MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB1

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009926	ACACT	2	10	2689	2698	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009926	GAAAC	2	10	5444	5453	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009926	GACAA	2	10	25583	25592	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009926	GGAGT	2	10	36875	36884	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009926	AACAT	2	10	57627	57636	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009926	TTCAG	2	10	57910	57919	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009926	TAGAA	2	10	59020	59029	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009926	AGGAA	2	10	61398	61407	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009926	GCTCG	2	10	64648	64657	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009926	ACCAT	2	10	76478	76487	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_009926	AACTG	2	10	78030	78039	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009926	GAATC	2	10	92128	92137	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009926	AAAAT	2	10	98639	98648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009926	TTATT	2	10	102358	102367	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009926	GCTCT	2	10	102654	102663	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_009926	CGTTA	2	10	103206	103215	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009926	TGTCG	2	10	105149	105158	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009926	CCTGG	2	10	105191	105200	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_009926	CGTTA	2	10	106527	106536	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009926	ATTCG	2	10	116392	116401	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009926	CTGCG	2	10	134302	134311	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_009926	CAATT	2	10	147971	147980	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009926	GCTCA	2	10	159838	159847	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_009926	TTGAA	2	10	175380	175389	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009926	TTTGA	2	10	176246	176255	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009926	TAACT	2	10	195268	195277	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009926	GCTCA	2	10	207276	207285	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009926	AATCA	2	10	213176	213185	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009926	GCGAT	2	10	261925	261934	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009926	CTTGC	2	10	270910	270919	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_009926	AGGAA	2	10	271063	271072	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009926	GATTT	2	10	280962	280971	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009926	GGCAT	2	10	330004	330013	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009926	TTCCT	2	10	330178	330187	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_009926	ACACC	2	10	330572	330581	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
36	NC_009926	TCACA	2	10	331772	331781	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_009926	CTTTC	2	10	335005	335014	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_009926	CTTTC	2	10	337122	337131	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_009926	GGGAA	2	10	347099	347108	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009926	TTGAT	2	10	368640	368649	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009926	GGAGT	2	10	373046	373055	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.