MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB8

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009933	GGCAAA	2	12	1105	1116	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158341504
2	NC_009933	ACAGCT	2	12	9143	9154	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158341508
3	NC_009933	AGATGA	2	12	11355	11366	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158341510
4	NC_009933	AGGAAC	2	12	11895	11906	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158341511
5	NC_009933	TGGTCT	2	12	15519	15530	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	158341520
6	NC_009933	TTGAAT	2	12	20695	20706	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158341524
7	NC_009933	CCAGGA	2	12	22290	22301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341526
8	NC_009933	TGCCAA	2	12	22728	22739	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009933	GCAATC	2	12	32447	32458	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158341543
10	NC_009933	TATTCC	2	12	32977	32988	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009933	CTTTTA	2	12	37058	37069	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	158341552
12	NC_009933	TCATGA	2	12	40583	40594	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158341557
13	NC_009933	TTCATA	2	12	41347	41358	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	158341557
14	NC_009933	TGATCC	2	12	52205	52216	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158341564
15	NC_009933	GGGCTA	2	12	55559	55570	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158341565
16	NC_009933	CTACCG	2	12	57253	57264	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158341566
17	NC_009933	ACAAGC	2	12	63263	63274	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009933	ATAGTC	2	12	65181	65192	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158341572
19	NC_009933	GGCAAA	2	12	68240	68251	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158341574
20	NC_009933	CTGGTT	2	12	70288	70299	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009933	CTTTAG	2	12	71429	71440	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158341580
22	NC_009933	CATCCG	2	12	73625	73636	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158341581
23	NC_009933	CCTGAT	2	12	84495	84506	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158341588
24	NC_009933	CATCCG	2	12	85135	85146	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158341589
25	NC_009933	CCAGAC	2	12	87300	87311	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158341589
26	NC_009933	AGTTGT	2	12	88161	88172	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	158341589
27	NC_009933	GAATGA	2	12	88912	88923	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158341592
28	NC_009933	CTCCAT	2	12	95686	95697	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158341595
29	NC_009933	CCCAAG	2	12	96231	96242	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158341596
30	NC_009933	CGCTGC	2	12	96832	96843	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158341596
31	NC_009933	CCCATG	2	12	97366	97377	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158341597
32	NC_009933	TTTGGT	2	12	99022	99033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158341598
33	NC_009933	GCCAAA	2	12	99534	99545	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158341599
34	NC_009933	GCCTGT	2	12	100334	100345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341600
35	NC_009933	CATCAA	2	12	109493	109504	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	158341608
36	NC_009933	AGCCGC	2	12	110561	110572	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158341608
37	NC_009933	CAGTCT	2	12	111097	111108	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158341609
38	NC_009933	GAATGG	2	12	112773	112784	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158341611
39	NC_009933	AGGATA	2	12	113478	113489	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158341612
40	NC_009933	CAACAG	2	12	115464	115475	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158341614

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.