MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB1

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009926	TTTGCC	2	12	9904	9915	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158339667
2	NC_009926	AATGGT	2	12	14923	14934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339670
3	NC_009926	GATAAT	2	12	17378	17389	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158339671
4	NC_009926	TCTTTA	2	12	17423	17434	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	158339671
5	NC_009926	TAAAGA	2	12	17584	17595	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	158339671
6	NC_009926	AGTTGG	2	12	19214	19225	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158339673
7	NC_009926	CATAGG	2	12	27524	27535	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158339678
8	NC_009926	CAGCAT	2	12	31491	31502	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158339681
9	NC_009926	GATGGA	2	12	32954	32965	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158339681
10	NC_009926	ATCATG	2	12	33406	33417	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158339682
11	NC_009926	AGCGAT	2	12	34090	34101	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158339683
12	NC_009926	TCTGGG	2	12	34564	34575	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158339683
13	NC_009926	TTTGTC	2	12	35416	35427	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	158339684
14	NC_009926	AGCTTG	2	12	36186	36197	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158339685
15	NC_009926	GGCCGG	2	12	38324	38335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158339687
16	NC_009926	TTGGGG	2	12	38623	38634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158339687
17	NC_009926	ACTTCT	2	12	44835	44846	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158339692
18	NC_009926	TATTGC	2	12	46781	46792	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158339692
19	NC_009926	AATTCA	2	12	48887	48898	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158339695
20	NC_009926	GGAAGC	2	12	54235	54246	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158339702
21	NC_009926	TAGCTT	2	12	54838	54849	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158339703
22	NC_009926	GATTCA	2	12	72630	72641	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158339729
23	NC_009926	CTGGTT	2	12	73414	73425	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	158339731
24	NC_009926	ATTTGC	2	12	80184	80195	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158339739
25	NC_009926	GGCATA	2	12	82702	82713	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158339742
26	NC_009926	GCTTCA	2	12	82919	82930	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158339742
27	NC_009926	TCCGGT	2	12	84576	84587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339743
28	NC_009926	GGCTTG	2	12	84689	84700	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158339743
29	NC_009926	TACCGT	2	12	89278	89289	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158339747
30	NC_009926	TGGTAT	2	12	94891	94902	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	158339754
31	NC_009926	AAAAAC	2	12	96634	96645	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	158339759
32	NC_009926	CGCTCA	2	12	104340	104351	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158339771
33	NC_009926	GCACTT	2	12	111637	111648	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158339776
34	NC_009926	CCGCTT	2	12	117097	117108	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	158339781
35	NC_009926	AGATCG	2	12	125323	125334	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158339793
36	NC_009926	CGGATA	2	12	127081	127092	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158339796
37	NC_009926	TGATGG	2	12	128856	128867	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158339797
38	NC_009926	TACGAT	2	12	132318	132329	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158339802
39	NC_009926	TTTCTT	2	12	141591	141602	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	158339810
40	NC_009926	TCAGGA	2	12	144297	144308	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158339813
41	NC_009926	GCTCCA	2	12	147522	147533	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158339817
42	NC_009926	GCTCCA	4	24	147546	147569	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158339817
43	NC_009926	GCTCCA	3	18	147582	147599	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158339817
44	NC_009926	GCTCCA	2	12	147612	147623	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158339817
45	NC_009926	CCAGCT	2	12	147657	147668	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158339817
46	NC_009926	GCTCCA	4	24	147684	147707	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158339817
47	NC_009926	GCTCCG	2	12	147732	147743	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158339817
48	NC_009926	GCATGA	2	12	149294	149305	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158339818
49	NC_009926	CAGTTT	2	12	149836	149847	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158339819
50	NC_009926	CCACCG	2	12	151361	151372	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158339820
51	NC_009926	AACTTT	2	12	151681	151692	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	158339820
52	NC_009926	GGGCCT	2	12	155158	155169	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158339822
53	NC_009926	CTGCAA	2	12	155940	155951	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158339822
54	NC_009926	CAGCGC	2	12	156360	156371	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158339822
55	NC_009926	CCCTTG	2	12	160258	160269	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	158339826
56	NC_009926	CATCTT	2	12	168701	168712	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158339834
57	NC_009926	GGGTAA	2	12	180487	180498	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158339846
58	NC_009926	CAGAGA	2	12	180676	180687	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158339847
59	NC_009926	ATTGGG	2	12	190645	190656	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158339861
60	NC_009926	TCGAAG	2	12	195699	195710	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158339870
61	NC_009926	TGTGAT	2	12	198201	198212	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	158339490
62	NC_009926	TAGAGC	2	12	198562	198573	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158339491
63	NC_009926	CAAGCG	2	12	201438	201449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339491
64	NC_009926	TGGGCA	2	12	202209	202220	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158339492
65	NC_009926	CTTTGG	2	12	203092	203103	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	158339492
66	NC_009926	TCTGAC	2	12	206726	206737	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158339492
67	NC_009926	CGATCT	2	12	208987	208998	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158339493
68	NC_009926	GTTGCT	2	12	212053	212064	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	158339493
69	NC_009926	CCCAAA	2	12	212622	212633	50 %	0 %	0 %	50 %	158339493
70	NC_009926	GTCAAC	2	12	218023	218034	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158339495
71	NC_009926	GCCTGT	2	12	220479	220490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339495
72	NC_009926	GGAGCA	2	12	221742	221753	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158339495
73	NC_009926	TACGGA	2	12	230371	230382	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158339498
74	NC_009926	GAATCT	2	12	230713	230724	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158339498
75	NC_009926	ACAGCT	2	12	232248	232259	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158339498
76	NC_009926	CAACCG	2	12	232408	232419	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158339498
77	NC_009926	CAACCG	2	12	235609	235620	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158339498
78	NC_009926	TGACCC	2	12	235878	235889	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158339498
79	NC_009926	GCCTGT	2	12	237187	237198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339498
80	NC_009926	TATCGT	2	12	238349	238360	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158339499
81	NC_009926	AATTCA	2	12	247998	248009	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158339507
82	NC_009926	ACCTAC	2	12	248603	248614	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	158339509
83	NC_009926	GATTTA	2	12	250693	250704	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158339510
84	NC_009926	TGGAGA	2	12	252626	252637	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158339512
85	NC_009926	TTTGCC	2	12	265251	265262	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158339521
86	NC_009926	GAGTAG	2	12	277824	277835	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158339535
87	NC_009926	ATTGAC	2	12	282674	282685	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158339542
88	NC_009926	GGGCTT	3	18	283216	283233	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158339542
89	NC_009926	CAGGCC	2	12	283959	283970	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158339542
90	NC_009926	AGTAAG	2	12	285131	285142	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158339543
91	NC_009926	TTGCCA	2	12	285238	285249	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158339543
92	NC_009926	ACCGGA	2	12	289121	289132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339548
93	NC_009926	CAGTGC	2	12	294020	294031	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158339551
94	NC_009926	AGTTTG	2	12	295499	295510	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	158339554
95	NC_009926	CCAAAC	2	12	298319	298330	50 %	0 %	0 %	50 %	158339554
96	NC_009926	GCTGGC	2	12	305461	305472	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158339559
97	NC_009926	CGCCAC	2	12	305586	305597	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158339559
98	NC_009926	GACTCT	2	12	309015	309026	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158339560
99	NC_009926	CAATGC	2	12	310155	310166	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158339561
100	NC_009926	TCGCCC	2	12	311421	311432	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158339562
101	NC_009926	TACCTA	2	12	311868	311879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339563
102	NC_009926	AATGTA	2	12	314835	314846	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158339565
103	NC_009926	CTCAAT	2	12	317937	317948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339571
104	NC_009926	CCACTA	2	12	323182	323193	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	158339579
105	NC_009926	GGACCG	2	12	323267	323278	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158339579
106	NC_009926	GTTGCA	2	12	327959	327970	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158339588
107	NC_009926	GGAGAG	2	12	328661	328672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158339589
108	NC_009926	CCTCAT	2	12	329254	329265	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158339590
109	NC_009926	GCCACA	2	12	329393	329404	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158339590
110	NC_009926	GTATTG	2	12	332674	332685	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	158339598
111	NC_009926	AGAAAG	2	12	333450	333461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339600
112	NC_009926	ACAAGC	2	12	340286	340297	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158339615
113	NC_009926	CGATAA	2	12	343566	343577	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158339622
114	NC_009926	ACTGAT	2	12	344376	344387	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158339623
115	NC_009926	CAGGAA	2	12	351435	351446	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158339630
116	NC_009926	TGGAGA	2	12	352867	352878	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158339631
117	NC_009926	TGGTGA	2	12	352948	352959	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158339631
118	NC_009926	CTTGGG	2	12	354036	354047	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158339631
119	NC_009926	TTCCAA	2	12	355762	355773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339632
120	NC_009926	GATGGC	2	12	359763	359774	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158339642
121	NC_009926	GTTGCA	2	12	361144	361155	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158339645
122	NC_009926	AGGCAG	2	12	364287	364298	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158339648
123	NC_009926	TCAGCC	2	12	369006	369017	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158339649
124	NC_009926	GCTTTC	2	12	369336	369347	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158339649
125	NC_009926	CTTACC	2	12	372689	372700	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158339651

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.