MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 chromosome

Total Repeats: 274

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009925	AAAAGT	2	12	27106	27117	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009925	TAAATT	2	12	31782	31793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009925	GCTTGA	2	12	58906	58917	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009925	CTATTC	2	12	62438	62449	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009925	TTAATA	2	12	103106	103117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009925	CCATCA	2	12	127553	127564	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009925	GGAATA	2	12	192490	192501	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009925	TAAAAA	2	12	223680	223691	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009925	TTAATT	2	12	227520	227531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009925	TTCTGG	2	12	240423	240434	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009925	GCAACT	2	12	262451	262462	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009925	CAAGGC	2	12	288328	288339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009925	GAAAAA	2	12	292951	292962	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009925	GTAGCA	2	12	297185	297196	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_009925	GATTTT	2	12	312658	312669	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009925	GCCATC	2	12	318783	318794	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009925	TGCCAA	2	12	321485	321496	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009925	TCCAAA	2	12	336562	336573	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009925	ACATAA	2	12	345519	345530	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_009925	GACTAG	2	12	359441	359452	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009925	CCTACA	2	12	364556	364567	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009925	CCAATC	2	12	374604	374615	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009925	TCCTTA	2	12	438237	438248	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009925	AGGGGC	2	12	441183	441194	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_009925	AATGTG	2	12	490844	490855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009925	GCAATA	2	12	500636	500647	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009925	TAAAAT	2	12	505307	505318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009925	GGGCTT	2	12	556260	556271	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009925	TCACAC	2	12	557929	557940	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009925	TGTTTG	2	12	591975	591986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009925	TTGATG	2	12	611510	611521	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009925	AAAGGC	2	12	674594	674605	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_009925	AGCTAG	2	12	720139	720150	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_009925	TAATTT	2	12	723848	723859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009925	GGATAG	2	12	811589	811600	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009925	AATCTC	2	12	811972	811983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009925	ATCCCC	2	12	817443	817454	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_009925	TTTAAG	2	12	830783	830794	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009925	AGAATT	2	12	835557	835568	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009925	ATCTCC	2	12	849955	849966	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009925	TTGGCC	2	12	861596	861607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009925	CAGGGG	2	12	871475	871486	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_009925	CATATC	2	12	875253	875264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009925	TTCAGT	2	12	962930	962941	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_009925	CCTTTA	2	12	978875	978886	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009925	AATATC	2	12	1061941	1061952	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_009925	AAGCCT	2	12	1089381	1089392	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009925	GCCATA	2	12	1099614	1099625	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009925	ATTTTT	2	12	1104266	1104277	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009925	TAGGCT	2	12	1129076	1129087	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_009925	GGATAG	2	12	1194959	1194970	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009925	ATTAAT	2	12	1198540	1198551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009925	TTAGCT	2	12	1237488	1237499	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_009925	TTTCTA	2	12	1249641	1249652	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_009925	GCACTA	2	12	1259301	1259312	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009925	ATTCTC	2	12	1267719	1267730	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009925	CCTCTT	2	12	1297213	1297224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009925	GCCATA	2	12	1300630	1300641	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009925	TCAATA	2	12	1391163	1391174	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_009925	AAGGTA	2	12	1399290	1399301	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009925	AATCTA	2	12	1405387	1405398	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_009925	GTACAA	2	12	1407426	1407437	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_009925	TAAAAT	2	12	1438238	1438249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009925	GAAGTT	2	12	1469256	1469267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009925	CCAATC	2	12	1473378	1473389	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009925	TATCCA	2	12	1475270	1475281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009925	TAGATA	2	12	1497593	1497604	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009925	GGATAG	2	12	1502625	1502636	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009925	TCAATC	2	12	1516522	1516533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009925	TCTTAT	2	12	1538727	1538738	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_009925	ATCTCA	2	12	1547111	1547122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009925	ATTGCC	2	12	1548274	1548285	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009925	CAGCAA	2	12	1565229	1565240	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009925	GCCATA	2	12	1580726	1580737	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009925	TTCACG	2	12	1602274	1602285	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009925	TTAGTA	2	12	1617297	1617308	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009925	AAAAGC	2	12	1630793	1630804	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_009925	GATATA	2	12	1632647	1632658	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009925	GGAAAG	2	12	1647257	1647268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009925	CTTTAC	2	12	1648756	1648767	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009925	CTTCAA	2	12	1651584	1651595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009925	AGCAAC	2	12	1698604	1698615	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009925	AGTAGG	2	12	1701278	1701289	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009925	GATAAC	2	12	1713207	1713218	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_009925	ATCAAT	2	12	1721841	1721852	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_009925	TGGTAT	2	12	1742201	1742212	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009925	TGCAAT	2	12	1742906	1742917	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_009925	TTTCAG	2	12	1767688	1767699	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_009925	CCCCCA	2	12	1768952	1768963	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
90	NC_009925	GATTCG	2	12	1770634	1770645	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_009925	TAAGGC	2	12	1770948	1770959	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_009925	GATAAT	2	12	1803469	1803480	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009925	AGAAAA	2	12	1825545	1825556	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009925	CTGAAT	2	12	1842235	1842246	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_009925	TGTTCT	2	12	1855194	1855205	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_009925	ATTGAG	2	12	1860577	1860588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009925	TATCTC	2	12	1876542	1876553	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009925	TTGGCA	2	12	1895589	1895600	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_009925	TATATC	2	12	1900611	1900622	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_009925	TCTAAC	2	12	2038626	2038637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009925	GGTTTC	2	12	2039838	2039849	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_009925	AAAGCC	2	12	2041362	2041373	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009925	GGCTTT	2	12	2041395	2041406	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_009925	GATACT	2	12	2076379	2076390	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_009925	TGTGTT	2	12	2080946	2080957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009925	ATGCAG	2	12	2111523	2111534	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_009925	GAACGG	2	12	2111738	2111749	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_009925	CGAGCC	2	12	2112280	2112291	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009925	CGCGAT	2	12	2112497	2112508	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009925	TCCTAT	2	12	2175011	2175022	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009925	AACCCT	2	12	2209206	2209217	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009925	TATCTT	2	12	2216003	2216014	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_009925	CCTATA	2	12	2273722	2273733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009925	GATCAT	2	12	2274347	2274358	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_009925	ATACTT	2	12	2280222	2280233	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_009925	AAAGGA	2	12	2340116	2340127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009925	TGCCTG	2	12	2373619	2373630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009925	CCATCA	2	12	2413028	2413039	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009925	AATATT	2	12	2432074	2432085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009925	TGGGAT	2	12	2444139	2444150	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009925	GAGATA	2	12	2482284	2482295	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009925	AACTCA	2	12	2483011	2483022	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009925	AATCAT	2	12	2497745	2497756	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_009925	CCACAA	2	12	2572370	2572381	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009925	TCCTAT	2	12	2613439	2613450	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009925	CAACCC	2	12	2665587	2665598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_009925	TGTCTT	2	12	2691639	2691650	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_009925	TGCTTC	2	12	2722850	2722861	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009925	GATAGG	2	12	2744253	2744264	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009925	TGGAGC	2	12	2821222	2821233	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_009925	CAAAAG	2	12	2835693	2835704	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_009925	TAATGA	2	12	2929420	2929431	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009925	AATATT	2	12	2933932	2933943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009925	TCAGCA	2	12	2934935	2934946	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009925	AACAGA	2	12	2942181	2942192	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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138	NC_009925	TGCTTG	2	12	3058252	3058263	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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140	NC_009925	AATGAT	2	12	3093625	3093636	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009925	CATCCA	2	12	3094883	3094894	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009925	TTTAAA	2	12	3114503	3114514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009925	AGGGAT	2	12	3151384	3151395	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_009925	TATAGA	2	12	3215872	3215883	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_009925	TGCCTA	2	12	3946098	3946109	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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243	NC_009925	ATAAAA	2	12	5895169	5895180	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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246	NC_009925	GATTGA	2	12	5960395	5960406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
247	NC_009925	ACCTAA	2	12	6003442	6003453	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_009925	TTGGCA	2	12	6014820	6014831	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
249	NC_009925	AATACT	2	12	6038333	6038344	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
250	NC_009925	AACTCA	2	12	6060565	6060576	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_009925	AATGAG	2	12	6083824	6083835	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_009925	TTATAT	2	12	6103299	6103310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_009925	AATAGT	2	12	6131516	6131527	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
255	NC_009925	CCTTCG	2	12	6149242	6149253	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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259	NC_009925	TATTGG	2	12	6237737	6237748	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.