MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB1

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009926	TTCCG	2	10	796	805	0 %	40 %	20 %	40 %	158339656
2	NC_009926	CAATC	2	10	1162	1171	40 %	20 %	0 %	40 %	158339656
3	NC_009926	GAATA	2	10	4146	4155	60 %	20 %	20 %	0 %	158339661
4	NC_009926	CAATG	2	10	7976	7985	40 %	20 %	20 %	20 %	158339665
5	NC_009926	CCAAG	2	10	12633	12642	40 %	0 %	20 %	40 %	158339668
6	NC_009926	CAGTT	2	10	13100	13109	20 %	40 %	20 %	20 %	158339668
7	NC_009926	TCCAC	2	10	20164	20173	20 %	20 %	0 %	60 %	158339674
8	NC_009926	GAATG	2	10	23588	23597	40 %	20 %	40 %	0 %	158339676
9	NC_009926	TCAAA	2	10	23776	23785	60 %	20 %	0 %	20 %	158339676
10	NC_009926	GCTTG	2	10	25803	25812	0 %	40 %	40 %	20 %	158339677
11	NC_009926	GGGTC	2	10	26515	26524	0 %	20 %	60 %	20 %	158339677
12	NC_009926	AAGCT	2	10	29121	29130	40 %	20 %	20 %	20 %	158339680
13	NC_009926	TTGAC	2	10	35290	35299	20 %	40 %	20 %	20 %	158339684
14	NC_009926	GCCAA	2	10	35323	35332	40 %	0 %	20 %	40 %	158339684
15	NC_009926	TTGGA	2	10	37587	37596	20 %	40 %	40 %	0 %	158339687
16	NC_009926	GGTAA	2	10	41850	41859	40 %	20 %	40 %	0 %	158339688
17	NC_009926	GACTT	2	10	44737	44746	20 %	40 %	20 %	20 %	158339692
18	NC_009926	TCAAC	2	10	45130	45139	40 %	20 %	0 %	40 %	158339692
19	NC_009926	TAAAC	2	10	45893	45902	60 %	20 %	0 %	20 %	158339692
20	NC_009926	CATAT	2	10	46460	46469	40 %	40 %	0 %	20 %	158339692
21	NC_009926	AAATC	2	10	47737	47746	60 %	20 %	0 %	20 %	158339693
22	NC_009926	AGTCA	2	10	49126	49135	40 %	20 %	20 %	20 %	158339695
23	NC_009926	ATCGT	2	10	55317	55326	20 %	40 %	20 %	20 %	158339704
24	NC_009926	TCAGA	2	10	57733	57742	40 %	20 %	20 %	20 %	158339708
25	NC_009926	GCATT	2	10	58442	58451	20 %	40 %	20 %	20 %	158339709
26	NC_009926	CACCT	2	10	60003	60012	20 %	20 %	0 %	60 %	158339712
27	NC_009926	GCAGA	2	10	60109	60118	40 %	0 %	40 %	20 %	158339712
28	NC_009926	CATCA	2	10	61059	61068	40 %	20 %	0 %	40 %	158339711
29	NC_009926	AATCA	2	10	62791	62800	60 %	20 %	0 %	20 %	158339715
30	NC_009926	TTGAG	2	10	63281	63290	20 %	40 %	40 %	0 %	158339715
31	NC_009926	ACAAT	2	10	64222	64231	60 %	20 %	0 %	20 %	158339718
32	NC_009926	AGTTG	2	10	70077	70086	20 %	40 %	40 %	0 %	158339727
33	NC_009926	TGGGG	2	10	72733	72742	0 %	20 %	80 %	0 %	158339729
34	NC_009926	CAAGC	2	10	73506	73515	40 %	0 %	20 %	40 %	158339731
35	NC_009926	GGCGA	2	10	77878	77887	20 %	0 %	60 %	20 %	158339734
36	NC_009926	CTCAC	2	10	79037	79046	20 %	20 %	0 %	60 %	158339736
37	NC_009926	CATTG	2	10	81168	81177	20 %	40 %	20 %	20 %	158339741
38	NC_009926	CAAAC	2	10	81996	82005	60 %	0 %	0 %	40 %	158339742
39	NC_009926	TCCAC	2	10	82631	82640	20 %	20 %	0 %	60 %	158339742
40	NC_009926	TCAGC	2	10	85357	85366	20 %	20 %	20 %	40 %	158339743
41	NC_009926	CATGG	2	10	85376	85385	20 %	20 %	40 %	20 %	158339743
42	NC_009926	ATCTG	2	10	85572	85581	20 %	40 %	20 %	20 %	158339743
43	NC_009926	GGTTT	2	10	85941	85950	0 %	60 %	40 %	0 %	158339743
44	NC_009926	TGATT	2	10	94291	94300	20 %	60 %	20 %	0 %	158339754
45	NC_009926	TTGGT	2	10	95773	95782	0 %	60 %	40 %	0 %	158339757
46	NC_009926	AGGAT	2	10	100053	100062	40 %	20 %	40 %	0 %	158339766
47	NC_009926	AACCG	2	10	100136	100145	40 %	0 %	20 %	40 %	158339766
48	NC_009926	GCATG	2	10	100533	100542	20 %	20 %	40 %	20 %	158339766
49	NC_009926	TGATT	2	10	100681	100690	20 %	60 %	20 %	0 %	158339766
50	NC_009926	GTCTT	2	10	101580	101589	0 %	60 %	20 %	20 %	158339767
51	NC_009926	TAAAG	2	10	102517	102526	60 %	20 %	20 %	0 %	158339768
52	NC_009926	ACAAA	2	10	105689	105698	80 %	0 %	0 %	20 %	158339772
53	NC_009926	ATGAA	2	10	111714	111723	60 %	20 %	20 %	0 %	158339776
54	NC_009926	ATTTT	2	10	112380	112389	20 %	80 %	0 %	0 %	158339777
55	NC_009926	CTCTG	2	10	114297	114306	0 %	40 %	20 %	40 %	158339779
56	NC_009926	CTGTC	2	10	116155	116164	0 %	40 %	20 %	40 %	158339780
57	NC_009926	CGGGT	2	10	116834	116843	0 %	20 %	60 %	20 %	158339781
58	NC_009926	AAACC	2	10	119047	119056	60 %	0 %	0 %	40 %	158339787
59	NC_009926	GAAGG	2	10	119591	119600	40 %	0 %	60 %	0 %	158339787
60	NC_009926	CTGCG	2	10	122254	122263	0 %	20 %	40 %	40 %	158339791
61	NC_009926	GGCGA	2	10	123533	123542	20 %	0 %	60 %	20 %	158339791
62	NC_009926	TGAGG	2	10	123902	123911	20 %	20 %	60 %	0 %	158339791
63	NC_009926	ATTTT	2	10	124837	124846	20 %	80 %	0 %	0 %	158339793
64	NC_009926	CATCG	2	10	127691	127700	20 %	20 %	20 %	40 %	158339797
65	NC_009926	TGAGG	2	10	135212	135221	20 %	20 %	60 %	0 %	158339805
66	NC_009926	TCAGG	2	10	136451	136460	20 %	20 %	40 %	20 %	158339806
67	NC_009926	AAAAC	2	10	137016	137025	80 %	0 %	0 %	20 %	158339807
68	NC_009926	CAGTT	2	10	137396	137405	20 %	40 %	20 %	20 %	158339807
69	NC_009926	GATTC	2	10	137945	137954	20 %	40 %	20 %	20 %	158339807
70	NC_009926	CAGAA	2	10	152541	152550	60 %	0 %	20 %	20 %	158339820
71	NC_009926	CTGCT	2	10	152750	152759	0 %	40 %	20 %	40 %	158339820
72	NC_009926	CCACT	2	10	155338	155347	20 %	20 %	0 %	60 %	158339822
73	NC_009926	AGGTT	2	10	158506	158515	20 %	40 %	40 %	0 %	158339824
74	NC_009926	CTTTG	2	10	161747	161756	0 %	60 %	20 %	20 %	158339828
75	NC_009926	CATTA	2	10	162957	162966	40 %	40 %	0 %	20 %	158339830
76	NC_009926	GGCAT	2	10	164667	164676	20 %	20 %	40 %	20 %	158339832
77	NC_009926	ACCTT	2	10	164698	164707	20 %	40 %	0 %	40 %	158339832
78	NC_009926	AAATC	2	10	165245	165254	60 %	20 %	0 %	20 %	158339832
79	NC_009926	GGGAA	2	10	165379	165388	40 %	0 %	60 %	0 %	158339832
80	NC_009926	AGATT	2	10	167495	167504	40 %	40 %	20 %	0 %	158339834
81	NC_009926	GTTGG	2	10	168871	168880	0 %	40 %	60 %	0 %	158339834
82	NC_009926	CTGTC	2	10	168978	168987	0 %	40 %	20 %	40 %	158339834
83	NC_009926	GCCAC	2	10	176518	176527	20 %	0 %	20 %	60 %	158339844
84	NC_009926	CGTCA	2	10	177293	177302	20 %	20 %	20 %	40 %	158339845
85	NC_009926	CGATG	2	10	184039	184048	20 %	20 %	40 %	20 %	158339852
86	NC_009926	GGAAC	2	10	186713	186722	40 %	0 %	40 %	20 %	158339855
87	NC_009926	TTAGC	2	10	189909	189918	20 %	40 %	20 %	20 %	158339860
88	NC_009926	GAAGA	2	10	190083	190092	60 %	0 %	40 %	0 %	158339860
89	NC_009926	AAAGC	2	10	195957	195966	60 %	0 %	20 %	20 %	158339870
90	NC_009926	TTTGC	2	10	196518	196527	0 %	60 %	20 %	20 %	158339489
91	NC_009926	CAGCG	2	10	199125	199134	20 %	0 %	40 %	40 %	158339491
92	NC_009926	TGCTC	2	10	205752	205761	0 %	40 %	20 %	40 %	158339492
93	NC_009926	TCAGC	2	10	208654	208663	20 %	20 %	20 %	40 %	158339493
94	NC_009926	TTTCG	2	10	209376	209385	0 %	60 %	20 %	20 %	158339493
95	NC_009926	CACGG	2	10	214181	214190	20 %	0 %	40 %	40 %	158339494
96	NC_009926	AGCTC	2	10	215065	215074	20 %	20 %	20 %	40 %	158339494
97	NC_009926	ATCTT	2	10	216150	216159	20 %	60 %	0 %	20 %	158339494
98	NC_009926	ATCGG	2	10	216946	216955	20 %	20 %	40 %	20 %	158339494
99	NC_009926	GGGCT	2	10	217107	217116	0 %	20 %	60 %	20 %	158339494
100	NC_009926	TCCCG	2	10	220858	220867	0 %	20 %	20 %	60 %	158339495
101	NC_009926	CGTTC	2	10	221592	221601	0 %	40 %	20 %	40 %	158339495
102	NC_009926	CCCCG	2	10	222010	222019	0 %	0 %	20 %	80 %	158339495
103	NC_009926	CTGGA	2	10	225868	225877	20 %	20 %	40 %	20 %	158339495
104	NC_009926	TCAGC	2	10	229246	229255	20 %	20 %	20 %	40 %	158339498
105	NC_009926	TCCCG	2	10	234266	234275	0 %	20 %	20 %	60 %	158339498
106	NC_009926	TCCCG	2	10	237566	237575	0 %	20 %	20 %	60 %	158339498
107	NC_009926	AACCG	2	10	238060	238069	40 %	0 %	20 %	40 %	158339498
108	NC_009926	GCTGA	2	10	239035	239044	20 %	20 %	40 %	20 %	158339499
109	NC_009926	AGTAC	2	10	239552	239561	40 %	20 %	20 %	20 %	158339499
110	NC_009926	CTGAA	2	10	239825	239834	40 %	20 %	20 %	20 %	158339499
111	NC_009926	AGCGC	2	10	240877	240886	20 %	0 %	40 %	40 %	158339499
112	NC_009926	GTTCC	2	10	244004	244013	0 %	40 %	20 %	40 %	158339501
113	NC_009926	CTCAA	2	10	246897	246906	40 %	20 %	0 %	40 %	158339505
114	NC_009926	CTGAT	2	10	247330	247339	20 %	40 %	20 %	20 %	158339506
115	NC_009926	TCAGC	2	10	247536	247545	20 %	20 %	20 %	40 %	158339506
116	NC_009926	GATCG	2	10	247971	247980	20 %	20 %	40 %	20 %	158339507
117	NC_009926	ATGGG	2	10	248430	248439	20 %	20 %	60 %	0 %	158339508
118	NC_009926	TGCTC	2	10	248689	248698	0 %	40 %	20 %	40 %	158339509
119	NC_009926	CCCAG	2	10	252299	252308	20 %	0 %	20 %	60 %	158339512
120	NC_009926	CCTGC	2	10	254155	254164	0 %	20 %	20 %	60 %	158339513
121	NC_009926	GGTAC	2	10	254257	254266	20 %	20 %	40 %	20 %	158339513
122	NC_009926	AAGAG	2	10	255245	255254	60 %	0 %	40 %	0 %	158339514
123	NC_009926	TGGAT	2	10	255454	255463	20 %	40 %	40 %	0 %	158339514
124	NC_009926	AAATC	2	10	259535	259544	60 %	20 %	0 %	20 %	158339518
125	NC_009926	CATGA	2	10	260049	260058	40 %	20 %	20 %	20 %	158339518
126	NC_009926	TCCAT	2	10	260490	260499	20 %	40 %	0 %	40 %	158339518
127	NC_009926	AAACC	2	10	263508	263517	60 %	0 %	0 %	40 %	158339519
128	NC_009926	CTGAA	2	10	270462	270471	40 %	20 %	20 %	20 %	158339529
129	NC_009926	CGATG	2	10	271757	271766	20 %	20 %	40 %	20 %	158339530
130	NC_009926	CGATG	2	10	272873	272882	20 %	20 %	40 %	20 %	158339532
131	NC_009926	CAATT	2	10	276091	276100	40 %	40 %	0 %	20 %	158339535
132	NC_009926	AAACT	2	10	277490	277499	60 %	20 %	0 %	20 %	158339535
133	NC_009926	TCAGT	2	10	277848	277857	20 %	40 %	20 %	20 %	158339535
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174	NC_009926	CGTCT	2	10	372873	372882	0 %	40 %	20 %	40 %	158339651

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.