MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB5

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009930	AAGA	2	8	694	701	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009930	ATAA	2	8	840	847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009930	CTTA	2	8	1082	1089	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009930	AGTT	2	8	1156	1163	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009930	TGAT	2	8	9075	9082	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009930	TGTA	2	8	11032	11039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009930	CTTG	2	8	12841	12848	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009930	TATC	2	8	12902	12909	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009930	AAAT	2	8	13068	13075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009930	TAAT	2	8	14586	14593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009930	TAAT	2	8	14751	14758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009930	TATT	3	12	14771	14782	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009930	ATCT	2	8	15032	15039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009930	AAAT	2	8	15118	15125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009930	TGAA	2	8	15149	15156	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009930	TCAT	2	8	15183	15190	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009930	TTTA	2	8	15288	15295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009930	CTTA	2	8	16648	16655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009930	GCTG	2	8	16661	16668	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009930	TTTG	2	8	17340	17347	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009930	TATT	2	8	17996	18003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009930	CAGA	2	8	20751	20758	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009930	ATTT	2	8	20833	20840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009930	TTTG	2	8	23671	23678	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009930	AATA	2	8	23720	23727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009930	CTGT	2	8	25325	25332	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009930	AATA	2	8	25705	25712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009930	GGAT	2	8	28286	28293	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009930	AATT	2	8	34017	34024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009930	TTAG	2	8	36024	36031	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009930	GCCA	2	8	37291	37298	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009930	CTCC	2	8	38339	38346	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_009930	AGAT	2	8	41097	41104	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009930	CATT	2	8	44262	44269	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009930	TAAT	2	8	48942	48949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009930	AGAC	2	8	58710	58717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009930	GTAA	2	8	58859	58866	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009930	CAGG	2	8	60645	60652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009930	TTTA	2	8	63188	63195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009930	ATTG	2	8	72135	72142	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009930	TGAC	2	8	73087	73094	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009930	AGTG	2	8	73104	73111	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009930	AATT	2	8	81307	81314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009930	TATT	2	8	81517	81524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009930	TAAT	2	8	82050	82057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009930	TTAA	2	8	82171	82178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009930	TTCT	2	8	87199	87206	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009930	AAGT	2	8	87631	87638	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009930	TCTT	2	8	87793	87800	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009930	TATC	2	8	87838	87845	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009930	ATTG	2	8	89865	89872	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009930	TGTT	2	8	91882	91889	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009930	TGCG	2	8	92344	92351	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009930	ATGG	2	8	95683	95690	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009930	TCTT	2	8	97363	97370	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009930	TTTA	2	8	97640	97647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009930	TAAC	2	8	102391	102398	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009930	TATT	2	8	104857	104864	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009930	TCTT	2	8	105102	105109	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009930	TGAA	2	8	106274	106281	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009930	GTTC	2	8	107463	107470	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009930	ACAG	2	8	107978	107985	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009930	TTTG	2	8	110018	110025	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009930	TAAA	2	8	110068	110075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009930	GGTC	2	8	116968	116975	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009930	TAGA	2	8	117023	117030	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009930	GGGT	2	8	121048	121055	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009930	ACCG	2	8	122432	122439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009930	CAAG	2	8	122468	122475	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009930	TAAG	2	8	124341	124348	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009930	GCCA	2	8	131087	131094	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009930	AGTT	2	8	132822	132829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009930	GAAG	2	8	140524	140531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009930	TTGC	2	8	142059	142066	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009930	CATC	2	8	152396	152403	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009930	TTCA	2	8	152738	152745	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009930	CATA	2	8	153632	153639	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009930	TATC	2	8	153659	153666	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009930	CTAT	2	8	153776	153783	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009930	ATTG	2	8	154393	154400	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009930	TCTG	2	8	163797	163804	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009930	GTAG	2	8	167199	167206	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009930	ATTG	2	8	168687	168694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009930	ATTT	2	8	170122	170129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009930	TTCA	2	8	172014	172021	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009930	TATC	2	8	172094	172101	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009930	TAAA	2	8	172180	172187	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009930	CCAA	2	8	172283	172290	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009930	CTCA	2	8	174264	174271	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009930	AGCA	2	8	174557	174564	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009930	CTCG	2	8	176684	176691	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009930	GTTC	2	8	177123	177130	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.