MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB6

Total Repeats: 221

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009931	GA	3	6	919	924	50 %	0 %	50 %	0 %	158341141
2	NC_009931	AT	3	6	1310	1315	50 %	50 %	0 %	0 %	158341141
3	NC_009931	GT	3	6	1544	1549	0 %	50 %	50 %	0 %	158341141
4	NC_009931	AG	3	6	1982	1987	50 %	0 %	50 %	0 %	158341141
5	NC_009931	GT	3	6	2502	2507	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009931	CT	3	6	3904	3909	0 %	50 %	0 %	50 %	158341326
7	NC_009931	AT	3	6	4483	4488	50 %	50 %	0 %	0 %	158341326
8	NC_009931	GA	3	6	4723	4728	50 %	0 %	50 %	0 %	158341326
9	NC_009931	TG	3	6	5232	5237	0 %	50 %	50 %	0 %	158341326
10	NC_009931	AG	3	6	5576	5581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009931	TC	3	6	6792	6797	0 %	50 %	0 %	50 %	158341325
12	NC_009931	GA	3	6	8795	8800	50 %	0 %	50 %	0 %	158341324
13	NC_009931	AT	3	6	9186	9191	50 %	50 %	0 %	0 %	158341324
14	NC_009931	GT	3	6	9420	9425	0 %	50 %	50 %	0 %	158341324
15	NC_009931	AG	3	6	9858	9863	50 %	0 %	50 %	0 %	158341324
16	NC_009931	GA	3	6	10628	10633	50 %	0 %	50 %	0 %	158341323
17	NC_009931	TC	3	6	10735	10740	0 %	50 %	0 %	50 %	158341322
18	NC_009931	GA	3	6	11345	11350	50 %	0 %	50 %	0 %	158341321
19	NC_009931	TA	4	8	11411	11418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009931	TG	4	8	13237	13244	0 %	50 %	50 %	0 %	158341318
21	NC_009931	AT	3	6	14188	14193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009931	GT	3	6	15084	15089	0 %	50 %	50 %	0 %	158341314
23	NC_009931	TG	3	6	15568	15573	0 %	50 %	50 %	0 %	158341313
24	NC_009931	AG	3	6	15651	15656	50 %	0 %	50 %	0 %	158341313
25	NC_009931	GA	3	6	17993	17998	50 %	0 %	50 %	0 %	158341308
26	NC_009931	GA	3	6	18055	18060	50 %	0 %	50 %	0 %	158341307
27	NC_009931	CT	3	6	19528	19533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009931	TG	3	6	19854	19859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009931	AC	3	6	19946	19951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009931	TG	3	6	20244	20249	0 %	50 %	50 %	0 %	158341303
31	NC_009931	AG	4	8	21117	21124	50 %	0 %	50 %	0 %	158341301
32	NC_009931	GA	3	6	21452	21457	50 %	0 %	50 %	0 %	158341300
33	NC_009931	GA	3	6	21661	21666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009931	TG	3	6	23154	23159	0 %	50 %	50 %	0 %	158341296
35	NC_009931	AC	3	6	25451	25456	50 %	0 %	0 %	50 %	158341294
36	NC_009931	GA	3	6	29628	29633	50 %	0 %	50 %	0 %	158341292
37	NC_009931	TC	3	6	32403	32408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009931	TG	3	6	33196	33201	0 %	50 %	50 %	0 %	158341288
39	NC_009931	GA	3	6	34072	34077	50 %	0 %	50 %	0 %	158341288
40	NC_009931	TC	3	6	34186	34191	0 %	50 %	0 %	50 %	158341288
41	NC_009931	AG	3	6	34242	34247	50 %	0 %	50 %	0 %	158341288
42	NC_009931	GA	3	6	34444	34449	50 %	0 %	50 %	0 %	158341288
43	NC_009931	CA	3	6	35398	35403	50 %	0 %	0 %	50 %	158341286
44	NC_009931	GA	3	6	36323	36328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009931	CT	3	6	36334	36339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009931	CA	3	6	37048	37053	50 %	0 %	0 %	50 %	158341285
47	NC_009931	AC	3	6	39135	39140	50 %	0 %	0 %	50 %	158341283
48	NC_009931	AT	3	6	40703	40708	50 %	50 %	0 %	0 %	158341282
49	NC_009931	GT	3	6	41323	41328	0 %	50 %	50 %	0 %	158341282
50	NC_009931	CG	3	6	41667	41672	0 %	0 %	50 %	50 %	158341281
51	NC_009931	TC	3	6	41853	41858	0 %	50 %	0 %	50 %	158341281
52	NC_009931	AC	3	6	43243	43248	50 %	0 %	0 %	50 %	158341277
53	NC_009931	TC	3	6	43742	43747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009931	AT	3	6	46583	46588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009931	CT	3	6	47977	47982	0 %	50 %	0 %	50 %	158341273
56	NC_009931	GC	3	6	48031	48036	0 %	0 %	50 %	50 %	158341273
57	NC_009931	CT	3	6	48771	48776	0 %	50 %	0 %	50 %	158341273
58	NC_009931	TG	3	6	49337	49342	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009931	AT	4	8	49472	49479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009931	CT	3	6	49725	49730	0 %	50 %	0 %	50 %	158341272
61	NC_009931	AT	3	6	50680	50685	50 %	50 %	0 %	0 %	158341272
62	NC_009931	GC	3	6	50725	50730	0 %	0 %	50 %	50 %	158341272
63	NC_009931	CT	3	6	52754	52759	0 %	50 %	0 %	50 %	158341270
64	NC_009931	AT	3	6	53333	53338	50 %	50 %	0 %	0 %	158341270
65	NC_009931	GA	3	6	53573	53578	50 %	0 %	50 %	0 %	158341270
66	NC_009931	TG	3	6	54082	54087	0 %	50 %	50 %	0 %	158341270
67	NC_009931	AG	3	6	54426	54431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009931	TC	3	6	55642	55647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009931	AC	3	6	55662	55667	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009931	CT	3	6	57540	57545	0 %	50 %	0 %	50 %	158341269
71	NC_009931	CA	3	6	57977	57982	50 %	0 %	0 %	50 %	158341269
72	NC_009931	AT	3	6	58212	58217	50 %	50 %	0 %	0 %	158341269
73	NC_009931	TC	3	6	58603	58608	0 %	50 %	0 %	50 %	158341269
74	NC_009931	TA	3	6	59080	59085	50 %	50 %	0 %	0 %	158341267
75	NC_009931	AT	3	6	59584	59589	50 %	50 %	0 %	0 %	158341267
76	NC_009931	CA	3	6	59617	59622	50 %	0 %	0 %	50 %	158341268
77	NC_009931	TA	3	6	61187	61192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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81	NC_009931	GA	3	6	63561	63566	50 %	0 %	50 %	0 %	158341262
82	NC_009931	AG	3	6	64944	64949	50 %	0 %	50 %	0 %	158341261
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84	NC_009931	GC	3	6	65820	65825	0 %	0 %	50 %	50 %	158341260
85	NC_009931	GA	3	6	66347	66352	50 %	0 %	50 %	0 %	158341260
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87	NC_009931	CT	3	6	71058	71063	0 %	50 %	0 %	50 %	158341255
88	NC_009931	TC	3	6	71157	71162	0 %	50 %	0 %	50 %	158341255
89	NC_009931	TG	3	6	71792	71797	0 %	50 %	50 %	0 %	158341253
90	NC_009931	CT	4	8	72079	72086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009931	CA	3	6	72828	72833	50 %	0 %	0 %	50 %	158341250
92	NC_009931	CA	3	6	72921	72926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009931	TC	3	6	73146	73151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009931	TC	3	6	73369	73374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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96	NC_009931	AT	3	6	73964	73969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009931	AT	3	6	74057	74062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009931	TG	4	8	74334	74341	0 %	50 %	50 %	0 %	158341247
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104	NC_009931	CT	3	6	77297	77302	0 %	50 %	0 %	50 %	158341244
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106	NC_009931	AT	3	6	78693	78698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009931	TC	3	6	79266	79271	0 %	50 %	0 %	50 %	158341242
108	NC_009931	AT	3	6	79588	79593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009931	AG	3	6	79922	79927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009931	TC	3	6	81932	81937	0 %	50 %	0 %	50 %	158341238
111	NC_009931	AT	3	6	82319	82324	50 %	50 %	0 %	0 %	158341238
112	NC_009931	GA	3	6	82383	82388	50 %	0 %	50 %	0 %	158341238
113	NC_009931	CT	3	6	82799	82804	0 %	50 %	0 %	50 %	158341238
114	NC_009931	AC	3	6	82927	82932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_009931	AG	3	6	82963	82968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009931	GA	3	6	83089	83094	50 %	0 %	50 %	0 %	158341236
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118	NC_009931	GA	4	8	84729	84736	50 %	0 %	50 %	0 %	158341235
119	NC_009931	CT	3	6	85016	85021	0 %	50 %	0 %	50 %	158341233
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121	NC_009931	TG	4	8	86683	86690	0 %	50 %	50 %	0 %	158341231
122	NC_009931	AC	3	6	88842	88847	50 %	0 %	0 %	50 %	158341228
123	NC_009931	GA	4	8	89177	89184	50 %	0 %	50 %	0 %	158341227
124	NC_009931	AC	3	6	89826	89831	50 %	0 %	0 %	50 %	158341225
125	NC_009931	AT	3	6	90077	90082	50 %	50 %	0 %	0 %	158341225
126	NC_009931	GT	3	6	90218	90223	0 %	50 %	50 %	0 %	158341225
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128	NC_009931	TC	3	6	92257	92262	0 %	50 %	0 %	50 %	158341221
129	NC_009931	CT	3	6	92858	92863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009931	TC	3	6	93241	93246	0 %	50 %	0 %	50 %	158341220
131	NC_009931	CA	3	6	94800	94805	50 %	0 %	0 %	50 %	158341218
132	NC_009931	AT	3	6	95633	95638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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136	NC_009931	GA	3	6	97607	97612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009931	CA	3	6	97625	97630	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.