MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 chromosome

Total Repeats: 55481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009952	CGA	2	6	214	219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042557
2	NC_009952	GCC	2	6	236	241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042557
3	NC_009952	GCC	2	6	248	253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042557
4	NC_009952	CAA	2	6	316	321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159042557
5	NC_009952	CCG	2	6	345	350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042557
6	NC_009952	CCA	2	6	387	392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042557
7	NC_009952	CAT	2	6	583	588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042557
8	NC_009952	GCG	3	9	611	619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042557
9	NC_009952	TGC	2	6	624	629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042557
10	NC_009952	GCC	2	6	630	635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042557
11	NC_009952	GGC	2	6	677	682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042557
12	NC_009952	CTG	2	6	683	688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042557
13	NC_009952	ACG	2	6	828	833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042557
14	NC_009952	GCG	2	6	975	980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042557
15	NC_009952	GTC	2	6	1007	1012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042557
16	NC_009952	CGG	3	9	1015	1023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042557
17	NC_009952	AGG	2	6	1146	1151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159042557
18	NC_009952	AGA	2	6	1224	1229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159042557
19	NC_009952	GCC	2	6	1257	1262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042557
20	NC_009952	TCA	2	6	1314	1319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042557
21	NC_009952	GCG	2	6	1445	1450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042557
22	NC_009952	TGG	2	6	1476	1481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042557
23	NC_009952	GCC	2	6	1508	1513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042557
24	NC_009952	GCC	3	9	1806	1814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042558
25	NC_009952	AAG	2	6	1864	1869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159042558
26	NC_009952	CTC	2	6	1874	1879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159042558
27	NC_009952	GCG	2	6	1882	1887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042558
28	NC_009952	TTC	2	6	2040	2045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159042558
29	NC_009952	ATC	2	6	2274	2279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042558
30	NC_009952	CCG	3	9	2336	2344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042558
31	NC_009952	GGC	5	15	2354	2368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042558
32	NC_009952	ATC	2	6	2412	2417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042558
33	NC_009952	ATG	2	6	2427	2432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042558
34	NC_009952	CCA	2	6	2518	2523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042558
35	NC_009952	GTG	2	6	2537	2542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042558
36	NC_009952	CGG	2	6	2641	2646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042558
37	NC_009952	ATC	2	6	2679	2684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042558
38	NC_009952	TCG	2	6	2694	2699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042558
39	NC_009952	CGG	2	6	2704	2709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042558
40	NC_009952	CTG	2	6	2772	2777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042558
41	NC_009952	GTG	2	6	2952	2957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042558
42	NC_009952	GGC	2	6	3079	3084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042558
43	NC_009952	CGG	2	6	3235	3240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042558
44	NC_009952	GAG	2	6	3252	3257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159042558
45	NC_009952	CGA	2	6	3317	3322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042558
46	NC_009952	CGC	2	6	3325	3330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042558
47	NC_009952	TTC	2	6	3369	3374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159042558
48	NC_009952	TGA	2	6	3433	3438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042558
49	NC_009952	CGG	2	6	3598	3603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042558
50	NC_009952	ATT	2	6	3835	3840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159042558
51	NC_009952	GCT	2	6	3923	3928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042558
52	NC_009952	GTT	2	6	3983	3988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159042558
53	NC_009952	TCG	2	6	4023	4028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042558
54	NC_009952	TGG	2	6	4075	4080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042558
55	NC_009952	GAC	2	6	4124	4129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042558
56	NC_009952	TGC	2	6	4189	4194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042558
57	NC_009952	CGG	2	6	4199	4204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042558
58	NC_009952	CGG	2	6	4218	4223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042558
59	NC_009952	GGC	2	6	4271	4276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042558
60	NC_009952	TCC	2	6	4287	4292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159042558
61	NC_009952	CCG	2	6	4335	4340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042558
62	NC_009952	CTG	2	6	4356	4361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042558
63	NC_009952	CGC	2	6	4369	4374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042558
64	NC_009952	GAG	2	6	4395	4400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159042558
65	NC_009952	GCG	2	6	4525	4530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042558
66	NC_009952	GGA	2	6	4538	4543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159042558
67	NC_009952	CCG	2	6	4627	4632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042558
68	NC_009952	GAG	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159042558
69	NC_009952	CGC	3	9	4777	4785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042558
70	NC_009952	TGG	2	6	4873	4878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042558
71	NC_009952	CGT	2	6	4879	4884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042558
72	NC_009952	CGC	2	6	4901	4906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042558
73	NC_009952	GGC	2	6	4956	4961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042558
74	NC_009952	AAC	2	6	5049	5054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159042558
75	NC_009952	CAT	2	6	5180	5185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042558
76	NC_009952	GAG	2	6	5238	5243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159042558
77	NC_009952	GGT	2	6	5276	5281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042558
78	NC_009952	AGG	2	6	5305	5310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159042558
79	NC_009952	CGC	2	6	5324	5329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042558
80	NC_009952	GCT	2	6	5429	5434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042558
81	NC_009952	GCA	2	6	5453	5458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042558
82	NC_009952	CAA	2	6	5474	5479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159042558
83	NC_009952	GGT	3	9	5789	5797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042558
84	NC_009952	CGC	2	6	5815	5820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042558
85	NC_009952	ATC	2	6	5841	5846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042558
86	NC_009952	CGC	2	6	5888	5893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042558
87	NC_009952	GGT	2	6	5939	5944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042558
88	NC_009952	CGG	2	6	5984	5989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042558
89	NC_009952	ATG	2	6	6087	6092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042558
90	NC_009952	GCC	2	6	6195	6200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042558
91	NC_009952	GCA	2	6	6209	6214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042558
92	NC_009952	CGC	2	6	6280	6285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042558
93	NC_009952	CGG	2	6	6310	6315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042558
94	NC_009952	CGG	2	6	7275	7280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042560
95	NC_009952	CGG	2	6	7337	7342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042560
96	NC_009952	TCC	3	9	7369	7377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159042560
97	NC_009952	TGA	2	6	7412	7417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042560
98	NC_009952	AAC	2	6	7498	7503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159042560
99	NC_009952	GCC	2	6	7521	7526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042560
100	NC_009952	GCA	2	6	7643	7648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042560
101	NC_009952	CGC	2	6	7670	7675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042560
102	NC_009952	CGC	2	6	7721	7726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042560
103	NC_009952	CCT	2	6	7799	7804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159042560
104	NC_009952	GTC	2	6	7995	8000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042560
105	NC_009952	CGG	2	6	8054	8059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042560
106	NC_009952	TGG	2	6	8071	8076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042560
107	NC_009952	GTC	2	6	8103	8108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042560
108	NC_009952	GTG	2	6	8334	8339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042561
109	NC_009952	GAT	2	6	8355	8360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042561
110	NC_009952	GCG	2	6	8385	8390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042561
111	NC_009952	CCG	2	6	8454	8459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042561
112	NC_009952	CCG	2	6	8485	8490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042561
113	NC_009952	GCG	2	6	8532	8537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042561
114	NC_009952	GAT	2	6	8546	8551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042561
115	NC_009952	GCG	2	6	8598	8603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042561
116	NC_009952	GCC	2	6	8618	8623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042561
117	NC_009952	GCC	2	6	8649	8654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042561
118	NC_009952	CCG	2	6	8659	8664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042561
119	NC_009952	AGC	2	6	8665	8670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042561
120	NC_009952	GGC	2	6	8672	8677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042561
121	NC_009952	TGC	2	6	8722	8727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042561
122	NC_009952	GGC	2	6	8740	8745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042561
123	NC_009952	GAC	2	6	8862	8867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042561
124	NC_009952	GCC	2	6	9061	9066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042562
125	NC_009952	CCA	2	6	9095	9100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042562
126	NC_009952	AAG	2	6	9211	9216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159042562
127	NC_009952	TGC	2	6	9221	9226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042562
128	NC_009952	GGC	2	6	9262	9267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042562
129	NC_009952	GCG	2	6	9275	9280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042562
130	NC_009952	TGG	2	6	9283	9288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042562
131	NC_009952	GCG	2	6	9323	9328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042562
132	NC_009952	GTG	2	6	9367	9372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042562
133	NC_009952	GTG	2	6	9400	9405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042562
134	NC_009952	GCG	2	6	9518	9523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042562
135	NC_009952	CGG	2	6	9531	9536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042562
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257	NC_009952	CCG	2	6	19152	19157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042572
258	NC_009952	AAG	2	6	19262	19267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159042572
259	NC_009952	CTG	2	6	19280	19285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042572
260	NC_009952	ATC	2	6	19322	19327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042572
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