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Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfococcus oleovorans Hxd3 chromosome

Total Repeats: 1393

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009943	TAAA	2	8	11880	11887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009943	TGGA	2	8	11983	11990	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009943	CCCG	2	8	17007	17014	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_009943	CTGA	2	8	17907	17914	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009943	ATGG	2	8	17984	17991	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009943	AAAC	2	8	18760	18767	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009943	CGGC	2	8	24330	24337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009943	CCGG	2	8	24550	24557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009943	TCCT	2	8	28549	28556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009943	CGGC	2	8	28641	28648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009943	CGGC	2	8	36143	36150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009943	CGCA	2	8	38760	38767	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009943	CAAC	2	8	42921	42928	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009943	CTGA	2	8	54142	54149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009943	ATGG	2	8	54219	54226	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009943	CGGT	2	8	54697	54704	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009943	TCTT	2	8	59298	59305	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009943	CCGG	2	8	60953	60960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009943	TTTA	2	8	62392	62399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009943	TGAA	2	8	62499	62506	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009943	CAGA	2	8	67156	67163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009943	GCGA	2	8	71347	71354	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009943	CGCC	2	8	71509	71516	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_009943	TTGA	2	8	71890	71897	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009943	GAGT	2	8	72013	72020	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009943	TCCA	2	8	74142	74149	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009943	GCTT	2	8	74189	74196	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009943	GATG	2	8	74302	74309	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009943	CGGC	2	8	74562	74569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009943	AAAC	2	8	74702	74709	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009943	CGGC	2	8	74768	74775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009943	CGGC	2	8	74933	74940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009943	GGCG	2	8	74991	74998	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009943	GCTC	2	8	75830	75837	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009943	GGCC	2	8	77403	77410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009943	GGAA	2	8	77447	77454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009943	GCAG	2	8	77470	77477	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009943	CGGC	2	8	81499	81506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009943	GTAT	2	8	85644	85651	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009943	TTAT	2	8	88670	88677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009943	CGGC	2	8	92704	92711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009943	ACAA	2	8	94323	94330	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009943	TTTA	2	8	94339	94346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009943	CCGG	2	8	95533	95540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009943	TTTA	2	8	102901	102908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009943	TTTA	2	8	103053	103060	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009943	CTTT	2	8	121045	121052	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009943	AAAG	2	8	121201	121208	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009943	TCCA	2	8	122772	122779	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009943	GATG	2	8	122935	122942	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009943	TCCA	2	8	126169	126176	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009943	AAAG	2	8	126581	126588	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009943	TGCG	2	8	131376	131383	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009943	GGCC	2	8	131437	131444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009943	GAAT	2	8	131468	131475	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009943	CCGC	2	8	137575	137582	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_009943	AAAC	2	8	137727	137734	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009943	TAAT	2	8	138965	138972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009943	TAAA	2	8	139467	139474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009943	TTTA	2	8	139602	139609	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009943	CGGG	2	8	140743	140750	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009943	CAAT	2	8	142972	142979	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009943	AAAT	2	8	143041	143048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009943	CAGA	2	8	145947	145954	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009943	TTAT	2	8	150101	150108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009943	GCAG	2	8	152867	152874	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009943	GCAA	2	8	153312	153319	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009943	GTTC	2	8	154506	154513	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009943	GCCC	2	8	155187	155194	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_009943	CAGG	2	8	155231	155238	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009943	GATG	2	8	158926	158933	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009943	TCAA	2	8	162750	162757	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009943	GCAG	2	8	164787	164794	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009943	TCGA	2	8	169228	169235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009943	CGAC	2	8	169412	169419	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009943	CTAT	2	8	169545	169552	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009943	TTCA	2	8	169675	169682	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009943	TCTT	2	8	175702	175709	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009943	CATC	2	8	182054	182061	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009943	CCGG	2	8	193639	193646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009943	GGCT	2	8	194305	194312	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009943	CAAT	2	8	195074	195081	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009943	TCAG	2	8	195180	195187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009943	GCCG	2	8	195215	195222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009943	GAAG	2	8	195231	195238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009943	TCCA	3	12	199098	199109	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009943	GACT	2	8	201476	201483	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009943	GCCT	2	8	205650	205657	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009943	CGTC	2	8	205669	205676	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009943	CAGA	2	8	214232	214239	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009943	CGTA	2	8	226933	226940	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009943	GTGG	2	8	229162	229169	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009943	TGGA	2	8	233091	233098	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009943	GTCT	2	8	233410	233417	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009943	CTGT	2	8	233452	233459	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009943	CCTG	2	8	233469	233476	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009943	GCCG	2	8	238806	238813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009943	GCAA	2	8	238817	238824	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009943	CCGG	2	8	239377	239384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009943	TAGA	2	8	239393	239400	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009943	ACAA	2	8	241461	241468	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009943	CCTC	2	8	250916	250923	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
103	NC_009943	TTGA	2	8	255255	255262	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009943	AGAC	2	8	255591	255598	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009943	AAAC	2	8	257656	257663	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009943	GTCT	2	8	257733	257740	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009943	AATC	2	8	257848	257855	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009943	TAAA	2	8	257993	258000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009943	ATTT	2	8	279191	279198	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009943	CCGG	2	8	279263	279270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009943	TTGT	2	8	301015	301022	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009943	TTTG	2	8	301732	301739	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009943	GCCG	2	8	301836	301843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009943	ATTA	2	8	303873	303880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009943	CCCA	2	8	311802	311809	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_009943	CAAA	2	8	316315	316322	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009943	TAAA	2	8	316383	316390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009943	TTGC	2	8	322358	322365	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009943	TATT	2	8	324428	324435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009943	AGAT	2	8	324489	324496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009943	ATCT	2	8	324562	324569	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009943	TAGT	2	8	324746	324753	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009943	TTAT	2	8	324814	324821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009943	TTTG	2	8	324921	324928	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009943	CGTA	2	8	325240	325247	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009943	CAGC	2	8	328758	328765	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009943	TTGG	2	8	329350	329357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009943	CTTC	2	8	329439	329446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009943	CACG	2	8	330968	330975	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009943	TGAG	2	8	331088	331095	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009943	GTTT	2	8	331213	331220	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009943	TGGG	2	8	331336	331343	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009943	CCTT	2	8	336211	336218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009943	ATTT	2	8	336373	336380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009943	CGCC	2	8	337918	337925	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_009943	GCCG	2	8	337928	337935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009943	CGGG	2	8	339400	339407	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009943	CAGG	2	8	341389	341396	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009943	TTAA	2	8	349386	349393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009943	TTCA	2	8	350176	350183	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_009943	CCTG	2	8	350325	350332	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009943	ACTC	2	8	350334	350341	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_009943	CGGA	2	8	356002	356009	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_009943	GGAC	2	8	358748	358755	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009943	GGTT	2	8	361040	361047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009943	AAAT	2	8	362052	362059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009943	ACAA	2	8	365101	365108	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009943	TCCA	2	8	365469	365476	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_009943	TGAT	2	8	365678	365685	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009943	GTCA	2	8	367045	367052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_009943	AAAG	2	8	368415	368422	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009943	CAGG	2	8	370173	370180	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_009943	TAAT	2	8	383157	383164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009943	TTAA	2	8	383166	383173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009943	TTCA	2	8	383433	383440	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_009943	CGAT	2	8	384216	384223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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159	NC_009943	TTCA	2	8	388832	388839	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
160	NC_009943	AAAG	2	8	396222	396229	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
161	NC_009943	TGTC	2	8	406504	406511	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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495	NC_009943	GGCA	2	8	1341610	1341617	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
496	NC_009943	CGTT	2	8	1346423	1346430	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
497	NC_009943	GGGC	2	8	1346443	1346450	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
498	NC_009943	GCCG	2	8	1347624	1347631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
499	NC_009943	TCAT	2	8	1350673	1350680	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
500	NC_009943	TTTG	2	8	1351015	1351022	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

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