MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB4

Total Repeats: 315

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009929	GA	3	6	907	912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009929	CT	3	6	936	941	0 %	50 %	0 %	50 %	158340645
3	NC_009929	TC	3	6	974	979	0 %	50 %	0 %	50 %	158340645
4	NC_009929	TC	3	6	993	998	0 %	50 %	0 %	50 %	158340645
5	NC_009929	GA	3	6	2593	2598	50 %	0 %	50 %	0 %	158340646
6	NC_009929	AC	3	6	3601	3606	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009929	CA	3	6	4462	4467	50 %	0 %	0 %	50 %	158340649
8	NC_009929	AC	3	6	4977	4982	50 %	0 %	0 %	50 %	158340650
9	NC_009929	TC	3	6	5521	5526	0 %	50 %	0 %	50 %	158340651
10	NC_009929	CT	3	6	6122	6127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009929	TC	3	6	6505	6510	0 %	50 %	0 %	50 %	158340652
12	NC_009929	GA	3	6	7875	7880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009929	CT	3	6	7960	7965	0 %	50 %	0 %	50 %	158340655
14	NC_009929	AT	3	6	8813	8818	50 %	50 %	0 %	0 %	158340656
15	NC_009929	CT	3	6	9014	9019	0 %	50 %	0 %	50 %	158340657
16	NC_009929	TC	3	6	9985	9990	0 %	50 %	0 %	50 %	158340659
17	NC_009929	GA	3	6	10201	10206	50 %	0 %	50 %	0 %	158340659
18	NC_009929	CT	3	6	10293	10298	0 %	50 %	0 %	50 %	158340659
19	NC_009929	TG	3	6	10306	10311	0 %	50 %	50 %	0 %	158340659
20	NC_009929	AG	3	6	10673	10678	50 %	0 %	50 %	0 %	158340660
21	NC_009929	GA	3	6	10786	10791	50 %	0 %	50 %	0 %	158340660
22	NC_009929	CA	3	6	10804	10809	50 %	0 %	0 %	50 %	158340660
23	NC_009929	GA	3	6	11305	11310	50 %	0 %	50 %	0 %	158340661
24	NC_009929	TA	3	6	11404	11409	50 %	50 %	0 %	0 %	158340661
25	NC_009929	GT	3	6	11544	11549	0 %	50 %	50 %	0 %	158340661
26	NC_009929	CT	3	6	11642	11647	0 %	50 %	0 %	50 %	158340662
27	NC_009929	AG	3	6	12256	12261	50 %	0 %	50 %	0 %	158340663
28	NC_009929	AT	3	6	13863	13868	50 %	50 %	0 %	0 %	158340664
29	NC_009929	GA	3	6	14189	14194	50 %	0 %	50 %	0 %	158340664
30	NC_009929	AG	3	6	14629	14634	50 %	0 %	50 %	0 %	158340664
31	NC_009929	CA	3	6	14813	14818	50 %	0 %	0 %	50 %	158340664
32	NC_009929	TA	3	6	15531	15536	50 %	50 %	0 %	0 %	158340665
33	NC_009929	AT	4	8	16520	16527	50 %	50 %	0 %	0 %	158340666
34	NC_009929	TG	3	6	17418	17423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009929	AG	3	6	18046	18051	50 %	0 %	50 %	0 %	158340668
36	NC_009929	CT	3	6	18241	18246	0 %	50 %	0 %	50 %	158340668
37	NC_009929	TC	3	6	18292	18297	0 %	50 %	0 %	50 %	158340668
38	NC_009929	GA	3	6	18498	18503	50 %	0 %	50 %	0 %	158340668
39	NC_009929	AT	3	6	19104	19109	50 %	50 %	0 %	0 %	158340668
40	NC_009929	GA	3	6	21283	21288	50 %	0 %	50 %	0 %	158340668
41	NC_009929	GA	3	6	23076	23081	50 %	0 %	50 %	0 %	158340672
42	NC_009929	CT	3	6	23136	23141	0 %	50 %	0 %	50 %	158340672
43	NC_009929	CG	3	6	24862	24867	0 %	0 %	50 %	50 %	158340673
44	NC_009929	CA	3	6	24950	24955	50 %	0 %	0 %	50 %	158340673
45	NC_009929	GA	3	6	25611	25616	50 %	0 %	50 %	0 %	158340674
46	NC_009929	AC	3	6	26632	26637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009929	AG	3	6	27405	27410	50 %	0 %	50 %	0 %	158340679
48	NC_009929	CT	3	6	27580	27585	0 %	50 %	0 %	50 %	158340679
49	NC_009929	TG	4	8	28272	28279	0 %	50 %	50 %	0 %	158340679
50	NC_009929	TC	3	6	28927	28932	0 %	50 %	0 %	50 %	158340679
51	NC_009929	CT	3	6	30083	30088	0 %	50 %	0 %	50 %	158340679
52	NC_009929	GA	3	6	30318	30323	50 %	0 %	50 %	0 %	158340680
53	NC_009929	AG	3	6	30593	30598	50 %	0 %	50 %	0 %	158340680
54	NC_009929	TC	3	6	31617	31622	0 %	50 %	0 %	50 %	158340681
55	NC_009929	AT	3	6	33845	33850	50 %	50 %	0 %	0 %	158340683
56	NC_009929	GT	3	6	34423	34428	0 %	50 %	50 %	0 %	158340683
57	NC_009929	GA	3	6	34549	34554	50 %	0 %	50 %	0 %	158340684
58	NC_009929	TG	3	6	35268	35273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009929	TA	3	6	36054	36059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009929	AG	3	6	37803	37808	50 %	0 %	50 %	0 %	158340688
61	NC_009929	AT	3	6	40316	40321	50 %	50 %	0 %	0 %	158340690
62	NC_009929	AT	4	8	40354	40361	50 %	50 %	0 %	0 %	158340690
63	NC_009929	GC	3	6	40574	40579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009929	GA	3	6	42336	42341	50 %	0 %	50 %	0 %	158340692
65	NC_009929	CT	3	6	44378	44383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009929	TG	3	6	44861	44866	0 %	50 %	50 %	0 %	158340694
67	NC_009929	TC	3	6	45525	45530	0 %	50 %	0 %	50 %	158340694
68	NC_009929	CA	3	6	45657	45662	50 %	0 %	0 %	50 %	158340694
69	NC_009929	AG	3	6	45698	45703	50 %	0 %	50 %	0 %	158340694
70	NC_009929	TG	3	6	46534	46539	0 %	50 %	50 %	0 %	158340695
71	NC_009929	GT	3	6	46556	46561	0 %	50 %	50 %	0 %	158340695
72	NC_009929	GA	3	6	46607	46612	50 %	0 %	50 %	0 %	158340695
73	NC_009929	AG	4	8	47058	47065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009929	TG	3	6	47819	47824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009929	TC	3	6	47864	47869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009929	AC	3	6	48993	48998	50 %	0 %	0 %	50 %	158340697
77	NC_009929	AC	3	6	49388	49393	50 %	0 %	0 %	50 %	158340697
78	NC_009929	GA	3	6	50364	50369	50 %	0 %	50 %	0 %	158340699
79	NC_009929	TC	3	6	51863	51868	0 %	50 %	0 %	50 %	158340698
80	NC_009929	AT	3	6	52114	52119	50 %	50 %	0 %	0 %	158340698
81	NC_009929	CT	3	6	52197	52202	0 %	50 %	0 %	50 %	158340698
82	NC_009929	CT	3	6	52602	52607	0 %	50 %	0 %	50 %	158340698
83	NC_009929	GA	3	6	53030	53035	50 %	0 %	50 %	0 %	158340698
84	NC_009929	TC	4	8	53274	53281	0 %	50 %	0 %	50 %	158340698
85	NC_009929	AC	3	6	53588	53593	50 %	0 %	0 %	50 %	158340698
86	NC_009929	AT	3	6	55603	55608	50 %	50 %	0 %	0 %	158340701
87	NC_009929	GA	3	6	57493	57498	50 %	0 %	50 %	0 %	158340706
88	NC_009929	AG	3	6	57870	57875	50 %	0 %	50 %	0 %	158340706
89	NC_009929	CA	3	6	58532	58537	50 %	0 %	0 %	50 %	158340708
90	NC_009929	GA	3	6	59356	59361	50 %	0 %	50 %	0 %	158340709
91	NC_009929	TG	3	6	59934	59939	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009929	GT	3	6	59979	59984	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009929	AG	3	6	60869	60874	50 %	0 %	50 %	0 %	158340712
94	NC_009929	AG	3	6	62609	62614	50 %	0 %	50 %	0 %	158340713
95	NC_009929	AG	4	8	62655	62662	50 %	0 %	50 %	0 %	158340713
96	NC_009929	CT	3	6	63329	63334	0 %	50 %	0 %	50 %	158340713
97	NC_009929	TA	3	6	65814	65819	50 %	50 %	0 %	0 %	158340716
98	NC_009929	AT	3	6	66447	66452	50 %	50 %	0 %	0 %	158340716
99	NC_009929	AT	3	6	66599	66604	50 %	50 %	0 %	0 %	158340716
100	NC_009929	AT	3	6	66711	66716	50 %	50 %	0 %	0 %	158340716
101	NC_009929	AT	3	6	66822	66827	50 %	50 %	0 %	0 %	158340716
102	NC_009929	TA	3	6	67140	67145	50 %	50 %	0 %	0 %	158340716
103	NC_009929	AT	3	6	67289	67294	50 %	50 %	0 %	0 %	158340716
104	NC_009929	CA	3	6	68025	68030	50 %	0 %	0 %	50 %	158340717
105	NC_009929	AT	3	6	68307	68312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009929	TA	3	6	69682	69687	50 %	50 %	0 %	0 %	158340718
107	NC_009929	TC	3	6	69727	69732	0 %	50 %	0 %	50 %	158340718
108	NC_009929	TA	3	6	70066	70071	50 %	50 %	0 %	0 %	158340718
109	NC_009929	AT	3	6	70345	70350	50 %	50 %	0 %	0 %	158340718
110	NC_009929	AT	3	6	71619	71624	50 %	50 %	0 %	0 %	158340720
111	NC_009929	CA	3	6	71898	71903	50 %	0 %	0 %	50 %	158340720
112	NC_009929	AG	4	8	72652	72659	50 %	0 %	50 %	0 %	158340720
113	NC_009929	AT	3	6	73752	73757	50 %	50 %	0 %	0 %	158340722
114	NC_009929	TA	3	6	73836	73841	50 %	50 %	0 %	0 %	158340722
115	NC_009929	GT	3	6	74639	74644	0 %	50 %	50 %	0 %	158340723
116	NC_009929	AG	3	6	75111	75116	50 %	0 %	50 %	0 %	158340724
117	NC_009929	AG	3	6	75899	75904	50 %	0 %	50 %	0 %	158340725
118	NC_009929	TA	3	6	76144	76149	50 %	50 %	0 %	0 %	158340726
119	NC_009929	TA	3	6	76177	76182	50 %	50 %	0 %	0 %	158340726
120	NC_009929	AT	3	6	76537	76542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009929	CT	3	6	76704	76709	0 %	50 %	0 %	50 %	158340727
122	NC_009929	TC	3	6	80109	80114	0 %	50 %	0 %	50 %	158340730
123	NC_009929	TC	3	6	81602	81607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_009929	CT	3	6	83879	83884	0 %	50 %	0 %	50 %	158340736
125	NC_009929	AG	3	6	84782	84787	50 %	0 %	50 %	0 %	158340738
126	NC_009929	AC	3	6	85023	85028	50 %	0 %	0 %	50 %	158340739
127	NC_009929	AT	3	6	85629	85634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009929	TA	4	8	86052	86059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009929	CT	3	6	86470	86475	0 %	50 %	0 %	50 %	158340742
130	NC_009929	AC	3	6	87791	87796	50 %	0 %	0 %	50 %	158340745
131	NC_009929	AG	3	6	88139	88144	50 %	0 %	50 %	0 %	158340746
132	NC_009929	AC	3	6	88685	88690	50 %	0 %	0 %	50 %	158340747
133	NC_009929	CT	3	6	89770	89775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009929	TG	3	6	90696	90701	0 %	50 %	50 %	0 %	158340751
135	NC_009929	AT	3	6	91578	91583	50 %	50 %	0 %	0 %	158340755
136	NC_009929	AG	3	6	93050	93055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_009929	GA	3	6	94552	94557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.