MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB4

Total Repeats: 165

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009929	TCAAA	2	10	6908	6917	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009929	AATCA	2	10	7601	7610	60 %	20 %	0 %	20 %	158340654
3	NC_009929	ACTCA	2	10	7916	7925	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_009929	ACTCA	2	10	7933	7942	40 %	20 %	0 %	40 %	158340655
5	NC_009929	TGACT	2	10	9881	9890	20 %	40 %	20 %	20 %	158340659
6	NC_009929	TGCAT	2	10	10811	10820	20 %	40 %	20 %	20 %	158340660
7	NC_009929	CCCAA	2	10	12606	12615	40 %	0 %	0 %	60 %	158340663
8	NC_009929	CAAAT	2	10	14437	14446	60 %	20 %	0 %	20 %	158340664
9	NC_009929	GAATG	2	10	14460	14469	40 %	20 %	40 %	0 %	158340664
10	NC_009929	GCCGT	2	10	16409	16418	0 %	20 %	40 %	40 %	158340666
11	NC_009929	TTTTG	2	10	16733	16742	0 %	80 %	20 %	0 %	158340666
12	NC_009929	ACCTC	2	10	18537	18546	20 %	20 %	0 %	60 %	158340668
13	NC_009929	GCAGC	2	10	21544	21553	20 %	0 %	40 %	40 %	158340669
14	NC_009929	CTCAA	2	10	23566	23575	40 %	20 %	0 %	40 %	158340672
15	NC_009929	AATCA	2	10	24935	24944	60 %	20 %	0 %	20 %	158340673
16	NC_009929	AACTC	2	10	26192	26201	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009929	ACGGG	2	10	28187	28196	20 %	0 %	60 %	20 %	158340679
18	NC_009929	TTGGC	2	10	31131	31140	0 %	40 %	40 %	20 %	158340680
19	NC_009929	CCTAT	2	10	32423	32432	20 %	40 %	0 %	40 %	158340682
20	NC_009929	CCCAG	2	10	33796	33805	20 %	0 %	20 %	60 %	158340683
21	NC_009929	CAGCA	2	10	34536	34545	40 %	0 %	20 %	40 %	158340684
22	NC_009929	GCTCT	2	10	34699	34708	0 %	40 %	20 %	40 %	158340684
23	NC_009929	TGTAC	2	10	39244	39253	20 %	40 %	20 %	20 %	158340689
24	NC_009929	TGGGT	2	10	40264	40273	0 %	40 %	60 %	0 %	158340690
25	NC_009929	AGAAT	2	10	40554	40563	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009929	GCAGG	2	10	43583	43592	20 %	0 %	60 %	20 %	158340692
27	NC_009929	ATGAG	2	10	44600	44609	40 %	20 %	40 %	0 %	158340694
28	NC_009929	GCTCA	2	10	47557	47566	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_009929	GCAAG	2	10	50860	50869	40 %	0 %	40 %	20 %	158340699
30	NC_009929	TCTTG	2	10	51434	51443	0 %	60 %	20 %	20 %	158340698
31	NC_009929	GATCA	2	10	51711	51720	40 %	20 %	20 %	20 %	158340698
32	NC_009929	GACCT	2	10	52359	52368	20 %	20 %	20 %	40 %	158340698
33	NC_009929	TTGAG	2	10	52612	52621	20 %	40 %	40 %	0 %	158340698
34	NC_009929	CTTTC	2	10	53085	53094	0 %	60 %	0 %	40 %	158340698
35	NC_009929	GTGAC	2	10	53386	53395	20 %	20 %	40 %	20 %	158340698
36	NC_009929	TTCTT	2	10	54431	54440	0 %	80 %	0 %	20 %	158340698
37	NC_009929	AAGGG	2	10	56743	56752	40 %	0 %	60 %	0 %	158340704
38	NC_009929	GCTGG	2	10	57150	57159	0 %	20 %	60 %	20 %	158340705
39	NC_009929	TGGAC	2	10	58851	58860	20 %	20 %	40 %	20 %	158340709
40	NC_009929	ATTTA	2	10	59118	59127	40 %	60 %	0 %	0 %	158340709
41	NC_009929	CTGAA	2	10	62072	62081	40 %	20 %	20 %	20 %	158340713
42	NC_009929	AGAAT	2	10	62119	62128	60 %	20 %	20 %	0 %	158340713
43	NC_009929	CTAGT	2	10	63518	63527	20 %	40 %	20 %	20 %	158340713
44	NC_009929	GTCGA	2	10	63838	63847	20 %	20 %	40 %	20 %	158340713
45	NC_009929	ATTAA	2	10	65032	65041	60 %	40 %	0 %	0 %	158340714
46	NC_009929	TACGC	2	10	65046	65055	20 %	20 %	20 %	40 %	158340714
47	NC_009929	ACAAA	2	10	65607	65616	80 %	0 %	0 %	20 %	158340716
48	NC_009929	ATTAG	2	10	65757	65766	40 %	40 %	20 %	0 %	158340716
49	NC_009929	AAGCA	2	10	66811	66820	60 %	0 %	20 %	20 %	158340716
50	NC_009929	TAGCT	2	10	68357	68366	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009929	ATATT	2	10	69370	69379	40 %	60 %	0 %	0 %	158340718
52	NC_009929	CCTTT	2	10	71566	71575	0 %	60 %	0 %	40 %	158340720
53	NC_009929	TAATA	2	10	73771	73780	60 %	40 %	0 %	0 %	158340722
54	NC_009929	CTTTA	2	10	75084	75093	20 %	60 %	0 %	20 %	158340724
55	NC_009929	CAATT	2	10	75820	75829	40 %	40 %	0 %	20 %	158340725
56	NC_009929	ATTTA	2	10	77590	77599	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009929	CAATC	2	10	80163	80172	40 %	20 %	0 %	40 %	158340730
58	NC_009929	TAGGT	2	10	83187	83196	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009929	AGTGT	2	10	90838	90847	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009929	GTTGT	2	10	92610	92619	0 %	60 %	40 %	0 %	158340757
61	NC_009929	AGGGA	2	10	94150	94159	40 %	0 %	60 %	0 %	158340761
62	NC_009929	TGATG	2	10	96312	96321	20 %	40 %	40 %	0 %	158340765
63	NC_009929	AGAAC	2	10	96484	96493	60 %	0 %	20 %	20 %	158340766
64	NC_009929	CAGTT	2	10	97220	97229	20 %	40 %	20 %	20 %	158340767
65	NC_009929	ATACA	2	10	99380	99389	60 %	20 %	0 %	20 %	158340769
66	NC_009929	GATCT	2	10	102083	102092	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009929	TTGAT	2	10	102397	102406	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009929	ATGCC	2	10	103072	103081	20 %	20 %	20 %	40 %	158340775
69	NC_009929	CCTCG	2	10	107445	107454	0 %	20 %	20 %	60 %	158340780
70	NC_009929	AGTCA	2	10	107673	107682	40 %	20 %	20 %	20 %	158340780
71	NC_009929	CGGCA	2	10	109246	109255	20 %	0 %	40 %	40 %	158340782
72	NC_009929	ACGGA	2	10	112892	112901	40 %	0 %	40 %	20 %	158340788
73	NC_009929	GGTGA	2	10	114411	114420	20 %	20 %	60 %	0 %	158340790
74	NC_009929	TCTAC	2	10	114504	114513	20 %	40 %	0 %	40 %	158340790
75	NC_009929	TCAAC	2	10	117546	117555	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_009929	TGCTT	2	10	121778	121787	0 %	60 %	20 %	20 %	158340797
77	NC_009929	ACAGG	2	10	122651	122660	40 %	0 %	40 %	20 %	158340797
78	NC_009929	ATGTG	2	10	123345	123354	20 %	40 %	40 %	0 %	158340797
79	NC_009929	GTTTG	2	10	125841	125850	0 %	60 %	40 %	0 %	158340800
80	NC_009929	GTTTT	2	10	126158	126167	0 %	80 %	20 %	0 %	158340801
81	NC_009929	GTGAT	2	10	126332	126341	20 %	40 %	40 %	0 %	158340801
82	NC_009929	CCGAT	2	10	126734	126743	20 %	20 %	20 %	40 %	158340801
83	NC_009929	TTCGG	2	10	131392	131401	0 %	40 %	40 %	20 %	158340808
84	NC_009929	TCCAA	2	10	134897	134906	40 %	20 %	0 %	40 %	158340812
85	NC_009929	TCAGG	2	10	137052	137061	20 %	20 %	40 %	20 %	158340813
86	NC_009929	ATCAG	2	10	137318	137327	40 %	20 %	20 %	20 %	158340814
87	NC_009929	CTTGC	2	10	137472	137481	0 %	40 %	20 %	40 %	158340814
88	NC_009929	TGTGA	2	10	138006	138015	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009929	CAATC	2	10	138537	138546	40 %	20 %	0 %	40 %	158340815
90	NC_009929	CCTTG	2	10	138732	138741	0 %	40 %	20 %	40 %	158340815
91	NC_009929	TCATC	2	10	139325	139334	20 %	40 %	0 %	40 %	158340816
92	NC_009929	TTAAC	2	10	142578	142587	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_009929	GCAAT	2	10	142717	142726	40 %	20 %	20 %	20 %	158340819
94	NC_009929	CCCTT	2	10	143925	143934	0 %	40 %	0 %	60 %	158340821
95	NC_009929	ACCTT	2	10	144844	144853	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_009929	ATTGG	2	10	146451	146460	20 %	40 %	40 %	0 %	158340824
97	NC_009929	AAATT	2	10	146591	146600	60 %	40 %	0 %	0 %	158340824
98	NC_009929	AGATC	2	10	147392	147401	40 %	20 %	20 %	20 %	158340826
99	NC_009929	AACGG	2	10	147669	147678	40 %	0 %	40 %	20 %	158340826
100	NC_009929	GTTGG	2	10	148265	148274	0 %	40 %	60 %	0 %	158340826
101	NC_009929	CAATT	2	10	148497	148506	40 %	40 %	0 %	20 %	158340826
102	NC_009929	ATCCA	2	10	151945	151954	40 %	20 %	0 %	40 %	158340830
103	NC_009929	AGGTT	2	10	152132	152141	20 %	40 %	40 %	0 %	158340830
104	NC_009929	CAGAA	2	10	157174	157183	60 %	0 %	20 %	20 %	158340836
105	NC_009929	AATTT	2	10	157545	157554	40 %	60 %	0 %	0 %	158340837
106	NC_009929	ATCTC	2	10	158436	158445	20 %	40 %	0 %	40 %	158340838
107	NC_009929	CGCCA	2	10	161036	161045	20 %	0 %	20 %	60 %	158340839
108	NC_009929	AGAGA	2	10	161541	161550	60 %	0 %	40 %	0 %	158340839
109	NC_009929	TTGGA	2	10	162918	162927	20 %	40 %	40 %	0 %	158340839
110	NC_009929	ATTTT	2	10	164163	164172	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009929	CGTAT	2	10	164211	164220	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_009929	TTGTC	2	10	164489	164498	0 %	60 %	20 %	20 %	158340840
113	NC_009929	TTCAT	2	10	164671	164680	20 %	60 %	0 %	20 %	158340841
114	NC_009929	TCAAC	2	10	165634	165643	40 %	20 %	0 %	40 %	158340841
115	NC_009929	CGATT	2	10	166306	166315	20 %	40 %	20 %	20 %	158340841
116	NC_009929	CTAAA	2	10	168545	168554	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009929	TGCCA	2	10	168581	168590	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_009929	TCCAT	2	10	170017	170026	20 %	40 %	0 %	40 %	158340845
119	NC_009929	ACCCC	2	10	171256	171265	20 %	0 %	0 %	80 %	158340847
120	NC_009929	TCAAT	2	10	172251	172260	40 %	40 %	0 %	20 %	158340849
121	NC_009929	CCAAT	2	10	172570	172579	40 %	20 %	0 %	40 %	158340849
122	NC_009929	GAAAG	2	10	173853	173862	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009929	ATTGG	2	10	174823	174832	20 %	40 %	40 %	0 %	158340852
124	NC_009929	AGGTG	2	10	177768	177777	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009929	AGTCT	2	10	177918	177927	20 %	40 %	20 %	20 %	158340855
126	NC_009929	ATCTC	2	10	178672	178681	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_009929	TGAGG	2	10	180021	180030	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009929	GTCAG	2	10	182117	182126	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_009929	GAGTT	2	10	182673	182682	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009929	CACAG	2	10	185880	185889	40 %	0 %	20 %	40 %	158340866
131	NC_009929	GCAGA	2	10	188878	188887	40 %	0 %	40 %	20 %	158340869
132	NC_009929	TGAGT	2	10	188941	188950	20 %	40 %	40 %	0 %	158340869
133	NC_009929	CCACT	2	10	189024	189033	20 %	20 %	0 %	60 %	158340869
134	NC_009929	TGATA	2	10	191201	191210	40 %	40 %	20 %	0 %	158340875
135	NC_009929	TGCCT	2	10	192957	192966	0 %	40 %	20 %	40 %	158340876
136	NC_009929	ATACA	2	10	192989	192998	60 %	20 %	0 %	20 %	158340876
137	NC_009929	AATTT	2	10	193935	193944	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009929	AAGTG	2	10	193994	194003	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_009929	TAGAG	2	10	204656	204665	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_009929	CGAAT	2	10	216181	216190	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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162	NC_009929	GCTTT	2	10	222738	222747	0 %	60 %	20 %	20 %	158340910
163	NC_009929	TGGAA	2	10	223747	223756	40 %	20 %	40 %	0 %	158340911
164	NC_009929	AATCA	2	10	225744	225753	60 %	20 %	0 %	20 %	158340914
165	NC_009929	TCTGC	2	10	226296	226305	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.