MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB2

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009927	ATCCT	2	10	4796	4805	20 %	40 %	0 %	40 %	158339876
2	NC_009927	TTGAT	2	10	6709	6718	20 %	60 %	20 %	0 %	158339878
3	NC_009927	GCCAA	2	10	6751	6760	40 %	0 %	20 %	40 %	158339878
4	NC_009927	TGGGA	2	10	7544	7553	20 %	20 %	60 %	0 %	158339880
5	NC_009927	GCTCA	2	10	8690	8699	20 %	20 %	20 %	40 %	158339882
6	NC_009927	CTTCA	2	10	11864	11873	20 %	40 %	0 %	40 %	158339885
7	NC_009927	ATACG	2	10	13252	13261	40 %	20 %	20 %	20 %	158339886
8	NC_009927	CACAA	2	10	15843	15852	60 %	0 %	0 %	40 %	158339889
9	NC_009927	GTGAT	2	10	16913	16922	20 %	40 %	40 %	0 %	158339891
10	NC_009927	TTACC	2	10	17845	17854	20 %	40 %	0 %	40 %	158339893
11	NC_009927	GTTCC	2	10	21207	21216	0 %	40 %	20 %	40 %	158339899
12	NC_009927	ATGTA	2	10	21494	21503	40 %	40 %	20 %	0 %	158339899
13	NC_009927	TCGGC	2	10	23269	23278	0 %	20 %	40 %	40 %	158339903
14	NC_009927	ACGGG	2	10	23773	23782	20 %	0 %	60 %	20 %	158339905
15	NC_009927	ATCAA	2	10	23800	23809	60 %	20 %	0 %	20 %	158339905
16	NC_009927	TTACA	2	10	26709	26718	40 %	40 %	0 %	20 %	158339910
17	NC_009927	CCTGT	2	10	29011	29020	0 %	40 %	20 %	40 %	158339913
18	NC_009927	TGAAA	2	10	29069	29078	60 %	20 %	20 %	0 %	158339913
19	NC_009927	GGATC	2	10	31559	31568	20 %	20 %	40 %	20 %	158339920
20	NC_009927	AATTT	2	10	32028	32037	40 %	60 %	0 %	0 %	158339920
21	NC_009927	GAGCT	2	10	32866	32875	20 %	20 %	40 %	20 %	158339921
22	NC_009927	TTCCC	2	10	33188	33197	0 %	40 %	0 %	60 %	158339921
23	NC_009927	GTCTT	2	10	33863	33872	0 %	60 %	20 %	20 %	158339922
24	NC_009927	TTGGG	2	10	35423	35432	0 %	40 %	60 %	0 %	158339924
25	NC_009927	AAAAC	2	10	42018	42027	80 %	0 %	0 %	20 %	158339933
26	NC_009927	CAGTA	2	10	45360	45369	40 %	20 %	20 %	20 %	158339937
27	NC_009927	CCCAG	2	10	48062	48071	20 %	0 %	20 %	60 %	158339941
28	NC_009927	CCTCA	2	10	48538	48547	20 %	20 %	0 %	60 %	158339942
29	NC_009927	AACAA	2	10	51484	51493	80 %	0 %	0 %	20 %	158339945
30	NC_009927	TCTGC	2	10	55689	55698	0 %	40 %	20 %	40 %	158339952
31	NC_009927	CAGCA	2	10	56207	56216	40 %	0 %	20 %	40 %	158339953
32	NC_009927	GTGAT	2	10	58026	58035	20 %	40 %	40 %	0 %	158339957
33	NC_009927	GATTG	2	10	58759	58768	20 %	40 %	40 %	0 %	158339957
34	NC_009927	TGACA	2	10	61435	61444	40 %	20 %	20 %	20 %	158339962
35	NC_009927	ACTGG	2	10	61707	61716	20 %	20 %	40 %	20 %	158339963
36	NC_009927	TCAAC	2	10	64556	64565	40 %	20 %	0 %	40 %	158339967
37	NC_009927	AAGCC	2	10	70227	70236	40 %	0 %	20 %	40 %	158339977
38	NC_009927	CAGCT	2	10	74479	74488	20 %	20 %	20 %	40 %	158339981
39	NC_009927	TGAGT	2	10	82314	82323	20 %	40 %	40 %	0 %	158339993
40	NC_009927	GGTTT	2	10	83609	83618	0 %	60 %	40 %	0 %	158339994
41	NC_009927	ACGGT	2	10	84778	84787	20 %	20 %	40 %	20 %	158339995
42	NC_009927	CCGCG	2	10	85121	85130	0 %	0 %	40 %	60 %	158339996
43	NC_009927	GGTTT	2	10	85761	85770	0 %	60 %	40 %	0 %	158339996
44	NC_009927	CAATC	2	10	86160	86169	40 %	20 %	0 %	40 %	158339996
45	NC_009927	AGGGA	2	10	87518	87527	40 %	0 %	60 %	0 %	158339998
46	NC_009927	TCTTT	2	10	88259	88268	0 %	80 %	0 %	20 %	158340001
47	NC_009927	CGGCG	2	10	89890	89899	0 %	0 %	60 %	40 %	158340005
48	NC_009927	GGATG	2	10	90000	90009	20 %	20 %	60 %	0 %	158340005
49	NC_009927	TGAGA	2	10	90098	90107	40 %	20 %	40 %	0 %	158340005
50	NC_009927	TGGAC	2	10	92998	93007	20 %	20 %	40 %	20 %	158340008
51	NC_009927	AGGTG	2	10	93044	93053	20 %	20 %	60 %	0 %	158340008
52	NC_009927	GCTGG	2	10	93521	93530	0 %	20 %	60 %	20 %	158340009
53	NC_009927	CCCAT	2	10	94789	94798	20 %	20 %	0 %	60 %	158340010
54	NC_009927	TGATC	2	10	98320	98329	20 %	40 %	20 %	20 %	158340016
55	NC_009927	ACGGA	2	10	99896	99905	40 %	0 %	40 %	20 %	158340017
56	NC_009927	AGTCC	2	10	108615	108624	20 %	20 %	20 %	40 %	158340024
57	NC_009927	AACCG	2	10	109935	109944	40 %	0 %	20 %	40 %	158340025
58	NC_009927	TTGAT	2	10	111976	111985	20 %	60 %	20 %	0 %	158340031
59	NC_009927	CTTCC	2	10	112163	112172	0 %	40 %	0 %	60 %	158340031
60	NC_009927	GGGGC	2	10	112535	112544	0 %	0 %	80 %	20 %	158340031
61	NC_009927	GGACT	2	10	113489	113498	20 %	20 %	40 %	20 %	158340032
62	NC_009927	TGCCC	2	10	115775	115784	0 %	20 %	20 %	60 %	158340035
63	NC_009927	CCAAG	2	10	116866	116875	40 %	0 %	20 %	40 %	158340034
64	NC_009927	TGCGA	2	10	120219	120228	20 %	20 %	40 %	20 %	158340039
65	NC_009927	GGACA	2	10	121782	121791	40 %	0 %	40 %	20 %	158340041
66	NC_009927	ATGAG	2	10	131060	131069	40 %	20 %	40 %	0 %	158340049
67	NC_009927	TGGAC	2	10	133429	133438	20 %	20 %	40 %	20 %	158340051
68	NC_009927	CGACT	2	10	134080	134089	20 %	20 %	20 %	40 %	158340051
69	NC_009927	TTGGA	2	10	135785	135794	20 %	40 %	40 %	0 %	158340053
70	NC_009927	GGATT	2	10	138647	138656	20 %	40 %	40 %	0 %	158340055
71	NC_009927	ACACC	2	10	138771	138780	40 %	0 %	0 %	60 %	158340055
72	NC_009927	TGAAA	2	10	142756	142765	60 %	20 %	20 %	0 %	158340055
73	NC_009927	ACTGC	2	10	144062	144071	20 %	20 %	20 %	40 %	158340057
74	NC_009927	TGGAG	2	10	145392	145401	20 %	20 %	60 %	0 %	158340059
75	NC_009927	GATGA	2	10	145445	145454	40 %	20 %	40 %	0 %	158340059
76	NC_009927	TCAAG	2	10	146017	146026	40 %	20 %	20 %	20 %	158340059
77	NC_009927	AGAGA	2	10	148968	148977	60 %	0 %	40 %	0 %	158340065
78	NC_009927	ACAAG	2	10	150538	150547	60 %	0 %	20 %	20 %	158340067
79	NC_009927	GGGTT	2	10	151557	151566	0 %	40 %	60 %	0 %	158340069
80	NC_009927	TGGTC	2	10	152141	152150	0 %	40 %	40 %	20 %	158340070
81	NC_009927	AACTG	2	10	155638	155647	40 %	20 %	20 %	20 %	158340072
82	NC_009927	ATCAC	2	10	157315	157324	40 %	20 %	0 %	40 %	158340076
83	NC_009927	CCAGC	2	10	157347	157356	20 %	0 %	20 %	60 %	158340076
84	NC_009927	CAGTT	2	10	158767	158776	20 %	40 %	20 %	20 %	158340079
85	NC_009927	TTGTC	2	10	159065	159074	0 %	60 %	20 %	20 %	158340079
86	NC_009927	GCAGA	2	10	161163	161172	40 %	0 %	40 %	20 %	158340085
87	NC_009927	ACTAA	2	10	161957	161966	60 %	20 %	0 %	20 %	158340088
88	NC_009927	AGTTC	2	10	164002	164011	20 %	40 %	20 %	20 %	158340091
89	NC_009927	GTTGG	2	10	165134	165143	0 %	40 %	60 %	0 %	158340092
90	NC_009927	AAGCG	2	10	166161	166170	40 %	0 %	40 %	20 %	158340093
91	NC_009927	CGTTG	2	10	166759	166768	0 %	40 %	40 %	20 %	158340093
92	NC_009927	TTTGG	2	10	168760	168769	0 %	60 %	40 %	0 %	158340095
93	NC_009927	TCAAA	2	10	169815	169824	60 %	20 %	0 %	20 %	158340095
94	NC_009927	GCTAA	2	10	173050	173059	40 %	20 %	20 %	20 %	158340102
95	NC_009927	TAGAT	2	10	173463	173472	40 %	40 %	20 %	0 %	158340103
96	NC_009927	GACTG	2	10	184258	184267	20 %	20 %	40 %	20 %	158340122
97	NC_009927	TCGTT	2	10	184875	184884	0 %	60 %	20 %	20 %	158340123
98	NC_009927	ATCGC	2	10	185176	185185	20 %	20 %	20 %	40 %	158340125
99	NC_009927	AGCTG	2	10	185301	185310	20 %	20 %	40 %	20 %	158340124
100	NC_009927	AAGTA	2	10	191183	191192	60 %	20 %	20 %	0 %	158340129
101	NC_009927	TAAAT	2	10	193160	193169	60 %	40 %	0 %	0 %	158340130
102	NC_009927	CCTTG	2	10	193446	193455	0 %	40 %	20 %	40 %	158340130
103	NC_009927	TTGGG	2	10	194204	194213	0 %	40 %	60 %	0 %	158340130
104	NC_009927	CAAGA	2	10	194848	194857	60 %	0 %	20 %	20 %	158340131
105	NC_009927	CATAC	2	10	195131	195140	40 %	20 %	0 %	40 %	158340131
106	NC_009927	CATAT	2	10	197152	197161	40 %	40 %	0 %	20 %	158340133
107	NC_009927	GCTTA	2	10	198091	198100	20 %	40 %	20 %	20 %	158340135
108	NC_009927	GGTTT	2	10	199705	199714	0 %	60 %	40 %	0 %	158340135
109	NC_009927	AAAGG	2	10	201918	201927	60 %	0 %	40 %	0 %	158340134
110	NC_009927	TGAGC	2	10	203565	203574	20 %	20 %	40 %	20 %	158340136
111	NC_009927	CAGTA	2	10	204339	204348	40 %	20 %	20 %	20 %	158340138
112	NC_009927	TCCAA	2	10	216450	216459	40 %	20 %	0 %	40 %	158340147
113	NC_009927	ATTCG	2	10	217348	217357	20 %	40 %	20 %	20 %	158340147
114	NC_009927	CAGAC	2	10	218464	218473	40 %	0 %	20 %	40 %	158340147
115	NC_009927	GGCTG	2	10	220329	220338	0 %	20 %	60 %	20 %	158340149
116	NC_009927	TCAAA	2	10	223083	223092	60 %	20 %	0 %	20 %	158340153
117	NC_009927	GAATA	2	10	224094	224103	60 %	20 %	20 %	0 %	158340155
118	NC_009927	TCTGC	2	10	231066	231075	0 %	40 %	20 %	40 %	158340157
119	NC_009927	AATTG	2	10	231778	231787	40 %	40 %	20 %	0 %	158340158
120	NC_009927	AGCCA	2	10	231943	231952	40 %	0 %	20 %	40 %	158340158
121	NC_009927	CGTCT	2	10	233520	233529	0 %	40 %	20 %	40 %	158340160
122	NC_009927	CTGAA	2	10	238468	238477	40 %	20 %	20 %	20 %	158340162
123	NC_009927	TCTAT	2	10	241780	241789	20 %	60 %	0 %	20 %	158340164
124	NC_009927	TAGTT	2	10	243012	243021	20 %	60 %	20 %	0 %	158340165
125	NC_009927	TAAGA	2	10	249722	249731	60 %	20 %	20 %	0 %	158340170
126	NC_009927	TTCCC	2	10	250335	250344	0 %	40 %	0 %	60 %	158340170
127	NC_009927	CAATA	2	10	255665	255674	60 %	20 %	0 %	20 %	158340178
128	NC_009927	ATCTA	2	10	256700	256709	40 %	40 %	0 %	20 %	158340179
129	NC_009927	ACTGA	2	10	258539	258548	40 %	20 %	20 %	20 %	158340181
130	NC_009927	AAAAG	2	10	258667	258676	80 %	0 %	20 %	0 %	158340181
131	NC_009927	CTTAC	2	10	259749	259758	20 %	40 %	0 %	40 %	158340181
132	NC_009927	CTAAC	2	10	259779	259788	40 %	20 %	0 %	40 %	158340181
133	NC_009927	ATGAA	2	10	261357	261366	60 %	20 %	20 %	0 %	158340182
134	NC_009927	AATTA	2	10	262227	262236	60 %	40 %	0 %	0 %	158340182
135	NC_009927	ATCTT	2	10	264562	264571	20 %	60 %	0 %	20 %	158340182
136	NC_009927	ATTTG	2	10	264631	264640	20 %	60 %	20 %	0 %	158340182
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173	NC_009927	TAATG	2	10	349346	349355	40 %	40 %	20 %	0 %	158340275
174	NC_009927	TCACT	2	10	350210	350219	20 %	40 %	0 %	40 %	158340275
175	NC_009927	CATGG	2	10	350595	350604	20 %	20 %	40 %	20 %	158340275
176	NC_009927	TCATT	2	10	352539	352548	20 %	60 %	0 %	20 %	158340276

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.