MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB8

Total Repeats: 272

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009933	ATCT	2	8	775	782	25 %	50 %	0 %	25 %	158341504
2	NC_009933	GTTG	2	8	1782	1789	0 %	50 %	50 %	0 %	158341505
3	NC_009933	AATT	2	8	2052	2059	50 %	50 %	0 %	0 %	158341505
4	NC_009933	TCCA	2	8	2509	2516	25 %	25 %	0 %	50 %	158341506
5	NC_009933	CATC	2	8	3107	3114	25 %	25 %	0 %	50 %	158341506
6	NC_009933	AATT	2	8	3830	3837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009933	AAAT	2	8	3855	3862	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009933	ATAG	2	8	4397	4404	50 %	25 %	25 %	0 %	158341507
9	NC_009933	CTGA	2	8	4973	4980	25 %	25 %	25 %	25 %	158341507
10	NC_009933	ATCC	2	8	5286	5293	25 %	25 %	0 %	50 %	158341507
11	NC_009933	GGGT	2	8	6742	6749	0 %	25 %	75 %	0 %	158341507
12	NC_009933	CTTT	2	8	8343	8350	0 %	75 %	0 %	25 %	158341508
13	NC_009933	AACT	2	8	8786	8793	50 %	25 %	0 %	25 %	158341508
14	NC_009933	AGAA	2	8	9124	9131	75 %	0 %	25 %	0 %	158341508
15	NC_009933	CCAA	2	8	9856	9863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009933	AATC	2	8	9996	10003	50 %	25 %	0 %	25 %	158341509
17	NC_009933	GGGC	2	8	10173	10180	0 %	0 %	75 %	25 %	158341509
18	NC_009933	GATG	2	8	10807	10814	25 %	25 %	50 %	0 %	158341509
19	NC_009933	ATGA	2	8	11083	11090	50 %	25 %	25 %	0 %	158341510
20	NC_009933	GGAT	2	8	12098	12105	25 %	25 %	50 %	0 %	158341512
21	NC_009933	TCAG	2	8	12176	12183	25 %	25 %	25 %	25 %	158341512
22	NC_009933	GACC	2	8	13475	13482	25 %	0 %	25 %	50 %	158341515
23	NC_009933	CTGG	2	8	14047	14054	0 %	25 %	50 %	25 %	158341517
24	NC_009933	CTTG	2	8	15321	15328	0 %	50 %	25 %	25 %	158341520
25	NC_009933	CAAG	2	8	15349	15356	50 %	0 %	25 %	25 %	158341520
26	NC_009933	AGCA	2	8	15676	15683	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009933	ACCT	2	8	16613	16620	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009933	TCAG	2	8	16786	16793	25 %	25 %	25 %	25 %	158341522
29	NC_009933	CAAT	2	8	17728	17735	50 %	25 %	0 %	25 %	158341523
30	NC_009933	TTGT	2	8	18487	18494	0 %	75 %	25 %	0 %	158341524
31	NC_009933	ACCA	2	8	20197	20204	50 %	0 %	0 %	50 %	158341524
32	NC_009933	AACA	2	8	20441	20448	75 %	0 %	0 %	25 %	158341524
33	NC_009933	TTCT	2	8	20455	20462	0 %	75 %	0 %	25 %	158341524
34	NC_009933	ACCC	2	8	20659	20666	25 %	0 %	0 %	75 %	158341524
35	NC_009933	GACC	2	8	20786	20793	25 %	0 %	25 %	50 %	158341524
36	NC_009933	TCCC	2	8	21111	21118	0 %	25 %	0 %	75 %	158341524
37	NC_009933	GTTG	2	8	21174	21181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009933	GGAG	2	8	21221	21228	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009933	ATTT	2	8	21851	21858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009933	CATC	2	8	21876	21883	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009933	CGAG	2	8	22835	22842	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009933	CCCA	2	8	23047	23054	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_009933	TGGG	2	8	23603	23610	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009933	CTGT	2	8	23668	23675	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009933	GATT	2	8	23848	23855	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009933	CAAT	2	8	24197	24204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009933	TCTT	2	8	24642	24649	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009933	GATG	2	8	24729	24736	25 %	25 %	50 %	0 %	158341528
49	NC_009933	AATT	2	8	25040	25047	50 %	50 %	0 %	0 %	158341528
50	NC_009933	GAAC	2	8	25051	25058	50 %	0 %	25 %	25 %	158341528
51	NC_009933	CGAG	2	8	25081	25088	25 %	0 %	50 %	25 %	158341528
52	NC_009933	TCTG	2	8	25493	25500	0 %	50 %	25 %	25 %	158341530
53	NC_009933	GGAC	2	8	26149	26156	25 %	0 %	50 %	25 %	158341530
54	NC_009933	CTTC	2	8	26810	26817	0 %	50 %	0 %	50 %	158341529
55	NC_009933	TTCC	2	8	27906	27913	0 %	50 %	0 %	50 %	158341532
56	NC_009933	AAGT	2	8	28261	28268	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009933	GTAT	2	8	29283	29290	25 %	50 %	25 %	0 %	158341537
58	NC_009933	CACC	2	8	29692	29699	25 %	0 %	0 %	75 %	158341538
59	NC_009933	TTTG	2	8	29816	29823	0 %	75 %	25 %	0 %	158341538
60	NC_009933	CCAA	2	8	30759	30766	50 %	0 %	0 %	50 %	158341540
61	NC_009933	GGAA	2	8	31095	31102	50 %	0 %	50 %	0 %	158341540
62	NC_009933	AGTG	2	8	31382	31389	25 %	25 %	50 %	0 %	158341540
63	NC_009933	TGCC	2	8	31431	31438	0 %	25 %	25 %	50 %	158341540
64	NC_009933	ACCA	2	8	31587	31594	50 %	0 %	0 %	50 %	158341541
65	NC_009933	GTTC	2	8	31861	31868	0 %	50 %	25 %	25 %	158341541
66	NC_009933	TGAA	2	8	32624	32631	50 %	25 %	25 %	0 %	158341543
67	NC_009933	TGTA	2	8	32916	32923	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009933	GGCT	2	8	32963	32970	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009933	GAAC	2	8	33428	33435	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009933	TTGC	2	8	33779	33786	0 %	50 %	25 %	25 %	158341545
71	NC_009933	CAAT	2	8	34784	34791	50 %	25 %	0 %	25 %	158341548
72	NC_009933	ATTC	2	8	34959	34966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009933	AACT	2	8	35007	35014	50 %	25 %	0 %	25 %	158341549
74	NC_009933	CCCT	2	8	35026	35033	0 %	25 %	0 %	75 %	158341549
75	NC_009933	AAAT	2	8	35233	35240	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009933	TACT	2	8	36660	36667	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009933	TCAC	2	8	36746	36753	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009933	ACCA	2	8	37626	37633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009933	TAAT	2	8	37781	37788	50 %	50 %	0 %	0 %	158341553
80	NC_009933	TATC	2	8	37801	37808	25 %	50 %	0 %	25 %	158341553
81	NC_009933	ATTT	2	8	37867	37874	25 %	75 %	0 %	0 %	158341553
82	NC_009933	CAAG	2	8	38040	38047	50 %	0 %	25 %	25 %	158341553
83	NC_009933	AATC	2	8	39136	39143	50 %	25 %	0 %	25 %	158341554
84	NC_009933	GAAG	2	8	39384	39391	50 %	0 %	50 %	0 %	158341554
85	NC_009933	TGGT	2	8	39472	39479	0 %	50 %	50 %	0 %	158341554
86	NC_009933	CTTT	2	8	40321	40328	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009933	AGCC	2	8	40844	40851	25 %	0 %	25 %	50 %	158341557
88	NC_009933	TGTT	2	8	41008	41015	0 %	75 %	25 %	0 %	158341557
89	NC_009933	TAAT	2	8	41837	41844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009933	AAAG	2	8	43083	43090	75 %	0 %	25 %	0 %	158341558
91	NC_009933	AAAC	2	8	43117	43124	75 %	0 %	0 %	25 %	158341558
92	NC_009933	CCAA	2	8	43250	43257	50 %	0 %	0 %	50 %	158341558
93	NC_009933	TCAG	2	8	43653	43660	25 %	25 %	25 %	25 %	158341558
94	NC_009933	ATCA	2	8	44393	44400	50 %	25 %	0 %	25 %	158341559
95	NC_009933	GCTA	2	8	45646	45653	25 %	25 %	25 %	25 %	158341560
96	NC_009933	ACTC	2	8	46147	46154	25 %	25 %	0 %	50 %	158341560
97	NC_009933	AAGT	2	8	46512	46519	50 %	25 %	25 %	0 %	158341561
98	NC_009933	AAAT	2	8	47086	47093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009933	CTTA	2	8	47167	47174	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009933	TAAA	2	8	47271	47278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009933	ATGT	2	8	47312	47319	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009933	GAAA	2	8	47362	47369	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009933	ATTT	2	8	47398	47405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009933	AGAT	2	8	47511	47518	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009933	ATTG	2	8	47941	47948	25 %	50 %	25 %	0 %	158341562
106	NC_009933	TGGT	2	8	48304	48311	0 %	50 %	50 %	0 %	158341562
107	NC_009933	CATG	2	8	48590	48597	25 %	25 %	25 %	25 %	158341562
108	NC_009933	TTTA	2	8	48712	48719	25 %	75 %	0 %	0 %	158341562
109	NC_009933	CAGT	2	8	49188	49195	25 %	25 %	25 %	25 %	158341562
110	NC_009933	AAAT	2	8	49320	49327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009933	CTGA	2	8	49376	49383	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009933	GACT	2	8	49495	49502	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009933	GCTA	2	8	49527	49534	25 %	25 %	25 %	25 %	158341563
114	NC_009933	TTGA	2	8	50480	50487	25 %	50 %	25 %	0 %	158341563
115	NC_009933	AATC	2	8	50551	50558	50 %	25 %	0 %	25 %	158341563
116	NC_009933	CCCA	2	8	51033	51040	25 %	0 %	0 %	75 %	158341563
117	NC_009933	AGCT	2	8	51380	51387	25 %	25 %	25 %	25 %	158341563
118	NC_009933	CAGC	2	8	51404	51411	25 %	0 %	25 %	50 %	158341563
119	NC_009933	CCCA	2	8	51485	51492	25 %	0 %	0 %	75 %	158341563
120	NC_009933	CGAC	2	8	51567	51574	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009933	GAGG	2	8	51595	51602	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009933	TGCC	2	8	51617	51624	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_009933	ATGT	2	8	53936	53943	25 %	50 %	25 %	0 %	158341565
124	NC_009933	ATGT	2	8	54692	54699	25 %	50 %	25 %	0 %	158341565
125	NC_009933	CTGC	2	8	55040	55047	0 %	25 %	25 %	50 %	158341565
126	NC_009933	ATCC	2	8	55079	55086	25 %	25 %	0 %	50 %	158341565
127	NC_009933	GGTT	2	8	55397	55404	0 %	50 %	50 %	0 %	158341565
128	NC_009933	ACCC	2	8	55635	55642	25 %	0 %	0 %	75 %	158341565
129	NC_009933	TTGA	2	8	57056	57063	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009933	GAAC	2	8	57116	57123	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009933	GAAG	2	8	58058	58065	50 %	0 %	50 %	0 %	158341567
132	NC_009933	GTCA	2	8	58077	58084	25 %	25 %	25 %	25 %	158341567
133	NC_009933	AATT	2	8	58377	58384	50 %	50 %	0 %	0 %	158341568
134	NC_009933	ACCT	2	8	58542	58549	25 %	25 %	0 %	50 %	158341568
135	NC_009933	TAAA	2	8	58635	58642	75 %	25 %	0 %	0 %	158341568
136	NC_009933	CCGA	2	8	59043	59050	25 %	0 %	25 %	50 %	158341568
137	NC_009933	AATT	2	8	59982	59989	50 %	50 %	0 %	0 %	158341568
138	NC_009933	CAGC	2	8	60416	60423	25 %	0 %	25 %	50 %	158341568
139	NC_009933	ATCA	2	8	60813	60820	50 %	25 %	0 %	25 %	158341568
140	NC_009933	GAAA	2	8	61140	61147	75 %	0 %	25 %	0 %	158341568
141	NC_009933	CCAG	2	8	61357	61364	25 %	0 %	25 %	50 %	158341568
142	NC_009933	TTAC	2	8	62049	62056	25 %	50 %	0 %	25 %	158341569
143	NC_009933	TGTA	2	8	62962	62969	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009933	TCAA	2	8	63285	63292	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009933	CAGA	2	8	63354	63361	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.