MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB2

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009927	CCAAT	2	10	17825	17834	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009927	AGTAT	2	10	19159	19168	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009927	AACTC	2	10	27246	27255	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_009927	ACTCT	2	10	48300	48309	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009927	GAAAA	2	10	52596	52605	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009927	CACAC	2	10	63982	63991	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
7	NC_009927	CAGTC	2	10	64999	65008	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_009927	CCTGA	2	10	69470	69479	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009927	TATCC	2	10	75453	75462	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009927	AGTCA	2	10	87253	87262	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009927	TATCA	2	10	96553	96562	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009927	CCAAA	2	10	96589	96598	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009927	CCAAG	2	10	102349	102358	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_009927	AAGAC	2	10	105549	105558	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009927	CATTT	2	10	105568	105577	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009927	TTGTC	2	10	108466	108475	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009927	TGATC	2	10	112942	112951	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009927	CCAAG	2	10	115072	115081	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_009927	GCGCT	2	10	115189	115198	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_009927	AATTT	2	10	116993	117002	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009927	TTCCG	2	10	119647	119656	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_009927	CATCC	2	10	127033	127042	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_009927	AATCC	2	10	127112	127121	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_009927	AAATC	2	10	127284	127293	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009927	TACCC	2	10	148130	148139	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
26	NC_009927	CCAGG	2	10	159784	159793	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_009927	GCGTA	2	10	176382	176391	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009927	ATTTA	2	10	225750	225759	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009927	TTAAA	2	10	229944	229953	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009927	CTTAA	2	10	232160	232169	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009927	TATAT	2	10	232205	232214	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009927	AGATG	2	10	246562	246571	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009927	TTATA	2	10	260196	260205	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009927	ATGAA	2	10	269700	269709	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009927	ATTCA	2	10	270416	270425	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009927	ACACA	2	10	277388	277397	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_009927	TAAAA	2	10	288145	288154	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009927	AGGAA	2	10	291258	291267	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009927	ATTAG	2	10	291457	291466	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009927	ATAAG	2	10	294169	294178	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009927	TACCA	2	10	301344	301353	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_009927	TTTTA	2	10	310961	310970	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009927	ATCGT	2	10	315353	315362	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_009927	AAAGA	2	10	315501	315510	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009927	CTACT	2	10	322217	322226	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_009927	TAAGG	2	10	335208	335217	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009927	CCATG	2	10	337895	337904	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_009927	ACGAT	2	10	341579	341588	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.