MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB7

Total Repeats: 385

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009932	GTTC	2	8	399	406	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009932	GTTT	2	8	521	528	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009932	TCTT	2	8	738	745	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009932	TGGT	2	8	1087	1094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009932	AGGT	2	8	1212	1219	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009932	AGAA	3	12	1550	1561	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009932	GAAA	2	8	2376	2383	75 %	0 %	25 %	0 %	158341332
8	NC_009932	AATT	2	8	2662	2669	50 %	50 %	0 %	0 %	158341332
9	NC_009932	AAAT	2	8	2789	2796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009932	TAAT	2	8	2819	2826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009932	AATT	2	8	2990	2997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009932	TAAT	2	8	3019	3026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009932	GCCA	2	8	3670	3677	25 %	0 %	25 %	50 %	158341333
14	NC_009932	GCCA	2	8	3976	3983	25 %	0 %	25 %	50 %	158341333
15	NC_009932	TGGG	2	8	4376	4383	0 %	25 %	75 %	0 %	158341333
16	NC_009932	GGCC	2	8	4905	4912	0 %	0 %	50 %	50 %	158341333
17	NC_009932	AACC	2	8	6494	6501	50 %	0 %	0 %	50 %	158341333
18	NC_009932	ATTG	2	8	6553	6560	25 %	50 %	25 %	0 %	158341333
19	NC_009932	GCTG	2	8	6869	6876	0 %	25 %	50 %	25 %	158341333
20	NC_009932	AGGT	2	8	7656	7663	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009932	GCCT	2	8	7810	7817	0 %	25 %	25 %	50 %	158341336
22	NC_009932	GTTC	2	8	8907	8914	0 %	50 %	25 %	25 %	158341336
23	NC_009932	TCAA	2	8	9186	9193	50 %	25 %	0 %	25 %	158341336
24	NC_009932	CTCA	2	8	9206	9213	25 %	25 %	0 %	50 %	158341336
25	NC_009932	CTTT	2	8	10162	10169	0 %	75 %	0 %	25 %	158341336
26	NC_009932	CATA	2	8	10384	10391	50 %	25 %	0 %	25 %	158341336
27	NC_009932	CAAG	2	8	10554	10561	50 %	0 %	25 %	25 %	158341336
28	NC_009932	TAGT	2	8	10804	10811	25 %	50 %	25 %	0 %	158341336
29	NC_009932	TTGA	2	8	10849	10856	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009932	TCCT	3	12	10983	10994	0 %	50 %	0 %	50 %	158341337
31	NC_009932	ATTG	2	8	12133	12140	25 %	50 %	25 %	0 %	158341338
32	NC_009932	CAAG	2	8	12474	12481	50 %	0 %	25 %	25 %	158341338
33	NC_009932	CTCA	2	8	12494	12501	25 %	25 %	0 %	50 %	158341338
34	NC_009932	CCCA	2	8	12687	12694	25 %	0 %	0 %	75 %	158341338
35	NC_009932	GGGA	2	8	12798	12805	25 %	0 %	75 %	0 %	158341338
36	NC_009932	CCCA	2	8	13139	13146	25 %	0 %	0 %	75 %	158341338
37	NC_009932	CGAC	2	8	13221	13228	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009932	TTGC	2	8	14088	14095	0 %	50 %	25 %	25 %	158341339
39	NC_009932	GGAC	2	8	14297	14304	25 %	0 %	50 %	25 %	158341339
40	NC_009932	AGGC	2	8	14549	14556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009932	TTTC	2	8	15238	15245	0 %	75 %	0 %	25 %	158341340
42	NC_009932	TTTC	2	8	15364	15371	0 %	75 %	0 %	25 %	158341340
43	NC_009932	CTGC	2	8	16695	16702	0 %	25 %	25 %	50 %	158341340
44	NC_009932	GGTT	2	8	17052	17059	0 %	50 %	50 %	0 %	158341340
45	NC_009932	CCCA	2	8	17291	17298	25 %	0 %	0 %	75 %	158341340
46	NC_009932	AAAC	2	8	18157	18164	75 %	0 %	0 %	25 %	158341340
47	NC_009932	CAGG	2	8	18313	18320	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009932	CTGC	2	8	18529	18536	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009932	ATAG	2	8	18538	18545	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009932	TTGA	2	8	18710	18717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009932	GAAC	2	8	18769	18776	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009932	TTTG	2	8	19686	19693	0 %	75 %	25 %	0 %	158341343
53	NC_009932	GCCA	2	8	19922	19929	25 %	0 %	25 %	50 %	158341344
54	NC_009932	TCAT	2	8	20131	20138	25 %	50 %	0 %	25 %	158341344
55	NC_009932	GTTG	2	8	20328	20335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009932	CATA	2	8	20792	20799	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009932	ATTG	2	8	21113	21120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009932	CAAA	2	8	21341	21348	75 %	0 %	0 %	25 %	158341347
59	NC_009932	AATC	2	8	22480	22487	50 %	25 %	0 %	25 %	158341348
60	NC_009932	TTTG	2	8	22904	22911	0 %	75 %	25 %	0 %	158341348
61	NC_009932	ATCG	2	8	22917	22924	25 %	25 %	25 %	25 %	158341348
62	NC_009932	CTGT	2	8	23052	23059	0 %	50 %	25 %	25 %	158341348
63	NC_009932	TCCC	2	8	23393	23400	0 %	25 %	0 %	75 %	158341348
64	NC_009932	TGAT	2	8	24305	24312	25 %	50 %	25 %	0 %	158341349
65	NC_009932	CCCT	2	8	24694	24701	0 %	25 %	0 %	75 %	158341350
66	NC_009932	AGTC	2	8	24722	24729	25 %	25 %	25 %	25 %	158341350
67	NC_009932	AGGG	2	8	25088	25095	25 %	0 %	75 %	0 %	158341350
68	NC_009932	TGGA	2	8	26510	26517	25 %	25 %	50 %	0 %	158341350
69	NC_009932	AATC	2	8	26750	26757	50 %	25 %	0 %	25 %	158341350
70	NC_009932	ATCC	2	8	26773	26780	25 %	25 %	0 %	50 %	158341350
71	NC_009932	GTCT	2	8	28731	28738	0 %	50 %	25 %	25 %	158341352
72	NC_009932	CTCA	2	8	29341	29348	25 %	25 %	0 %	50 %	158341353
73	NC_009932	GACT	2	8	29443	29450	25 %	25 %	25 %	25 %	158341353
74	NC_009932	CTCG	2	8	30055	30062	0 %	25 %	25 %	50 %	158341354
75	NC_009932	GCTT	2	8	31323	31330	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009932	AGTG	2	8	31650	31657	25 %	25 %	50 %	0 %	158341357
77	NC_009932	CAAG	2	8	31728	31735	50 %	0 %	25 %	25 %	158341357
78	NC_009932	AAGC	2	8	31819	31826	50 %	0 %	25 %	25 %	158341357
79	NC_009932	CAAG	2	8	31875	31882	50 %	0 %	25 %	25 %	158341357
80	NC_009932	TGAT	2	8	32134	32141	25 %	50 %	25 %	0 %	158341358
81	NC_009932	AAAC	2	8	32207	32214	75 %	0 %	0 %	25 %	158341358
82	NC_009932	ATGT	2	8	32941	32948	25 %	50 %	25 %	0 %	158341360
83	NC_009932	ATTG	2	8	33275	33282	25 %	50 %	25 %	0 %	158341360
84	NC_009932	ATTG	2	8	33403	33410	25 %	50 %	25 %	0 %	158341360
85	NC_009932	TTCT	2	8	33505	33512	0 %	75 %	0 %	25 %	158341360
86	NC_009932	TTGA	2	8	33532	33539	25 %	50 %	25 %	0 %	158341360
87	NC_009932	GGAT	2	8	33670	33677	25 %	25 %	50 %	0 %	158341360
88	NC_009932	GGAG	2	8	34041	34048	25 %	0 %	75 %	0 %	158341361
89	NC_009932	CCGC	2	8	34783	34790	0 %	0 %	25 %	75 %	158341361
90	NC_009932	ATGG	2	8	34830	34837	25 %	25 %	50 %	0 %	158341361
91	NC_009932	AAGT	2	8	34881	34888	50 %	25 %	25 %	0 %	158341361
92	NC_009932	ACGG	2	8	35426	35433	25 %	0 %	50 %	25 %	158341361
93	NC_009932	CCTC	2	8	35458	35465	0 %	25 %	0 %	75 %	158341361
94	NC_009932	TCCT	2	8	36961	36968	0 %	50 %	0 %	50 %	158341363
95	NC_009932	AGAT	2	8	36972	36979	50 %	25 %	25 %	0 %	158341363
96	NC_009932	CAAT	2	8	37075	37082	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009932	TAAC	2	8	37093	37100	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009932	CATC	2	8	37273	37280	25 %	25 %	0 %	50 %	158341364
99	NC_009932	GATT	2	8	37323	37330	25 %	50 %	25 %	0 %	158341364
100	NC_009932	ATGA	2	8	37665	37672	50 %	25 %	25 %	0 %	158341364
101	NC_009932	ATAG	2	8	37815	37822	50 %	25 %	25 %	0 %	158341364
102	NC_009932	CTTA	2	8	37865	37872	25 %	50 %	0 %	25 %	158341364
103	NC_009932	TAAT	2	8	38274	38281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009932	TTTC	2	8	39334	39341	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009932	TATT	2	8	41071	41078	25 %	75 %	0 %	0 %	158341369
106	NC_009932	TGGG	2	8	41772	41779	0 %	25 %	75 %	0 %	158341370
107	NC_009932	GCCA	2	8	42584	42591	25 %	0 %	25 %	50 %	158341370
108	NC_009932	GTTT	2	8	42620	42627	0 %	75 %	25 %	0 %	158341370
109	NC_009932	AACA	2	8	43583	43590	75 %	0 %	0 %	25 %	158341371
110	NC_009932	AAAC	2	8	43666	43673	75 %	0 %	0 %	25 %	158341371
111	NC_009932	CAGC	2	8	43957	43964	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009932	TTGC	2	8	44689	44696	0 %	50 %	25 %	25 %	158341372
113	NC_009932	GATT	2	8	45392	45399	25 %	50 %	25 %	0 %	158341372
114	NC_009932	TTCA	2	8	45659	45666	25 %	50 %	0 %	25 %	158341373
115	NC_009932	TGTT	2	8	46215	46222	0 %	75 %	25 %	0 %	158341373
116	NC_009932	CATT	2	8	46595	46602	25 %	50 %	0 %	25 %	158341374
117	NC_009932	CTGG	2	8	46662	46669	0 %	25 %	50 %	25 %	158341374
118	NC_009932	ACTA	2	8	47001	47008	50 %	25 %	0 %	25 %	158341374
119	NC_009932	AATT	2	8	47148	47155	50 %	50 %	0 %	0 %	158341374
120	NC_009932	ACTA	2	8	47466	47473	50 %	25 %	0 %	25 %	158341374
121	NC_009932	AGAA	2	8	47657	47664	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009932	CTCA	2	8	47746	47753	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_009932	CATT	2	8	47894	47901	25 %	50 %	0 %	25 %	158341375
124	NC_009932	GAAA	2	8	47952	47959	75 %	0 %	25 %	0 %	158341375
125	NC_009932	AATC	2	8	48027	48034	50 %	25 %	0 %	25 %	158341375
126	NC_009932	GGTT	2	8	48924	48931	0 %	50 %	50 %	0 %	158341375
127	NC_009932	GGTC	2	8	49234	49241	0 %	25 %	50 %	25 %	158341375
128	NC_009932	TCAA	2	8	49400	49407	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_009932	TTGA	2	8	49423	49430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009932	TTTA	2	8	49997	50004	25 %	75 %	0 %	0 %	158341376
131	NC_009932	ACTG	2	8	50051	50058	25 %	25 %	25 %	25 %	158341376
132	NC_009932	GAAT	2	8	50182	50189	50 %	25 %	25 %	0 %	158341376
133	NC_009932	CTTG	2	8	50403	50410	0 %	50 %	25 %	25 %	158341376
134	NC_009932	CCTT	2	8	51787	51794	0 %	50 %	0 %	50 %	158341377
135	NC_009932	GATG	2	8	52393	52400	25 %	25 %	50 %	0 %	158341378
136	NC_009932	TTTG	2	8	52746	52753	0 %	75 %	25 %	0 %	158341378
137	NC_009932	ATGG	2	8	52888	52895	25 %	25 %	50 %	0 %	158341378
138	NC_009932	AATG	2	8	52996	53003	50 %	25 %	25 %	0 %	158341378
139	NC_009932	ACTC	2	8	53575	53582	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009932	TGAG	2	8	53843	53850	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009932	ATTT	2	8	53851	53858	25 %	75 %	0 %	0 %	158341379
142	NC_009932	TCTT	2	8	54105	54112	0 %	75 %	0 %	25 %	158341380
143	NC_009932	TCAT	2	8	54402	54409	25 %	50 %	0 %	25 %	158341380
144	NC_009932	ATGA	2	8	55382	55389	50 %	25 %	25 %	0 %	158341380
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.