MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009928	CAATC	2	10	1104	1113	40 %	20 %	0 %	40 %	158340458
2	NC_009928	ACCTC	2	10	7493	7502	20 %	20 %	0 %	60 %	158340468
3	NC_009928	CTCAT	2	10	8241	8250	20 %	40 %	0 %	40 %	158340468
4	NC_009928	AAGAC	2	10	11116	11125	60 %	0 %	20 %	20 %	158340469
5	NC_009928	ATGAG	2	10	11207	11216	40 %	20 %	40 %	0 %	158340469
6	NC_009928	CTGAA	2	10	15910	15919	40 %	20 %	20 %	20 %	158340472
7	NC_009928	CGATT	2	10	17659	17668	20 %	40 %	20 %	20 %	158340473
8	NC_009928	GAGCA	2	10	19678	19687	40 %	0 %	40 %	20 %	158340474
9	NC_009928	GTCGG	2	10	19892	19901	0 %	20 %	60 %	20 %	158340474
10	NC_009928	TGATG	2	10	20427	20436	20 %	40 %	40 %	0 %	158340474
11	NC_009928	ACCGA	2	10	21780	21789	40 %	0 %	20 %	40 %	158340475
12	NC_009928	AAAAC	2	10	24785	24794	80 %	0 %	0 %	20 %	158340478
13	NC_009928	GACAA	2	10	30326	30335	60 %	0 %	20 %	20 %	158340484
14	NC_009928	GCTTG	2	10	30547	30556	0 %	40 %	40 %	20 %	158340485
15	NC_009928	CGGGG	2	10	31163	31172	0 %	0 %	80 %	20 %	158340485
16	NC_009928	GGGTC	2	10	31262	31271	0 %	20 %	60 %	20 %	158340485
17	NC_009928	GGCTG	2	10	31305	31314	0 %	20 %	60 %	20 %	158340485
18	NC_009928	AAGCT	2	10	33875	33884	40 %	20 %	20 %	20 %	158340488
19	NC_009928	AGACG	2	10	34531	34540	40 %	0 %	40 %	20 %	158340488
20	NC_009928	GCCAA	2	10	40082	40091	40 %	0 %	20 %	40 %	158340491
21	NC_009928	GTGGG	2	10	45725	45734	0 %	20 %	80 %	0 %	158340495
22	NC_009928	GATAT	2	10	50548	50557	40 %	40 %	20 %	0 %	158340498
23	NC_009928	ATCAA	2	10	50759	50768	60 %	20 %	0 %	20 %	158340498
24	NC_009928	AATGA	2	10	51328	51337	60 %	20 %	20 %	0 %	158340500
25	NC_009928	TACCT	2	10	55583	55592	20 %	40 %	0 %	40 %	158340506
26	NC_009928	CGAGC	2	10	56798	56807	20 %	0 %	40 %	40 %	158340507
27	NC_009928	CAGTA	2	10	57231	57240	40 %	20 %	20 %	20 %	158340508
28	NC_009928	GCTAA	2	10	58137	58146	40 %	20 %	20 %	20 %	158340509
29	NC_009928	GCAAT	2	10	58941	58950	40 %	20 %	20 %	20 %	158340510
30	NC_009928	GACCA	2	10	60516	60525	40 %	0 %	20 %	40 %	158340512
31	NC_009928	GCATT	2	10	63985	63994	20 %	40 %	20 %	20 %	158340515
32	NC_009928	GCAGA	2	10	65654	65663	40 %	0 %	40 %	20 %	158340517
33	NC_009928	TTCAT	2	10	66375	66384	20 %	60 %	0 %	20 %	158340519
34	NC_009928	TTCAT	2	10	71645	71654	20 %	60 %	0 %	20 %	158340524
35	NC_009928	GGAAC	2	10	73296	73305	40 %	0 %	40 %	20 %	158340530
36	NC_009928	GTTCT	2	10	73665	73674	0 %	60 %	20 %	20 %	158340530
37	NC_009928	CAAAC	2	10	75496	75505	60 %	0 %	0 %	40 %	158340532
38	NC_009928	TGAGT	2	10	75769	75778	20 %	40 %	40 %	0 %	158340532
39	NC_009928	GCTCA	2	10	76360	76369	20 %	20 %	20 %	40 %	158340533
40	NC_009928	TCCAA	2	10	78922	78931	40 %	20 %	0 %	40 %	158340535
41	NC_009928	GCTTG	2	10	84631	84640	0 %	40 %	40 %	20 %	158340543
42	NC_009928	TTCAG	2	10	85902	85911	20 %	40 %	20 %	20 %	158340545
43	NC_009928	TCAGG	2	10	92261	92270	20 %	20 %	40 %	20 %	158340554
44	NC_009928	ACTCA	2	10	96765	96774	40 %	20 %	0 %	40 %	158340559
45	NC_009928	TCAAT	2	10	98513	98522	40 %	40 %	0 %	20 %	158340561
46	NC_009928	GTTCT	2	10	99717	99726	0 %	60 %	20 %	20 %	158340564
47	NC_009928	CTAAG	2	10	106352	106361	40 %	20 %	20 %	20 %	158340572
48	NC_009928	ATCAG	2	10	106849	106858	40 %	20 %	20 %	20 %	158340573
49	NC_009928	CGGGT	2	10	112079	112088	0 %	20 %	60 %	20 %	158340582
50	NC_009928	AAACC	2	10	113560	113569	60 %	0 %	0 %	40 %	158340586
51	NC_009928	AAAGC	2	10	115093	115102	60 %	0 %	20 %	20 %	158340587
52	NC_009928	GTTAC	2	10	121519	121528	20 %	40 %	20 %	20 %	158340599
53	NC_009928	TGCAA	2	10	122037	122046	40 %	20 %	20 %	20 %	158340600
54	NC_009928	ATAAG	2	10	124414	124423	60 %	20 %	20 %	0 %	158340603
55	NC_009928	TTGTC	2	10	125246	125255	0 %	60 %	20 %	20 %	158340606
56	NC_009928	CTTGT	2	10	125437	125446	0 %	60 %	20 %	20 %	158340607
57	NC_009928	TCCCT	2	10	130940	130949	0 %	40 %	0 %	60 %	158340615
58	NC_009928	AAAGC	2	10	137271	137280	60 %	0 %	20 %	20 %	158340622
59	NC_009928	TTGCT	2	10	152936	152945	0 %	60 %	20 %	20 %	158340281
60	NC_009928	AAGCC	2	10	153697	153706	40 %	0 %	20 %	40 %	158340283
61	NC_009928	TTGAG	2	10	154823	154832	20 %	40 %	40 %	0 %	158340284
62	NC_009928	TCAAT	2	10	157421	157430	40 %	40 %	0 %	20 %	158340286
63	NC_009928	ATCCC	2	10	159987	159996	20 %	20 %	0 %	60 %	158340290
64	NC_009928	AAGCA	2	10	164969	164978	60 %	0 %	20 %	20 %	158340297
65	NC_009928	GTTCC	2	10	169325	169334	0 %	40 %	20 %	40 %	158340303
66	NC_009928	GAGTT	2	10	173056	173065	20 %	40 %	40 %	0 %	158340311
67	NC_009928	GGTGA	2	10	174671	174680	20 %	20 %	60 %	0 %	158340314
68	NC_009928	GCGGA	2	10	175227	175236	20 %	0 %	60 %	20 %	158340316
69	NC_009928	TTCCT	2	10	175396	175405	0 %	60 %	0 %	40 %	158340316
70	NC_009928	GGTCC	2	10	175605	175614	0 %	20 %	40 %	40 %	158340317
71	NC_009928	CGGAG	2	10	176039	176048	20 %	0 %	60 %	20 %	158340317
72	NC_009928	CAAAG	2	10	176620	176629	60 %	0 %	20 %	20 %	158340318
73	NC_009928	GGAAT	2	10	180731	180740	40 %	20 %	40 %	0 %	158340324
74	NC_009928	TACTG	2	10	182339	182348	20 %	40 %	20 %	20 %	158340328
75	NC_009928	ATACC	2	10	183046	183055	40 %	20 %	0 %	40 %	158340330
76	NC_009928	TTCTT	2	10	183466	183475	0 %	80 %	0 %	20 %	158340330
77	NC_009928	TGTTT	2	10	183893	183902	0 %	80 %	20 %	0 %	158340330
78	NC_009928	CTATT	2	10	185593	185602	20 %	60 %	0 %	20 %	158340334
79	NC_009928	AAAAC	2	10	191340	191349	80 %	0 %	0 %	20 %	158340341
80	NC_009928	TAATT	2	10	195605	195614	40 %	60 %	0 %	0 %	158340347
81	NC_009928	CTCAA	2	10	196350	196359	40 %	20 %	0 %	40 %	158340348
82	NC_009928	CCAAT	2	10	202147	202156	40 %	20 %	0 %	40 %	158340357
83	NC_009928	CAACA	2	10	205074	205083	60 %	0 %	0 %	40 %	158340362
84	NC_009928	CTTCT	2	10	205663	205672	0 %	60 %	0 %	40 %	158340363
85	NC_009928	GCTAA	2	10	206124	206133	40 %	20 %	20 %	20 %	158340363
86	NC_009928	GGGTT	2	10	207355	207364	0 %	40 %	60 %	0 %	158340366
87	NC_009928	GTGAG	2	10	211295	211304	20 %	20 %	60 %	0 %	158340370
88	NC_009928	CCCAG	2	10	215810	215819	20 %	0 %	20 %	60 %	158340376
89	NC_009928	CAAGA	2	10	216193	216202	60 %	0 %	20 %	20 %	158340377
90	NC_009928	ATCAA	2	10	216916	216925	60 %	20 %	0 %	20 %	158340378
91	NC_009928	CTATG	2	10	219444	219453	20 %	40 %	20 %	20 %	158340381
92	NC_009928	ATTTC	2	10	220412	220421	20 %	60 %	0 %	20 %	158340384
93	NC_009928	ACTGG	2	10	223218	223227	20 %	20 %	40 %	20 %	158340392
94	NC_009928	TGACA	2	10	224586	224595	40 %	20 %	20 %	20 %	158340395
95	NC_009928	CTTTT	2	10	224834	224843	0 %	80 %	0 %	20 %	158340396
96	NC_009928	TTTAT	2	10	224858	224867	20 %	80 %	0 %	0 %	158340396
97	NC_009928	TGCTG	2	10	227076	227085	0 %	40 %	40 %	20 %	158340399
98	NC_009928	TCAGC	2	10	227423	227432	20 %	20 %	20 %	40 %	158340399
99	NC_009928	ACCAA	2	10	233234	233243	60 %	0 %	0 %	40 %	158340405
100	NC_009928	ACAGC	2	10	238294	238303	40 %	0 %	20 %	40 %	158340415
101	NC_009928	GAATG	2	10	238672	238681	40 %	20 %	40 %	0 %	158340416
102	NC_009928	CAGCA	2	10	241959	241968	40 %	0 %	20 %	40 %	158340422
103	NC_009928	GATTT	2	10	249817	249826	20 %	60 %	20 %	0 %	158340437
104	NC_009928	CTCTT	2	10	251410	251419	0 %	60 %	0 %	40 %	158340438
105	NC_009928	CCGAT	2	10	252816	252825	20 %	20 %	20 %	40 %	158340438
106	NC_009928	GAATG	2	10	256427	256436	40 %	20 %	40 %	0 %	158340439
107	NC_009928	AATGT	2	10	257941	257950	40 %	40 %	20 %	0 %	158340440
108	NC_009928	GATCT	2	10	258243	258252	20 %	40 %	20 %	20 %	158340441
109	NC_009928	GCTTG	2	10	261044	261053	0 %	40 %	40 %	20 %	158340447
110	NC_009928	CGGAA	2	10	262072	262081	40 %	0 %	40 %	20 %	158340448
111	NC_009928	AAGCA	2	10	263437	263446	60 %	0 %	20 %	20 %	158340451
112	NC_009928	GACCA	2	10	265675	265684	40 %	0 %	20 %	40 %	158340451
113	NC_009928	TGGGG	2	10	269475	269484	0 %	20 %	80 %	0 %	158340452
114	NC_009928	CGTCT	2	10	272437	272446	0 %	40 %	20 %	40 %	158340454
115	NC_009928	TGGGG	2	10	272765	272774	0 %	20 %	80 %	0 %	158340455

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.