MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3

Total Repeats: 244

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009928	CT	3	6	1538	1543	0 %	50 %	0 %	50 %	158340459
2	NC_009928	CT	3	6	1565	1570	0 %	50 %	0 %	50 %	158340459
3	NC_009928	CT	3	6	1576	1581	0 %	50 %	0 %	50 %	158340459
4	NC_009928	CT	3	6	2773	2778	0 %	50 %	0 %	50 %	158340461
5	NC_009928	AC	3	6	4029	4034	50 %	0 %	0 %	50 %	158340464
6	NC_009928	GA	3	6	4271	4276	50 %	0 %	50 %	0 %	158340464
7	NC_009928	GA	3	6	5120	5125	50 %	0 %	50 %	0 %	158340465
8	NC_009928	GA	3	6	6050	6055	50 %	0 %	50 %	0 %	158340467
9	NC_009928	AG	3	6	7002	7007	50 %	0 %	50 %	0 %	158340468
10	NC_009928	CT	3	6	7197	7202	0 %	50 %	0 %	50 %	158340468
11	NC_009928	AT	3	6	8060	8065	50 %	50 %	0 %	0 %	158340468
12	NC_009928	AC	3	6	8124	8129	50 %	0 %	0 %	50 %	158340468
13	NC_009928	AT	3	6	10722	10727	50 %	50 %	0 %	0 %	158340469
14	NC_009928	AG	3	6	11232	11237	50 %	0 %	50 %	0 %	158340469
15	NC_009928	AG	3	6	12424	12429	50 %	0 %	50 %	0 %	158340469
16	NC_009928	CA	3	6	13676	13681	50 %	0 %	0 %	50 %	158340470
17	NC_009928	TG	3	6	14509	14514	0 %	50 %	50 %	0 %	158340471
18	NC_009928	GT	3	6	14900	14905	0 %	50 %	50 %	0 %	158340471
19	NC_009928	GT	3	6	15390	15395	0 %	50 %	50 %	0 %	158340471
20	NC_009928	TC	3	6	19521	19526	0 %	50 %	0 %	50 %	158340474
21	NC_009928	CT	3	6	21060	21065	0 %	50 %	0 %	50 %	158340474
22	NC_009928	GA	3	6	23552	23557	50 %	0 %	50 %	0 %	158340478
23	NC_009928	AC	3	6	25816	25821	50 %	0 %	0 %	50 %	158340478
24	NC_009928	GT	3	6	25879	25884	0 %	50 %	50 %	0 %	158340478
25	NC_009928	TG	3	6	27297	27302	0 %	50 %	50 %	0 %	158340483
26	NC_009928	TG	3	6	34271	34276	0 %	50 %	50 %	0 %	158340488
27	NC_009928	CT	3	6	37110	37115	0 %	50 %	0 %	50 %	158340489
28	NC_009928	TC	3	6	37690	37695	0 %	50 %	0 %	50 %	158340489
29	NC_009928	GA	3	6	38561	38566	50 %	0 %	50 %	0 %	158340490
30	NC_009928	GA	3	6	38757	38762	50 %	0 %	50 %	0 %	158340491
31	NC_009928	GA	3	6	38846	38851	50 %	0 %	50 %	0 %	158340491
32	NC_009928	AT	3	6	40319	40324	50 %	50 %	0 %	0 %	158340491
33	NC_009928	AT	3	6	40472	40477	50 %	50 %	0 %	0 %	158340491
34	NC_009928	TA	3	6	42645	42650	50 %	50 %	0 %	0 %	158340494
35	NC_009928	TC	4	8	42700	42707	0 %	50 %	0 %	50 %	158340494
36	NC_009928	CT	3	6	43410	43415	0 %	50 %	0 %	50 %	158340495
37	NC_009928	AG	3	6	44788	44793	50 %	0 %	50 %	0 %	158340495
38	NC_009928	AT	3	6	45590	45595	50 %	50 %	0 %	0 %	158340495
39	NC_009928	TC	3	6	46196	46201	0 %	50 %	0 %	50 %	158340495
40	NC_009928	GA	3	6	46402	46407	50 %	0 %	50 %	0 %	158340495
41	NC_009928	AG	3	6	46453	46458	50 %	0 %	50 %	0 %	158340495
42	NC_009928	CT	3	6	46648	46653	0 %	50 %	0 %	50 %	158340495
43	NC_009928	CT	3	6	47881	47886	0 %	50 %	0 %	50 %	158340496
44	NC_009928	CT	3	6	48803	48808	0 %	50 %	0 %	50 %	158340497
45	NC_009928	AG	3	6	50069	50074	50 %	0 %	50 %	0 %	158340498
46	NC_009928	TG	3	6	50690	50695	0 %	50 %	50 %	0 %	158340498
47	NC_009928	AT	3	6	50833	50838	50 %	50 %	0 %	0 %	158340499
48	NC_009928	AT	3	6	50950	50955	50 %	50 %	0 %	0 %	158340499
49	NC_009928	TA	3	6	51264	51269	50 %	50 %	0 %	0 %	158340499
50	NC_009928	TA	3	6	51566	51571	50 %	50 %	0 %	0 %	158340500
51	NC_009928	AT	3	6	51642	51647	50 %	50 %	0 %	0 %	158340500
52	NC_009928	TG	3	6	52390	52395	0 %	50 %	50 %	0 %	158340501
53	NC_009928	TC	3	6	52408	52413	0 %	50 %	0 %	50 %	158340501
54	NC_009928	TC	3	6	52520	52525	0 %	50 %	0 %	50 %	158340501
55	NC_009928	AG	4	8	52802	52809	50 %	0 %	50 %	0 %	158340502
56	NC_009928	TC	3	6	52859	52864	0 %	50 %	0 %	50 %	158340502
57	NC_009928	CA	3	6	53004	53009	50 %	0 %	0 %	50 %	158340502
58	NC_009928	GT	3	6	53276	53281	0 %	50 %	50 %	0 %	158340502
59	NC_009928	AG	4	8	53423	53430	50 %	0 %	50 %	0 %	158340502
60	NC_009928	TG	3	6	54641	54646	0 %	50 %	50 %	0 %	158340505
61	NC_009928	GA	3	6	54890	54895	50 %	0 %	50 %	0 %	158340505
62	NC_009928	GA	3	6	56075	56080	50 %	0 %	50 %	0 %	158340507
63	NC_009928	TC	3	6	57783	57788	0 %	50 %	0 %	50 %	158340509
64	NC_009928	CT	3	6	58869	58874	0 %	50 %	0 %	50 %	158340510
65	NC_009928	CA	4	8	58999	59006	50 %	0 %	0 %	50 %	158340510
66	NC_009928	GC	3	6	60354	60359	0 %	0 %	50 %	50 %	158340511
67	NC_009928	TC	3	6	62116	62121	0 %	50 %	0 %	50 %	158340513
68	NC_009928	TC	3	6	62570	62575	0 %	50 %	0 %	50 %	158340514
69	NC_009928	GA	3	6	64231	64236	50 %	0 %	50 %	0 %	158340515
70	NC_009928	TC	3	6	66269	66274	0 %	50 %	0 %	50 %	158340518
71	NC_009928	CG	3	6	66416	66421	0 %	0 %	50 %	50 %	158340519
72	NC_009928	AG	3	6	67832	67837	50 %	0 %	50 %	0 %	158340520
73	NC_009928	GC	3	6	68901	68906	0 %	0 %	50 %	50 %	158340521
74	NC_009928	CA	3	6	70028	70033	50 %	0 %	0 %	50 %	158340522
75	NC_009928	CA	3	6	70513	70518	50 %	0 %	0 %	50 %	158340522
76	NC_009928	TC	3	6	72784	72789	0 %	50 %	0 %	50 %	158340529
77	NC_009928	AG	3	6	73001	73006	50 %	0 %	50 %	0 %	158340529
78	NC_009928	TC	3	6	73361	73366	0 %	50 %	0 %	50 %	158340530
79	NC_009928	CA	3	6	74816	74821	50 %	0 %	0 %	50 %	158340531
80	NC_009928	TG	3	6	76622	76627	0 %	50 %	50 %	0 %	158340533
81	NC_009928	TC	3	6	76667	76672	0 %	50 %	0 %	50 %	158340533
82	NC_009928	AC	3	6	77795	77800	50 %	0 %	0 %	50 %	158340534
83	NC_009928	AC	3	6	78190	78195	50 %	0 %	0 %	50 %	158340534
84	NC_009928	CT	3	6	78674	78679	0 %	50 %	0 %	50 %	158340535
85	NC_009928	AG	3	6	82207	82212	50 %	0 %	50 %	0 %	158340538
86	NC_009928	TG	3	6	84622	84627	0 %	50 %	50 %	0 %	158340543
87	NC_009928	TA	3	6	86935	86940	50 %	50 %	0 %	0 %	158340546
88	NC_009928	AT	3	6	87158	87163	50 %	50 %	0 %	0 %	158340546
89	NC_009928	TA	3	6	87831	87836	50 %	50 %	0 %	0 %	158340547
90	NC_009928	AC	3	6	88832	88837	50 %	0 %	0 %	50 %	158340549
91	NC_009928	CA	3	6	89487	89492	50 %	0 %	0 %	50 %	158340551
92	NC_009928	GA	3	6	89658	89663	50 %	0 %	50 %	0 %	158340551
93	NC_009928	AT	3	6	90398	90403	50 %	50 %	0 %	0 %	158340552
94	NC_009928	CA	3	6	90505	90510	50 %	0 %	0 %	50 %	158340552
95	NC_009928	CA	3	6	90550	90555	50 %	0 %	0 %	50 %	158340552
96	NC_009928	CT	3	6	91700	91705	0 %	50 %	0 %	50 %	158340554
97	NC_009928	TA	3	6	97246	97251	50 %	50 %	0 %	0 %	158340560
98	NC_009928	TG	3	6	97824	97829	0 %	50 %	50 %	0 %	158340560
99	NC_009928	AT	3	6	98702	98707	50 %	50 %	0 %	0 %	158340561
100	NC_009928	AG	3	6	99618	99623	50 %	0 %	50 %	0 %	158340564
101	NC_009928	GA	4	8	101642	101649	50 %	0 %	50 %	0 %	158340567
102	NC_009928	GT	3	6	101681	101686	0 %	50 %	50 %	0 %	158340567
103	NC_009928	AT	3	6	101776	101781	50 %	50 %	0 %	0 %	158340567
104	NC_009928	AT	3	6	103086	103091	50 %	50 %	0 %	0 %	158340569
105	NC_009928	GA	3	6	105254	105259	50 %	0 %	50 %	0 %	158340571
106	NC_009928	TA	4	8	105789	105796	50 %	50 %	0 %	0 %	158340572
107	NC_009928	AG	3	6	106323	106328	50 %	0 %	50 %	0 %	158340572
108	NC_009928	AG	3	6	106743	106748	50 %	0 %	50 %	0 %	158340573
109	NC_009928	TC	3	6	106909	106914	0 %	50 %	0 %	50 %	158340573
110	NC_009928	CA	3	6	106977	106982	50 %	0 %	0 %	50 %	158340573
111	NC_009928	AT	3	6	107008	107013	50 %	50 %	0 %	0 %	158340573
112	NC_009928	CA	3	6	107134	107139	50 %	0 %	0 %	50 %	158340573
113	NC_009928	AT	3	6	109899	109904	50 %	50 %	0 %	0 %	158340578
114	NC_009928	TG	3	6	113863	113868	0 %	50 %	50 %	0 %	158340586
115	NC_009928	CT	3	6	114981	114986	0 %	50 %	0 %	50 %	158340587
116	NC_009928	AG	3	6	115164	115169	50 %	0 %	50 %	0 %	158340587
117	NC_009928	TG	3	6	116496	116501	0 %	50 %	50 %	0 %	158340591
118	NC_009928	CT	3	6	117413	117418	0 %	50 %	0 %	50 %	158340593
119	NC_009928	CA	3	6	117850	117855	50 %	0 %	0 %	50 %	158340593
120	NC_009928	AT	3	6	118085	118090	50 %	50 %	0 %	0 %	158340593
121	NC_009928	TC	3	6	118476	118481	0 %	50 %	0 %	50 %	158340593
122	NC_009928	AG	3	6	119071	119076	50 %	0 %	50 %	0 %	158340595
123	NC_009928	AG	3	6	119924	119929	50 %	0 %	50 %	0 %	158340597
124	NC_009928	CT	3	6	120028	120033	0 %	50 %	0 %	50 %	158340597
125	NC_009928	AG	3	6	121813	121818	50 %	0 %	50 %	0 %	158340600
126	NC_009928	AC	3	6	122271	122276	50 %	0 %	0 %	50 %	158340601
127	NC_009928	CA	3	6	122322	122327	50 %	0 %	0 %	50 %	158340601
128	NC_009928	TG	3	6	124791	124796	0 %	50 %	50 %	0 %	158340605
129	NC_009928	AG	3	6	124915	124920	50 %	0 %	50 %	0 %	158340605
130	NC_009928	GA	3	6	126360	126365	50 %	0 %	50 %	0 %	158340609
131	NC_009928	GA	3	6	129117	129122	50 %	0 %	50 %	0 %	158340613
132	NC_009928	AT	3	6	132842	132847	50 %	50 %	0 %	0 %	158340618
133	NC_009928	TC	3	6	133432	133437	0 %	50 %	0 %	50 %	158340618
134	NC_009928	TG	3	6	134057	134062	0 %	50 %	50 %	0 %	158340619
135	NC_009928	AG	3	6	134177	134182	50 %	0 %	50 %	0 %	158340620
136	NC_009928	GT	3	6	134256	134261	0 %	50 %	50 %	0 %	158340620
137	NC_009928	CT	3	6	137159	137164	0 %	50 %	0 %	50 %	158340622
138	NC_009928	AG	3	6	137342	137347	50 %	0 %	50 %	0 %	158340622
139	NC_009928	AT	3	6	138529	138534	50 %	50 %	0 %	0 %	158340624
140	NC_009928	AT	3	6	138936	138941	50 %	50 %	0 %	0 %	158340624
141	NC_009928	GT	3	6	141071	141076	0 %	50 %	50 %	0 %	158340624
142	NC_009928	TA	3	6	142536	142541	50 %	50 %	0 %	0 %	158340625
143	NC_009928	AG	3	6	142784	142789	50 %	0 %	50 %	0 %	158340625
144	NC_009928	TG	3	6	143114	143119	0 %	50 %	50 %	0 %	158340626
145	NC_009928	GC	3	6	143993	143998	0 %	0 %	50 %	50 %	158340626
146	NC_009928	CA	3	6	144481	144486	50 %	0 %	0 %	50 %	158340627
147	NC_009928	AT	3	6	146068	146073	50 %	50 %	0 %	0 %	158340631
148	NC_009928	AT	3	6	146428	146433	50 %	50 %	0 %	0 %	158340631
149	NC_009928	TA	3	6	147909	147914	50 %	50 %	0 %	0 %	158340636
150	NC_009928	AT	3	6	148124	148129	50 %	50 %	0 %	0 %	158340637
151	NC_009928	CA	3	6	148231	148236	50 %	0 %	0 %	50 %	158340637
152	NC_009928	CA	3	6	148276	148281	50 %	0 %	0 %	50 %	158340637
153	NC_009928	AT	3	6	155039	155044	50 %	50 %	0 %	0 %	158340284
154	NC_009928	TA	3	6	156154	156159	50 %	50 %	0 %	0 %	158340285
155	NC_009928	TG	3	6	156732	156737	0 %	50 %	50 %	0 %	158340285
156	NC_009928	AT	3	6	157610	157615	50 %	50 %	0 %	0 %	158340286
157	NC_009928	TG	3	6	161236	161241	0 %	50 %	50 %	0 %	158340292
158	NC_009928	GT	3	6	161891	161896	0 %	50 %	50 %	0 %	158340293
159	NC_009928	TA	3	6	162771	162776	50 %	50 %	0 %	0 %	158340295
160	NC_009928	AT	3	6	163444	163449	50 %	50 %	0 %	0 %	158340296
161	NC_009928	TA	3	6	163667	163672	50 %	50 %	0 %	0 %	158340296
162	NC_009928	CT	3	6	164508	164513	0 %	50 %	0 %	50 %	158340297
163	NC_009928	GA	3	6	168253	168258	50 %	0 %	50 %	0 %	158340302
164	NC_009928	TC	3	6	169171	169176	0 %	50 %	0 %	50 %	158340303
165	NC_009928	AT	3	6	169652	169657	50 %	50 %	0 %	0 %	158340303
166	NC_009928	CA	3	6	170118	170123	50 %	0 %	0 %	50 %	158340305
167	NC_009928	AC	3	6	170441	170446	50 %	0 %	0 %	50 %	158340307
168	NC_009928	GT	3	6	170567	170572	0 %	50 %	50 %	0 %	158340307
169	NC_009928	AG	3	6	174515	174520	50 %	0 %	50 %	0 %	158340314
170	NC_009928	TC	3	6	174608	174613	0 %	50 %	0 %	50 %	158340314
171	NC_009928	GA	3	6	177263	177268	50 %	0 %	50 %	0 %	158340318
172	NC_009928	GC	3	6	177754	177759	0 %	0 %	50 %	50 %	158340319
173	NC_009928	AC	3	6	181169	181174	50 %	0 %	0 %	50 %	158340326
174	NC_009928	GA	3	6	181183	181188	50 %	0 %	50 %	0 %	158340326
175	NC_009928	AT	3	6	183990	183995	50 %	50 %	0 %	0 %	158340330
176	NC_009928	GA	3	6	185858	185863	50 %	0 %	50 %	0 %	158340334
177	NC_009928	TA	3	6	186443	186448	50 %	50 %	0 %	0 %	158340334
178	NC_009928	AT	3	6	186895	186900	50 %	50 %	0 %	0 %	158340334
179	NC_009928	AC	3	6	193899	193904	50 %	0 %	0 %	50 %	158340346
180	NC_009928	AT	3	6	194220	194225	50 %	50 %	0 %	0 %	158340346
181	NC_009928	AT	5	10	194745	194754	50 %	50 %	0 %	0 %	158340346
182	NC_009928	GA	3	6	195337	195342	50 %	0 %	50 %	0 %	158340347
183	NC_009928	CT	6	12	196123	196134	0 %	50 %	0 %	50 %	158340348
184	NC_009928	CT	3	6	196299	196304	0 %	50 %	0 %	50 %	158340348
185	NC_009928	TC	3	6	196487	196492	0 %	50 %	0 %	50 %	158340348
186	NC_009928	CA	3	6	206404	206409	50 %	0 %	0 %	50 %	158340364
187	NC_009928	AG	3	6	208438	208443	50 %	0 %	50 %	0 %	158340367
188	NC_009928	AG	3	6	210284	210289	50 %	0 %	50 %	0 %	158340368
189	NC_009928	CA	3	6	210521	210526	50 %	0 %	0 %	50 %	158340369
190	NC_009928	CT	3	6	211941	211946	0 %	50 %	0 %	50 %	158340371
191	NC_009928	TC	3	6	212870	212875	0 %	50 %	0 %	50 %	158340372
192	NC_009928	GT	3	6	215582	215587	0 %	50 %	50 %	0 %	158340376
193	NC_009928	TC	3	6	217244	217249	0 %	50 %	0 %	50 %	158340378
194	NC_009928	CT	3	6	218063	218068	0 %	50 %	0 %	50 %	158340378
195	NC_009928	GA	3	6	219834	219839	50 %	0 %	50 %	0 %	158340381
196	NC_009928	GA	3	6	221065	221070	50 %	0 %	50 %	0 %	158340386
197	NC_009928	AG	3	6	222451	222456	50 %	0 %	50 %	0 %	158340390
198	NC_009928	AG	3	6	223301	223306	50 %	0 %	50 %	0 %	158340392
199	NC_009928	TC	3	6	224215	224220	0 %	50 %	0 %	50 %	158340394
200	NC_009928	AG	3	6	224564	224569	50 %	0 %	50 %	0 %	158340395
201	NC_009928	GA	3	6	225351	225356	50 %	0 %	50 %	0 %	158340397
202	NC_009928	AC	3	6	228371	228376	50 %	0 %	0 %	50 %	158340399
203	NC_009928	AG	3	6	229084	229089	50 %	0 %	50 %	0 %	158340400
204	NC_009928	CA	3	6	229270	229275	50 %	0 %	0 %	50 %	158340400
205	NC_009928	GA	3	6	231348	231353	50 %	0 %	50 %	0 %	158340402
206	NC_009928	AG	3	6	231811	231816	50 %	0 %	50 %	0 %	158340403
207	NC_009928	CT	3	6	233802	233807	0 %	50 %	0 %	50 %	158340408
208	NC_009928	CT	3	6	234807	234812	0 %	50 %	0 %	50 %	158340410
209	NC_009928	CT	3	6	235630	235635	0 %	50 %	0 %	50 %	158340411
210	NC_009928	GT	3	6	238741	238746	0 %	50 %	50 %	0 %	158340416
211	NC_009928	TC	4	8	238892	238899	0 %	50 %	0 %	50 %	158340416
212	NC_009928	AC	3	6	239080	239085	50 %	0 %	0 %	50 %	158340416
213	NC_009928	AT	3	6	240360	240365	50 %	50 %	0 %	0 %	158340419
214	NC_009928	TC	3	6	241206	241211	0 %	50 %	0 %	50 %	158340420
215	NC_009928	TC	3	6	242080	242085	0 %	50 %	0 %	50 %	158340422
216	NC_009928	AG	3	6	243510	243515	50 %	0 %	50 %	0 %	158340425
217	NC_009928	TG	3	6	244151	244156	0 %	50 %	50 %	0 %	158340427
218	NC_009928	TC	5	10	244304	244313	0 %	50 %	0 %	50 %	158340427
219	NC_009928	CT	5	10	245723	245732	0 %	50 %	0 %	50 %	158340430
220	NC_009928	AT	3	6	245786	245791	50 %	50 %	0 %	0 %	158340430
221	NC_009928	TC	3	6	248036	248041	0 %	50 %	0 %	50 %	158340435
222	NC_009928	TG	3	6	250302	250307	0 %	50 %	50 %	0 %	158340437
223	NC_009928	TG	3	6	250740	250745	0 %	50 %	50 %	0 %	158340437
224	NC_009928	CT	3	6	252214	252219	0 %	50 %	0 %	50 %	158340438
225	NC_009928	GT	3	6	253133	253138	0 %	50 %	50 %	0 %	158340438
226	NC_009928	TC	3	6	254242	254247	0 %	50 %	0 %	50 %	158340439
227	NC_009928	TC	3	6	254780	254785	0 %	50 %	0 %	50 %	158340439
228	NC_009928	CA	3	6	256552	256557	50 %	0 %	0 %	50 %	158340439
229	NC_009928	AC	3	6	256561	256566	50 %	0 %	0 %	50 %	158340439
230	NC_009928	AT	3	6	257429	257434	50 %	50 %	0 %	0 %	158340440
231	NC_009928	GT	3	6	260419	260424	0 %	50 %	50 %	0 %	158340445
232	NC_009928	CT	3	6	261394	261399	0 %	50 %	0 %	50 %	158340447
233	NC_009928	GA	3	6	261693	261698	50 %	0 %	50 %	0 %	158340447
234	NC_009928	GA	3	6	262352	262357	50 %	0 %	50 %	0 %	158340451
235	NC_009928	TC	3	6	262384	262389	0 %	50 %	0 %	50 %	158340451
236	NC_009928	GT	3	6	262661	262666	0 %	50 %	50 %	0 %	158340451
237	NC_009928	CT	3	6	262924	262929	0 %	50 %	0 %	50 %	158340451
238	NC_009928	GA	3	6	263220	263225	50 %	0 %	50 %	0 %	158340451
239	NC_009928	CT	3	6	265525	265530	0 %	50 %	0 %	50 %	158340451
240	NC_009928	TC	3	6	267230	267235	0 %	50 %	0 %	50 %	158340451
241	NC_009928	AG	3	6	267358	267363	50 %	0 %	50 %	0 %	158340451
242	NC_009928	AG	3	6	267430	267435	50 %	0 %	50 %	0 %	158340451
243	NC_009928	TC	3	6	268301	268306	0 %	50 %	0 %	50 %	158340452
244	NC_009928	AC	3	6	271490	271495	50 %	0 %	0 %	50 %	158340454

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.