MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB4

Total Repeats: 2619

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009929	GAT	2	6	215722	215727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340900
2502	NC_009929	TGA	2	6	215856	215861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340900
2503	NC_009929	GAA	2	6	215878	215883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340900
2504	NC_009929	AGC	2	6	216029	216034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340900
2505	NC_009929	AAG	2	6	216128	216133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_009929	AGC	2	6	216202	216207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_009929	ACA	2	6	216215	216220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340901
2508	NC_009929	ATG	2	6	216235	216240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340901
2509	NC_009929	CAG	2	6	216356	216361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340901
2510	NC_009929	AGA	2	6	216371	216376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340901
2511	NC_009929	CAT	2	6	216383	216388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340901
2512	NC_009929	CTG	2	6	216393	216398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340901
2513	NC_009929	CTA	2	6	216491	216496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340901
2514	NC_009929	GTG	2	6	216540	216545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340901
2515	NC_009929	ACT	2	6	216667	216672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340901
2516	NC_009929	GCA	2	6	216677	216682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340901
2517	NC_009929	AGA	2	6	216728	216733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340901
2518	NC_009929	AAC	2	6	216853	216858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340901
2519	NC_009929	GAA	2	6	216930	216935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340901
2520	NC_009929	AGG	2	6	216961	216966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340901
2521	NC_009929	TTA	2	6	217224	217229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_009929	CAG	2	6	217284	217289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340902
2523	NC_009929	GAA	2	6	217360	217365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340902
2524	NC_009929	ATG	2	6	217381	217386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340902
2525	NC_009929	GCA	2	6	217467	217472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340902
2526	NC_009929	AGT	2	6	217515	217520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340902
2527	NC_009929	CAG	2	6	217590	217595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340902
2528	NC_009929	TCA	2	6	217599	217604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340902
2529	NC_009929	ATC	2	6	217607	217612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340902
2530	NC_009929	AGC	2	6	217676	217681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340902
2531	NC_009929	GTT	2	6	217726	217731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340902
2532	NC_009929	CTT	2	6	217821	217826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340902
2533	NC_009929	CAG	2	6	218020	218025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340902
2534	NC_009929	CAT	2	6	218139	218144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340902
2535	NC_009929	TCA	2	6	218228	218233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340902
2536	NC_009929	ACC	2	6	218365	218370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2537	NC_009929	ATC	2	6	218527	218532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340903
2538	NC_009929	TTG	2	6	218605	218610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340903
2539	NC_009929	GTT	2	6	218708	218713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340903
2540	NC_009929	AAT	2	6	219027	219032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340903
2541	NC_009929	CAA	2	6	219074	219079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340903
2542	NC_009929	TCA	2	6	219193	219198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340903
2543	NC_009929	CAA	2	6	219456	219461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340903
2544	NC_009929	TGT	2	6	219479	219484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340903
2545	NC_009929	TCA	2	6	219622	219627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340904
2546	NC_009929	TAA	2	6	219662	219667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340904
2547	NC_009929	TAT	2	6	219669	219674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_009929	AAT	2	6	219749	219754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_009929	CTT	2	6	219759	219764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340905
2550	NC_009929	TAA	2	6	219770	219775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340905
2551	NC_009929	GAA	2	6	219869	219874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340905
2552	NC_009929	CCA	2	6	219875	219880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340905
2553	NC_009929	TAT	2	6	220012	220017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340905
2554	NC_009929	CTC	2	6	220123	220128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340905
2555	NC_009929	GGA	2	6	220294	220299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340905
2556	NC_009929	TCA	2	6	220338	220343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340905
2557	NC_009929	TGA	2	6	220502	220507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340905
2558	NC_009929	AGT	2	6	220611	220616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_009929	CTT	2	6	220812	220817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340906
2560	NC_009929	GAT	2	6	220848	220853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340906
2561	NC_009929	TTG	2	6	220991	220996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340906
2562	NC_009929	CTT	2	6	221043	221048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340906
2563	NC_009929	CAT	2	6	221074	221079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340906
2564	NC_009929	GCA	2	6	221114	221119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340906
2565	NC_009929	TCT	2	6	221174	221179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340906
2566	NC_009929	ACT	2	6	221297	221302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340906
2567	NC_009929	AAT	2	6	221330	221335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340906
2568	NC_009929	ATT	2	6	221888	221893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_009929	TTC	2	6	221991	221996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340908
2570	NC_009929	GTC	2	6	222028	222033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340908
2571	NC_009929	ATT	2	6	222297	222302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340909
2572	NC_009929	ATT	2	6	222309	222314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340909
2573	NC_009929	AGC	2	6	222475	222480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2574	NC_009929	AAG	2	6	222728	222733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340910
2575	NC_009929	ATG	2	6	222762	222767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340910
2576	NC_009929	GAA	2	6	222770	222775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340910
2577	NC_009929	TGT	2	6	222877	222882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_009929	TCC	2	6	223007	223012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2579	NC_009929	ACT	2	6	223050	223055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_009929	CTG	2	6	223281	223286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_009929	AAG	2	6	223341	223346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340911
2582	NC_009929	GTG	2	6	223347	223352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340911
2583	NC_009929	TCT	2	6	223412	223417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340911
2584	NC_009929	TCT	2	6	223565	223570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340911
2585	NC_009929	CAC	2	6	223741	223746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340911
2586	NC_009929	TCA	2	6	223796	223801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340911
2587	NC_009929	CAT	2	6	224154	224159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2588	NC_009929	ACT	2	6	224230	224235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340912
2589	NC_009929	GGC	2	6	224393	224398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_009929	TGA	2	6	224541	224546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340913
2591	NC_009929	ACG	2	6	224717	224722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340913
2592	NC_009929	GTG	2	6	224882	224887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340913
2593	NC_009929	GTC	2	6	224924	224929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340913
2594	NC_009929	GCT	2	6	224939	224944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340913
2595	NC_009929	CAC	2	6	225124	225129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340913
2596	NC_009929	TCG	2	6	225175	225180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340913
2597	NC_009929	GAA	2	6	225193	225198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340913
2598	NC_009929	CTC	2	6	225255	225260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340913
2599	NC_009929	TAG	2	6	225321	225326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340913
2600	NC_009929	GCA	2	6	225384	225389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340913
2601	NC_009929	ATC	2	6	225432	225437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340913
2602	NC_009929	AGA	2	6	225450	225455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340913
2603	NC_009929	AGC	2	6	225459	225464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340913
2604	NC_009929	GAG	2	6	225536	225541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340913
2605	NC_009929	TTC	2	6	225629	225634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340914
2606	NC_009929	ATT	2	6	225755	225760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340914
2607	NC_009929	GAT	2	6	225773	225778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340914
2608	NC_009929	CCA	2	6	225819	225824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340914
2609	NC_009929	AGG	2	6	225895	225900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340914
2610	NC_009929	TCT	2	6	226000	226005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_009929	CAA	2	6	226022	226027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_009929	TGC	2	6	226158	226163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340915
2613	NC_009929	TCC	2	6	226242	226247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340915
2614	NC_009929	TCT	2	6	226350	226355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_009929	TGA	2	6	226423	226428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_009929	TCA	2	6	226444	226449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340916
2617	NC_009929	TCT	2	6	226468	226473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340916
2618	NC_009929	TGT	2	6	226513	226518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340916
2619	NC_009929	CAT	2	6	226608	226613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340916

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.