MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB6

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009931	CTGGCT	2	12	1634	1645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341141
2	NC_009931	AGCCAA	2	12	3175	3186	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158341327
3	NC_009931	GTTTCC	2	12	7433	7444	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158341325
4	NC_009931	AGTTTG	2	12	7660	7671	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	158341325
5	NC_009931	CTGGCT	2	12	9510	9521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341324
6	NC_009931	TTCCAA	2	12	11110	11121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341321
7	NC_009931	CTTCAA	2	12	12110	12121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341319
8	NC_009931	CCCCAT	2	12	22156	22167	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	158341299
9	NC_009931	CCGGTC	2	12	24484	24495	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158341295
10	NC_009931	TTGCTG	2	12	24857	24868	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	158341294
11	NC_009931	GATATT	2	12	26832	26843	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158341292
12	NC_009931	GGTAAA	2	12	33408	33419	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158341288
13	NC_009931	TGGTCG	2	12	33629	33640	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158341288
14	NC_009931	AATGAA	2	12	39034	39045	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	158341283
15	NC_009931	AGCATC	2	12	50082	50093	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158341272
16	NC_009931	AGCCAG	2	12	57882	57893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341269
17	NC_009931	ATCGTG	2	12	58767	58778	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158341269
18	NC_009931	ATGATA	2	12	68390	68401	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158341256
19	NC_009931	ATGATA	2	12	71472	71483	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158341254
20	NC_009931	AAGCGG	2	12	80508	80519	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158341239
21	NC_009931	AATGGA	2	12	90264	90275	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158341225
22	NC_009931	CCAAGA	2	12	91091	91102	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158341224
23	NC_009931	CCCGCT	2	12	94783	94794	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158341218
24	NC_009931	TGAATT	2	12	96938	96949	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158341216
25	NC_009931	CGTCTT	2	12	98985	98996	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158341212
26	NC_009931	GAAAAA	2	12	99531	99542	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	158341212
27	NC_009931	CTTGGC	2	12	101587	101598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341209
28	NC_009931	ACATTG	2	12	102013	102024	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158341209
29	NC_009931	ATCTGG	2	12	105391	105402	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158341206
30	NC_009931	GTTTGG	2	12	109893	109904	0 %	50 %	50 %	0 %	158341205
31	NC_009931	TTCCAA	2	12	110870	110881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341204
32	NC_009931	GCCCAG	2	12	111131	111142	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158341204
33	NC_009931	ACCCCA	2	12	114638	114649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158341201
34	NC_009931	GATTTT	2	12	116177	116188	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	158341200
35	NC_009931	AGCAAC	2	12	116190	116201	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158341200
36	NC_009931	TTCTAC	2	12	117709	117720	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158341196
37	NC_009931	TTGCCT	2	12	117805	117816	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158341196
38	NC_009931	GTGGGT	2	12	118657	118668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158341195
39	NC_009931	CCCCAG	2	12	124729	124740	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158341191
40	NC_009931	ATCAAT	2	12	126329	126340	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158341190
41	NC_009931	CAGGCC	2	12	127167	127178	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158341189
42	NC_009931	TGCCCG	2	12	129587	129598	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158341187
43	NC_009931	TGACTA	2	12	129878	129889	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158341187
44	NC_009931	GTCCCA	2	12	131784	131795	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158341186
45	NC_009931	ATTGGG	2	12	132384	132395	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158341185
46	NC_009931	GGCAAA	2	12	137021	137032	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158341182
47	NC_009931	TCGACC	2	12	138536	138547	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158341180
48	NC_009931	TGGGTC	2	12	141867	141878	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158341177
49	NC_009931	CTGATA	2	12	141936	141947	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158341177
50	NC_009931	TTGATA	2	12	144373	144384	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158341176
51	NC_009931	GGGTTT	2	12	147003	147014	0 %	50 %	50 %	0 %	158341176
52	NC_009931	GCCATA	2	12	148057	148068	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158341176
53	NC_009931	TCCCCT	2	12	148131	148142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158341176
54	NC_009931	GGCCCT	2	12	149573	149584	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158341173
55	NC_009931	AGTCTA	2	12	160483	160494	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158341154
56	NC_009931	TACTTG	2	12	163059	163070	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158341149
57	NC_009931	CTGGCT	2	12	166781	166792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341144

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.