MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB4

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009929	AACGGT	2	12	2483	2494	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158340646
2	NC_009929	AAAATA	2	12	15345	15356	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	158340665
3	NC_009929	CCTGAA	2	12	24698	24709	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158340673
4	NC_009929	CGAGTG	2	12	27052	27063	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158340678
5	NC_009929	ATCAGA	2	12	28054	28065	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158340679
6	NC_009929	GATTAC	2	12	28175	28186	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158340679
7	NC_009929	CAACAG	3	18	33288	33305	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158340683
8	NC_009929	GCAAGC	2	12	33685	33696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340683
9	NC_009929	ATTGGT	2	12	34221	34232	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	158340683
10	NC_009929	GCACTG	2	12	41438	41449	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158340692
11	NC_009929	GCGTTG	2	12	42431	42442	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158340692
12	NC_009929	TCCTCG	2	12	44519	44530	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	158340694
13	NC_009929	AAATCA	2	12	45817	45828	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	158340694
14	NC_009929	AATTAC	2	12	46283	46294	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158340695
15	NC_009929	AAGCCA	2	12	51110	51121	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158340699
16	NC_009929	GATAGA	2	12	63030	63041	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158340713
17	NC_009929	CGTTGC	2	12	72606	72617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340720
18	NC_009929	CTTGGT	2	12	74418	74429	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	158340723
19	NC_009929	TGTCGA	2	12	74456	74467	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158340723
20	NC_009929	CTTAGC	2	12	78313	78324	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158340728
21	NC_009929	TCTGCT	2	12	78642	78653	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158340728
22	NC_009929	GGTCGG	2	12	79743	79754	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	158340728
23	NC_009929	TCGTTC	2	12	80241	80252	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158340730
24	NC_009929	AGTCCA	2	12	81839	81850	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158340733
25	NC_009929	ACCTCC	2	12	84385	84396	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	158340737
26	NC_009929	CTTCAA	2	12	89009	89020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340748
27	NC_009929	TTGAAC	2	12	94611	94622	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158340763
28	NC_009929	TCCGGT	2	12	96177	96188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340765
29	NC_009929	TTGAGC	2	12	98247	98258	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158340768
30	NC_009929	ACATCG	2	12	100227	100238	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158340770
31	NC_009929	GATGGC	2	12	101735	101746	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158340773
32	NC_009929	GTCATT	2	12	104926	104937	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158340776
33	NC_009929	AACGCA	2	12	106696	106707	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158340779
34	NC_009929	TTTAAA	2	12	106809	106820	50 %	50 %	0 %	0 %	158340779
35	NC_009929	AAGCCA	2	12	108713	108724	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158340782
36	NC_009929	ATGAGT	2	12	109307	109318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340782
37	NC_009929	GATTGC	2	12	115117	115128	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158340791
38	NC_009929	GCCTTT	2	12	117317	117328	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158340791
39	NC_009929	GCCCAT	2	12	119916	119927	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158340795
40	NC_009929	GCCTAT	2	12	121385	121396	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158340797
41	NC_009929	GAGAAG	2	12	124465	124476	50 %	0 %	50 %	0 %	158340798
42	NC_009929	CCATTG	2	12	128486	128497	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158340804
43	NC_009929	TGGCGA	2	12	131300	131311	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158340808
44	NC_009929	CAAACC	2	12	145444	145455	50 %	0 %	0 %	50 %	158340823
45	NC_009929	AAGCGG	2	12	149249	149260	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158340827
46	NC_009929	AATTCC	2	12	160100	160111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340839
47	NC_009929	TCAAGA	2	12	167002	167013	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158340841
48	NC_009929	GATGCA	2	12	167180	167191	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158340841
49	NC_009929	TCATTG	2	12	167378	167389	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158340842
50	NC_009929	GTCTGA	2	12	169298	169309	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158340844
51	NC_009929	GCAGTG	2	12	172314	172325	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158340849
52	NC_009929	CGAAGT	2	12	172793	172804	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158340849
53	NC_009929	TCTTAT	2	12	174803	174814	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	158340852
54	NC_009929	TTTATT	2	12	175128	175139	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	158340852
55	NC_009929	GCTGCA	2	12	180515	180526	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158340860
56	NC_009929	GGCAAA	2	12	187342	187353	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158340867
57	NC_009929	TTTAAT	2	12	190591	190602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340873
58	NC_009929	CATCCC	2	12	195971	195982	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	158340878
59	NC_009929	TTCTTA	2	12	201099	201110	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	158340882
60	NC_009929	CTATCT	2	12	204937	204948	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158340888
61	NC_009929	GACCAG	2	12	205482	205493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340889
62	NC_009929	GTGGGT	2	12	205725	205736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340889
63	NC_009929	TGGAGT	2	12	206961	206972	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158340891
64	NC_009929	GGATAG	2	12	208715	208726	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158340893
65	NC_009929	GAGAAT	2	12	225662	225673	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158340914

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.