MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfococcus oleovorans Hxd3 chromosome

Total Repeats: 491

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009943	TTTTA	2	10	7	16	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009943	AATTT	2	10	1520	1529	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009943	TCCAG	2	10	17855	17864	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_009943	GTTAT	2	10	18655	18664	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009943	GTTTT	2	10	42710	42719	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009943	CCGGC	2	10	42750	42759	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_009943	TAGTA	2	10	42792	42801	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009943	CGGTG	2	10	54808	54817	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009943	CAATC	2	10	60011	60020	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009943	CCCGG	2	10	69881	69890	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_009943	CTCTC	2	10	71327	71336	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NC_009943	CCGTG	2	10	71667	71676	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009943	CAAAG	2	10	71767	71776	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009943	CCCGC	2	10	80359	80368	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15	NC_009943	AACGG	2	10	88630	88639	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009943	ATCCC	2	10	102868	102877	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_009943	AAGGC	2	10	112517	112526	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009943	CAGAA	2	10	121106	121115	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009943	CATTG	2	10	121336	121345	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009943	AACCG	2	10	143129	143138	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009943	GCTTC	2	10	162845	162854	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_009943	TTTAC	2	10	205723	205732	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009943	GTCAA	2	10	207039	207048	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009943	TTTAT	2	10	208820	208829	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009943	GCCCG	2	10	237119	237128	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_009943	GGACC	2	10	253870	253879	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_009943	GAAAA	2	10	257838	257847	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009943	GTTTT	2	10	272089	272098	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009943	CACCT	2	10	273223	273232	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_009943	TCGGG	2	10	292039	292048	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009943	CTAAA	2	10	303837	303846	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009943	GAAAA	2	10	305647	305656	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009943	ACTAT	2	10	312147	312156	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009943	TGATG	2	10	325335	325344	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009943	GAAAG	2	10	331114	331123	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009943	CAATA	2	10	331184	331193	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009943	TCGCT	2	10	337712	337721	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_009943	CGCCA	2	10	339265	339274	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_009943	GCTGC	2	10	339388	339397	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_009943	TTATG	2	10	342447	342456	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009943	ACATT	2	10	355960	355969	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009943	ACCGA	2	10	358760	358769	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_009943	GCAGC	2	10	358852	358861	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_009943	GTCAT	2	10	361958	361967	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_009943	GCTTC	2	10	364464	364473	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_009943	ATTAA	2	10	383225	383234	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009943	GCTGC	2	10	385593	385602	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_009943	AGCCG	2	10	388067	388076	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_009943	GGGCC	2	10	388808	388817	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_009943	TGCGC	2	10	390267	390276	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_009943	AACCC	2	10	407382	407391	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
52	NC_009943	TCGCT	2	10	408663	408672	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_009943	GCAGC	2	10	439223	439232	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_009943	AGCGA	2	10	439276	439285	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009943	GAAAC	2	10	441182	441191	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_009943	AATAA	2	10	450258	450267	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009943	GGCAA	2	10	459993	460002	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_009943	GAAGC	2	10	463876	463885	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009943	GCTTC	2	10	463920	463929	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_009943	AAATT	2	10	474348	474357	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009943	AAAAC	2	10	477801	477810	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009943	AGAAT	2	10	483797	483806	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009943	TCCCT	2	10	489972	489981	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
64	NC_009943	TAAAT	2	10	490444	490453	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009943	TGCGC	2	10	510694	510703	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_009943	TTATT	2	10	512975	512984	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009943	GGTAG	2	10	517884	517893	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009943	CAAAA	2	10	522993	523002	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009943	TTGGT	2	10	523907	523916	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009943	CCGGG	2	10	525775	525784	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
71	NC_009943	CCGGC	2	10	538850	538859	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
72	NC_009943	ATATT	2	10	551965	551974	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009943	GGCCG	2	10	561974	561983	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
74	NC_009943	CCCGG	2	10	566016	566025	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
75	NC_009943	GCTGC	2	10	566333	566342	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_009943	GCCCT	2	10	618698	618707	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_009943	AATTT	2	10	624215	624224	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009943	TGCGC	2	10	625344	625353	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_009943	TGCCT	2	10	631129	631138	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_009943	TGCCG	2	10	631361	631370	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_009943	TTTTC	2	10	635720	635729	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009943	TTGGA	2	10	640048	640057	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009943	GCTGC	2	10	640453	640462	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_009943	AAACG	2	10	645179	645188	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_009943	AGTCA	2	10	665576	665585	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_009943	TCGTG	2	10	682002	682011	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009943	GAAAA	2	10	683327	683336	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009943	GAAAT	2	10	684376	684385	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009943	GAAGA	2	10	684454	684463	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009943	ATATT	2	10	689062	689071	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009943	TTTGA	2	10	689148	689157	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009943	TCCTT	2	10	740790	740799	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_009943	GCAAG	2	10	758199	758208	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_009943	CCGCC	2	10	780709	780718	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
95	NC_009943	AAAAC	2	10	780860	780869	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_009943	CCGGT	2	10	782093	782102	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_009943	AAGAA	2	10	783588	783597	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009943	GCTGC	2	10	784489	784498	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_009943	GCAGC	2	10	787436	787445	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_009943	GCTTC	2	10	787695	787704	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_009943	CGATT	2	10	788558	788567	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_009943	CGGGC	2	10	790106	790115	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
103	NC_009943	CTATT	2	10	791234	791243	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_009943	ATAAA	2	10	796159	796168	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009943	CCTTT	2	10	799947	799956	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_009943	CGCTC	2	10	801139	801148	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
107	NC_009943	AGCGC	2	10	808012	808021	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_009943	AAAAG	2	10	811630	811639	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009943	TTATT	2	10	812467	812476	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009943	ATTAT	2	10	823846	823855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009943	CATGC	2	10	829476	829485	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_009943	CCGCA	2	10	855903	855912	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
113	NC_009943	TCTTT	2	10	860177	860186	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_009943	AAAAG	2	10	872665	872674	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009943	AAAAG	2	10	911127	911136	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009943	CAGGG	2	10	911227	911236	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009943	TCGGA	2	10	931905	931914	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_009943	TCTGG	2	10	932190	932199	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_009943	CAGCG	2	10	934463	934472	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_009943	TCGCT	2	10	934550	934559	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_009943	AATAA	2	10	943984	943993	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009943	GACAC	2	10	974320	974329	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_009943	GGGAG	2	10	975241	975250	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009943	CGGAC	2	10	1000598	1000607	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_009943	CCCCT	2	10	1001918	1001927	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
126	NC_009943	GGAAA	2	10	1009286	1009295	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009943	GTTTT	2	10	1014892	1014901	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009943	GCCGG	2	10	1031814	1031823	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
129	NC_009943	GGCCG	2	10	1040381	1040390	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
130	NC_009943	TCCCC	2	10	1043052	1043061	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
131	NC_009943	GAGAA	2	10	1055419	1055428	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009943	CACCC	2	10	1073659	1073668	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
133	NC_009943	TTTAA	2	10	1082026	1082035	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009943	GCGCA	2	10	1100697	1100706	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_009943	TCAGT	2	10	1115411	1115420	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_009943	GCCGG	2	10	1117314	1117323	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
137	NC_009943	CGGCC	2	10	1119360	1119369	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138	NC_009943	AATTT	2	10	1123538	1123547	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009943	AGTTA	2	10	1125113	1125122	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009943	TCATA	2	10	1134490	1134499	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_009943	GCCGG	2	10	1138169	1138178	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
142	NC_009943	TCCCT	2	10	1168773	1168782	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
143	NC_009943	TAATT	2	10	1176908	1176917	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009943	TTCCC	2	10	1203075	1203084	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
145	NC_009943	GCAGC	2	10	1211284	1211293	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_009943	ATAAG	2	10	1239783	1239792	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009943	TATTT	2	10	1252519	1252528	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_009943	TGCCC	2	10	2228480	2228489	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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270	NC_009943	GCTTC	2	10	2244611	2244620	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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273	NC_009943	CGTTA	2	10	2254093	2254102	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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287	NC_009943	ATTTT	2	10	2358716	2358725	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_009943	AAAAT	2	10	2363136	2363145	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_009943	TGGCG	2	10	3417131	3417140	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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459	NC_009943	CTTTT	2	10	3667106	3667115	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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463	NC_009943	GGACC	2	10	3677241	3677250	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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465	NC_009943	CAATT	2	10	3679497	3679506	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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471	NC_009943	AAATA	2	10	3746918	3746927	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_009943	GCTGC	2	10	3829775	3829784	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
481	NC_009943	CTCGT	2	10	3845551	3845560	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
482	NC_009943	CATTA	2	10	3845788	3845797	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
483	NC_009943	TCGGC	2	10	3854925	3854934	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
484	NC_009943	CCCTT	2	10	3866241	3866250	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
485	NC_009943	GCTGC	2	10	3866676	3866685	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
486	NC_009943	GCTTC	2	10	3889632	3889641	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
487	NC_009943	GCTTC	2	10	3889673	3889682	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
488	NC_009943	GCTTC	2	10	3893032	3893041	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
489	NC_009943	ACCCA	2	10	3893395	3893404	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
490	NC_009943	TGATA	2	10	3921112	3921121	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
491	NC_009943	ACATC	2	10	3930694	3930703	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.