MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB4

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009929	GTTT	2	8	468	475	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009929	AAAT	2	8	3895	3902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009929	GTCC	2	8	5241	5248	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009929	CAAA	2	8	6221	6228	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009929	ACTA	2	8	15233	15240	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009929	TAAA	2	8	15650	15657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009929	TTAA	2	8	17429	17436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009929	GATC	2	8	17452	17459	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009929	ATCT	2	8	35868	35875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009929	ATTG	2	8	35989	35996	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009929	GAGG	2	8	36046	36053	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009929	ATAA	2	8	46701	46708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009929	TGGA	2	8	47330	47337	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009929	CTAC	2	8	48499	48506	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009929	CTTA	2	8	49468	49475	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009929	CAGG	2	8	56116	56123	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009929	CGGT	2	8	58678	58685	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009929	CACT	2	8	59967	59974	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009929	CCGC	2	8	59988	59995	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_009929	ATTT	2	8	60131	60138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009929	ATTT	2	8	65469	65476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009929	AATT	2	8	68155	68162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009929	TAAT	2	8	74044	74051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009929	TTAG	2	8	74089	74096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009929	GGGC	2	8	74718	74725	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009929	TTCG	2	8	74982	74989	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009929	ATTT	2	8	76406	76413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009929	AAAT	2	8	76446	76453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009929	GAGT	2	8	82840	82847	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009929	TCAT	2	8	82891	82898	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009929	TTGA	2	8	83252	83259	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009929	ATCT	2	8	84160	84167	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009929	GTAG	2	8	85731	85738	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009929	TAAT	2	8	85903	85910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009929	TATT	2	8	86066	86073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009929	CAAG	2	8	88722	88729	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009929	TTTC	2	8	89590	89597	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009929	AGCT	2	8	90178	90185	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009929	ATTA	2	8	90212	90219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009929	TTTG	2	8	92068	92075	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009929	ATCC	2	8	93535	93542	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009929	ACCC	2	8	95501	95508	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_009929	GTAG	2	8	99843	99850	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009929	GTAG	2	8	100490	100497	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009929	ACCT	2	8	101330	101337	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009929	TCAG	2	8	102155	102162	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009929	ACAA	2	8	117445	117452	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009929	GAGG	2	8	119432	119439	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009929	TTCC	2	8	123780	123787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009929	ATGA	2	8	132636	132643	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009929	TGAA	2	8	132905	132912	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009929	CTTA	2	8	133414	133421	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009929	ACAA	2	8	136083	136090	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009929	CAGC	2	8	138044	138051	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009929	AGTC	2	8	139128	139135	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009929	GGAT	2	8	144778	144785	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009929	TCAC	2	8	144863	144870	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009929	GGAA	2	8	145198	145205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009929	TTGA	2	8	153667	153674	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009929	TAAC	2	8	154893	154900	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009929	TCAA	2	8	164191	164198	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009929	CCCG	2	8	164351	164358	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_009929	GCTG	2	8	168566	168573	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009929	CTAT	2	8	171833	171840	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009929	CACC	2	8	171856	171863	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_009929	GGAA	2	8	174013	174020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009929	GAGT	2	8	174039	174046	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009929	ATAG	2	8	176626	176633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009929	TTCT	2	8	177000	177007	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009929	ATCA	2	8	177580	177587	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009929	TCAC	2	8	177731	177738	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009929	AAAT	2	8	178405	178412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009929	AGGG	2	8	178424	178431	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009929	ACTT	2	8	178468	178475	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009929	ACAA	2	8	179553	179560	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009929	AGTC	2	8	182156	182163	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009929	CGGA	2	8	182175	182182	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009929	GAAG	2	8	182249	182256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009929	GAAA	2	8	182414	182421	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009929	ATCT	2	8	189791	189798	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009929	TTTC	2	8	189977	189984	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009929	TTGC	2	8	190939	190946	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009929	ATTC	2	8	193841	193848	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009929	TTGA	2	8	194291	194298	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009929	TTTG	2	8	196697	196704	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009929	TGCA	2	8	196961	196968	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009929	GGAA	2	8	213517	213524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009929	CCGA	2	8	214736	214743	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009929	CTTA	2	8	222365	222372	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009929	CAGT	2	8	222450	222457	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009929	ATCT	2	8	222919	222926	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009929	TCAT	2	8	223018	223025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009929	TCAA	2	8	225983	225990	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009929	CTTC	2	8	226052	226059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.