 %	60 %	159040595
19	NC_009954	TTAAT	2	10	13859	13868	40 %	60 %	0 %	0 %	159040595
20	NC_009954	GAGTA	2	10	13996	14005	40 %	20 %	40 %	0 %	159040595
21	NC_009954	GAGTA	2	10	14698	14707	40 %	20 %	40 %	0 %	159040595
22	NC_009954	ATAAC	2	10	15740	15749	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009954	CTTTA	2	10	15910	15919	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009954	CATCC	2	10	16078	16087	20 %	20 %	0 %	60 %	159040597
25	NC_009954	CCAGT	2	10	16325	16334	20 %	20 %	20 %	40 %	159040597
26	NC_009954	CTATC	2	10	16999	17008	20 %	40 %	0 %	40 %	159040597
27	NC_009954	AGCTA	2	10	17949	17958	40 %	20 %	20 %	20 %	159040598
28	NC_009954	ATTCA	2	10	18067	18076	40 %	40 %	0 %	20 %	159040598
29	NC_009954	GGCTA	2	10	18285	18294	20 %	20 %	40 %	20 %	159040598
30	NC_009954	TTGGG	2	10	20047	20056	0 %	40 %	60 %	0 %	159040599
31	NC_009954	TCCTC	2	10	20095	20104	0 %	40 %	0 %	60 %	159040599
32	NC_009954	GTCAC	2	10	20985	20994	20 %	20 %	20 %	40 %	159040599
33	NC_009954	ATTAC	2	10	21713	21722	40 %	40 %	0 %	20 %	159040600
34	NC_009954	TTAAT	2	10	22083	22092	40 %	60 %	0 %	0 %	159040600
35	NC_009954	TGAGG	2	10	23694	23703	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009954	GGTTA	2	10	26017	26026	20 %	40 %	40 %	0 %	159040605
37	NC_009954	TACCT	2	10	27117	27126	20 %	40 %	0 %	40 %	159040606
38	NC_009954	CAGTG	2	10	29202	29211	20 %	20 %	40 %	20 %	159040609
39	NC_009954	AACCA	2	10	30348	30357	60 %	0 %	0 %	40 %	159040609
40	NC_009954	TAAAA	2	10	30439	30448	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009954	CAACC	2	10	32255	32264	40 %	0 %	0 %	60 %	159040611
42	NC_009954	TAATA	2	10	32343	32352	60 %	40 %	0 %	0 %	159040611
43	NC_009954	AGGTA	2	10	33532	33541	40 %	20 %	40 %	0 %	159040612
44	NC_009954	ATTGG	2	10	33748	33757	20 %	40 %	40 %	0 %	159040612
45	NC_009954	AAGGG	2	10	33938	33947	40 %	0 %	60 %	0 %	159040612
46	NC_009954	TTACC	2	10	34701	34710	20 %	40 %	0 %	40 %	159040613
47	NC_009954	TAAGG	2	10	35198	35207	40 %	20 %	40 %	0 %	159040613
48	NC_009954	GACCC	2	10	36050	36059	20 %	0 %	20 %	60 %	159040614
49	NC_009954	AGTTA	2	10	36079	36088	40 %	40 %	20 %	0 %	159040614
50	NC_009954	GTACT	2	10	36557	36566	20 %	40 %	20 %	20 %	159040614
51	NC_009954	TCCTC	2	10	38151	38160	0 %	40 %	0 %	60 %	159040616
52	NC_009954	TGATT	2	10	38880	38889	20 %	60 %	20 %	0 %	159040616
53	NC_009954	TGGGT	2	10	40741	40750	0 %	40 %	60 %	0 %	159040619
54	NC_009954	TGAGT	2	10	40886	40895	20 %	40 %	40 %	0 %	159040619
55	NC_009954	CTAAT	2	10	42205	42214	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_009954	AGGGG	2	10	42691	42700	20 %	0 %	80 %	0 %	159040621
57	NC_009954	GGGTA	2	10	43225	43234	20 %	20 %	60 %	0 %	159040621
58	NC_009954	GGGTT	2	10	44711	44720	0 %	40 %	60 %	0 %	159040622
59	NC_009954	TACTT	2	10	47390	47399	20 %	60 %	0 %	20 %	159040624
60	NC_009954	TCAAC	2	10	49418	49427	40 %	20 %	0 %	40 %	159040625
61	NC_009954	AATCC	2	10	55638	55647	40 %	20 %	0 %	40 %	159040632
62	NC_009954	GTTAA	2	10	56166	56175	40 %	40 %	20 %	0 %	159040633
63	NC_009954	TAGCT	2	10	56938	56947	20 %	40 %	20 %	20 %	159040633
64	NC_009954	GAGAA	2	10	58879	58888	60 %	0 %	40 %	0 %	159040635
65	NC_009954	TTAAC	2	10	59153	59162	40 %	40 %	0 %	20 %	159040635
66	NC_009954	TAGTT	2	10	60619	60628	20 %	60 %	20 %	0 %	159040638
67	NC_009954	GTTAA	2	10	61436	61445	40 %	40 %	20 %	0 %	159040638
68	NC_009954	TCACC	2	10	61541	61550	20 %	20 %	0 %	60 %	159040639
69	NC_009954	TTACC	2	10	62572	62581	20 %	40 %	0 %	40 %	159040639
70	NC_009954	TTAAC	2	10	63621	63630	40 %	40 %	0 %	20 %	159040640
71	NC_009954	GTATA	2	10	64937	64946	40 %	40 %	20 %	0 %	159040641
72	NC_009954	GTAAC	2	10	65395	65404	40 %	20 %	20 %	20 %	159040641
73	NC_009954	GTGTT	2	10	66462	66471	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009954	TGACT	2	10	66570	66579	20 %	40 %	20 %	20 %	159040642
75	NC_009954	AGGTA	2	10	69622	69631	40 %	20 %	40 %	0 %	159040645
76	NC_009954	TGTAA	2	10	70090	70099	40 %	40 %	20 %	0 %	159040645
77	NC_009954	AGGGT	2	10	71045	71054	20 %	20 %	60 %	0 %	159040646
78	NC_009954	CACTA	2	10	73865	73874	40 %	20 %	0 %	40 %	159040650
79	NC_009954	GCTAG	2	10	74328	74337	20 %	20 %	40 %	20 %	159040651
80	NC_009954	GGTTA	2	10	76103	76112	20 %	40 %	40 %	0 %	159040654
81	NC_009954	TGCCT	2	10	76607	76616	0 %	40 %	20 %	40 %	159040654
82	NC_009954	TTCCC	2	10	78836	78845	0 %	40 %	0 %	60 %	159040656
83	NC_009954	ACCCT	2	10	79726	79735	20 %	20 %	0 %	60 %	159040657
84	NC_009954	TTACC	2	10	81175	81184	20 %	40 %	0 %	40 %	159040658
85	NC_009954	GTGAA	2	10	82180	82189	40 %	20 %	40 %	0 %	159040660
86	NC_009954	GGTGC	2	10	83136	83145	0 %	20 %	60 %	20 %	159040660
87	NC_009954	AGTGA	2	10	83683	83692	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009954	TTTAA	2	10	84327	84336	40 %	60 %	0 %	0 %	159040662
89	NC_009954	CTATA	2	10	84447	84456	40 %	40 %	0 %	20 %	159040662
90	NC_009954	CTGGG	2	10	85723	85732	0 %	20 %	60 %	20 %	159040664
91	NC_009954	TTCTC	2	10	87268	87277	0 %	60 %	0 %	40 %	159040665
92	NC_009954	CACTT	2	10	88885	88894	20 %	40 %	0 %	40 %	159040666
93	NC_009954	TTAAG	2	10	89010	89019	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009954	TAATC	2	10	90971	90980	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_009954	GTGAT	2	10	93309	93318	20 %	40 %	40 %	0 %	159040671
96	NC_009954	CTGAA	2	10	93387	93396	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_009954	GTATG	2	10	93547	93556	20 %	40 %	40 %	0 %	159040672
98	NC_009954	GGGTT	2	10	93645	93654	0 %	40 %	60 %	0 %	159040672
99	NC_009954	TAACT	2	10	99809	99818	40 %	40 %	0 %	20 %	159040676
100	NC_009954	GTGGG	2	10	101054	101063	0 %	20 %	80 %	0 %	159040676
101	NC_009954	TAACC	2	10	101661	101670	40 %	20 %	0 %	40 %	159040677
102	NC_009954	CATTA	2	10	102414	102423	40 %	40 %	0 %	20 %	159040677
103	NC_009954	ACTTC	2	10	103087	103096	20 %	40 %	0 %	40 %	159040678
104	NC_009954	GTTAA	2	10	103716	103725	40 %	40 %	20 %	0 %	159040678
105	NC_009954	CATTA	2	10	103805	103814	40 %	40 %	0 %	20 %	159040678
106	NC_009954	ATGTT	2	10	103834	103843	20 %	60 %	20 %	0 %	159040678
107	NC_009954	AGTAT	2	10	108841	108850	40 %	40 %	20 %	0 %	159040682
108	NC_009954	ATGCC	2	10	109725	109734	20 %	20 %	20 %	40 %	159040683
109	NC_009954	TACCT	2	10	109825	109834	20 %	40 %	0 %	40 %	159040684
110	NC_009954	ACCTT	2	10	110310	110319	20 %	40 %	0 %	40 %	159040684
111	NC_009954	TGGGT	2	10	110355	110364	0 %	40 %	60 %	0 %	159040684
112	NC_009954	ATTAA	2	10	111928	111937	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009954	ATTTA	2	10	115641	115650	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009954	AGTGG	2	10	116267	116276	20 %	20 %	60 %	0 %	159040690
115	NC_009954	CCTAC	2	10	118769	118778	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
116	NC_009954	TTAAT	2	10	122823	122832	40 %	60 %	0 %	0 %	159040696
117	NC_009954	TGACT	2	10	124488	124497	20 %	40 %	20 %	20 %	159040696
118	NC_009954	CTGCC	2	10	126063	126072	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
119	NC_009954	GACCC	2	10	127091	127100	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
120	NC_009954	CACGG	2	10	127348	127357	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_009954	CGAGC	2	10	129048	129057	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_009954	AGGGT	2	10	129549	129558	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009954	AGGTT	2	10	134620	134629	20 %	40 %	40 %	0 %	159040701
124	NC_009954	TTAAT	2	10	134950	134959	40 %	60 %	0 %	0 %	159040701
125	NC_009954	ACTTG	2	10	135080	135089	20 %	40 %	20 %	20 %	159040701
126	NC_009954	TCACC	2	10	137638	137647	20 %	20 %	0 %	60 %	159040704
127	NC_009954	TTACC	2	10	139396	139405	20 %	40 %	0 %	40 %	159040706
128	NC_009954	TAATC	2	10	140511	140520	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_009954	GAACA	2	10	141248	141257	60 %	0 %	20 %	20 %	159040707
130	NC_009954	TAGGT	2	10	141635	141644	20 %	40 %	40 %	0 %	159040707
131	NC_009954	ATATT	2	10	143551	143560	40 %	60 %	0 %	0 %	159040708
132	NC_009954	GTTGA	2	10	145406	145415	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009954	AGTAT	2	10	145575	145584	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009954	TTACC	2	10	146451	146460	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_009954	TAAGG	2	10	147135	147144	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009954	TCATT	2	10	147248	147257	20 %	60 %	0 %	20 %	159040713
137	NC_009954	ACGGC	2	10	147275	147284	20 %	0 %	40 %	40 %	159040713
138	NC_009954	TAACA	2	10	147825	147834	60 %	20 %	0 %	20 %	159040713
139	NC_009954	GGGTA	2	10	151668	151677	20 %	20 %	60 %	0 %	159040716
140	NC_009954	TACTT	2	10	151964	151973	20 %	60 %	0 %	20 %	159040716
141	NC_009954	ACCAC	2	10	156958	156967	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
142	NC_009954	TTAAT	2	10	157579	157588	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_009954	ACTGC	2	10	159292	159301	20 %	20 %	20 %	40 %	159040721
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148	NC_009954	CACTT	2	10	160931	160940	20 %	40 %	0 %	40 %	159040724
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151	NC_009954	AGGTT	2	10	164240	164249	20 %	40 %	40 %	0 %	159040726
152	NC_009954	AGTTA	2	10	165105	165114	40 %	40 %	20 %	0 %	159040727
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155	NC_009954	AAGGC	2	10	167428	167437	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
156	NC_009954	ACTAT	2	10	168902	168911	40 %	40 %	0 %	20 %	159040731
157	NC_009954	AGTTT	2	10	172153	172162	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
158	NC_009954	TGGGT	2	10	172596	172605	0 %	40 %	60 %	0 %	159040733
159	NC_009954	CCTCC	2	10	173772	173781	0 %	20 %	0 %	80 %	159040734
160	NC_009954	CTTAA	2	10	175666	175675	40 %	40 %	0 %	20 %	159040736
161	NC_009954	CAATA	2	10	179772	179781	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
162	NC_009954	TCACA	2	10	183335	183344	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
163	NC_009954	AATTA	2	10	184045	184054	60 %	40 %	0 %	0 %	159040743
164	NC_009954	CAATC	2	10	184962	184971	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
165	NC_009954	AACCC	2	10	186705	186714	40 %	0 %	0 %	60 %	159040747
166	NC_009954	TACAT	2	10	187680	187689	40 %	40 %	0 %	20 %	159040747
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169	NC_009954	TTAAT	2	10	188849	188858	40 %	60 %	0 %	0 %	159040748
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173	NC_009954	TAAGT	2	10	192255	192264	40 %	40 %	20 %	0 %	159040750
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177	NC_009954	TCATC	2	10	195587	195596	20 %	40 %	0 %	40 %	159040753
178	NC_009954	AATTA	2	10	196921	196930	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_009954	TACCC	2	10	227192	227201	20 %	20 %	0 %	60 %	159040777
198	NC_009954	ATGTT	2	10	231384	231393	20 %	60 %	20 %	0 %	159040780
199	NC_009954	TGGGT	2	10	236077	236086	0 %	40 %	60 %	0 %	159040783
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210	NC_009954	TAAGT	2	10	240606	240615	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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220	NC_009954	GTTAA	2	10	258115	258124	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
221	NC_009954	CATTA	2	10	260854	260863	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
222	NC_009954	CATTA	2	10	263355	263364	40 %	40 %	0 %	20 %	159040815
223	NC_009954	AAACC	2	10	263557	263566	60 %	0 %	0 %	40 %	159040815
224	NC_009954	TAATC	2	10	264174	264183	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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236	NC_009954	TCCTC	2	10	277692	277701	0 %	40 %	0 %	60 %	159040828
237	NC_009954	TCACT	2	10	278494	278503	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
238	NC_009954	GGTTA	2	10	279837	279846	20 %	40 %	40 %	0 %	159040831
239	NC_009954	GCGCC	2	10	280068	280077	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
240	NC_009954	CCTTA	2	10	280971	280980	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
241	NC_009954	GATTC	2	10	281853	281862	20 %	40 %	20 %	20 %	159040833
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243	NC_009954	TCAAC	2	10	285047	285056	40 %	20 %	0 %	40 %	159040836
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245	NC_009954	TCATA	2	10	290382	290391	40 %	40 %	0 %	20 %	159040840
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248	NC_009954	TTACC	2	10	296082	296091	20 %	40 %	0 %	40 %	159040845
249	NC_009954	TTAAG	2	10	296606	296615	40 %	40 %	20 %	0 %	159040846
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253	NC_009954	CTTAT	2	10	302764	302773	20 %	60 %	0 %	20 %	159040850
254	NC_009954	ACCTG	2	10	304933	304942	20 %	20 %	20 %	40 %	159040853
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258	NC_009954	GGTTA	2	10	307605	307614	20 %	40 %	40 %	0 %	159040855
259	NC_009954	GGTGC	2	10	309737	309746	0 %	20 %	60 %	20 %	159040858
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261	NC_009954	AGGAG	2	10	312219	312228	40 %	0 %	60 %	0 %	159040860
262	NC_009954	ACTCA	2	10	312972	312981	40 %	20 %	0 %	40 %	159040860
263	NC_009954	AAGGC	2	10	313387	313396	40 %	0 %	40 %	20 %	159040861
264	NC_009954	GTTAT	2	10	314801	314810	20 %	60 %	20 %	0 %	159040863
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266	NC_009954	TGGTT	2	10	316004	316013	0 %	60 %	40 %	0 %	159040864
267	NC_009954	CCTTA	2	10	319150	319159	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
268	NC_009954	AGAGG	2	10	319658	319667	40 %	0 %	60 %	0 %	159040867
269	NC_009954	AGCCC	2	10	319846	319855	20 %	0 %	20 %	60 %	159040867
270	NC_009954	CCTAA	2	10	320671	320680	40 %	20 %	0 %	40 %	159040868
271	NC_009954	TTAAC	2	10	321239	321248	40 %	40 %	0 %	20 %	159040868
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397	NC_009954	TAACC	2	10	485277	485286	40 %	20 %	0 %	40 %	159041032
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399	NC_009954	GCTTG	2	10	486320	486329	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
400	NC_009954	TAATG	2	10	489109	489118	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_009954	CTCCA	2	10	491675	491684	20 %	20 %	0 %	60 %	159041037
404	NC_009954	TAAAC	2	10	491862	491871	60 %	20 %	0 %	20 %	159041037
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420	NC_009954	TTACC	2	10	512712	512721	20 %	40 %	0 %	40 %	159041056
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433	NC_009954	TTAAG	2	10	534130	534139	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_009954	TTACT	2	10	544027	544036	20 %	60 %	0 %	20 %	159041090
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450	NC_009954	TGGCT	2	10	552846	552855	0 %	40 %	40 %	20 %	159041102
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489	NC_009954	GTTAA	2	10	591616	591625	40 %	40 %	20 %	0 %	159041138
490	NC_009954	AAGTA	2	10	592788	592797	60 %	20 %	20 %	0 %	159041138
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497	NC_009954	GCCTC	2	10	598420	598429	0 %	20 %	20 %	60 %	159041145
498	NC_009954	TAATT	2	10	599779	599788	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_009954	ATTCA	2	10	600035	600044	40 %	40 %	0 %	20 %	159041148
500	NC_009954	ATATT	2	10	602296	602305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

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