MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB6

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009931	ATAC	2	8	3578	3585	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009931	ATTC	2	8	5449	5456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009931	GTCT	2	8	5470	5477	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009931	ATTG	2	8	5613	5620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009931	CAAG	2	8	11822	11829	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009931	CCCA	2	8	13689	13696	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_009931	CTTC	2	8	13763	13770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009931	AGCT	2	8	15742	15749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009931	CGGT	2	8	22113	22120	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009931	CAAT	2	8	22130	22137	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009931	TCCC	2	8	23708	23715	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_009931	ATCA	2	8	26374	26381	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009931	ATCT	2	8	30799	30806	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009931	CCCT	2	8	30929	30936	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_009931	GGGA	2	8	30948	30955	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009931	TTTA	2	8	32588	32595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009931	CTGT	2	8	36119	36126	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009931	TTGA	2	8	43919	43926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009931	AGTC	2	8	45925	45932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009931	ATGA	2	8	46569	46576	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009931	ATGG	2	8	46808	46815	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009931	TCAT	2	8	51666	51673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009931	TGTT	2	8	52239	52246	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009931	ATAC	2	8	52428	52435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009931	ATTC	2	8	54299	54306	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009931	GTCT	2	8	54320	54327	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009931	ATTG	2	8	54463	54470	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009931	AATC	2	8	55273	55280	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009931	CTGG	2	8	55696	55703	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009931	TTCA	2	8	60812	60819	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009931	ATCT	2	8	61693	61700	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009931	AATA	2	8	65171	65178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009931	CTGT	2	8	66650	66657	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009931	CTGA	2	8	68258	68265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009931	GTCG	2	8	73158	73165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009931	GCGT	2	8	76205	76212	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009931	AAAC	2	8	76323	76330	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009931	GCTA	2	8	76389	76396	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009931	CTTA	2	8	78684	78691	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009931	TTTG	2	8	78768	78775	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009931	ATTG	2	8	78801	78808	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009931	CCAT	2	8	79345	79352	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009931	GAAA	2	8	79560	79567	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009931	CAGA	2	8	87597	87604	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009931	AGTG	2	8	89103	89110	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009931	ACTG	2	8	91964	91971	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009931	GTCC	2	8	91977	91984	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009931	CTAG	2	8	99980	99987	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009931	TATG	2	8	100396	100403	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009931	AAGT	2	8	111353	111360	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009931	GATC	2	8	113832	113839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009931	AGCT	2	8	116374	116381	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009931	CAAA	2	8	132560	132567	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009931	CCAT	2	8	135535	135542	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009931	GATG	2	8	135591	135598	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009931	TAAT	2	8	138832	138839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009931	ACTA	2	8	149267	149274	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009931	TGAT	2	8	149281	149288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009931	GGTC	2	8	153355	153362	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009931	CTTT	2	8	153461	153468	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009931	GGCG	2	8	154031	154038	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009931	ACGA	2	8	155595	155602	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009931	AAAC	2	8	155640	155647	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009931	AACT	2	8	156091	156098	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009931	TGAG	2	8	156159	156166	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009931	AACA	2	8	157053	157060	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009931	ACAG	2	8	157150	157157	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009931	CCCA	2	8	157354	157361	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_009931	ATTA	2	8	157419	157426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009931	CCAC	2	8	158054	158061	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_009931	GTTC	2	8	158173	158180	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009931	TGGG	2	8	158229	158236	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009931	TGAT	2	8	158532	158539	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009931	TTGA	2	8	159591	159598	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009931	TCAG	2	8	160324	160331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009931	ATGA	2	8	160378	160385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009931	AATG	2	8	161542	161549	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009931	ATTA	2	8	164697	164704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009931	CCAG	2	8	168971	168978	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009931	GATT	2	8	169394	169401	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009931	TCAA	2	8	170203	170210	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009931	CAGA	2	8	170346	170353	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009931	GAAT	2	8	170368	170375	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009931	GTAT	2	8	172239	172246	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009931	TATT	2	8	172386	172393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.