MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB8

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009933	TTCTG	2	10	4440	4449	0 %	60 %	20 %	20 %	158341507
2	NC_009933	GGTGC	2	10	6158	6167	0 %	20 %	60 %	20 %	158341507
3	NC_009933	GGTTC	2	10	6730	6739	0 %	40 %	40 %	20 %	158341507
4	NC_009933	TGAGC	2	10	6938	6947	20 %	20 %	40 %	20 %	158341507
5	NC_009933	AGCAA	2	10	8709	8718	60 %	0 %	20 %	20 %	158341508
6	NC_009933	CCAAA	2	10	13753	13762	60 %	0 %	0 %	40 %	158341516
7	NC_009933	CCCAG	2	10	14484	14493	20 %	0 %	20 %	60 %	158341518
8	NC_009933	TCCCT	2	10	16256	16265	0 %	40 %	0 %	60 %	158341521
9	NC_009933	TTGCA	2	10	20205	20214	20 %	40 %	20 %	20 %	158341524
10	NC_009933	CAACT	2	10	20483	20492	40 %	20 %	0 %	40 %	158341524
11	NC_009933	ATTTG	2	10	22533	22542	20 %	60 %	20 %	0 %	158341527
12	NC_009933	AGCTG	2	10	25564	25573	20 %	20 %	40 %	20 %	158341530
13	NC_009933	GCGGA	2	10	27128	27137	20 %	0 %	60 %	20 %	158341529
14	NC_009933	ATTTG	2	10	32115	32124	20 %	60 %	20 %	0 %	158341542
15	NC_009933	GACAA	2	10	32405	32414	60 %	0 %	20 %	20 %	158341543
16	NC_009933	GAACT	2	10	32702	32711	40 %	20 %	20 %	20 %	158341543
17	NC_009933	CCAAT	2	10	33612	33621	40 %	20 %	0 %	40 %	158341545
18	NC_009933	TGCTG	2	10	34129	34138	0 %	40 %	40 %	20 %	158341546
19	NC_009933	TGTGA	2	10	34161	34170	20 %	40 %	40 %	0 %	158341546
20	NC_009933	CTTAC	2	10	38187	38196	20 %	40 %	0 %	40 %	158341553
21	NC_009933	AAGTT	2	10	38443	38452	40 %	40 %	20 %	0 %	158341553
22	NC_009933	CCTAG	2	10	38509	38518	20 %	20 %	20 %	40 %	158341553
23	NC_009933	ATTTG	2	10	40202	40211	20 %	60 %	20 %	0 %	158341556
24	NC_009933	AAGGA	2	10	40609	40618	60 %	0 %	40 %	0 %	158341557
25	NC_009933	GGATA	2	10	41202	41211	40 %	20 %	40 %	0 %	158341557
26	NC_009933	GTCCA	2	10	44712	44721	20 %	20 %	20 %	40 %	158341559
27	NC_009933	AATTA	2	10	45328	45337	60 %	40 %	0 %	0 %	158341560
28	NC_009933	GGGCT	2	10	56088	56097	0 %	20 %	60 %	20 %	158341565
29	NC_009933	TGACT	2	10	58447	58456	20 %	40 %	20 %	20 %	158341568
30	NC_009933	CTTAG	2	10	62636	62645	20 %	40 %	20 %	20 %	158341570
31	NC_009933	CATTG	2	10	65715	65724	20 %	40 %	20 %	20 %	158341572
32	NC_009933	TTTGT	2	10	80337	80346	0 %	80 %	20 %	0 %	158341585
33	NC_009933	CTTTT	2	10	83516	83525	0 %	80 %	0 %	20 %	158341588
34	NC_009933	AGATC	2	10	83619	83628	40 %	20 %	20 %	20 %	158341588
35	NC_009933	CTGGT	2	10	92526	92535	0 %	40 %	40 %	20 %	158341594
36	NC_009933	ATCGC	2	10	95304	95313	20 %	20 %	20 %	40 %	158341595
37	NC_009933	GAAGG	2	10	95719	95728	40 %	0 %	60 %	0 %	158341595
38	NC_009933	TTTGA	2	10	98310	98319	20 %	60 %	20 %	0 %	158341597
39	NC_009933	ACTAA	2	10	98614	98623	60 %	20 %	0 %	20 %	158341597
40	NC_009933	TTGAA	2	10	103503	103512	40 %	40 %	20 %	0 %	158341603
41	NC_009933	AATGG	2	10	108113	108122	40 %	20 %	40 %	0 %	158341606
42	NC_009933	AGACC	2	10	110703	110712	40 %	0 %	20 %	40 %	158341609
43	NC_009933	TCAAA	2	10	114968	114977	60 %	20 %	0 %	20 %	158341614
44	NC_009933	GCTAG	2	10	115566	115575	20 %	20 %	40 %	20 %	158341614
45	NC_009933	ATTTG	2	10	118311	118320	20 %	60 %	20 %	0 %	158341618
46	NC_009933	TTGGA	2	10	119785	119794	20 %	40 %	40 %	0 %	158341620
47	NC_009933	CATGT	2	10	119931	119940	20 %	40 %	20 %	20 %	158341620

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.