MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3

Total Repeats: 2400

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009928	AGG	2	6	334	339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340457
2	NC_009928	TGC	2	6	395	400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340457
3	NC_009928	CAG	2	6	430	435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340457
4	NC_009928	CTT	2	6	504	509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340458
5	NC_009928	AGC	2	6	517	522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340458
6	NC_009928	TGA	2	6	809	814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340458
7	NC_009928	AAT	2	6	1026	1031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340458
8	NC_009928	TGT	2	6	1181	1186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340458
9	NC_009928	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340459
10	NC_009928	TGA	2	6	1620	1625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340459
11	NC_009928	ATT	2	6	1626	1631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340459
12	NC_009928	CGA	2	6	1714	1719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340459
13	NC_009928	GAG	2	6	1907	1912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340459
14	NC_009928	TCT	2	6	1914	1919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340459
15	NC_009928	CTT	2	6	2204	2209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340460
16	NC_009928	CTT	2	6	2698	2703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340461
17	NC_009928	AGC	2	6	2707	2712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340461
18	NC_009928	CTT	2	6	2784	2789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340461
19	NC_009928	GCT	2	6	2810	2815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340461
20	NC_009928	CAT	2	6	2868	2873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340461
21	NC_009928	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340461
22	NC_009928	TTC	2	6	3315	3320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340462
23	NC_009928	TTC	2	6	3344	3349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340462
24	NC_009928	CTC	2	6	3350	3355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340462
25	NC_009928	CTC	2	6	3554	3559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340462
26	NC_009928	TGA	2	6	4108	4113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340464
27	NC_009928	GTT	2	6	4221	4226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340464
28	NC_009928	TAG	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340464
29	NC_009928	CCT	2	6	4400	4405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340464
30	NC_009928	GCA	2	6	4555	4560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340464
31	NC_009928	CCA	2	6	4636	4641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340464
32	NC_009928	CTG	2	6	4719	4724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340464
33	NC_009928	TTC	2	6	4734	4739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340464
34	NC_009928	TAC	2	6	4784	4789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340464
35	NC_009928	TGA	2	6	4984	4989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340465
36	NC_009928	GGA	2	6	5078	5083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340465
37	NC_009928	TGG	2	6	5164	5169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340465
38	NC_009928	ATG	2	6	5196	5201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340465
39	NC_009928	TGA	3	9	5406	5414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340466
40	NC_009928	AGT	2	6	5545	5550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340466
41	NC_009928	CTT	2	6	7083	7088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340468
42	NC_009928	CAG	2	6	7108	7113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340468
43	NC_009928	TCG	2	6	7130	7135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340468
44	NC_009928	ATT	2	6	7547	7552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340468
45	NC_009928	TGG	2	6	7716	7721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340468
46	NC_009928	TGA	2	6	7754	7759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340468
47	NC_009928	GAT	2	6	7764	7769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340468
48	NC_009928	CAG	2	6	7848	7853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340468
49	NC_009928	CAA	2	6	7914	7919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340468
50	NC_009928	CGC	2	6	8019	8024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340468
51	NC_009928	AGA	2	6	8103	8108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340468
52	NC_009928	AGC	2	6	8139	8144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340468
53	NC_009928	GCC	2	6	8152	8157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340468
54	NC_009928	ACA	3	9	8181	8189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340468
55	NC_009928	GGA	2	6	8433	8438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340468
56	NC_009928	AAG	2	6	9066	9071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340468
57	NC_009928	GCT	2	6	9307	9312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340468
58	NC_009928	TGA	2	6	9317	9322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340468
59	NC_009928	GTG	2	6	9330	9335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340468
60	NC_009928	CCA	2	6	9475	9480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340468
61	NC_009928	AAG	2	6	9495	9500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340468
62	NC_009928	TGG	2	6	9519	9524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340468
63	NC_009928	GCC	2	6	9609	9614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340468
64	NC_009928	GAA	3	9	9648	9656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340468
65	NC_009928	GAC	2	6	9715	9720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340468
66	NC_009928	GTG	2	6	9756	9761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340468
67	NC_009928	GCC	2	6	9828	9833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340468
68	NC_009928	AAG	2	6	9897	9902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340468
69	NC_009928	CAA	2	6	9909	9914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340468
70	NC_009928	GTG	2	6	9915	9920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340468
71	NC_009928	TTG	2	6	10277	10282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340468
72	NC_009928	ATA	2	6	10655	10660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340469
73	NC_009928	TTC	2	6	10693	10698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340469
74	NC_009928	ACA	2	6	10731	10736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340469
75	NC_009928	TAT	2	6	10737	10742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340469
76	NC_009928	CTT	2	6	10749	10754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340469
77	NC_009928	CAA	2	6	10822	10827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340469
78	NC_009928	GAT	2	6	10835	10840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340469
79	NC_009928	CTG	3	9	11070	11078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340469
80	NC_009928	AAG	2	6	11089	11094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340469
81	NC_009928	GTT	2	6	11162	11167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340469
82	NC_009928	TAA	2	6	11290	11295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340469
83	NC_009928	TGA	2	6	11321	11326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340469
84	NC_009928	ACG	2	6	11375	11380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340469
85	NC_009928	GCC	2	6	11536	11541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340469
86	NC_009928	TGG	2	6	11645	11650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340469
87	NC_009928	TGA	2	6	11739	11744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340469
88	NC_009928	TGA	2	6	11775	11780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340469
89	NC_009928	AAT	2	6	11846	11851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340469
90	NC_009928	CAC	2	6	11967	11972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340469
91	NC_009928	TTG	2	6	11998	12003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340469
92	NC_009928	ATG	2	6	12050	12055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340469
93	NC_009928	CAA	2	6	12168	12173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340469
94	NC_009928	GTT	2	6	12174	12179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340469
95	NC_009928	GCA	2	6	12441	12446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340469
96	NC_009928	CTG	2	6	12453	12458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340469
97	NC_009928	GAT	2	6	12469	12474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340469
98	NC_009928	TTC	2	6	12496	12501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340469
99	NC_009928	ACC	2	6	12548	12553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340469
100	NC_009928	TTG	2	6	12604	12609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340469
101	NC_009928	TCA	2	6	13096	13101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340470
102	NC_009928	TCT	2	6	13107	13112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340470
103	NC_009928	CTC	2	6	13221	13226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340470
104	NC_009928	TAC	2	6	13249	13254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340470
105	NC_009928	GCT	2	6	13319	13324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340470
106	NC_009928	CTC	2	6	13325	13330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340470
107	NC_009928	CTC	2	6	13340	13345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340470
108	NC_009928	ACC	2	6	13475	13480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340470
109	NC_009928	GTC	2	6	13484	13489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340470
110	NC_009928	GAT	2	6	13625	13630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340470
111	NC_009928	TCA	2	6	13698	13703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340470
112	NC_009928	AGC	2	6	13715	13720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340470
113	NC_009928	TCG	2	6	13785	13790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340470
114	NC_009928	ATT	2	6	13832	13837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340470
115	NC_009928	GCC	2	6	13844	13849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340470
116	NC_009928	TGA	2	6	13914	13919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340470
117	NC_009928	TCC	2	6	13967	13972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340470
118	NC_009928	CTA	2	6	14005	14010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340470
119	NC_009928	GAT	2	6	14081	14086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340470
120	NC_009928	ACC	2	6	14094	14099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340470
121	NC_009928	TCT	2	6	14463	14468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340471
122	NC_009928	TGG	2	6	14544	14549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340471
123	NC_009928	ATC	2	6	14566	14571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340471
124	NC_009928	AAG	2	6	14677	14682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340471
125	NC_009928	GGC	2	6	14872	14877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158340471
126	NC_009928	CCA	4	12	14884	14895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340471
127	NC_009928	TTA	2	6	14953	14958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340471
128	NC_009928	CAA	2	6	15004	15009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340471
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131	NC_009928	CAT	2	6	15142	15147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340471
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133	NC_009928	AGA	2	6	15327	15332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340471
134	NC_009928	AGT	2	6	15403	15408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340471
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137	NC_009928	AGA	2	6	15575	15580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340471
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253	NC_009928	GAG	2	6	25989	25994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340478
254	NC_009928	AGC	2	6	26048	26053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340478
255	NC_009928	AGG	2	6	26133	26138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340478
256	NC_009928	TGA	2	6	26211	26216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340478
257	NC_009928	TCA	2	6	26260	26265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340479
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259	NC_009928	ATC	2	6	26352	26357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340479
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269	NC_009928	AAC	2	6	28024	28029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340483
270	NC_009928	GCG	2	6	28251	28256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158340483
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281	NC_009928	CTG	2	6	31109	31114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340485
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500	NC_009928	CTG	2	6	52751	52756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340502

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