MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB6

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009931	AAATC	2	10	4437	4446	60 %	20 %	0 %	20 %	158341326
2	NC_009931	CATGA	2	10	4951	4960	40 %	20 %	20 %	20 %	158341326
3	NC_009931	TCCAT	2	10	5392	5401	20 %	40 %	0 %	40 %	158341326
4	NC_009931	GCGAT	2	10	6827	6836	20 %	20 %	40 %	20 %	158341325
5	NC_009931	CTTTT	2	10	13948	13957	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009931	GAAAT	2	10	15382	15391	60 %	20 %	20 %	0 %	158341313
7	NC_009931	AGTGT	2	10	16812	16821	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009931	ATTCT	2	10	19054	19063	20 %	60 %	0 %	20 %	158341305
9	NC_009931	CTGCC	2	10	19227	19236	0 %	20 %	20 %	60 %	158341306
10	NC_009931	CAAGT	2	10	19255	19264	40 %	20 %	20 %	20 %	158341306
11	NC_009931	GAGAG	2	10	21852	21861	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009931	ATCCA	2	10	22143	22152	40 %	20 %	0 %	40 %	158341299
13	NC_009931	TATCC	2	10	22657	22666	20 %	40 %	0 %	40 %	158341297
14	NC_009931	AGCCA	2	10	24637	24646	40 %	0 %	20 %	40 %	158341295
15	NC_009931	TGCAC	2	10	26247	26256	20 %	20 %	20 %	40 %	158341293
16	NC_009931	CACCT	2	10	27491	27500	20 %	20 %	0 %	60 %	158341292
17	NC_009931	AGCTG	2	10	29262	29271	20 %	20 %	40 %	20 %	158341292
18	NC_009931	AATAC	2	10	29951	29960	60 %	20 %	0 %	20 %	158341292
19	NC_009931	TTTCC	2	10	31499	31508	0 %	60 %	0 %	40 %	158341291
20	NC_009931	ACGGT	2	10	31656	31665	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009931	GTCGA	2	10	32016	32025	20 %	20 %	40 %	20 %	158341289
22	NC_009931	AGAAA	2	10	32109	32118	80 %	0 %	20 %	0 %	158341290
23	NC_009931	AACGC	2	10	33508	33517	40 %	0 %	20 %	40 %	158341288
24	NC_009931	TGGCA	2	10	35074	35083	20 %	20 %	40 %	20 %	158341287
25	NC_009931	CAAGC	2	10	39121	39130	40 %	0 %	20 %	40 %	158341283
26	NC_009931	TCAAA	2	10	39644	39653	60 %	20 %	0 %	20 %	158341283
27	NC_009931	CAAAA	2	10	40947	40956	80 %	0 %	0 %	20 %	158341282
28	NC_009931	TCCCT	2	10	41261	41270	0 %	40 %	0 %	60 %	158341282
29	NC_009931	GGATG	2	10	41888	41897	20 %	20 %	60 %	0 %	158341281
30	NC_009931	GGACT	2	10	43434	43443	20 %	20 %	40 %	20 %	158341277
31	NC_009931	CACTT	2	10	45182	45191	20 %	40 %	0 %	40 %	158341276
32	NC_009931	AAATG	2	10	46624	46633	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009931	GTCTT	2	10	46643	46652	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009931	CTTGG	2	10	48450	48459	0 %	40 %	40 %	20 %	158341273
35	NC_009931	AAATC	2	10	53287	53296	60 %	20 %	0 %	20 %	158341270
36	NC_009931	CATGA	2	10	53801	53810	40 %	20 %	20 %	20 %	158341270
37	NC_009931	TCCAT	2	10	54242	54251	20 %	40 %	0 %	40 %	158341270
38	NC_009931	GCGAT	2	10	55677	55686	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009931	GATCA	2	10	64824	64833	40 %	20 %	20 %	20 %	158341261
40	NC_009931	CATCA	2	10	65139	65148	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_009931	AAGCG	2	10	66149	66158	40 %	0 %	40 %	20 %	158341260
42	NC_009931	TTTGG	2	10	66555	66564	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009931	ATGAT	2	10	66590	66599	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009931	GATGG	2	10	68355	68364	20 %	20 %	60 %	0 %	158341256
45	NC_009931	GTCCA	2	10	71829	71838	20 %	20 %	20 %	40 %	158341253
46	NC_009931	GAAGC	2	10	72607	72616	40 %	0 %	40 %	20 %	158341252
47	NC_009931	TCCCC	2	10	73574	73583	0 %	20 %	0 %	80 %	158341248
48	NC_009931	GTGAG	2	10	73970	73979	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009931	CGTAA	2	10	76379	76388	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009931	CGAAT	2	10	81215	81224	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009931	AGGAC	2	10	81450	81459	40 %	0 %	40 %	20 %	158341237
52	NC_009931	ATTCA	2	10	84067	84076	40 %	40 %	0 %	20 %	158341235
53	NC_009931	TGGGA	2	10	84986	84995	20 %	20 %	60 %	0 %	158341233
54	NC_009931	TCCAG	2	10	88098	88107	20 %	20 %	20 %	40 %	158341228
55	NC_009931	CCTCA	2	10	89066	89075	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_009931	CTCCC	2	10	89614	89623	0 %	20 %	0 %	80 %	158341225
57	NC_009931	AAACT	2	10	90854	90863	60 %	20 %	0 %	20 %	158341224
58	NC_009931	GAAAG	2	10	91743	91752	60 %	0 %	40 %	0 %	158341223
59	NC_009931	GCTTC	2	10	92486	92495	0 %	40 %	20 %	40 %	158341221
60	NC_009931	AATCA	2	10	94441	94450	60 %	20 %	0 %	20 %	158341219
61	NC_009931	ACTCA	2	10	94756	94765	40 %	20 %	0 %	40 %	158341218
62	NC_009931	TGACT	2	10	96701	96710	20 %	40 %	20 %	20 %	158341216
63	NC_009931	AATCA	2	10	99514	99523	60 %	20 %	0 %	20 %	158341212
64	NC_009931	AGCTG	2	10	99795	99804	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009931	TTGAG	2	10	101219	101228	20 %	40 %	40 %	0 %	158341209
66	NC_009931	TCAGT	2	10	104226	104235	20 %	40 %	20 %	20 %	158341208
67	NC_009931	TGCGA	2	10	104732	104741	20 %	20 %	40 %	20 %	158341208
68	NC_009931	TGCAT	2	10	106778	106787	20 %	40 %	20 %	20 %	158341206
69	NC_009931	TTTTG	2	10	108796	108805	0 %	80 %	20 %	0 %	158341205
70	NC_009931	ACACC	2	10	109840	109849	40 %	0 %	0 %	60 %	158341205
71	NC_009931	GAAAG	2	10	110251	110260	60 %	0 %	40 %	0 %	158341204
72	NC_009931	TTCTC	2	10	110593	110602	0 %	60 %	0 %	40 %	158341204
73	NC_009931	TTAAT	2	10	111569	111578	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009931	CAACT	2	10	116997	117006	40 %	20 %	0 %	40 %	158341198
75	NC_009931	CAGAT	2	10	118862	118871	40 %	20 %	20 %	20 %	158341195
76	NC_009931	ACTGA	2	10	119170	119179	40 %	20 %	20 %	20 %	158341195
77	NC_009931	TCAAG	2	10	121626	121635	40 %	20 %	20 %	20 %	158341142
78	NC_009931	GAGAC	2	10	124229	124238	40 %	0 %	40 %	20 %	158341191
79	NC_009931	CCTCC	2	10	124988	124997	0 %	20 %	0 %	80 %	158341191
80	NC_009931	AGCAA	2	10	128401	128410	60 %	0 %	20 %	20 %	158341189
81	NC_009931	GGTGT	2	10	129190	129199	0 %	40 %	60 %	0 %	158341188
82	NC_009931	ATCCC	2	10	132921	132930	20 %	20 %	0 %	60 %	158341184
83	NC_009931	AGCAA	2	10	133686	133695	60 %	0 %	20 %	20 %	158341184
84	NC_009931	CAATG	2	10	135393	135402	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_009931	ATCAA	2	10	138774	138783	60 %	20 %	0 %	20 %	158341180
86	NC_009931	CTCAG	2	10	140141	140150	20 %	20 %	20 %	40 %	158341178
87	NC_009931	CCTGA	2	10	142313	142322	20 %	20 %	20 %	40 %	158341176
88	NC_009931	CCTGG	2	10	143351	143360	0 %	20 %	40 %	40 %	158341176
89	NC_009931	CCTGC	2	10	143637	143646	0 %	20 %	20 %	60 %	158341176
90	NC_009931	CCCTT	2	10	143870	143879	0 %	40 %	0 %	60 %	158341176
91	NC_009931	ATCCA	2	10	145063	145072	40 %	20 %	0 %	40 %	158341176
92	NC_009931	GCTGA	2	10	146347	146356	20 %	20 %	40 %	20 %	158341176
93	NC_009931	TGGCT	2	10	147135	147144	0 %	40 %	40 %	20 %	158341176
94	NC_009931	GAACC	2	10	149442	149451	40 %	0 %	20 %	40 %	158341173
95	NC_009931	CTGAT	2	10	151742	151751	20 %	40 %	20 %	20 %	158341170
96	NC_009931	GAAGA	2	10	152213	152222	60 %	0 %	40 %	0 %	158341169
97	NC_009931	TGCTG	2	10	158598	158607	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009931	CAATC	2	10	158728	158737	40 %	20 %	0 %	40 %	158341157
99	NC_009931	AGAAT	2	10	161330	161339	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009931	TTCAG	2	10	163245	163254	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_009931	TTGAG	2	10	163503	163512	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009931	CTCTG	2	10	163966	163975	0 %	40 %	20 %	40 %	158341148
103	NC_009931	GAAAG	2	10	164760	164769	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009931	CTTTC	2	10	165319	165328	0 %	60 %	0 %	40 %	158341145
105	NC_009931	ATCGC	2	10	168988	168997	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_009931	TCATG	2	10	170864	170873	20 %	40 %	20 %	20 %	158341143
107	NC_009931	GATTT	2	10	171378	171387	20 %	60 %	20 %	0 %	158341143

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.