MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB4

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009929	TCAAA	2	10	6908	6917	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009929	ACTCA	2	10	7916	7925	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_009929	AACTC	2	10	26192	26201	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_009929	AGAAT	2	10	40554	40563	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009929	GCTCA	2	10	47557	47566	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_009929	TAGCT	2	10	68357	68366	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009929	ATTTA	2	10	77590	77599	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009929	TAGGT	2	10	83187	83196	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009929	AGTGT	2	10	90838	90847	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009929	GATCT	2	10	102083	102092	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009929	TTGAT	2	10	102397	102406	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009929	TCAAC	2	10	117546	117555	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009929	TGTGA	2	10	138006	138015	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009929	TTAAC	2	10	142578	142587	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009929	ACCTT	2	10	144844	144853	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_009929	ATTTT	2	10	164163	164172	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009929	CGTAT	2	10	164211	164220	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009929	CTAAA	2	10	168545	168554	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009929	TGCCA	2	10	168581	168590	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_009929	GAAAG	2	10	173853	173862	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009929	AGGTG	2	10	177768	177777	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009929	ATCTC	2	10	178672	178681	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_009929	TGAGG	2	10	180021	180030	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009929	GTCAG	2	10	182117	182126	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009929	GAGTT	2	10	182673	182682	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009929	AATTT	2	10	193935	193944	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009929	AAGTG	2	10	193994	194003	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009929	TAGAG	2	10	204656	204665	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009929	CGAAT	2	10	216181	216190	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009929	GTCGG	2	10	222422	222431	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009929	TCTAC	2	10	222574	222583	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_009929	TCTGC	2	10	226296	226305	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.