MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB2

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009927	TTTGCC	2	12	2534	2545	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158339874
2	NC_009927	GCTGCA	2	12	6730	6741	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158339878
3	NC_009927	GTCCAT	2	12	9380	9391	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158339882
4	NC_009927	AATCAA	2	12	12881	12892	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	158339886
5	NC_009927	AGTTCA	2	12	14782	14793	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158339887
6	NC_009927	GGATGG	2	12	16219	16230	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009927	GCTGAG	2	12	16483	16494	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158339890
8	NC_009927	ATTACG	2	12	17309	17320	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158339892
9	NC_009927	AAGCTG	2	12	17688	17699	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158339892
10	NC_009927	AGCTAC	2	12	18161	18172	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158339893
11	NC_009927	TGGGAA	2	12	22671	22682	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158339902
12	NC_009927	GATATT	2	12	24144	24155	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158339905
13	NC_009927	GATGGC	2	12	28709	28720	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158339912
14	NC_009927	CACCTG	2	12	29680	29691	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158339914
15	NC_009927	CCTTCT	2	12	33946	33957	0 %	50 %	0 %	50 %	158339922
16	NC_009927	ATTTGA	2	12	34205	34216	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158339922
17	NC_009927	TAGGGC	2	12	41185	41196	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158339932
18	NC_009927	TGCTAG	2	12	41395	41406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158339932
19	NC_009927	GATGTG	2	12	42090	42101	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158339933
20	NC_009927	CCAAAA	2	12	47304	47315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339939
21	NC_009927	AGTTTA	2	12	49427	49438	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158339942
22	NC_009927	TTCTGA	2	12	49514	49525	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158339942
23	NC_009927	GACAAT	2	12	54900	54911	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158339950
24	NC_009927	TTTGGA	2	12	56741	56752	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	158339954
25	NC_009927	AGCTTC	2	12	68392	68403	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158339974
26	NC_009927	GATATT	2	12	73599	73610	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158339981
27	NC_009927	ACCATC	2	12	74137	74148	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	158339981
28	NC_009927	CGATCA	2	12	74198	74209	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158339981
29	NC_009927	CGTCTC	2	12	75780	75791	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	158339985
30	NC_009927	TCTGAC	2	12	82977	82988	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158339994
31	NC_009927	TTCAGA	2	12	86110	86121	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158339996
32	NC_009927	ATTATC	2	12	93351	93362	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_009927	ATTATC	2	12	94751	94762	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	158340010
34	NC_009927	ATAAGC	2	12	94813	94824	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_009927	CGAACA	2	12	98362	98373	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158340016
36	NC_009927	CAGGTG	2	12	99971	99982	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158340017
37	NC_009927	TTCACC	2	12	112452	112463	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158340031
38	NC_009927	GAAATC	2	12	114978	114989	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_009927	TGCGGC	2	12	115896	115907	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158340035
40	NC_009927	AGTCGC	2	12	116398	116409	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158340035
41	NC_009927	AATGAT	2	12	119565	119576	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158340038
42	NC_009927	TATCAT	2	12	119577	119588	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	158340038
43	NC_009927	TCAAAC	2	12	121254	121265	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	158340041
44	NC_009927	CAACGA	2	12	121367	121378	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158340041
45	NC_009927	GCGATG	3	18	131119	131136	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158340049
46	NC_009927	GCGCGG	4	24	131137	131160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158340049
47	NC_009927	TGGCGC	2	12	131165	131176	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158340049
48	NC_009927	GGTCGA	3	18	131213	131230	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158340049
49	NC_009927	TGGCGA	2	12	131255	131266	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158340049
50	NC_009927	GGGCGC	2	12	131267	131278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158340049
51	NC_009927	GGGCGC	2	12	131309	131320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158340049
52	NC_009927	GGTCGA	2	12	131327	131338	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158340049
53	NC_009927	TGGCGA	2	12	131369	131380	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158340049
54	NC_009927	TGGTTG	2	12	134473	134484	0 %	50 %	50 %	0 %	158340051
55	NC_009927	GATGTG	2	12	136719	136730	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158340054
56	NC_009927	TATTTG	2	12	137650	137661	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	158340054
57	NC_009927	AAGCAG	2	12	140490	140501	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158340055
58	NC_009927	GAATTA	2	12	142586	142597	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158340055
59	NC_009927	GCAAAG	2	12	143140	143151	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158340055
60	NC_009927	GAACTG	2	12	144130	144141	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_009927	AGAAAA	2	12	151650	151661	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009927	CTTGCT	2	12	154761	154772	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158340072
63	NC_009927	CAGAAA	2	12	160908	160919	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	158340084
64	NC_009927	GCTAAG	2	12	161403	161414	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158340087
65	NC_009927	TCCCAC	2	12	166378	166389	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	158340093
66	NC_009927	CTAGGT	2	12	170590	170601	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_009927	TCACCT	2	12	170669	170680	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158340096
68	NC_009927	CTCAAT	2	12	171994	172005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340099
69	NC_009927	ACCATC	2	12	174433	174444	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	158340105
70	NC_009927	ACTGGG	2	12	174573	174584	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158340105
71	NC_009927	TTCTAT	2	12	178682	178693	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	158340111
72	NC_009927	AACCTA	2	12	179720	179731	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	158340112
73	NC_009927	ATCAGG	2	12	182038	182049	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158340118
74	NC_009927	CCTTAG	2	12	185873	185884	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158340126
75	NC_009927	TTTGGT	2	12	189368	189379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340128
76	NC_009927	GTCAGG	2	12	192701	192712	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158340129
77	NC_009927	ACCCGA	2	12	193126	193137	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158340130
78	NC_009927	CTTGTT	2	12	194956	194967	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	158340131
79	NC_009927	GCGACA	2	12	201936	201947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340134
80	NC_009927	TACCCG	2	12	205853	205864	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158340138
81	NC_009927	TGTCGT	2	12	210867	210878	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	158340141
82	NC_009927	GGGCTT	2	12	211846	211857	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158340142
83	NC_009927	TCAATA	2	12	224495	224506	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158340155
84	NC_009927	CATCCG	2	12	226511	226522	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158340156
85	NC_009927	TCTGCT	2	12	226612	226623	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158340156
86	NC_009927	CCACTA	2	12	233560	233571	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	158340160
87	NC_009927	CCTGAT	2	12	246682	246693	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158340168
88	NC_009927	TCAGCC	2	12	246955	246966	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158340168
89	NC_009927	CATCCC	2	12	247171	247182	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	158340168
90	NC_009927	CTGGCA	2	12	248886	248897	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158340170
91	NC_009927	TGGCTC	2	12	252449	252460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340173
92	NC_009927	AACCCT	2	12	253228	253239	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009927	CACTAG	2	12	261833	261844	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158340182
94	NC_009927	GTTTAG	2	12	263885	263896	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	158340182
95	NC_009927	TCTTTC	2	12	266151	266162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340185
96	NC_009927	TCTGAT	2	12	267769	267780	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158340188
97	NC_009927	GAAACT	2	12	274253	274264	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158340195
98	NC_009927	AGCGAA	2	12	275118	275129	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_009927	CAAAAG	2	12	275388	275399	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	158340196
100	NC_009927	GTAGAG	2	12	280917	280928	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158340204
101	NC_009927	GCTGGT	2	12	280981	280992	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158340204
102	NC_009927	CGGTCG	2	12	282557	282568	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158340207
103	NC_009927	AGGTCT	2	12	283736	283747	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158340207
104	NC_009927	GGTTGA	2	12	286801	286812	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158340210
105	NC_009927	GCATCA	2	12	287225	287236	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158340211
106	NC_009927	GCATCA	2	12	287603	287614	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158340211
107	NC_009927	AATTCC	2	12	290485	290496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340212
108	NC_009927	GCTGCA	2	12	293398	293409	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158340215
109	NC_009927	AGCATC	2	12	296838	296849	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158340217
110	NC_009927	TTTTAG	2	12	299646	299657	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009927	TTTGCC	2	12	302298	302309	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009927	CCTAGC	2	12	304182	304193	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158340228
113	NC_009927	TGGGGC	2	12	304260	304271	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	158340228
114	NC_009927	TTTGCC	2	12	313704	313715	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158340241
115	NC_009927	CGGATG	2	12	318367	318378	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158340244
116	NC_009927	CTATCT	2	12	329065	329076	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009927	GACTAA	2	12	334256	334267	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158340255
118	NC_009927	GGGTGA	2	12	339990	340001	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	158340261
119	NC_009927	AGGACT	2	12	342880	342891	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158340265
120	NC_009927	CGAGAC	2	12	343425	343436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340266
121	NC_009927	GTAGCT	2	12	346528	346539	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158340272
122	NC_009927	CTTTGT	2	12	346563	346574	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	158340272
123	NC_009927	GGCATA	2	12	347921	347932	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158340273
124	NC_009927	GCTTCA	2	12	348138	348149	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158340273
125	NC_009927	TACCGT	2	12	354457	354468	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158340279

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.