MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB6

Total Repeats: 410

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009931	ATGA	2	8	273	280	50 %	25 %	25 %	0 %	158341328
2	NC_009931	TATC	2	8	742	749	25 %	50 %	0 %	25 %	158341141
3	NC_009931	CATT	2	8	1459	1466	25 %	50 %	0 %	25 %	158341141
4	NC_009931	TGGG	2	8	1514	1521	0 %	25 %	75 %	0 %	158341141
5	NC_009931	GCAA	2	8	1771	1778	50 %	0 %	25 %	25 %	158341141
6	NC_009931	TGTC	2	8	1837	1844	0 %	50 %	25 %	25 %	158341141
7	NC_009931	CAAG	2	8	1907	1914	50 %	0 %	25 %	25 %	158341141
8	NC_009931	TCAT	2	8	2816	2823	25 %	50 %	0 %	25 %	158341327
9	NC_009931	AATA	2	8	3431	3438	75 %	25 %	0 %	0 %	158341327
10	NC_009931	ATAC	2	8	3578	3585	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009931	CATA	2	8	3699	3706	50 %	25 %	0 %	25 %	158341326
12	NC_009931	GACC	2	8	4402	4409	25 %	0 %	25 %	50 %	158341326
13	NC_009931	GCTT	2	8	4671	4678	0 %	50 %	25 %	25 %	158341326
14	NC_009931	TCCA	2	8	5195	5202	25 %	25 %	0 %	50 %	158341326
15	NC_009931	ATTC	2	8	5449	5456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009931	GTCT	2	8	5470	5477	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009931	ATTG	2	8	5613	5620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009931	AATC	2	8	6423	6430	50 %	25 %	0 %	25 %	158341325
19	NC_009931	CTGG	2	8	6846	6853	0 %	25 %	50 %	25 %	158341325
20	NC_009931	TATC	2	8	8618	8625	25 %	50 %	0 %	25 %	158341324
21	NC_009931	CATT	2	8	9335	9342	25 %	50 %	0 %	25 %	158341324
22	NC_009931	TGGG	2	8	9390	9397	0 %	25 %	75 %	0 %	158341324
23	NC_009931	GCAA	2	8	9647	9654	50 %	0 %	25 %	25 %	158341324
24	NC_009931	TGTC	2	8	9713	9720	0 %	50 %	25 %	25 %	158341324
25	NC_009931	CAAG	2	8	9783	9790	50 %	0 %	25 %	25 %	158341324
26	NC_009931	AGCC	2	8	11682	11689	25 %	0 %	25 %	50 %	158341320
27	NC_009931	ACCC	2	8	11787	11794	25 %	0 %	0 %	75 %	158341320
28	NC_009931	CAAG	2	8	11822	11829	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009931	TCTT	2	8	11990	11997	0 %	75 %	0 %	25 %	158341319
30	NC_009931	GATT	2	8	12122	12129	25 %	50 %	25 %	0 %	158341319
31	NC_009931	CCAC	2	8	12756	12763	25 %	0 %	0 %	75 %	158341318
32	NC_009931	CTGT	2	8	12990	12997	0 %	50 %	25 %	25 %	158341318
33	NC_009931	TGCC	2	8	13316	13323	0 %	25 %	25 %	50 %	158341318
34	NC_009931	CCAG	2	8	13352	13359	25 %	0 %	25 %	50 %	158341318
35	NC_009931	CCCA	2	8	13689	13696	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_009931	CTTC	2	8	13763	13770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009931	GATT	2	8	13845	13852	25 %	50 %	25 %	0 %	158341317
38	NC_009931	TTGC	2	8	14620	14627	0 %	50 %	25 %	25 %	158341315
39	NC_009931	TTGA	2	8	15028	15035	25 %	50 %	25 %	0 %	158341314
40	NC_009931	CAAT	2	8	15450	15457	50 %	25 %	0 %	25 %	158341313
41	NC_009931	AGCT	2	8	15742	15749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009931	GCTG	2	8	17924	17931	0 %	25 %	50 %	25 %	158341308
43	NC_009931	CTAT	2	8	18070	18077	25 %	50 %	0 %	25 %	158341307
44	NC_009931	ACCG	2	8	18240	18247	25 %	0 %	25 %	50 %	158341307
45	NC_009931	GGCG	2	8	18344	18351	0 %	0 %	75 %	25 %	158341307
46	NC_009931	TGGA	2	8	20137	20144	25 %	25 %	50 %	0 %	158341303
47	NC_009931	TGAT	2	8	20601	20608	25 %	50 %	25 %	0 %	158341302
48	NC_009931	CTTG	2	8	20836	20843	0 %	50 %	25 %	25 %	158341302
49	NC_009931	CGGT	2	8	22113	22120	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009931	CAAT	2	8	22130	22137	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009931	GTCG	2	8	22452	22459	0 %	25 %	50 %	25 %	158341297
52	NC_009931	TGGT	2	8	22780	22787	0 %	50 %	50 %	0 %	158341298
53	NC_009931	TTGT	2	8	23162	23169	0 %	75 %	25 %	0 %	158341296
54	NC_009931	GTCA	2	8	23317	23324	25 %	25 %	25 %	25 %	158341296
55	NC_009931	CCTT	2	8	23402	23409	0 %	50 %	0 %	50 %	158341296
56	NC_009931	GGAA	2	8	23493	23500	50 %	0 %	50 %	0 %	158341296
57	NC_009931	GGTT	2	8	23599	23606	0 %	50 %	50 %	0 %	158341296
58	NC_009931	TCCC	2	8	23708	23715	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_009931	CAAA	2	8	24071	24078	75 %	0 %	0 %	25 %	158341295
60	NC_009931	ATCT	2	8	24395	24402	25 %	50 %	0 %	25 %	158341295
61	NC_009931	CTAG	2	8	24922	24929	25 %	25 %	25 %	25 %	158341294
62	NC_009931	GAAA	2	8	26073	26080	75 %	0 %	25 %	0 %	158341293
63	NC_009931	AATT	2	8	26351	26358	50 %	50 %	0 %	0 %	158341293
64	NC_009931	ATCA	2	8	26374	26381	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009931	ATGA	2	8	26695	26702	50 %	25 %	25 %	0 %	158341292
66	NC_009931	TGTT	2	8	26918	26925	0 %	75 %	25 %	0 %	158341292
67	NC_009931	TCGT	2	8	27204	27211	0 %	50 %	25 %	25 %	158341292
68	NC_009931	ATGG	2	8	28384	28391	25 %	25 %	50 %	0 %	158341292
69	NC_009931	CTTC	2	8	28445	28452	0 %	50 %	0 %	50 %	158341292
70	NC_009931	AACT	2	8	28591	28598	50 %	25 %	0 %	25 %	158341292
71	NC_009931	TTGA	2	8	29074	29081	25 %	50 %	25 %	0 %	158341292
72	NC_009931	CCCT	2	8	29119	29126	0 %	25 %	0 %	75 %	158341292
73	NC_009931	AGCC	2	8	29191	29198	25 %	0 %	25 %	50 %	158341292
74	NC_009931	AGCC	2	8	29395	29402	25 %	0 %	25 %	50 %	158341292
75	NC_009931	AATA	2	8	29720	29727	75 %	25 %	0 %	0 %	158341292
76	NC_009931	CAAG	2	8	30517	30524	50 %	0 %	25 %	25 %	158341292
77	NC_009931	ATCT	2	8	30799	30806	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009931	CCCT	2	8	30929	30936	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_009931	GGGA	2	8	30948	30955	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009931	GGGT	2	8	32043	32050	0 %	25 %	75 %	0 %	158341289
81	NC_009931	TTTA	2	8	32588	32595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009931	CTTC	2	8	33530	33537	0 %	50 %	0 %	50 %	158341288
83	NC_009931	GGTT	2	8	33797	33804	0 %	50 %	50 %	0 %	158341288
84	NC_009931	GCCA	2	8	33883	33890	25 %	0 %	25 %	50 %	158341288
85	NC_009931	TGTC	2	8	34712	34719	0 %	50 %	25 %	25 %	158341288
86	NC_009931	GCAG	2	8	34760	34767	25 %	0 %	50 %	25 %	158341288
87	NC_009931	TGGT	2	8	35896	35903	0 %	50 %	50 %	0 %	158341286
88	NC_009931	TGCA	2	8	35930	35937	25 %	25 %	25 %	25 %	158341286
89	NC_009931	CGTC	2	8	35982	35989	0 %	25 %	25 %	50 %	158341286
90	NC_009931	CTGT	2	8	36119	36126	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009931	TTAG	2	8	36525	36532	25 %	50 %	25 %	0 %	158341284
92	NC_009931	TGGT	2	8	36597	36604	0 %	50 %	50 %	0 %	158341284
93	NC_009931	TCAA	2	8	36817	36824	50 %	25 %	0 %	25 %	158341284
94	NC_009931	TTGA	2	8	36976	36983	25 %	50 %	25 %	0 %	158341285
95	NC_009931	GGGT	2	8	37344	37351	0 %	25 %	75 %	0 %	158341283
96	NC_009931	TCGC	2	8	37631	37638	0 %	25 %	25 %	50 %	158341283
97	NC_009931	GATG	2	8	37716	37723	25 %	25 %	50 %	0 %	158341283
98	NC_009931	GCTC	2	8	38073	38080	0 %	25 %	25 %	50 %	158341283
99	NC_009931	ATCG	2	8	38254	38261	25 %	25 %	25 %	25 %	158341283
100	NC_009931	AAAG	2	8	38585	38592	75 %	0 %	25 %	0 %	158341283
101	NC_009931	CGGT	2	8	39384	39391	0 %	25 %	50 %	25 %	158341283
102	NC_009931	ATCG	2	8	39772	39779	25 %	25 %	25 %	25 %	158341283
103	NC_009931	GATC	2	8	39870	39877	25 %	25 %	25 %	25 %	158341283
104	NC_009931	CCAG	2	8	40021	40028	25 %	0 %	25 %	50 %	158341283
105	NC_009931	CCAT	2	8	40681	40688	25 %	25 %	0 %	50 %	158341282
106	NC_009931	GCGG	2	8	41105	41112	0 %	0 %	75 %	25 %	158341282
107	NC_009931	TGAG	2	8	41275	41282	25 %	25 %	50 %	0 %	158341282
108	NC_009931	TTGA	2	8	43919	43926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009931	TGAT	2	8	44449	44456	25 %	50 %	25 %	0 %	158341276
110	NC_009931	GAAA	2	8	45579	45586	75 %	0 %	25 %	0 %	158341276
111	NC_009931	ACTC	2	8	45710	45717	25 %	25 %	0 %	50 %	158341276
112	NC_009931	AGTC	2	8	45925	45932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009931	ATGA	2	8	46569	46576	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009931	ATGG	2	8	46808	46815	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009931	TAAC	2	8	46940	46947	50 %	25 %	0 %	25 %	158341273
116	NC_009931	AATT	2	8	47361	47368	50 %	50 %	0 %	0 %	158341273
117	NC_009931	ACCA	2	8	47409	47416	50 %	0 %	0 %	50 %	158341273
118	NC_009931	ATAA	2	8	47761	47768	75 %	25 %	0 %	0 %	158341273
119	NC_009931	GCTG	2	8	48070	48077	0 %	25 %	50 %	25 %	158341273
120	NC_009931	AAAT	2	8	49041	49048	75 %	25 %	0 %	0 %	158341273
121	NC_009931	GTAA	2	8	49206	49213	50 %	25 %	25 %	0 %	158341273
122	NC_009931	TCCC	2	8	51065	51072	0 %	25 %	0 %	75 %	158341271
123	NC_009931	ATTG	2	8	51173	51180	25 %	50 %	25 %	0 %	158341271
124	NC_009931	TCAT	2	8	51666	51673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009931	TGTT	2	8	52239	52246	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009931	ATAC	2	8	52428	52435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009931	CATA	2	8	52549	52556	50 %	25 %	0 %	25 %	158341270
128	NC_009931	GACC	2	8	53252	53259	25 %	0 %	25 %	50 %	158341270
129	NC_009931	GCTT	2	8	53521	53528	0 %	50 %	25 %	25 %	158341270
130	NC_009931	TCCA	2	8	54045	54052	25 %	25 %	0 %	50 %	158341270
131	NC_009931	ATTC	2	8	54299	54306	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009931	GTCT	2	8	54320	54327	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009931	ATTG	2	8	54463	54470	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009931	AATC	2	8	55273	55280	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009931	CTGG	2	8	55696	55703	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009931	CTTG	2	8	57613	57620	0 %	50 %	25 %	25 %	158341269
137	NC_009931	GACA	2	8	57683	57690	50 %	0 %	25 %	25 %	158341269
138	NC_009931	TTGC	2	8	57749	57756	0 %	50 %	25 %	25 %	158341269
139	NC_009931	CCCA	2	8	58006	58013	25 %	0 %	0 %	75 %	158341269
140	NC_009931	GAAT	2	8	58060	58067	50 %	25 %	25 %	0 %	158341269
141	NC_009931	CGTT	2	8	58464	58471	0 %	50 %	25 %	25 %	158341269
142	NC_009931	TTAC	2	8	59219	59226	25 %	50 %	0 %	25 %	158341267
143	NC_009931	ATCA	2	8	59794	59801	50 %	25 %	0 %	25 %	158341268
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.