MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009928	ACACT	2	10	2630	2639	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009928	CTTAA	2	10	4000	4009	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009928	AGCTA	2	10	5870	5879	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009928	TGTGG	2	10	16625	16634	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009928	AGCTT	2	10	21663	21672	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009928	ATGAA	2	10	43258	43267	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009928	AACAA	2	10	57026	57035	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009928	CAAGC	2	10	59812	59821	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009928	AACAT	2	10	63170	63179	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009928	TCAGA	2	10	63276	63285	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009928	TTCAG	2	10	63453	63462	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009928	GCAAT	2	10	65980	65989	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009928	CAACC	2	10	72227	72236	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NC_009928	TCCAG	2	10	80265	80274	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009928	TGAGG	2	10	80913	80922	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009928	AGACG	2	10	81567	81576	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009928	TTTTA	2	10	82612	82621	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009928	TAATT	2	10	85434	85443	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009928	TACTT	2	10	92702	92711	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009928	TTTAT	2	10	95403	95412	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009928	TTCTT	2	10	97067	97076	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009928	TGAAG	2	10	100786	100795	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009928	TGAAA	2	10	101878	101887	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009928	TAAAG	2	10	104501	104510	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009928	CAATA	2	10	105509	105518	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009928	CAGCG	2	10	108571	108580	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_009928	AAATA	2	10	110081	110090	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009928	CCTGA	2	10	114683	114692	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_009928	GACAA	2	10	125964	125973	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009928	GTTTT	2	10	131365	131374	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009928	TGCTT	2	10	131498	131507	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009928	GTTCA	2	10	135837	135846	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009928	CCTGA	2	10	136861	136870	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009928	GCCTA	2	10	137889	137898	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_009928	CTGTG	2	10	141983	141992	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009928	TAAAC	2	10	146737	146746	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009928	GAGAA	2	10	149346	149355	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009928	CCCAA	2	10	152827	152836	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_009928	CATAC	2	10	155270	155279	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_009928	GTTTA	2	10	160529	160538	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009928	GAATT	2	10	164085	164094	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009928	TTTCA	2	10	164275	164284	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_009928	TTCTT	2	10	164312	164321	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_009928	CCTAA	2	10	165128	165137	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_009928	GCAAG	2	10	165842	165851	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_009928	TTGCT	2	10	167964	167973	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009928	TGATT	2	10	191817	191826	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009928	TCATC	2	10	192261	192270	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_009928	TATTT	2	10	194988	194997	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009928	TTTTC	2	10	195717	195726	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009928	CTTTC	2	10	196998	197007	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_009928	CAACC	2	10	206801	206810	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
53	NC_009928	CTTTC	2	10	222693	222702	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_009928	CTTAG	2	10	226287	226296	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009928	ACCAC	2	10	231510	231519	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_009928	CACAC	2	10	237052	237061	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
57	NC_009928	TTTTC	2	10	239486	239495	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_009928	GGGAA	2	10	248610	248619	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.