MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009928	CCCTCA	2	12	13120	13131	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	158340470
2	NC_009928	TGATAG	2	12	13269	13280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340470
3	NC_009928	AGGGTT	2	12	16810	16821	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158340473
4	NC_009928	TCAATC	2	12	19190	19201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340474
5	NC_009928	GGGTTC	2	12	20259	20270	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158340474
6	NC_009928	CCATAT	2	12	23846	23857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340478
7	NC_009928	ACTTAG	2	12	28200	28211	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158340483
8	NC_009928	CTTGGC	2	12	30827	30838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340485
9	NC_009928	CATAGG	2	12	32262	32273	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158340486
10	NC_009928	CAGCAT	2	12	36245	36256	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158340489
11	NC_009928	GATGGA	2	12	37708	37719	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158340489
12	NC_009928	TTCAAA	2	12	37736	37747	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158340489
13	NC_009928	ATCATG	2	12	38160	38171	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158340490
14	NC_009928	TTGGGG	2	12	39328	39339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340491
15	NC_009928	TTTGTC	2	12	40175	40186	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	158340491
16	NC_009928	ACCAAT	2	12	41358	41369	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	158340493
17	NC_009928	ATCCAA	2	12	41968	41979	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	158340493
18	NC_009928	TTGGAG	2	12	43768	43779	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158340495
19	NC_009928	TAGCTT	2	12	53652	53663	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158340503
20	NC_009928	CAAGTC	2	12	54718	54729	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158340505
21	NC_009928	CCGCAT	2	12	56234	56245	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158340507
22	NC_009928	TGGGCA	2	12	59393	59404	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158340510
23	NC_009928	GGAGCG	2	12	68058	68069	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158340520
24	NC_009928	TTTGCC	2	12	69582	69593	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158340522
25	NC_009928	CTTTGA	2	12	76749	76760	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158340533
26	NC_009928	GTCCAT	2	12	77050	77061	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158340533
27	NC_009928	TCAAGA	2	12	77274	77285	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158340533
28	NC_009928	TGCTTT	2	12	100373	100384	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	158340566
29	NC_009928	TCAAGC	2	12	104819	104830	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158340571
30	NC_009928	TGATGG	2	12	109268	109279	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158340577
31	NC_009928	CCGCTT	2	12	112342	112353	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	158340582
32	NC_009928	CAGATA	2	12	115319	115330	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158340587
33	NC_009928	AGCCAG	2	12	117755	117766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340593
34	NC_009928	ATCGTG	2	12	118640	118651	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158340593
35	NC_009928	CATCCC	2	12	130381	130392	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	158340614
36	NC_009928	CTAATC	2	12	133422	133433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340618
37	NC_009928	TGCGAT	2	12	140232	140243	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158340624
38	NC_009928	TGCTTC	2	12	140868	140879	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158340624
39	NC_009928	GTCAGT	2	12	159516	159527	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158340290
40	NC_009928	GTGCTG	2	12	175535	175546	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158340317
41	NC_009928	GCACCT	2	12	181135	181146	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158340326
42	NC_009928	TCCTGT	2	12	184788	184799	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158340332
43	NC_009928	AAAATC	2	12	187243	187254	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	158340334
44	NC_009928	TGGCAA	2	12	188479	188490	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158340337
45	NC_009928	AAAGAA	2	12	191573	191584	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	158340341
46	NC_009928	GCTGAG	2	12	200816	200827	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158340354
47	NC_009928	ATTACG	2	12	201631	201642	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158340356
48	NC_009928	AAGCTG	2	12	202010	202021	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158340356
49	NC_009928	AGCTAC	2	12	202480	202491	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158340357
50	NC_009928	TCCCAG	2	12	203487	203498	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158340359
51	NC_009928	ATTTTG	2	12	206147	206158	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	158340363
52	NC_009928	GCAAAT	2	12	207203	207214	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158340365
53	NC_009928	CCACTA	2	12	207999	208010	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	158340367
54	NC_009928	GGACCG	2	12	208084	208095	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158340367
55	NC_009928	AGGTGG	2	12	209025	209036	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	158340368
56	NC_009928	CAAGTA	2	12	224434	224445	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158340395
57	NC_009928	GAAACT	2	12	228516	228527	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158340399
58	NC_009928	CAGGAA	2	12	253384	253395	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158340438
59	NC_009928	TGGAGA	2	12	254816	254827	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158340439
60	NC_009928	TGGTGA	2	12	254897	254908	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158340439
61	NC_009928	CTTGGG	2	12	255985	255996	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158340439
62	NC_009928	TTCCAA	2	12	257707	257718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340440
63	NC_009928	AGGCCA	2	12	263603	263614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340451
64	NC_009928	GAAAGG	2	12	267492	267503	50 %	0 %	50 %	0 %	158340451
65	NC_009928	CCATCA	2	12	268762	268773	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	158340452

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.