MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB5

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009930	AGACA	2	10	1763	1772	60 %	0 %	20 %	20 %	158340919
2	NC_009930	TTATC	2	10	2539	2548	20 %	60 %	0 %	20 %	158340919
3	NC_009930	TAAAA	2	10	4400	4409	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009930	GATTA	2	10	7077	7086	40 %	40 %	20 %	0 %	158340922
5	NC_009930	ACAAT	2	10	11659	11668	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009930	TAATC	2	10	11745	11754	40 %	40 %	0 %	20 %	158340928
7	NC_009930	TTGTT	2	10	13391	13400	0 %	80 %	20 %	0 %	158340931
8	NC_009930	AACGA	2	10	13452	13461	60 %	0 %	20 %	20 %	158340931
9	NC_009930	TAGAA	2	10	15006	15015	60 %	20 %	20 %	0 %	158340933
10	NC_009930	AAATG	2	10	23501	23510	60 %	20 %	20 %	0 %	158340943
11	NC_009930	AACTA	2	10	23850	23859	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009930	ACGGA	2	10	24509	24518	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009930	CAGAA	2	10	29850	29859	60 %	0 %	20 %	20 %	158340954
14	NC_009930	ATTGA	2	10	30604	30613	40 %	40 %	20 %	0 %	158340955
15	NC_009930	GTCTT	2	10	32813	32822	0 %	60 %	20 %	20 %	158340956
16	NC_009930	AGTAT	2	10	33355	33364	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009930	ATCAG	2	10	35538	35547	40 %	20 %	20 %	20 %	158340963
18	NC_009930	GGTTT	2	10	38248	38257	0 %	60 %	40 %	0 %	158340971
19	NC_009930	GGAAC	2	10	39179	39188	40 %	0 %	40 %	20 %	158340974
20	NC_009930	TCCAG	2	10	39615	39624	20 %	20 %	20 %	40 %	158340974
21	NC_009930	TTTCT	2	10	41024	41033	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009930	CCATC	2	10	44005	44014	20 %	20 %	0 %	60 %	158340982
23	NC_009930	GTTCG	2	10	44744	44753	0 %	40 %	40 %	20 %	158340984
24	NC_009930	TTTTG	2	10	45733	45742	0 %	80 %	20 %	0 %	158340985
25	NC_009930	GTGCT	2	10	46134	46143	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009930	TGGGT	2	10	46500	46509	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009930	ACTTC	2	10	47424	47433	20 %	40 %	0 %	40 %	158340988
28	NC_009930	CAACA	2	10	49415	49424	60 %	0 %	0 %	40 %	158340989
29	NC_009930	GCGTT	2	10	50782	50791	0 %	40 %	40 %	20 %	158340991
30	NC_009930	TGGAT	2	10	57380	57389	20 %	40 %	40 %	0 %	158340999
31	NC_009930	GCATC	2	10	57766	57775	20 %	20 %	20 %	40 %	158341000
32	NC_009930	TTGAA	2	10	58772	58781	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009930	CTATC	2	10	63218	63227	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009930	AGAAA	2	10	63349	63358	80 %	0 %	20 %	0 %	158341007
35	NC_009930	TTGCT	2	10	63627	63636	0 %	60 %	20 %	20 %	158341007
36	NC_009930	TAACT	2	10	66038	66047	40 %	40 %	0 %	20 %	158341010
37	NC_009930	GAAGT	2	10	67596	67605	40 %	20 %	40 %	0 %	158341011
38	NC_009930	GGAGA	2	10	67886	67895	40 %	0 %	60 %	0 %	158341011
39	NC_009930	TTGGA	2	10	67950	67959	20 %	40 %	40 %	0 %	158341011
40	NC_009930	AATAA	2	10	71208	71217	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009930	TAGGA	2	10	71736	71745	40 %	20 %	40 %	0 %	158341015
42	NC_009930	CTGAT	2	10	71897	71906	20 %	40 %	20 %	20 %	158341015
43	NC_009930	TTGTT	2	10	72275	72284	0 %	80 %	20 %	0 %	158341016
44	NC_009930	CCTTC	2	10	74909	74918	0 %	40 %	0 %	60 %	158341022
45	NC_009930	AGTTA	2	10	78279	78288	40 %	40 %	20 %	0 %	158341024
46	NC_009930	ATCGT	2	10	78946	78955	20 %	40 %	20 %	20 %	158341024
47	NC_009930	ATCGT	2	10	79492	79501	20 %	40 %	20 %	20 %	158341024
48	NC_009930	CCAAT	2	10	81702	81711	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_009930	TTCCC	2	10	82536	82545	0 %	40 %	0 %	60 %	158341025
50	NC_009930	TGGTC	2	10	84113	84122	0 %	40 %	40 %	20 %	158341025
51	NC_009930	TGGAC	2	10	86283	86292	20 %	20 %	40 %	20 %	158341027
52	NC_009930	CATAT	2	10	88770	88779	40 %	40 %	0 %	20 %	158341030
53	NC_009930	ATTCA	2	10	90401	90410	40 %	40 %	0 %	20 %	158341031
54	NC_009930	ACCAG	2	10	91583	91592	40 %	0 %	20 %	40 %	158341031
55	NC_009930	CTCAA	2	10	91953	91962	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_009930	AGATG	2	10	93789	93798	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009930	AACTG	2	10	95751	95760	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_009930	CATAG	2	10	97463	97472	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009930	TTCAT	2	10	98748	98757	20 %	60 %	0 %	20 %	158341040
60	NC_009930	GAAGT	2	10	100078	100087	40 %	20 %	40 %	0 %	158341043
61	NC_009930	GGAGA	2	10	100368	100377	40 %	0 %	60 %	0 %	158341043
62	NC_009930	GGATT	2	10	100434	100443	20 %	40 %	40 %	0 %	158341043
63	NC_009930	TTAGC	2	10	101638	101647	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_009930	ATTTC	2	10	101742	101751	20 %	60 %	0 %	20 %	158341045
65	NC_009930	GGGTT	2	10	104780	104789	0 %	40 %	60 %	0 %	158341051
66	NC_009930	CAGTT	2	10	108188	108197	20 %	40 %	20 %	20 %	158341059
67	NC_009930	CTTGT	2	10	108485	108494	0 %	60 %	20 %	20 %	158341059
68	NC_009930	TGAAC	2	10	108983	108992	40 %	20 %	20 %	20 %	158341060
69	NC_009930	GAATG	2	10	109046	109055	40 %	20 %	40 %	0 %	158341061
70	NC_009930	CCAGG	2	10	109191	109200	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_009930	GCAGA	2	10	110569	110578	40 %	0 %	40 %	20 %	158341065
72	NC_009930	CGTTG	2	10	114948	114957	0 %	40 %	40 %	20 %	158341070
73	NC_009930	GACAA	2	10	116471	116480	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009930	TGCAC	2	10	116928	116937	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_009930	TGAGC	2	10	126249	126258	20 %	20 %	40 %	20 %	158341092
76	NC_009930	TGGCT	2	10	128476	128485	0 %	40 %	40 %	20 %	158341094
77	NC_009930	AGTTG	2	10	131331	131340	20 %	40 %	40 %	0 %	158341099
78	NC_009930	GCCTG	2	10	131771	131780	0 %	20 %	40 %	40 %	158341100
79	NC_009930	GCTTG	2	10	133309	133318	0 %	40 %	40 %	20 %	158341102
80	NC_009930	CCCTT	2	10	134454	134463	0 %	40 %	0 %	60 %	158341104
81	NC_009930	GCACT	2	10	135363	135372	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_009930	CCCAA	2	10	135915	135924	40 %	0 %	0 %	60 %	158341105
83	NC_009930	AACGC	2	10	136956	136965	40 %	0 %	20 %	40 %	158341106
84	NC_009930	GTCAC	2	10	137742	137751	20 %	20 %	20 %	40 %	158341106
85	NC_009930	ACAGA	2	10	137963	137972	60 %	0 %	20 %	20 %	158341106
86	NC_009930	ATCTA	2	10	141285	141294	40 %	40 %	0 %	20 %	158341108
87	NC_009930	ATTTT	2	10	141429	141438	20 %	80 %	0 %	0 %	158341108
88	NC_009930	TGATC	2	10	142477	142486	20 %	40 %	20 %	20 %	158341109
89	NC_009930	GGGGA	2	10	143271	143280	20 %	0 %	80 %	0 %	158341109
90	NC_009930	ATCTG	2	10	147760	147769	20 %	40 %	20 %	20 %	158341113
91	NC_009930	GTACA	2	10	149139	149148	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_009930	AATTT	2	10	152370	152379	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009930	CCAGG	2	10	154375	154384	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_009930	TGCTG	2	10	154865	154874	0 %	40 %	40 %	20 %	158341119
95	NC_009930	AGGCA	2	10	159941	159950	40 %	0 %	40 %	20 %	158341124
96	NC_009930	GGGCT	2	10	160597	160606	0 %	20 %	60 %	20 %	158341124
97	NC_009930	CGTTC	2	10	162320	162329	0 %	40 %	20 %	40 %	158341125
98	NC_009930	CCCAG	2	10	163061	163070	20 %	0 %	20 %	60 %	158341127
99	NC_009930	TAGGG	2	10	163367	163376	20 %	20 %	60 %	0 %	158341127
100	NC_009930	TTGAT	2	10	164102	164111	20 %	60 %	20 %	0 %	158341128
101	NC_009930	TTGAG	2	10	165456	165465	20 %	40 %	40 %	0 %	158341129
102	NC_009930	TCAGC	2	10	166385	166394	20 %	20 %	20 %	40 %	158341129
103	NC_009930	CTTGA	2	10	171094	171103	20 %	40 %	20 %	20 %	158341136
104	NC_009930	CATTC	2	10	172262	172271	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_009930	AGTTC	2	10	172720	172729	20 %	40 %	20 %	20 %	158341138
106	NC_009930	CTGCT	2	10	175741	175750	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.