MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB7

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009932	CCCAA	2	10	163	172	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_009932	GTCAG	2	10	1224	1233	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009932	GATTT	2	10	2850	2859	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009932	CTAAT	2	10	7523	7532	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009932	TTTCC	2	10	7721	7730	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_009932	GGCAG	2	10	14452	14461	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009932	CTGGT	2	10	18439	18448	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009932	ATTTA	2	10	18573	18582	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009932	AATTT	2	10	20559	20568	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009932	TATTG	2	10	20992	21001	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009932	AATTT	2	10	21030	21039	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009932	TTGTC	2	10	29261	29270	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009932	AAAAT	2	10	29279	29288	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009932	TTGCT	2	10	37997	38006	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009932	GTAGG	2	10	43528	43537	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009932	GCAAG	2	10	43679	43688	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009932	ATGGT	2	10	47762	47771	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009932	AAGTG	2	10	52132	52141	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009932	CTGTT	2	10	59818	59827	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009932	TTAAT	2	10	72098	72107	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009932	TAAAT	2	10	73253	73262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009932	TATTT	2	10	73703	73712	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009932	ACGGT	2	10	76840	76849	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009932	CAATG	2	10	84363	84372	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009932	CATTT	2	10	104057	104066	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009932	AACAG	2	10	108738	108747	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009932	CTAAC	2	10	123391	123400	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009932	CAAAA	2	10	123547	123556	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009932	ATTGA	2	10	124675	124684	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009932	TAAAA	2	10	124800	124809	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009932	CACTT	2	10	127000	127009	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_009932	GACAA	2	10	129103	129112	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009932	ATTCC	2	10	145670	145679	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009932	TTTAT	2	10	147134	147143	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009932	TCAAA	2	10	148203	148212	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.