MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 chromosome

Total Repeats: 8467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009952	TGCG	2	8	1040	1047	0 %	25 %	50 %	25 %	159042557
2	NC_009952	TGGC	2	8	1833	1840	0 %	25 %	50 %	25 %	159042558
3	NC_009952	GGGC	2	8	2008	2015	0 %	0 %	75 %	25 %	159042558
4	NC_009952	TGGC	2	8	2198	2205	0 %	25 %	50 %	25 %	159042558
5	NC_009952	GTGG	2	8	3140	3147	0 %	25 %	75 %	0 %	159042558
6	NC_009952	CGAT	2	8	3406	3413	25 %	25 %	25 %	25 %	159042558
7	NC_009952	GCTG	2	8	3763	3770	0 %	25 %	50 %	25 %	159042558
8	NC_009952	GCGG	2	8	3809	3816	0 %	0 %	75 %	25 %	159042558
9	NC_009952	CGAC	2	8	5869	5876	25 %	0 %	25 %	50 %	159042558
10	NC_009952	CGGG	2	8	5898	5905	0 %	0 %	75 %	25 %	159042558
11	NC_009952	GAAG	2	8	6436	6443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009952	CAAA	2	8	6488	6495	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009952	AAGG	2	8	6632	6639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009952	TCGA	2	8	7117	7124	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009952	CTTG	2	8	8093	8100	0 %	50 %	25 %	25 %	159042560
16	NC_009952	GTTG	2	8	8278	8285	0 %	50 %	50 %	0 %	159042561
17	NC_009952	GGCG	2	8	8446	8453	0 %	0 %	75 %	25 %	159042561
18	NC_009952	GGCC	2	8	9555	9562	0 %	0 %	50 %	50 %	159042562
19	NC_009952	CAAC	2	8	10202	10209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009952	CATG	2	8	10740	10747	25 %	25 %	25 %	25 %	159042564
21	NC_009952	CAGA	2	8	10953	10960	50 %	0 %	25 %	25 %	159042564
22	NC_009952	CAGC	2	8	11262	11269	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009952	AAGC	2	8	12092	12099	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009952	TCGG	2	8	12725	12732	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009952	GACC	2	8	13131	13138	25 %	0 %	25 %	50 %	159042568
26	NC_009952	CCGT	2	8	13171	13178	0 %	25 %	25 %	50 %	159042568
27	NC_009952	GATG	2	8	13593	13600	25 %	25 %	50 %	0 %	159042568
28	NC_009952	ACCG	2	8	13990	13997	25 %	0 %	25 %	50 %	159042568
29	NC_009952	ATGG	2	8	14649	14656	25 %	25 %	50 %	0 %	159042569
30	NC_009952	GGGC	2	8	14951	14958	0 %	0 %	75 %	25 %	159042570
31	NC_009952	GGAT	2	8	15470	15477	25 %	25 %	50 %	0 %	159042571
32	NC_009952	CCCG	2	8	15523	15530	0 %	0 %	25 %	75 %	159042571
33	NC_009952	GGGC	2	8	15933	15940	0 %	0 %	75 %	25 %	159042571
34	NC_009952	CGGG	2	8	16100	16107	0 %	0 %	75 %	25 %	159042571
35	NC_009952	CCCG	2	8	16254	16261	0 %	0 %	25 %	75 %	159042571
36	NC_009952	CCGA	2	8	16630	16637	25 %	0 %	25 %	50 %	159042571
37	NC_009952	ACGC	2	8	16878	16885	25 %	0 %	25 %	50 %	159042571
38	NC_009952	CGAC	2	8	17902	17909	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009952	GCCC	2	8	18272	18279	0 %	0 %	25 %	75 %	159042572
40	NC_009952	CTGC	2	8	18305	18312	0 %	25 %	25 %	50 %	159042572
41	NC_009952	CCGA	2	8	18869	18876	25 %	0 %	25 %	50 %	159042572
42	NC_009952	GCCG	2	8	18955	18962	0 %	0 %	50 %	50 %	159042572
43	NC_009952	GGGC	2	8	19064	19071	0 %	0 %	75 %	25 %	159042572
44	NC_009952	CCGG	2	8	19085	19092	0 %	0 %	50 %	50 %	159042572
45	NC_009952	CGGG	2	8	19200	19207	0 %	0 %	75 %	25 %	159042572
46	NC_009952	CTCG	2	8	19396	19403	0 %	25 %	25 %	50 %	159042572
47	NC_009952	GGGC	2	8	20034	20041	0 %	0 %	75 %	25 %	159042573
48	NC_009952	GGTT	2	8	20190	20197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009952	CGGG	2	8	20299	20306	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009952	GGTC	2	8	21003	21010	0 %	25 %	50 %	25 %	159042574
51	NC_009952	GGGC	2	8	21013	21020	0 %	0 %	75 %	25 %	159042574
52	NC_009952	CGTC	2	8	21045	21052	0 %	25 %	25 %	50 %	159042574
53	NC_009952	GCGG	2	8	21265	21272	0 %	0 %	75 %	25 %	159042574
54	NC_009952	CTGG	2	8	21841	21848	0 %	25 %	50 %	25 %	159042574
55	NC_009952	CATG	2	8	21858	21865	25 %	25 %	25 %	25 %	159042574
56	NC_009952	GGCG	2	8	23675	23682	0 %	0 %	75 %	25 %	159042575
57	NC_009952	CCCG	2	8	24016	24023	0 %	0 %	25 %	75 %	159042575
58	NC_009952	CCGG	2	8	24162	24169	0 %	0 %	50 %	50 %	159042575
59	NC_009952	GGGC	2	8	24319	24326	0 %	0 %	75 %	25 %	159042575
60	NC_009952	GTCC	2	8	25102	25109	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009952	TGGG	2	8	25229	25236	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009952	TCGC	2	8	25442	25449	0 %	25 %	25 %	50 %	159042576
63	NC_009952	CTGT	2	8	25852	25859	0 %	50 %	25 %	25 %	159042576
64	NC_009952	GCCT	2	8	26820	26827	0 %	25 %	25 %	50 %	159042578
65	NC_009952	CCTG	2	8	26863	26870	0 %	25 %	25 %	50 %	159042578
66	NC_009952	CTGC	2	8	26918	26925	0 %	25 %	25 %	50 %	159042578
67	NC_009952	GCGG	2	8	26970	26977	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009952	ATGG	2	8	27491	27498	25 %	25 %	50 %	0 %	159042579
69	NC_009952	CCGG	2	8	27871	27878	0 %	0 %	50 %	50 %	159042580
70	NC_009952	CTGG	2	8	27958	27965	0 %	25 %	50 %	25 %	159042580
71	NC_009952	GGCG	2	8	28288	28295	0 %	0 %	75 %	25 %	159042580
72	NC_009952	CGGG	2	8	28617	28624	0 %	0 %	75 %	25 %	159042580
73	NC_009952	GCCT	2	8	28884	28891	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009952	GCTG	2	8	29711	29718	0 %	25 %	50 %	25 %	159042581
75	NC_009952	GCCT	2	8	31109	31116	0 %	25 %	25 %	50 %	159042583
76	NC_009952	CCGC	2	8	31192	31199	0 %	0 %	25 %	75 %	159042583
77	NC_009952	GCGG	2	8	31769	31776	0 %	0 %	75 %	25 %	159042583
78	NC_009952	GCGG	2	8	31933	31940	0 %	0 %	75 %	25 %	159042584
79	NC_009952	GGCG	2	8	32388	32395	0 %	0 %	75 %	25 %	159042584
80	NC_009952	CGGT	2	8	32689	32696	0 %	25 %	50 %	25 %	159042584
81	NC_009952	TCGC	2	8	32887	32894	0 %	25 %	25 %	50 %	159042584
82	NC_009952	AGCG	2	8	32983	32990	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009952	CCAG	2	8	33586	33593	25 %	0 %	25 %	50 %	159042586
84	NC_009952	CGGG	2	8	33983	33990	0 %	0 %	75 %	25 %	159042586
85	NC_009952	TGCC	2	8	34019	34026	0 %	25 %	25 %	50 %	159042586
86	NC_009952	CGGC	2	8	34336	34343	0 %	0 %	50 %	50 %	159042587
87	NC_009952	GGGT	2	8	34452	34459	0 %	25 %	75 %	0 %	159042587
88	NC_009952	GGGC	2	8	35116	35123	0 %	0 %	75 %	25 %	159042587
89	NC_009952	CGGG	2	8	35227	35234	0 %	0 %	75 %	25 %	159042587
90	NC_009952	AGGA	2	8	35855	35862	50 %	0 %	50 %	0 %	159042588
91	NC_009952	CTTC	2	8	35901	35908	0 %	50 %	0 %	50 %	159042588
92	NC_009952	GCTC	2	8	36132	36139	0 %	25 %	25 %	50 %	159042588
93	NC_009952	GGCC	2	8	37835	37842	0 %	0 %	50 %	50 %	159042591
94	NC_009952	CTGG	2	8	38385	38392	0 %	25 %	50 %	25 %	159042591
95	NC_009952	TGTC	2	8	38469	38476	0 %	50 %	25 %	25 %	159042591
96	NC_009952	GGCG	2	8	39078	39085	0 %	0 %	75 %	25 %	159042592
97	NC_009952	CGGA	2	8	39311	39318	25 %	0 %	50 %	25 %	159042592
98	NC_009952	GGGC	2	8	40116	40123	0 %	0 %	75 %	25 %	159042593
99	NC_009952	TGCG	2	8	40420	40427	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009952	AGGG	2	8	41246	41253	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009952	GCGG	2	8	41546	41553	0 %	0 %	75 %	25 %	159042595
102	NC_009952	GGGC	2	8	42007	42014	0 %	0 %	75 %	25 %	159042595
103	NC_009952	GGCC	2	8	42347	42354	0 %	0 %	50 %	50 %	159042595
104	NC_009952	CGGG	2	8	42740	42747	0 %	0 %	75 %	25 %	159042597
105	NC_009952	GGCG	2	8	42961	42968	0 %	0 %	75 %	25 %	159042597
106	NC_009952	GGGC	2	8	43027	43034	0 %	0 %	75 %	25 %	159042597
107	NC_009952	GGGC	2	8	43068	43075	0 %	0 %	75 %	25 %	159042597
108	NC_009952	GCTG	2	8	43114	43121	0 %	25 %	50 %	25 %	159042597
109	NC_009952	GCGG	2	8	43280	43287	0 %	0 %	75 %	25 %	159042598
110	NC_009952	GCCT	2	8	43418	43425	0 %	25 %	25 %	50 %	159042598
111	NC_009952	CGGC	2	8	43761	43768	0 %	0 %	50 %	50 %	159042598
112	NC_009952	GCGG	2	8	43772	43779	0 %	0 %	75 %	25 %	159042598
113	NC_009952	TCAA	2	8	43885	43892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009952	TCGG	2	8	44726	44733	0 %	25 %	50 %	25 %	159042599
115	NC_009952	CCGG	2	8	46052	46059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009952	CGGG	2	8	46124	46131	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009952	TGTT	2	8	46626	46633	0 %	75 %	25 %	0 %	159042602
118	NC_009952	GCCG	2	8	46911	46918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009952	CAGG	2	8	46956	46963	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009952	TCTT	2	8	47010	47017	0 %	75 %	0 %	25 %	159042603
121	NC_009952	CATC	2	8	47530	47537	25 %	25 %	0 %	50 %	159042604
122	NC_009952	CGCC	2	8	48376	48383	0 %	0 %	25 %	75 %	159042604
123	NC_009952	GTAT	2	8	48507	48514	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009952	TTTA	2	8	49035	49042	25 %	75 %	0 %	0 %	159042606
125	NC_009952	GCGG	2	8	49885	49892	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009952	TGGC	2	8	50177	50184	0 %	25 %	50 %	25 %	159042609
127	NC_009952	TGGC	2	8	50315	50322	0 %	25 %	50 %	25 %	159042609
128	NC_009952	GCGG	2	8	50431	50438	0 %	0 %	75 %	25 %	159042609
129	NC_009952	GCCC	2	8	52710	52717	0 %	0 %	25 %	75 %	159042611
130	NC_009952	GGTC	2	8	52930	52937	0 %	25 %	50 %	25 %	159042612
131	NC_009952	GCGG	2	8	53694	53701	0 %	0 %	75 %	25 %	159042613
132	NC_009952	CGGG	2	8	54346	54353	0 %	0 %	75 %	25 %	159042613
133	NC_009952	GCGG	2	8	55821	55828	0 %	0 %	75 %	25 %	159042613
134	NC_009952	CGGG	2	8	56001	56008	0 %	0 %	75 %	25 %	159042614
135	NC_009952	GCGG	2	8	56585	56592	0 %	0 %	75 %	25 %	159042614
136	NC_009952	GGTG	2	8	56991	56998	0 %	25 %	75 %	0 %	159042615
137	NC_009952	GGGC	2	8	58224	58231	0 %	0 %	75 %	25 %	159042615
138	NC_009952	GGGC	2	8	58718	58725	0 %	0 %	75 %	25 %	159042615
139	NC_009952	GACC	2	8	59070	59077	25 %	0 %	25 %	50 %	159042615
140	NC_009952	CCGC	2	8	59380	59387	0 %	0 %	25 %	75 %	159042615
141	NC_009952	CTGG	2	8	59497	59504	0 %	25 %	50 %	25 %	159042615
142	NC_009952	CCCG	2	8	59595	59602	0 %	0 %	25 %	75 %	159042615
143	NC_009952	CGGG	2	8	59654	59661	0 %	0 %	75 %	25 %	159042615
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