MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB7

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009932	CTTTAT	2	12	1860	1871	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	158341332
2	NC_009932	AATATC	2	12	3163	3174	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158341333
3	NC_009932	TGGTGA	2	12	4689	4700	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158341333
4	NC_009932	TCCCTG	2	12	16426	16437	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	158341340
5	NC_009932	GGCTTG	2	12	18088	18099	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158341340
6	NC_009932	TCAAAA	2	12	20470	20481	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	158341345
7	NC_009932	TGCTAT	2	12	35035	35046	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158341361
8	NC_009932	TAGAGC	2	12	45566	45577	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158341372
9	NC_009932	CTACTG	2	12	46721	46732	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158341374
10	NC_009932	AACCAG	2	12	50824	50835	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158341376
11	NC_009932	TGAATC	2	12	51608	51619	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158341377
12	NC_009932	AGAGTT	2	12	53493	53504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341378
13	NC_009932	CATCCG	2	12	54422	54433	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158341380
14	NC_009932	AGTTGT	2	12	57448	57459	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	158341381
15	NC_009932	GAATGA	2	12	58189	58200	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158341384
16	NC_009932	CTCCAT	2	12	65027	65038	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158341388
17	NC_009932	CGCTGC	3	18	66173	66190	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158341390
18	NC_009932	CCATGC	2	12	66708	66719	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158341391
19	NC_009932	TTTGGT	2	12	68354	68365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158341392
20	NC_009932	GCCAAA	2	12	68858	68869	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158341394
21	NC_009932	AAGCCA	2	12	70633	70644	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158341396
22	NC_009932	CCCGTG	2	12	71067	71078	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158341396
23	NC_009932	AGGTAC	2	12	81127	81138	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158341407
24	NC_009932	CAGAAC	2	12	83815	83826	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158341410
25	NC_009932	TTTTTG	2	12	86465	86476	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	158341414
26	NC_009932	CTGTAC	2	12	87591	87602	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158341418
27	NC_009932	CATCAA	2	12	88541	88552	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	158341419
28	NC_009932	AGCCGC	2	12	89609	89620	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158341419
29	NC_009932	CTGATT	2	12	98724	98735	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158341427
30	NC_009932	AGGAAC	2	12	103017	103028	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158341431
31	NC_009932	TGGGAG	2	12	104511	104522	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	158341435
32	NC_009932	GGGATT	2	12	112638	112649	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158341446
33	NC_009932	GGCAAA	2	12	114211	114222	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158341447
34	NC_009932	TACCCC	2	12	117126	117137	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	158341451
35	NC_009932	TTATGC	2	12	121635	121646	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158341459
36	NC_009932	AGGATG	2	12	124114	124125	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158341464
37	NC_009932	GGCTTT	2	12	131695	131706	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	158341481
38	NC_009932	TAGAAA	2	12	144158	144169	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	158341493
39	NC_009932	GCCACC	2	12	151785	151796	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158341502
40	NC_009932	TGCGGA	2	12	154307	154318	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158341502

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.