MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB5

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009930	ATCGTG	2	12	8919	8930	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158340923
2	NC_009930	TCAACA	2	12	11787	11798	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	158340928
3	NC_009930	TAAATA	2	12	14901	14912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340933
4	NC_009930	TTAGAT	2	12	18288	18299	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158340939
5	NC_009930	AGAGTC	2	12	21019	21030	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158340943
6	NC_009930	AAATCA	2	12	21656	21667	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	158340943
7	NC_009930	TCAATC	2	12	25118	25129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340945
8	NC_009930	ATGGTG	2	12	25918	25929	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158340947
9	NC_009930	ATCTCA	2	12	28739	28750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340953
10	NC_009930	AACGAT	2	12	28970	28981	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158340953
11	NC_009930	ATAGAA	2	12	30797	30808	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	158340955
12	NC_009930	CCTTCT	2	12	32896	32907	0 %	50 %	0 %	50 %	158340956
13	NC_009930	ATTTGA	2	12	33155	33166	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158340956
14	NC_009930	GGTTTG	2	12	34099	34110	0 %	50 %	50 %	0 %	158340960
15	NC_009930	TTAAGT	2	12	37538	37549	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158340969
16	NC_009930	AATCCC	2	12	38057	38068	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	158340971
17	NC_009930	CCTAGA	2	12	39211	39222	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158340974
18	NC_009930	GGCAAA	2	12	53766	53777	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158340994
19	NC_009930	CCAAGA	2	12	70570	70581	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158341013
20	NC_009930	AGACAA	2	12	70781	70792	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	158341013
21	NC_009930	ATCAAC	2	12	71040	71051	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	158341013
22	NC_009930	AGTTGC	2	12	72583	72594	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158341016
23	NC_009930	GTATAG	2	12	77161	77172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341024
24	NC_009930	GTGTAG	2	12	77743	77754	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158341024
25	NC_009930	GTATCG	2	12	78508	78519	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158341024
26	NC_009930	CATCTC	2	12	78599	78610	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158341024
27	NC_009930	CATCTC	2	12	79148	79159	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158341024
28	NC_009930	CATCTC	2	12	79694	79705	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158341024
29	NC_009930	GAAATT	2	12	79797	79808	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158341024
30	NC_009930	AATGGG	2	12	90734	90745	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158341031
31	NC_009930	TGGGTG	2	12	91482	91493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158341031
32	NC_009930	CCTAGC	2	12	93951	93962	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158341034
33	NC_009930	AATCAA	2	12	96382	96393	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	158341039
34	NC_009930	TGTTTG	3	18	106021	106038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158341053
35	NC_009930	GTGATA	2	12	107060	107071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341056
36	NC_009930	GATTGC	2	12	108442	108453	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158341059
37	NC_009930	CAATGA	2	12	109536	109547	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158341062
38	NC_009930	CAGAAA	2	12	110314	110325	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	158341064
39	NC_009930	GCTAAG	2	12	110809	110820	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158341067
40	NC_009930	TCTGAG	2	12	110821	110832	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158341067
41	NC_009930	TGGAGC	2	12	111835	111846	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158341068
42	NC_009930	TCTTGA	2	12	125333	125344	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158341092
43	NC_009930	CATGGA	2	12	125556	125567	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158341092
44	NC_009930	AGTCAA	2	12	125856	125867	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158341092
45	NC_009930	ATACTG	2	12	128356	128367	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158341094
46	NC_009930	CTTCAT	2	12	131439	131450	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158341099
47	NC_009930	AGCCAG	2	12	133094	133105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341101
48	NC_009930	GCCTGA	2	12	142506	142517	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158341109
49	NC_009930	CCTTGG	2	12	142600	142611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341109
50	NC_009930	AAGCTC	2	12	143798	143809	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158341110
51	NC_009930	CGATAC	2	12	144387	144398	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158341111
52	NC_009930	TTGCGC	2	12	145779	145790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341111
53	NC_009930	GCTTTT	2	12	145864	145875	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	158341111
54	NC_009930	AACGCT	2	12	148000	148011	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158341113
55	NC_009930	AGGCAT	2	12	156514	156525	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158341121
56	NC_009930	GAACTG	2	12	158385	158396	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158341123
57	NC_009930	TGCCAA	2	12	158858	158869	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158341123
58	NC_009930	GGGCGA	2	12	159909	159920	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158341124
59	NC_009930	CGATAT	2	12	161841	161852	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158341124
60	NC_009930	GAAGGC	2	12	162608	162619	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158341125
61	NC_009930	AGGGTG	2	12	164660	164671	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	158341128
62	NC_009930	CAAACC	2	12	168438	168449	50 %	0 %	0 %	50 %	158341133
63	NC_009930	GGGTAG	2	12	170212	170223	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	158341136

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.